在工程啟動之後，編撰人員少娛樂，少貪睡，不閒適，多工作，無白髮的，添了白髮，有白髮的，多了白髮，衣帶慚寬終不悔，為伊消得人憔悴。有時候，一本書標點了，編輯了，校勘了，會忽然因為電腦或別的什麼地方出了毛病，前功盡棄，令辛苦人欲哭無淚，只得一切從頭另來。
這樣一件出版界的大好事，偏偏有人無端非議，指責設計時專主在「藏」，但並不實用，不收選本，不收註釋，很可能成為有錢人擺在書櫃裡的裝飾，於弘揚中華文化用處不大。也有人指責季羨林好大喜功。其實，季羨林早就功成名就，學界泰斗的地位早已確定，現在什麼也不幹，這個地位也不可動搖。對這樣指責的人來說，他們的邏輯依然是幹的不如不幹的，不幹的不如搗蛋的！不然，該作何解釋呢？
當全書出版工作告竣之後，季羨林於1996年10月11日晚上九點半，乘飛機從北京來到濟南，10月12日在山東大學舉行了北大教授季羨林、中國建行山東分行為山大九十五週年校慶獻禮的「《傳世藏書》捐贈儀式」，季羨林為母校捐贈了一套，建設銀行山東分行捐贈了一套，每套價值六萬八千元。
目前，這兩套書已經編碼啟用，以文史哲見長的山東大學莘莘學子，已經享受到季羨林貢獻給中華民族這份厚禮的精神營養，一批學術研究成果將依賴這套叢書而誕生。山大學子們衷心感謝季羨林老學長！
7．出任《四庫全書存目叢書》總編撰
這是又一個戰場，又一個宏大的項目，就是編修《四庫全書存目叢書》。項目主持人、總編撰是季羨林，因為此工程的策劃者《四庫全書存目叢書》編撰出版工作委員會認為，擔此重任者，非季羨林莫屬！
修撰這套大型叢書的起因，是因為《四庫全書》雖網羅典籍3461種，70309卷，號稱中國傳統文化之總匯，但此書並不全，這也是學術界眾所周知的，因為大量不合清王朝口味的，或列為存目，或遭禁毀。僅列存目的，就有6793種，93551卷，約占當時傳世典籍的一多半。加之清中葉以來，多有國難，文獻散亡，存目者十喪三四，如再不及時搶救，不但無法開發利用，且有繼續亡佚之虞，後果是不堪設想的。
鑒於這一理由，策劃者決定出版存目叢書。齊魯書社出大陸版，台灣莊嚴文化事業有限公司出大陸外版。組成了以季羨林為總編撰的編輯委員會、工作委員會，收錄了散藏在全國和歐、美、日等國家的200餘家圖書館四庫存目書4000種，6萬餘卷，分成約1200冊，分為百卷（總目），經、史、子、集四部，尾卷（索引）。這部叢書收錄的，其中有三成是孤本，許多具有極高學術價值、史料價值和版本價值，實為研究中國文化所必備，堪稱保存古代文獻之盛舉。
收錄在《四庫全書存目叢書》中有極高學術價值的比比皆是。
對研究哲學和政治思想很有價值的有李贄《藏書》、《續藏書》，張居正《太岳集》、王廷相《雅述》、《慎言》，呂坤《呻吟語》、《去偽齋文集》，方以智《藥地炮莊》、顏元《存學編》、《存性編》，李塨《論語傳注》、《大學傳注》、《中庸傳注》、《大學辨業》、《恕谷文集》，李顒《四書反身錄》、《二曲集》，黃宗羲《南雷文定》等。
史類著述最為可觀，引人注目者有《元典章》、《皇元聖武親征錄》、鄭麟趾《高麗史》、雷禮《皇明大政記》、傅維鱗《明書》等。野史筆記雜錄中姚汝能《安祿山事跡》、陶宗儀《草莽私錄》、黃瑜《雙槐歲鈔》、田藝蘅《留青日札》、陳全之《蓬窗日錄》、焦竑《玉堂叢語》、何良俊《四反齋叢說》、朱國楨《湧幢小品》、文秉《先撥志始》、蔣平階《東林始末》都很有價值。
