「那麼您為什麼不反對將軍提拔板倉內膳正呢？內膳正雖是深受將軍家信任的京都所司代的弟弟，但充其量也不過是個一萬石俸祿的小大名，而且年齡也還不到五十歲。換言之，內膳正和您一樣，對於打仗是完全的外行。派這樣的人去九州，難道您認為他能隨心所欲地支使細川家、鍋島家以及有馬家那些俸祿更高而又身經百戰的老臣嗎？將軍下命令的時候，您為什麼不請命自己前去呢？雖然對戰爭一無所知這一點上，您和內膳正都是一樣的，但您是將軍家的寵臣。難道您對將軍有著什麼深深的怨恨嗎？」
聽到柳生宗矩如此直接的話，伊豆守頓感全身冰涼。
「老人家，我對將軍哪有什麼怨恨啊……」
「若沒有的話，您為什麼故意不阻止將軍作出這樣的選擇呢？依照常理，內膳正沒有足夠的威望，所以誰也不會乖乖聽命。不聽命就會吃敗仗。若吃了敗仗，失去天下信任的是內膳正，還是德川家的第三代將軍？連這點都沒想到，算什麼『智囊伊豆』？我也不多說了。您趕緊提出申請，利落地解決掉當前的困境。若連這點事情都解決不了的話，你就不用再回來將軍身邊了。」
這是如刺骨之痛般決絕的諫言啊！
柳生宗矩也是松平信綱的兵法老師。如今柳生將一切都委託於他，他也就順從地糾正了之前的錯誤。
綽號「智囊伊豆」的松平信綱也是幕府中最有才幹的人物之一。聽了柳生宗矩的忠告後，他便爽快地轉變想法，將這次事變的處理當做自己的事情來應對。
轉變想法之後，就發現事情很是棘手。
簡單說來，事變的處理結果會決定三件大事。其中第一件事情至關重要——德川天下的安定已經走到了岔路口。
如果因此失去了旁系大名的信任，那麼初代將軍德川家康的理想則會被人懷疑為只謀一己私利的戰國武將的運氣。
也就是說，在世人的評價中，德川家康會淪為一個沒有理想、只是憑蠻力克敵奪天下的人。
第二則是，天主教和佛教將會面臨價值判斷的危機，讓人考量到底哪方在嚴格堅持其宗教本質。
家康非常認可宗教自由。正因為如此，被織田信長摧毀的本願寺才得以重建，以東西兩處的形式保存下來。禪寺和真宗也得到了認可。
家康對於天主教，也在其不與歐洲人支配日本的現世慾望相關聯的前提下，致力認可其自由性。
但如果對這次的暴動處理不當，則可能會演變為狹隘無理的排擠宗教的衝突。
現在的問題是，這次的暴動應該認為是由於松倉勝家和寺澤堅高的苛政引起的，所以與宗教自由這一人的根本原則根本沾不上邊。
第三，由於引起了如上錯覺，天子委託於德川家的行政大權被逼入歧途，陷入了思想上的混亂。
如果領導者的思想混亂，國民是不可能獲得幸福的。
闡明這個道理，指明應當依循的道路，與萬民共同前進，不管在什麼年代，都是最重要的人道精神。
就這樣，經柳生宗矩訓斥後，伊豆守松平信綱果然產生了思想飛躍，開闊了視野。
舉一反三，這就是「智囊伊豆」的本領。
通過柳生宗矩，他意識到了事態的嚴重性。於是，他首先通過大老土井利勝向家光將軍進言：「請讓山形城的保科正之閣下把嚴東北地區的警備。」
然後在十二月三日，他便離開江戶向九州進發了。
松平是這麼打算的：眾所周知，保科正之是將軍家光的胞弟。同時，他又是山形城領有二十萬石的城主。如果不先把嚴東北軍防再進兵九州的話，難保域外的旁系大名們不會心生嫌隙。
之後，松平信綱便出發去往九州，卻也並沒有特別著急趕路。
