因為帶有很深的偏見，傑斐遜對此時美國的描述確實有些言過其實。國會開會期間，紐約雲集了各個階層和各個黨派的人，有關政治體制的爭議一天都沒有停止過。到了今天，人類歷史上的全部政治體制均無法為美國提供借鑒，他們只是按照個人的理解在向前摸索。一個民族怎樣才能夠長時間、和諧、平等地管理自己，這是美利堅合眾國當前需要思考的緊要大事。問題解決與否，主要並不是看重經驗，而是要看重事實。但是直到當前為止，敢於實踐的人卻並不是很多。
1790年3月29日，國會開會對聯邦政府替代各州償還債務的問題進行研究。這一提案以2票的微弱優勢獲得了通過，隨後，國會議員就這件事情開始了討論。會議期間，馬薩諸塞州的議員堅決反對該項議案，進而使事情變得更加複雜化。持不同政見的人彼此互相攻擊，這讓華盛頓感到十分痛心。4月12日，當國會再次審議該項議案時，反對派竟以2票的優勢勝出了。
在國會4月下旬再次開會時，大家一致建議不要再糾纏住這個老問題不放，傑斐遜當時沒有參加這場大討論，因為他剛到紐約，對於許多事情還並不是很熟悉，他想要先觀察一段時間再說。一天，傑斐遜在前往總統府的路上，遇見了財政部長漢密爾頓。兩個人就在總統府附近交談了好長時間，漢密爾頓介紹了議員們的爭執內容，並傳達了自己對這些債權的厭惡。漢密爾頓的看法則是各自行動是十分危險的，內閣應該是一個整體，債務應該是大家的事情，大家應當共同來商量解決辦法。假如大家緊密地團結在華盛頓的周圍，竭盡全力為自己的國家服務的話，那麼，形勢決不至於像現在這樣糟糕。
聽完漢密爾頓的看法後，傑斐遜說自己並不太瞭解形勢，也不太瞭解政府的財政制度，所以他無法做出判斷。為了阻止不幸的後果出現，所有可能造成社會動盪的因素都應當被考慮進去。因此，傑斐遜表示第二天他要宴請大家，席間對更加合適的解決方案進行進一步的商量。通情達理的人是不會對坐下來進行談判進行回絕的，傑斐遜只不過是充當了一位和事佬。在那天的宴會結束後，眾人一致決定，不管議案有多麼重要，也全都比不上保全國家、保全聯邦重要。因此，他們希望可以撤回原本的投票，以便讓這些投反對票的議員們有一個改變立場的機會。這一方案緩和了過去產生的緊張氣氛。這樣，傑斐遜在無形之中便給了漢密爾頓很大的幫助。
國會最終還是同意由聯邦政府替代各州來償還債務，但是，國會這時批准的法案已經和漢密爾頓以前的法案有所不同了，決議中確定了代為償還的債務的數目為2150萬美元。該項法案於1790年的7月22日通過了，贊成票與反對票依然有兩票之差。7月24日，眾議院以34比28的票數再次通過了該法案。華盛頓對這一結果感到十分滿意，他感覺議員們成功地阻止了一次國家危機。由於各州分別從自己的利益角度進行考慮，政府所在地的問題就遲遲無法得到解決。無奈，大家只有採用了折中的方法，即在今後的10年當中，國會仍然會留在費城，在這期間，由國家出資選址興建政府辦公大樓，10年以後，聯邦政府將永久移駐此地。因此，在弗吉尼亞州和馬里蘭州的交界地區，開闢了出了一塊方圓10多英里的地方，準備用來修建政府的所有建築，很快，這個地方便被命名為哥倫比亞特區。
1791年的1月22日，華盛頓接到了莫裡斯從法國寫給他的信，信裡說拉菲特侯爵參加了法國的革命，正在著手接管聯省行政長官佛蘭德地區的隊伍。這樣，侯爵就把自己放在了一個十分危險的位置上，雖然他對法國的新憲法做出了一定的讓步，但事實證明，他的一些舉措是很不明智的。因為距離法國很遠，華盛頓對法國國內出現的事情瞭解很少。因此，在他寫給莫裡斯的回信裡還沒有發表什麼意見。他認為，法國革命的風暴確實滌蕩了整個歐洲，不管怎樣，它都將會產生十分巨大的影響。華盛頓表明他正在關注全部事情的進展，但因為並不瞭解形勢發展的實際情況，所以不能夠發表意見。不過有一點華盛頓卻十分確信，那就是沒有人會比他更加希望法國人民可以得到和平與幸福了。