地理類值得注意的有劉侗《帝京景物略》、馬歡《瀛涯勝覽》、鞏珍《西洋番國志》、黃省曾《西洋朝貢典錄》、顧炎武《天下郡國利病書》、徐崧《百城煙水》等。
文學類有郎瑛《七修類稿》、呂子孝《玉霄仙明珠集》、納蘭性德《通志堂集》、孫枝蔚《溉堂集》、萬鈳《詩經類考》、胡應麟《詩藪》、沈雄《古今詞語》、葉燮《原詩》等詩文評著述都很值得注意。
其他如小學類《四聲切韻表》、《黃公說字》、《匯雅》，目錄類《國史經籍志》、《讀書敏求記》、《述古堂書目》，醫家類《難經經釋》、《臨證指南醫案》、《醫史》、《瘡瘍經驗全書》，天文算法類《算法統宗》、《勾股述》、《天經或問後集》，農家類《沈氏農書》，藝術類《法書通釋》，刑法類《洗冤集錄》、《刑統賦》，雜家類《西學凡》、《辨學遺牘》、《天主實義》、《靈言蠡測》、《居家必用事類全集》、《多能鄙事》，釋家類《佛祖統記》、《南宋元明僧寶傳》等，都是極有價值的珍貴典籍。
四庫存目書之價值如此重要，近代以來學者多有肯定和使用，如梁啟超、陳垣、鄭振鐸、謝國楨等人都是。因此，「四庫存目書可以說是珍品雜陳，琳琅滿目，難以盡數」。[季羨林、任繼愈、劉俊文：《〈四庫全書存目叢書〉編撰緣起》，《文史哲》1997年第4期。]
對這樣有價值的大型叢書，也有人出來橫加指責，什麼名字便不通啦，大就一定好嗎？什麼既不經濟，也無必要啦；什麼在文化史上將流為笑談啦。好事者批評說「好大未必能成其大，急功未必能成其功。大的，不一定就是好的，正不必一見『大』，便為吹噓，替它做廣告」，甚至作打油詩說：文化弘揚事可歌，急功近利反蹉跎；真知灼見千般少，充數濫竽一個多。[《詩畫話·大就好嗎？》，《讀書》1995年第1期。]
對這樣的諷刺、挖苦，急於想讀書的讀者忍受不了，叢書編委會、工委會自然更忍受不了。在這樣的情況下，以寬厚出名的季羨林不得不出來說話了。他不理解，為什麼作幾件對弘揚中華民族優秀文化極為有利的事，偏偏有人出來反對，他寫信給發表諷刺畫、文的《讀書》編輯部說：
我本來想充當一次啞巴，現在已經逼到啞巴頭上，不說話不行了。我且以小人之心度君子之腹，我總懷疑，你們並不知道什麼叫《四庫全書》。你們不妨駕臨圖書館去翻閱幾分鐘，這樣總比閉著眼睛瞎說要好，這樣也能保護你們自己的面子。
他又說：
我只是感覺到文化學術界這樣的一件大事，事關我們全體的名聲，我不能不說幾句話，私心不能沒有一點，但是主要出之公心。[《關於〈四庫全書〉》，《讀書》1995年第5期。]
最近幾年，季羨林寫《糖史》，不管春夏秋冬，不顧酷暑嚴寒，幾乎天天跑一趟北大圖書館，主要的吸引力就是《四庫全書》，《糖史》中的很多資料，就來自《四庫全書》。
連著兩天，季羨林給《讀書》寫了兩封長信，道出了讀者和編者們的心聲，使他們有了信心，感到這樣的話由他說出來，份量就不一樣。[黃偉經：《我識季羨林先生》，《人格的魅力——名人學者淡季羨林》第114頁，延邊大學出版社1996年。]
是的，沒有人能阻擋住這一大型文化建設工程的推進，從1994年開始編撰，1995年首批《四庫全書存目叢書》出版，國內外名報《人民日報》、《文匯報》、《快報》、《世界日報》、《星島日報》、《世界週刊》、《澳門日報》、《商報》、《大公報》、《聯合報》等均以顯著位置作了報道。
