康熙四十二年十一月四日，辰時正牌，初升的太陽緩緩地從海平面上探出個頭來，金色的陽光驅散了海邊的迷霧，帶給人間一絲冬日的溫暖；海浪輕輕地拍打著停泊在長崎港口外那一排排的巨艦，發出陣陣輕輕的濤聲，海鷗在晨光裡上下飛舞；大地從沉睡中清醒了過來，早起的鳥兒們在密林裡鳴唱著、飛翔著，一派和諧的景象，唯一與這和諧的初冬不搭界的是長崎堡內外那些黑洞洞的火炮和明晃晃的刀搶。
胤站在高高的塔樓上，面色沉穩地看著面前的長崎堡，嚴峻的臉上沒有絲毫的表情，雙唇微啟，冷冷地說道：「開始吧！」屹立在胤身邊的旗號兵聞言立刻揮舞手中的信號旗，將開始攻擊的命令傳達了下去。
李柯回首看了眼高高的塔樓，深吸了口氣，猛地揮了下手下令道：「開炮！」霎那間兩百餘門火炮同時發出怒吼，隆隆的炮聲中，長崎堡城頭彈如雨下，在城頭上炸開了朵朵絢麗的氣浪，劇烈的爆炸聲響徹雲霄，大地在轟鳴聲中震顫了起來，躲在城垛後的長崎守軍何曾見識過如此強大的炮火，頓時被炸得哭爹叫娘，四下亂竄。火炮三次齊射之後，正面堡門上的長崎守軍早已被炸傻了，除了趴倒在地上祈求「天照大神」保佑外，壓根兒就沒有反抗的勇氣。
清軍三次火炮齊射之後並沒有立刻發動攻擊，也沒有再次展開炮擊，大隊清軍開始緩緩地向前移動。似乎在進行沖城前的準備，城頭的長崎守軍趁著清軍炮火地間隙，慌亂地呼叫著。打算依據堅城給沖城的清軍大隊一個迎頭痛擊，正忙碌間，突然城牆一陣劇烈的振顫之後。如同波浪般起伏了起來，隨即一聲巨大地爆炸聲響起，靠近堡門處的一段城牆猛地如同噴泉般爆發起來，碎石、碎磚、殘肢斷臂夾雜在滿天的塵埃中高高地飛上了半空。塵埃落定之後，高大地長崎城牆赫然出現了一段寬達數丈的大缺口，還沒等長崎守軍明白過來究竟是發生了何事，後堡門處也同時發生了相同的事情，又是一個巨大的豁口出現了。
不消說。這兩次劇烈的爆炸正是清軍趁夜色埋下的炸藥之傑作，別說倭國守軍意外。就連清軍也沒想到會是這種結果——當初胤祚將黃色炸藥交到李柯手中時，也曾做過演習，只是從來沒有用如此巨量的炸藥，誰也不知道兩大車的黃色炸藥竟然會有如此巨大地威力，一時間攻守雙方都有些傻了眼，各自目瞪口呆地看著狼藉的爆炸現場。心中一片地茫然。
李柯早聽過胤祚介紹過黃色炸藥的威力，算是所有人中最為清醒的了，此時見到戰機已然出現，立刻揮了下手下令道：「開炮！」，清軍陣中數百門火炮再次轟鳴起來，炮火將城牆的豁口處附近的城牆狠狠地犁了幾番。原本還在發呆著的守軍被這陣急促地火炮炸得死無全屍。
胤也被爆炸的威力驚呆了。他是曾聽胤祚介紹過此種炸藥的威力，可親眼見識卻還是第一次。直到李柯部的火炮再次轟鳴之後，才從震驚中回過了神來，眼瞅著城牆豁口處已然沒有了守軍，毫不猶豫地下達了總攻的命令，早已等候多時的清軍大隊如同決堤地潮水一般向城牆衝去，隊列前地軍士快速地將竹梯架上了護城河，並快速地鋪上木板，清軍大隊趁著守軍還沒反應過來之前蜂擁著沿著十餘道臨時橋樑衝過了護城河，狂吼著殺進了城中。
城已破，士氣已洩，加之守軍無論是人數還是訓練都遠不及清軍，這場戰鬥原也沒有什麼懸念，可令李柯沒有想到的是陷入了死局中地長崎守軍竟然人品大爆發，一派困獸猶斗的架勢，跟清軍死命地拚殺著，逐段城牆、逐段街道地拚殺著，雖然不足以抵擋清軍的強大攻勢，但依舊給清軍帶來了不少的傷亡。這裡所有的清軍士兵都是李柯一手訓練出來的，每一個參加過兩棲登陸作戰的士兵都是一顆寶貴的火種，李柯可不想在這麼座破城中損失過重，眼瞅著倭兵抵抗極為凶狠，站在城頭高處的李柯有些憤怒了，手一揮，讓始終跟隨在他左右的一小隊三十餘名手持怪模怪樣的「鳥銃」的軍士加入到了城市巷戰中去。
這一小隊清軍奔下城牆，快速地穿過清軍陣列，來到了陣前，動作劃一地排成一列，舉槍，扣動扳機，數十聲清脆的槍聲響起，數十米外的倭兵隊列中頓時倒下了一大排，接著也沒見這些清軍裝填火藥、槍彈，一連串的槍聲接連不斷地響起，倭兵陣列中不斷有人慘叫著倒了下去，一時間倭兵陣中頓時大亂起來，以為遇到了神兵，此時所有的守軍再也沒有了抵抗的勇氣，只恨爹娘少生了兩條腿，紛紛抱頭鼠竄而去。
