北洋軍在神策門、太平門、鍾阜門一帶軍事行動並不成功，僅僅只佔領了老虎山。
馮國璋對於城內的「伏兵」不待大軍進至城下就擅自行動大為光火，馮國璋本可以幾乎零傷亡地進入南京，生擒宋教仁等一班小丑，然而此時馮國璋卻在強攻南京的問題突然猶豫了起來。
袁世凱擔心南京不能迅速攻下，他處再起風波，特電令海軍總長劉冠雄護送陸軍大隊渡江，配合迅速蕩平南京。浙江都督朱瑞也收到了袁世凱進攻皖南的命令。
「辦好了此事，過往之事不予追究。」
得到大赦的朱瑞，三叩九拜，催動浙江大軍挑起了「浙皖」戰事。
在北洋軍兵臨城下之時，何鳴海與眾人商議後決定將宋教仁送至安徽後方，而這樣如此艱巨而重要的任務唯有柏文蔚才能擔當。至於南京保護戰成敗的關鍵，何鳴海認為這要看楊洪森能提供多少幫助。目前，南京的危局非楊洪森不能解救，
因此宋教仁到安徽，將起到有利的督促作用，使援助得以順利的，切實的到過南京。西進的部隊選擇王天培，正是何鳴海充分考慮到皖軍強大的戰鬥力，奪取大勝關，打通與安徽通道是整個南京保護戰中關鍵，非王天培不能勝任。
柏文蔚同意護送宋教仁去安徽，是因為強敵壓境之時，將領之間不能同心同德，感覺到前途無望的他去意漸生，只不過護送宋教仁讓他有了一個冠冕堂皇的理由。
本著對革命負責，柏文蔚主張棄守南京退守安徽，何海鳴等一班激進分子決心流乾最後一滴血，強烈反對柏氏的逃跑主義，柏文蔚把衛隊留在了南京，僅帶少數人隨王天培部從水西門出走。
大勝關、秣陵關一線和北洋軍遇到了久違的皖軍炮兵部隊，奉楊洪森之命增援南京的第10師張四維打響了進入江蘇的第一戰。張四維第10師與王天培第9師唯一不同的地方，在於他多了一個炮兵團，
不是頭上頂個破鐵鍋就是「嫡系」，有大炮才叫「嫡系」，更何況此戰還有「空軍」助威。
多數情況下這些「小蜜蜂」是用來偵察的，但是偶爾也能起到鼓舞己方士氣，震懾敵方的目的。
什麼是「嫡系」，「嫡系」指的就是像他這樣被特別關照的精銳部隊。
「報道師長，空中的偵察，駐守秣陵關的北洋軍正在撤退。」
張四維意氣奮發地揮動著手中馬鞭，「命令部隊，全速前進，務必要將這股北洋軍一舉消滅。」
皖軍欲東西對進，打通安徽至南京之間的通道，馮國璋是堅決不能答應的。如果不把這條通道切斷，那麼安徽的援軍將會不斷進入江蘇，這勢必造成南京進攻的壓力。
袁世凱下達攻取南京的命令是基於江西戰事的結束，段芝貴第一軍能迅速投入到安徽戰場，但是江西戰場上的真實情況袁世凱並不清楚，北洋軍只是攻入南昌城，並沒有奪取南昌，整個江西戰事遠不是李純所報告的那樣已經結束。袁世凱急於結束戰事，防止戰事拖延，其他省份的國民黨出來響應，國民黨人出響應到是其次，戰事拖的越久軍費開支就會越大，所以一切要速戰速決。
根據陸軍部戰略部署，大勝關一線必須完成阻擊任務，保證主力部隊奪取南京城。為此，海軍被派往大勝關江面提供火力，但是海軍對大勝關的火力支援僅限於白天，而夜間擅長於小兵團作戰的皖軍優勢明顯，比起南京這邊一陣死幾十人，大勝關一天之內就陣亡了三百北洋英魂。
面對著「天保城」這樣的釘子戶，馮國璋終於下定決心拔除它。
堅守在這裡的皖9師葉盛祥部決心與「中央軍」頑抗到底。
進攻南京的北洋炮兵近半數力量被調往天保城一線，在彈藥方面馮國璋準備12000發，主攻部隊為軍中尖刀。決戰前馮國璋給上下官兵增發了一個月的津貼，等戰爭結束還有多少人能拿到津貼那就全算看上帝的意思了。
在炮火轟擊後，北洋官兵攀籐附葛，猛力衝鋒，皖軍彈如雨下，經過長達6個小時的激烈戰鬥，被擊斃營長2名，連長3名，兵士死亡400人，傷者不計其數。
「天保城」的重要性，即使是不通軍務的何海鳴也非常清楚，在北洋軍集結重兵之時，他在南京城內動員了大量的民兵前往支援。增援「天保城」的民兵在槍林彈雨中毫不退卻，奮力反擊，戰鬥變得異常激烈，因為死亡過大，民兵各部不得不退了下來，清點之下傷亡盡過千人，何海鳴無法承受如此重大的傷亡。
同一天，神策門、太平門一線南北雙方也發生了激戰，可傷亡還不到200人。
「天保城」在鍾山半腰，鍾山山勢高峻，居高臨下，俯瞰南京全城，大炮可以轟到南京城內任何角落，城內革命黨的一舉一動也全在監控之下，奪取「天保城」，對下一步奪取南京城極其重要。
擔任「天保城」第2波主攻任務的系浙江友軍，「中央軍」擔任總預備隊。
炮兵繼續為第二波攻勢提供全程炮火支援。
打下「天保城」馮國璋有絕對的信心，對他而言這不過是時間的問題，當他一枝煙還沒有拔完，浙軍兩個營就光榮的退了下來。
針對「天保城」第一天的攻勢馮國璋考慮到天色已晚，再打下去就要增發津貼了，無奈之下，只好來日再戰。
葉盛祥在第一天也吃了不少虧，他沒有想到馮國璋會這麼照顧他，把半數炮兵都調了過來，而且炮火持續了很長時間，估計打了數千發。次日，一陣猛烈的炮火後，北洋軍開始了新一輪的攻勢。
就「天保城」屢攻不下的情況下，馮國璋只好在下關、鳳儀門一線尋找突破口，伺機奪取獅子山炮台，
海軍為此出動了所有的水上艦船，為進攻部隊火力支援，在強大的火力支援下，下關一線的革命軍全面潰逃，北洋軍趁勝攻入鳳儀門，與此同時北洋軍對神策門、太平門也發動了進攻、第7師和第4師一部對雨花台發起了進攻。
雖然當地人都說要取南京，必先奪取天保城，但是在強大的「中央軍」面前，誰先誰後都一樣。
在北洋軍的全力進攻，相繼奪了朝陽門、神策門，張宗昌騎兵隊殺入南京城內，狂喜的馮國璋向北京告捷，給張宗昌表功，電報剛發出去，就傳來張宗昌遭遇城內守軍伏擊，敗退出城的消息，馮國璋當即就把傳令兵拉出去斃了。
馮國軍的這種反「常規」的打法，讓何海鳴對葉盛祥人格產生了懷疑，為此他在電話命令葉盛祥主動出擊，直插北洋軍身後配合城中守軍的大反擊，
葉盛祥從來沒有想到南京的守軍會那麼沒有用，「天保城」還沒有失陷，南京城就要守不住。「天保城」是為南京城而存在的，南京城都沒有了，「天保城」也就失去了存在的意義，葉盛祥沒有辦法，只好下山增援南京城。
「報告大帥天保城方面動了」。
馮國璋頓時興奮地站了起來。