在眾多大名之中，有些人妒忌著松平信綱所受的寵遇，加上他對打仗一無所知，暗中等著看他打敗仗的人也不是沒有。十二月三日這天，板倉重昌剛到達肥前的神代，兩日後的十二月五日才初抵島原，接著便忙著準備十二月十日的第一次總攻擊。
而這個時候，松平信綱正十分悠閒地從東海道南下。
他裝作不知道板倉重昌第一回總攻擊失敗的消息，到達伏見後便暫住在小堀遠州的府邸裡。又把板倉重昌的哥哥、京都所司代板倉重宗叫來此處，若無其事地向他打探消息。這是十二月十四日的晚上的事情。
「九州那邊有什麼消息嗎？」
「不是什麼好消息。預定是在十日發動總攻擊，但諸事不如意，最後似乎以失敗告終……」
「暴動的隊伍是不是已經進入了原城？」
「是的。他們一聽到上使到達的消息，便進入古城原城據守。雖然是想要就此一舉殲滅敵人，但不知最終能否如此順利……」
「那麼，板倉大人，您也贊成我就這樣去九州赴任嗎？」
「那是自然，我還在暗暗高興呢。」
「您這樣說，那我就不著急了。若我一著急，板倉內膳正也會跟著著急，就會變成我們兩個冒失鬼的競爭了。因此我想先從這兒去大阪，準備好攻城用的大炮，確保它們順利運輸到達後再出發。」
「那麼您打算何從大阪出發呢？」
「最快也得在十二月十九日。或者也可能晚上一兩天。總之請您先帶個話，就說松平伊豆守前往九州並不是為了急著去討伐敵軍，著急容易壞事，不如花點時間斷了禍根……這才是我來此的目的。」
「您是在十二月二十日左右從大阪出發嗎？……」
「對。我會在大阪的川口乘船南下，到九州的小倉時最快也是年末了。還請您帶話給板倉內膳正，請他留心這一點來作今後的安排。」
京都所司代板倉重宗深知弟弟的脾氣，所以一臉消沉地反問道：
「您的意思我明白了。不過，在您到來之前，假使我弟弟認為可以再次發動總攻擊的話該怎麼辦呢？」
「那我也不會阻止他。武將若是打算賭上生死作戰，我說什麼也沒用。總而言之，在我到達當地之前，板倉內膳正是第一上使，我松平信綱是第二上使，同為將軍大人的上使，地位相同。到達九州後，說不定會得到以我為上的命令，不過那都是到達之後的事情了。因此，我的意思，希望您能理解！」
的確，這個建議是意味深長的。
如果不想死的話，那就在松平伊豆守到達之前停止總攻擊。然而若是出於武士的臉面和意氣，在此前再次發動總攻擊進行鎮壓，伊豆守也承諾不對其提出異議。
究竟板倉重宗是如何向戰場上的重昌傳達這件事的？此事已無從知曉。只是，身為第一使者的內膳正板倉重昌在他迎來五十一歲的第一天，在元旦的總攻擊中，陣亡了。
伊豆守松平信綱在築前的原田得知了這個消息。
「提前了啊……」
信綱話一出口，又故意用大家都能聽到的聲音沉吟道：
「行了，事情的原委我都清楚。估計在正月十一日，等到細川忠利、立花宗茂、鍋島勝茂、有馬豐氏和黑田忠之等人都回到各藩後，將軍大人會火速下達討伐的命令。那時候，若是各藩都能有幾個重傷員倒還好……」
這話在聽的人耳中，正是如扎入胸口的尖刀一般的威脅。
各家家臣侮辱上使是懦夫，導致板倉內膳正戰死，伊豆守說若各家家臣中也有傷員的話倒還說得過去，這是尖銳的諷刺。
自此，對於板倉內膳正的戰死，松平伊豆守便再沒有提及。