鳥銃？自然不是！這一小隊清軍手中所持的正是胤祚費盡了手中所有的資源所生產出來的5式半自動步槍。自打大規模煉鋼試驗成功之後，天津鋼鐵廠已然投入運營，儘管由於需求不足，並沒有建設成大規模的鋼廠，但就這麼個中型鋼廠已然能滿足全國過半的鋼鐵需求，手中有了鋼廠，又有了大批的有經驗的冶金人才，胤祚首先想到的就是槍械生產，可惜由於康熙老爺子的原因及當時的生產條件所限制，胤祚只能在私底下進行試驗。
鎢鋼的冶煉早已在康熙四十一年便已經取得突破，有了鎢鋼，製造現代化槍械所需的基本材料便算是有了，至於生產的動力蒸汽機也已經能夠投入實用中，雖然還只是單汽缸式的，但也足夠了，只可惜沖床、車床等設備的研製尚處於摸索階段，始終未曾突破，因此槍械的生產始終無法做到大規模化，且人工生產出來的槍械零件廢品率極高，彈藥也是如此，一年多來，胤祚名下的那些實驗室總共就生產出這三十支56式步槍，至於子彈則只有千餘發，成本更是高得驚人，只能用來進行戰場檢驗，壓根兒就無法大規模配置到部隊。當然，即使是能大規模配置胤祚也不會去做此等觸怒康熙老爺子的事情，至於戰場檢驗一下此等槍械的威力卻是不妨的，儘管可能為自己惹來麻煩，但胤祚也顧不得那麼多了。
長崎守軍的有次序抵抗被突然出現在戰場上56式步槍擊潰之後，整個長崎堡內再也沒有成建制的抵抗武裝了，清軍大隊人馬快速地掃蕩了全城，將佔據著大名府試圖做最後抵抗的小太郎養生生擒了，押解到胤面前。
胤輕蔑地看著被壓著跪在自己面前的長崎大名，冷冷一笑道：「此等廢物留著何用，拉出去砍了。」數名戈什哈一擁而上，不過小太郎養生的嚎叫和掙扎，拖將出去，就在帳外揮刀斬下了那顆骯髒的腦袋，並將之懸掛在長崎堡的正門上。
「小人小太郎六葉見過天朝上將軍。」小太郎六葉耳聽著自家族侄那臨時的慘叫，嚇得趕緊跪倒在地，哆嗦地拜見胤。
「嗯？上將軍？哈哈哈……」胤放聲大笑起來，好不容易才忍住笑道：「你懂得漢語？不錯嘛。」
「上將軍，小人自幼嚮往天朝上國，上次小人就是因為勸阻家主的暴行而獲罪，小人……」小太郎六葉嘮嘮叨叨地說著。
「好了，本帥沒功夫聽你這些廢話，既然你選擇投奔我天朝上國，本帥也不會虧待你，這長崎大名的位置就由你來幹好了，具體該做些什麼，自然有人會去通知你，去吧。」胤有些子不耐煩地揮斷了小太郎六葉的廢話。小太郎六葉一聽能保住自家性命，還能當上大名，自是千恩萬謝地去了。
仗打得很順，不到半天的時間就拿下了長崎，這讓胤高興之餘也有些子不爽，他還真沒盡興呢，有心去攻打其它城市，可惜他不敢違了胤祚的話，也只能在自個兒心中叨咕幾句，心中琢磨著回去之後也得設法為自己搞出一支嫡系部隊來，不過那是以後的事兒，現如今還有一大堆的將軍正等著他發號施令呢。
胤清了一下嗓子，飛快地下達了下一步的作戰命令——蕭三郎率右分艦隊十艘大型戰艦，十二艘中型戰艦及五艘補給船炮轟高知、奈良、神戶、大阪；參將喬旺率左分艦隊十二艘大型戰艦，十五艘中型戰艦及五艘補給船炮轟名古屋、橫濱、千葉、江戶，不必登陸作戰，但務必摧毀其抵抗意志，其餘各艦隊原地待命，隨時準備增援兩路出擊艦隊；李柯率部駐紮長崎，維持城內秩序，梁思澤率部把守上西山。
康熙四十二年十一月中旬，東瀛幕府得到戰報，剛知曉清軍已然攻佔了長崎，正人心惶惶，不知是該戰還是該和之際，高知、奈良、神戶、大阪，古屋、橫濱、千葉等沿海城市全部遭到清軍戰艦的狂轟亂炸，十一月二十五日，大清艦隊出現在江戶港灣，大量的炮彈從天而降，將江戶轟成一堆的瓦礫，原本就脆弱無比的德川幕府派出了求和使節，與大清簽訂了《長崎條約》，條約規定：大清租借長崎為通商口岸，租期一百年，每年繳納租金白銀一兩，大清商人可以在東瀛全境內通商，東瀛之海防由大清加以保護，大清保證德川幕府的合法統治，並承諾不干涉東瀛內政……
至此，長崎之戰落下了帷幕，以大清全勝而告終，大清海軍的初次亮相獲得了圓滿的成功，長崎事變標誌著大清海軍正式登上了歷史的舞台。