就在袁發表「帝制始末」的同一天，湖南靖武將軍湯薌銘宣佈獨立。
湯薌銘和陳宦同是袁的寵臣，他在湖南殺人如麻，可是他的哥哥湯化龍卻是反袁的，這一段期間他的處境很苦，背袁則不忠，背兄則不義，忠義不能兩全。而當時湖南情況又是如何呢？湖南本是四面用兵的孔道，湘西可以進兵川黔，湘南可以進兵粵桂，自國民黨二次革命失敗後，湖南軍被袁解散，剩下來只有地方團隊性質的五個守備隊，每隊兵力三五營不等，裝備和戰鬥力都很薄弱，湯薌銘直接指揮的北洋軍只有車震一個混成旅，駐防長沙、寶慶一帶。曹錕的北洋軍第三師駐防岳州，不受湯的指揮，是袁用以扼湖南咽喉的一支得力部隊。護國起義後，第三師調往四川，袁派第六、第二十等師到湘西進攻貴州，並調倪嗣沖的兄弟倪毓-帶領安武軍十五營到岳州，準備開往湖南進攻廣西。
湖南民軍紛紛起義，省城風聲鶴唳，4月中旬廣西護國軍向湖南出發，永州鎮守使望雲亭於27日宣佈獨立，廣西軍由永州向衡州移動，陸榮廷勸告湯獨立，要他放心，護國軍方面會支持他的湖南都督地位，而湖南的反袁人士趙恆惕、陳復初、曾繼梧等都前來湖南幫助湯收編各路軍成立湖南軍，受湯的節制，因此湯對袁的態度便由擁護轉為中立，電請袁撤退在湖南的北洋軍，以免湖南化為南北戰場。袁表示可以接受，暗中卻指使在岳州的倪毓-就近監視湯的行動。
4月底和5月初，湯態度由模糊轉變為明朗，馮國璋和張勳聯名的4月巧電和馮的5月東電發表後，湯於5月4日有支電反駁，湯說：「不能因大總統個人之行為，而將民國四年來之歷史全行刪去，轉而根據清室交付原案，則理論上終不為通，故建議大總統宣告退職，以副總統繼任，較為光明正大。」從這電報中顯示湯主張袁退位而以黎元洪繼任總統，這種態度正與反袁的護國立場相似。在湯私心上，由於他是湖北人，和黎元洪是湖北同鄉，因此黎繼任大總統，對湯是有利的，這一點他和北洋嫡系的段祺瑞和馮國璋的野心是分歧的，段、馮都不歡喜黎繼任總統。
5月下旬，北洋系內部愈趨渙散，袁政權日暮窮途，廣西護國軍對湖南的壓力日益加強，湖南反袁的民軍聲勢愈發壯大，5月24日湘西鎮守使、鎮篁軍統領田應詔宣佈獨立，這些新情勢逼得湯不得不於5月29日宣佈獨立。湯的獨立通電中，對袁還稱為「我公」，還說「感知遇之私」，電云：
「北京袁前大總統鈞鑒：前接馮上將軍通電，籲請我公敝屣尊榮，誠見我公本有為國犧牲之宣言，信我公之深，愛我公之摯，以有此電，循環三復，怦怦動心。國事棘矣，禍機叢伏，乃如萬箭在弦，觸機即發，非可以武力爭也。武力之勢力，可以與武力相抗，今茲之努力，乃起於無絲毫武力之人心，軍興以來，遍國中人，直接間接，積極消極，殆無一不為我公之梗阻。薌銘武人，初不知人心之勢力，乃至於此。即我公亦或未知其勢力之遽至於此。既已至此，靖人心而全末路，實別無他術出乎敝屣尊榮之上。我公所謂為國犧牲者，今猶及為之。及今不圖，則我公與國家同犧牲耳！議者謂我公方借善後之說，以為延宕之計。誠不免妄測高深，顧我公一日不退，即大局一日不安，現狀已不能維持，更無善後之可言。湘省軍民士氣久已激昂。至南京會議，迄無結果，和平希望，遙遙無期。軍民憤慨無可再抑。茲於二十九日已徇紳商軍民之請，宣佈獨立，與滇、黔、桂、粵、浙、川、陝諸省，取一致之行動，以促我公引退之決心，以速大局之解決。薌銘體我公愛國之計，感知遇之私，捧誠上貢，深望毅然獨斷，即日引退，以奠國家，以永令譽。無任干冒，言盡於斯。湯薌銘叩。艷。」
