左良玉自持兵多將廣，起兵後又順流而去，勢如破竹，並沒有太過注意耳目，九江久攻不下，才廣撒耳目，然而，左良玉的探子得到皇帝親征的消息卻不敢確認，反覆數次後才敢上報，使得左良玉的情報顯得落後。
「回大帥，此事已多次確認。」
「好，好，好。」左良玉連說了三個好字，原先有點蒼白的臉色佈滿了紅暈：「傳本帥令，不計死傷，全力進攻九江城，務必三日將城拿下，全軍殺往安慶，活捉皇帝。」
左良玉只想到若是在安慶捉住皇帝，不用攻南京就能取得勝利，卻沒有想過普通土兵得知皇帝御駕親征後會有怎樣的震憾，他們頭上那塊清君側的遮羞布等於完全拿掉，當真要面對皇帝的龍旗時，即使士兵能夠聽從命令進攻，他們的勇氣還會剩下多少。
面對左軍的全面進攻，九江城的防守陡然緊張起來，這些天九江城的各種防守物質已經消耗的差不多了，一些靠近城牆的房屋已被拆掉，取得的磚石都直接迎往城牆往下砸去，木料也是如此。
九江城頭的大炮早已打不響了，最具威力的就是城中的二千餘支火槍，這兩千多支火槍是總兵黃斌卿帶過來的，還是皇帝親自下令從南京軍械處調運給黃斌卿的，只是隨著時間的推移，火槍報廢的越來越快，這兩千支火槍只用了數日，已經報廢了三百多支，這充分說明了大明軍械處火器的質量是多麼不可靠，好在這批火槍經過挑選，炸膛的並不多，士兵才不至於不敢使用，不過，即使火槍不報廢，城中的彈藥也耗了大半，袁繼鹹，黃斌卿兩人開頭留著火槍不使用，除了要給叛軍一個出其不意外，何嘗又不是因為知道火槍太過嬌貴，彈藥不多的緣故。
見到城頭火槍比以前稀疏不少，叛軍士氣高漲，這些天，叛軍在城外已經打造了不少攻城器械，護城河也早已填平，沖車、轒轀車、巨盾輪翻而上，士兵們遠遠的藏在巨盾或轒轀車下，除了巨石，城頭的火槍、弓箭都對它們無可奈何，巨大的沖車撞擊在城頭，讓整個城池都嗦嗦發抖。
左良玉軍中也帶有數十門大炮，雖然損毀了一些，不過還有二十多門可以使用，巨大的炮彈砸在城牆上，碰到的士兵往往一下子就被砸成了肉泥，雖然由於數量和準頭問題，炮彈能打到守軍的並不多，數分鐘差不多只有幾發能打中城頭，真正能給士兵造成傷害的也就一兩發，有時炮彈還會落到左軍自己在城下進攻的隊伍中，只是只見對方火炮響，自己的火炮卻沒有動靜，無疑大為損傷守城官兵的士氣。
總督袁繼鹹和總兵黃斌卿兩人馬上意識到了危機，他們帶著親兵和預備隊在城頭如同救火隊員一樣左奔右突，哪裡有危險就往哪裡趕，總算將叛軍日落前的一波波攻勢擋了下來，當叛軍因為天黑開始收兵時，城頭的許多官軍都累得一下子癱坐在地上。
就在袁繼鹹和黃斌卿兩人慶幸總算又守住一天時，他們卻不知道，隨著叛軍攻勢的加強，城內官兵不可避免傷亡加大的情況下，九江城內已有一股暗流在湧動，無論是九江本地的兵馬還是黃斌卿帶來的官兵，他們本身的戰鬥意志都不強，若不是坐擁堅城，恐怕左良玉一來，許多人就要降了，畢竟雙方實力相差太大，左良玉又與流寇不同，投降左良玉沒有投降流寇的心裡障礙那麼大，李自成攻破北京時，大明的軍隊還不是成批成批的向李自成投降。
前些天因為守得輕鬆，這種思想在官兵當中並不盛行，只是今天眼看著身邊的同伴一個個倒在血泊中，城外叛軍越攻越猛，許多人漸漸抗不住了。
當晚，左良玉正在與眾將軍議時，一名親兵來報，城裡有人偷出來要求見大帥。
左良玉一愣，馬上意識到什麼，將軍議結束：「快，把人帶來。」
「慢，大帥，來人究竟是什麼目的還不清楚，大人萬重之軀，不可冒險，不如由末將先期接見，如果沒有問題，大帥再見來人也不遲。」一名三十多歲的武將起身攔道。
攔住左良玉的是總兵張應元，左良玉思付了一下，點了點頭，張應元行了一禮，先期退下，約過了小半個時辰，張應元滿臉喜色的重新進入帥帳：「大帥，大喜，大喜。」
「來者是誰？」
「是九江副將張世勳的家人，張世勳有意向大帥投誠，約定明晚，他在城中發動兵變，張世勳道北門守將和他甚有交情，他已說服北門守將，到時舉火為號，只要城中火起，大帥可以率兵從北門殺人。」
「張世勳。」左良玉也聽過此人名號，此人兵法武藝樣樣稀鬆，能當上九江城副將，完全是靠花樣巧語和賄賂上司，左良玉馬上就打消了懷疑：「好，大家回去好好休息，明晚本帥與諸位在九江痛飲。」
「遵令。」
左良玉和朝廷官兵在九江大戰時，李自成終於從逃出北京的打擊中恢復過來，從崇禎十七年四月二十一日與吳三桂在一片石交戰，到二十二日大敗，二十六日返回京城，二十九日北京稱帝，三十日從北京逃出來，李自成就像生活在噩夢中一般，進京的數十萬大軍跟隨李自成逃出來的不過三萬多人，地方上聽聞李自成大敗，紛紛暴亂，要麼向清廷投城，要麼重歸於大明。
李自成回到太原後，剛想喘一口氣，近在咫尺的榆次竟然叛亂，他雖然派陳永福將叛亂撲滅，可是接著又是原大同總兵姜襄叛亂，將李自成的心腹將領張天琳等人殺害，掛起了大明的旗幟，山東、河南等地的官紳紛紛反攻倒算，不是將大順朝派駐的官員驅逐，就是直接殺死。
在這種情況下，一向沉穩的李自成也亂了方寸，當李巖向李自成提出要帶二萬精兵前往河南收拾局面時，李自成終於暴怒了，他懷疑李巖離開他是想自立門戶，毫不猶豫的向牛金星下旨，將李巖、李侔兩兄弟處死，鑄下大錯，弄得下面的將領人人自危，面對吳三桂如附骨之蛆的追擊，兵無戰心的李自成只得再次逃跑，於七月渡黃河歸西安，依靠著潼關之險暫時擋住了吳三桂的追擊。