沒隔多久，侯爵就寫信告訴了華盛頓最近以來發生的事情。法國的革命推進了法蘭西民族前進的步伐，但是很多得到自由的人民卻把自由和無政府主義混淆了起來。國民公會著急要制定新憲法，王公大臣們則對過去的政權表示懷念。伴隨著革命洪流的向前推進，貴族階級手裡的特權正在逐漸減少。舊的制度被搗毀了，新的憲政還沒有完善，這就給很多小人提供了攻擊政府的時間和機會。侯爵認為目前法國有兩大敵人：一是反動的貴族階級階層，一是那些無政府主義者。侯爵希望華盛頓能夠瞭解到，法國革命正在改變著人們的生活方式和觀念，形勢是勢不可擋的。
華盛頓現在已經沒有精力去顧及法國了，因為美國自己的事情已經令他感到了焦頭爛額。為了緩解財政危機，有人建議成立國家銀行。這一提議在議員中間引起了廣泛的爭議，最終投票的結果是以多數通過。法案被送過來後，華盛頓十分重視，他清楚對於此件事情，內閣的意見並不統一，魯道夫和傑斐遜說此項議案違憲，但諾克斯和漢密爾頓等人卻認為它符合憲法。華盛頓要求各部部長都提出書面意見，依據這些意見，他批准了該項法案。傑斐遜要反對成立國家銀行的原因，並不只在於它的違憲，主要原因是國家銀行要實施紙幣代替硬幣的制度，這樣一來，勢必就會滋生出一批金融貴族階級，那些貪得無厭的投機者便會趁機魚肉百姓。
紙幣在流通當中雖然具有很多的優點，但是它的弊端卻也是突出的。傑斐遜則認為，漢密爾頓主張成立國家銀行，目的是要把它作為強有力的手段，使財政部來控制國家的立法機關，並以此來促成君主政體。傑斐遜表示，華盛頓之所以批准該項法案，並非是出於他的冷靜思考，而是源於對漢密爾頓個人的信任。其實，傑斐遜錯估了華盛頓，華盛頓判斷議案時一向不會因為偏愛而輕信，當他對什麼事情看不準時，他就會去詢問政府的那些顧問，讓他們提出一些建議。在戰爭時期，作為一名軍事領袖，華盛頓在很多重要的軍事問題上就都是這樣做的。為了表明自己對下屬的尊重，每當做出重大的決策前，華盛頓通常都會去聽取一下當事人的意見。
漢密爾頓和傑斐遜由於政見不和，曾經發生過多次爭吵。在內閣裡，傑斐遜和漢密爾頓就像是兩隻斗架的公雞。諾克斯十分敬佩自己老戰友的能力，因此，他常常會站在漢密爾頓這一邊；而魯道夫卻經常支持傑斐遜。每當雙方進行爭吵的時候，華盛頓常常用他那過人的智慧和能力去進行調節。華盛頓一向都不對他人的意見進行壓制，也不希望他人隱瞞自己的觀點，對於他人的才幹，他既不嫉妒也不輕視，而是把這些人全都看作政治力量，並將他們團結起來。
他始終都把漢密爾頓和傑斐遜之間的鬥爭控制在內閣裡面，不允許到內閣外面去進行爭論，以免影響到國家的正常運轉。在內閣裡，假如有什麼事情，華盛頓會在他們出現鬥爭的時候就出面進行解決。傑斐遜和漢密爾頓無疑是愛國的，只不過兩個人的政治觀點不同，彼此都認為對方的觀點中有一定的見不得人的地方。由於受到兩個政治家的影響，聯邦內部慢慢便形成了兩個政黨，儘管兩黨都非常熱愛自己的國家，但在維護國家利益的認識上卻有著極大的出入。共和黨人和民主黨人以傑斐遜為領袖，他們感覺聯邦黨人的目的就是要把國家引向君主政體；聯邦黨的楷模則是漢密爾頓，他們對加強全國性政府表示了支持，以防備國家被各州政府吞食。同時，他們也不贊成美國走君主政體的路。
除了體制問題的爭論讓人感到頭痛之外，印第安人的事情也很難辦。此前，國會就哈默准將對印第安人進行的討伐展開了激烈的辯論，議員們普遍都感覺到不滿意。不只議員不滿意，軍隊同樣心存不滿。哈默准將被調走之後，該地區依然麻煩不斷，邁阿密地區再次遭到了印第安人的洗劫。此時塞納卡印第安聯盟的哈夫唐、考普蘭特和格番特利3位首領正在費城，他們主動向華盛頓提出了申請，願意前去說服那些印第安人同政府進行和談。華盛頓准許了他們的請求，同時對他們的義舉表示十分讚賞。假如這3位首領可以成功說服這些叛亂的印第安人，那麼對於新生的聯邦政府來說，則必然是一件好事。長時間以來，華盛頓總是採取文明的方法來教化那些印第安人，但他們卻根本就不領情。華盛頓衷心地希望印第安人可以過上安定幸福的日子，那樣就將不會再有戰爭和忍饑挨餓了。
在國會開會的時候，佛蒙特和肯塔基兩州都提出了加入聯邦的申請，國會馬上予以了批准。3月3日，第一次國會結束。在諸多的討論當中，華盛頓看到了大家團結向上、同舟共濟的嶄新風貌後感到非常高興。當然，許多議案還沒有能夠獲得解決，但是這卻並沒有影響到議員之間的互相尊重。