湯電引起護國軍不滿，尤其是陸榮延，而廣西對湖南有嚴重威脅，湯乃再發一電云：
「北京前大總統袁公鈞鑒：自籌安會發生，樞府大僚，日以叛國之行為密授意旨，電書兩下，怵誘兼至。傀儡疆吏，奴隸國民，嘴實使然，路人共見。薌銘忍尤含垢，皆裂冠沖。以卵石之相懸，每徘徊而太息！天祐中國，義舉西南，正欲提我健兒，共-大舉，乃以瘠牛全力，壓我湖湘，左掣右牽，有加無已。現已忍無可忍，於本日誓師會眾，與雲、貴、粵、桂、浙、陝、川諸省取一致之行動。須知公即取消帝制，不能免國法之罪人。薌銘雖有知遇私情，不能忘國家之大義。前經盡情忠告，電請退位息爭，既充耳而不聞，彌拊心而滋痛。大局累卵，安能長此依違？將士同袍，實已義無反顧。但使有窮途之悔悟，正不為萁豆相煎，如必舉國而犧牲，惟有以干戈相見。情意兩迫，嚴陣上言，伏惟熟思審處為幸！湯薌銘叩。艷。印。」
湯有致獨立各省電：
「肇慶岑都司令，雲南、貴州、廣西、廣東、浙江、四川、陝西各都督、民政長官、各司令、各師、旅、團長鑒：項城叛國，法律無效，訴諸武力，知諸公之志苦也。薌銘粗明大義，久表同情，以左牽右掣之紛乘，致杖鉞秉旄之較晚。五中憤郁，寢饋難安，恫念民生，恐滋荼毒，委曲隱忍，以企和平。適項城取消帝制，宣言息事寧人，尚冀憬然悔悟，自行退職，以謝我國人。嗣因南京發起會議，乃遣派代表，據《約法》立論，猶冀公論大伸，合力勸退，使人民重見天日。乃迭接徐州、蚌埠來電，魯、鄂、湘、贛四省代表以不受彼黨劫持，主張項城早日退位，致受疑忌，宣言鳴鼓而攻。似此情形，已無和平解決之望，乃於本日會眾誓師，與袁政府斷絕關係，勉從諸公之後，共張撻伐之師。眾志僉同，將士用命，誓除株毒，還奠共和。望錫指針，下匡愚昧，敬執鞭絲，惟命是從！湖南都督湯薌銘。艷。」
在北方，陝西是北中國唯一獨立的省份，不過卻是反袁運動中一幕醜劇，獨立成為地方軍閥爭權奪利的手段。5月9日陝西鎮守使陳樹藩在三原宣佈獨立，自稱陝西護國軍總司令。提起陳樹藩倒不是無名之輩，在白朗入陝時，陝西將軍陸建章就是賴陳樹藩這員戰將保衛西安。當陝西民軍紛紛起義反袁時，陳樹藩的部隊與各路民軍早有聯絡，因此引起陸建章的猜疑，把陳由陝北調赴陝南，陳就舉起反袁大旗，陸建章的長子陸承武（第一旅旅長）自告奮勇，統率所部擊陳，不料在富平一戰，這位陸大少爺竟被陳樹藩所部營長胡景翼活捉，陳就把陸承武當作人質，脅迫陸建章宣佈獨立，陸建章表示願意自動離開陝西。於是陳樹藩乃發表獨立通電：「樹藩以辛亥以來，民力枯竭，不忍發生戰事，重困吾民，力持鎮靜，數月於茲。乃南北協商，久無效果，而陝民對陸督軍之貪暴行為，積怨久深，一發莫遏。致郡邑連陷，遠近騷然。加以陸部所至，擾亂更甚，同種相殘，殊悖人道。樹藩情不獲已，因於月之九日在陝北蒲城以陝西護國軍總司令名義正式宣佈獨立，期促和議之進行，謀吾陝之治安。風聲一樹，義旅全歸。今已駐軍三原，與陸軍切實交涉，令將所部軍隊繳械退出陝境。陸已承認，樹藩明日即進駐西安受降，預備建設一切。」