「現在是正月，暴動百姓中大概也有思鄉的人。對於那些想痛改前非回家的百姓，我們既往不咎。但是，對於那些正月十日後還繼續留在城內抵抗的人，即便是調動九州的百萬大軍，也一定要鎮壓。要將這個旨令清清楚楚地傳到城內。在那之前，我打算好好享受九州這閒暇而又溫暖的正月。」
此間無話。然而實際上，正月十日之時，松平信綱已經從島原趕到了有馬，在有馬組織了軍船，從城內無計可施的海上炮擊原城。
「下手不要太重。盡可能只摧毀城內的空地，耐心觀察老百姓的態度。」
大部分相關記載只是說此次攻擊遭到了守城信徒的猛烈反擊，沒有多少收效。但是，正是從正月十日這天開始，城內信徒的內心開始動搖了。
最為重要的是，包圍城池的軍隊不急著作戰，這點使守城的敵軍極為不安。
實際上就是進行嚴密的包圍封鎖，截斷敵軍的糧道。
「人不吃飯，還能堅持作戰幾天呢？」
這才是「智囊伊豆」深藏於心的戰術。
和以前內膳正板倉重昌的急功近利不同，松平伊豆守是等著柿子熟透了，自己掉下來。這就是「戰爭外行的新戰法」。
最先落入包圍圈中的是神子天草四郎時貞，也就是益田時貞的外甥，小平等一幫少年。
因為城內的糧食日益減少，小平等人便到城下的海裡去撿貝類。他們就是在這個時候，被監視者給抓住的。
這些少年俘虜被帶到了松平信綱的面前。看著他們梳著劉海的面容，松平信綱的腦海裡浮現出將軍家光小時候頑皮的樣子。他黯然問：
「你的名字，是不是叫小平？」
「是的。這位伯伯，既然已經落入你們手中，就盡快把我殺了吧。」
「但你和我們都是同一個神靈的子孫啊。」
「這麼說來，你不殺我了?」
「若殺了你，既對不起你的父母，也對不起神靈啊。」
「嗯。大家都是同一個神靈的子孫啊？」
「是啊。神靈的子孫都一樣，沒有吃的肚子會餓，肚子餓了就沒法活。怎麼樣，『天帝之子』天草四郎也正餓著肚子吧？」
聽到這兒，小平雙眼放光，搖著頭說：
「四郎大人的肚子不餓。因為他得到了天帝的祝福。」
「小平，你沒搞錯嗎？我可聽說，即使是『天帝之子』也一定會肚子餓的。那這麼說來，肚子餓的人就不是天帝的孩子了嗎？」
「嗯……」
「這麼一來，城內的眾人都不是天帝的孩子。天帝的孩子只有一人，就是天草四郎。如果是這樣的話，情況就不同了。可以這麼說，城內的百姓和漁民們明明不是天帝的孩子，卻裝成天帝之子的樣子餓肚子，直到成為乾屍。是這樣嗎？」
「我可不知道。這樣的事兒……哪兒可能有？」
「但確實如此啊。這可不得了了。天帝之子會倖存下來，但城內的其他人都會變成乾屍。這樣一來，能夠戰鬥的就只有天草四郎一個了。怎樣啊？就算是四郎大人，僅憑他一個，你認為能跟我數十萬士兵作戰嗎？」
「不……不久，四郎大人，就會帶來奇……奇跡的。」
「嗯。你說的奇跡，是不是把牆壁啊、草墊啊和石牆之類的東西都變成吃的呀？」
「是啊！草、木、石、土都可以變成食物的。」
「那他一定也打算把那些乾屍變成食物吃掉了吧。原來如此……那這樣就可以安心了。只要不早死，就不怕被變成食物。這樣啊，我終於明白啦。你們也是因為害怕死了被吃掉，所以才出來撿貝殼的吧。好了好了，今天沒能讓你們如願撿到貝殼，就補償你們一頓飯團吧。不過，吃完之後趕快回城。要堅持活下去，直到奇跡出現，直到草、木、乾屍都變成食物。不過，你們不能再出城來拾貝捕魚了，要是不小心又被抓住了，那時候可要砍頭的噢。」
此時此刻，酷似年幼家光的小平臉上，清清楚楚地浮現出恐懼的神色。