和《傳世藏書》一樣，季羨林相信「真理畢竟勝利」。而且，《四庫全書存目叢書》還未殺青，季羨林又擔任了由安徽教育出版社策劃準備出版的《胡適全集》的主編。
季羨林就這樣不斷有新的追求、新的開拓，這正應了曹操的那首《龜雖壽》詩所說：
老驥伏櫪，
志在於裡，
烈士暮年，
壯心不已。
四、道德文章
1．光風霽月
中國宋明時期的理學家們喜歡講氣象，氣象本是指大氣中各種物理現象和物理狀態的統稱，有時也在景象、光景的意義上使用。但理學家所講的「氣象」均不是指這兩方面的意義，而是指人的道德和精神的境界。程頤為程顥作《明道先生行狀》，說：
先生資稟即異，而充養有道：純粹如精金，溫潤如良玉，寬而有制，和而不流；忠誠貫於金石，孝弟通於神明。視其色，其接物也，如春陽之溫；聽其言，其入人也，如時雨之潤。胸懷洞然，徹視無間；測其蘊，則浩乎若滄溟之無際；極其德，美言蓋不足以形容。[《河南程氏遺書》卷十一。]
這里程頤所說，均屬程顥的「氣象」，顯系道德境界和精神境界兼而言之。另有黃山谷（庭堅）說理學家周敦頤：
濂溪先生胸懷灑落，如光風霽月。廉於取名而銳於求志，薄於徼福而厚於得民，菲於奉身而燕及煢嫠，陋於希世而尚友千古。[黃宗羲《宋元學案·濂溪學案下》。]
這樣一個對周敦頤氣象的評價，可以說是抓住了本質，所以這個評價深得後來理學家的讚許。
這樣的話，用來評價季羨林，也完全適用，毫無誇張。
季羨林道德境界之高尚，在學術界一直傳為美談，學人多有品評，這些品評多是將道德文章放在一起，這裡姑且做一個集錦。
著名歷史學家範文瀾說：季羨林不能整，他是國寶。民盟中央主席、北京大學前校長丁石孫教授說：要學習季老的優良品德，因為季老是我國知識分子的楷模。著名外國文學家、詩人馮至先生借用歌德的兩句格言詩改為第二人稱獻給季羨林：你的產業是這樣美，這樣廣，這樣寬／時間是你的財產，你的田地是時間。許多國際知名學者均對季羨林有極高評價，如稱他為「元老級的東洋學者」，「東亞，包括日本，最偉大的印度學家」等等。[均見李錚《祝賀季羨林教授八十壽辰》，《群言》1991年第10期。]
張中行先生說：他會得太多，而且既精且深，我等於站在牆外，自然就不能瞥見宗廟之美，百官之富。……他以一身而具有三種難能：一是學問精深，二是為人樸厚，三是有深情。三種難能之中，最難能的還是樸厚，像他這樣的難於找到第二位。
國際友人韓素音女士說：我真是幸運，能與中國最傑出的人物之一季羨林教授相遇，他是世界上最著名的梵文學者之一，我對他的尊敬和稱讚愈益增長。他是一位完全具備知識分子品格的人，決心要做出最好的學術成果，他從來沒有放棄堅持一切都要優秀的原則。我在他身上發現的不只是博學，而且是睿智，不僅是睿智，而且還有非常謙恭有禮和幽默。他的博識給人留下深刻的印象，可是他這樣謙虛，可以讓人們跟他談論那些他其實比他們知道得更多的話題。他尊嚴的人格，他的對於物質利益毫不動心，他對於書的熱愛，他的耐心，還有他的充分的真誠，對我來說，他將永遠是氣節的象徵。他毫不追求權力、財富或者被人頌揚，他整個地獻身於他的國家和人民，還有他的不動搖的忠誠，對所有的人來說，都是一個榜樣。
張學書說他儉以養德，愛國情深，律己謹嚴，待人以禮。