5月15日，陳樹藩率領部隊進入西安。5月18日陸建章以威武將軍名義，陳樹藩以陝西護國軍都督名義會銜發表通電：
「樹藩因欲縮短中原戰禍，減少陝西破壞區域，於九日以陝西護國軍名義宣告獨立，一面請求建章改稱都督，與中央脫離關係。建章念項城二十載相知之雅，則斷不敢贊成，念陝西八百萬生靈所關，又不忍反對，擬即各行其是，由樹藩以都督兼民政長名義，擔任全省治安，建章即當遄返都門，束身待罪。」
陳樹藩就任陝西護國軍都督後，就把自己所稱陝西護國軍總司令一職讓給陸承武。5月20日陸建章離開西安時，就把他在陝西將軍三年任內所搜括的幾十箱財物帶走，才出了西安城，就被陳樹藩所屬的部隊劫去，後來由陳樹藩親自出面才追回了一部分，並且派兵護送陸出境。
國民黨領袖之一居正和吳大洲等在山東濰縣、高密、周村一帶組織了武裝力量，居正稱中華革命軍東北總司令，不久吳大洲改稱山東護國軍。山東的反袁力量大為膨脹，5月上旬民軍進展到濟南附近，勸促山東將軍靳雲鵬宣佈獨立，如果靳雲鵬拒絕就要採取軍事行動。靳見民軍力量極大，不敢拒絕，乃用緩兵之計，他偽稱極贊成倒袁，但山東不能和雲南、貴州相比，何況地理上又不毗連，沒有獨立的必要，只有敦促袁下台，如果袁不答覆，山東全省軍政界人物就以總辭職來對付袁。當前為了地方安靖，民軍應各守原防，如果侵犯政府軍防地，政府被迫只好兵戎相見。這時山東境內的袁軍和民軍旗鼓相當，雙方一直處於僵持狀態中。靳雲鵬在北洋軍系中，和馮國璋、段祺瑞有密切關係，洪憲帝制後，他們都對袁離心離德，當山東民軍力量逐漸強大後，遂借此致電勸袁辭職讓賢，如果沒有滿意答覆，只好宣佈獨立。5月29日袁召靳入京討論退位問題，靳奉命即行，走到半路上就被袁下令免去其督理山東軍務一職，改派第五師師長張懷芝繼任。這一來山東的獨立就流產了。
居正所領導的中華革命軍起義時通電如下：
「孫中山先生、唐少川先生、肇慶岑雲階先生、雲南唐都督、貴州劉都督、廣西陸都督、浙江呂都督、四川蔡總司令、百色李總司令公鑒：戎事方始，南服粗定，撻伐未張，凶逆無恙，和議屢傳，日月坐荒，辜中原父老之望，灰海內壯士之心，縱使和平解決，草率就事，豺狼雖去，狐狸猶存，共和之實不舉，革命之禍無窮，內訌屢起，元氣愈傷，一時姑息，萬劫難復，悵望來茲，能無泣下。今我師崛起青齊，逼近京國，暫住濰邑，屢下名城，士有死心，人無生志，獎率三軍，以候明教，戮力同仇，靡有二心。區區之忱，當希鑒察。駐濰東北軍總司令居正叩。」
駐周村的山東護國軍都督吳大洲也發表護國軍起義討袁的通電：
「袁賊肆虐，禍我國家，摧挫民權，攘竊神器，普天同憤，萬眾離心。吾人亡命異域，嘗膽臥薪，歷有年所，奈賊祿未盡，天命難諶，空拳徒張，大勳未集。茲幸賊惡貫盈，皇天悔禍。億兆同聲，殺賊護國。吾人恫-桑梓，蒿目時艱，獎帥三軍，廓清妖孽，誓使海表雄邦，再睹天日。東亞聖域，重現文明。上報國恩，下盡天職。原非得已，豈曰佳兵。凡我同胞，允宜共諒。謹此露布。山東護國軍都督吳大洲，總司令薄天明。歌。印。」