8月20日，北京來電話，要葉飛速去北戴河。他立即乘專機趕去。21日下午3時，毛澤東派人找葉飛去他的住處。葉飛一見到主席，就詳細匯報了炮擊金門的準備情況，炮兵的數量和部署，以及實施突然猛襲的打法。彭德懷、林彪也參加了匯報會。
毛澤東一面聽葉飛匯報，一面看地圖，精神非常集中。匯報完後，毛澤東突然提出這麼一個問題：「你用這麼多的炮打，會不會把美國人打死呢？」
那時，美國顧問一直配備到國民黨部隊的營一級。葉飛回答說：「哎呀，那是打得到的啊！」
毛澤東考慮了十幾分鐘又問：「能不能不打美國人？」
「主席，那無法避免！」
毛澤東聽後，再也不問其它問題，也不作什麼指示，就宣佈休息。大家知道，這是毛澤東要進一步考慮問題了。
晚飯後，王尚榮拿了一張條子給葉飛，那是林彪寫給毛澤東的。林彪這個人很會捉摸毛澤東的意圖，他知道毛澤東很注意能否避免打到美國人問題，所以寫了這個條子提出：是否可能通過王炳南（正在華沙同美國進行大使級談判）給美國透露一點消息。林彪此人也有點莫名其妙：告訴美國人就等於告訴台灣，這怎麼行呢？
看到條子，葉飛很吃驚，便問王尚榮：「主席把這信交給我看，有沒有什麼交代？
是不是要我表態？」
「主席沒說什麼，只說拿給你看。」
第二天繼續開會。毛澤東下決心了，看來沒有理睬林彪的建議。
他說：「那好，照你們的計劃打。」並要葉飛留在北戴河指揮，跟彭德懷在一起住。
究竟是什麼意思？葉飛不懂，也不好問。彭德懷也沒派參謀來叫他住到他那裡去。
晚上葉飛散步後回到房間裡，正在發愁，恰好王尚榮來，他說：「老兄，主席不是交代你住到彭老總那裡嗎？」
葉飛說：「我哪好去往啊？！」
王知道葉飛為難，就說：「我替你想個辦法，把專線電話架到你的房間裡。」這下就解決問題了。
他們商定，前線直接同葉飛通話，葉飛再通過王尚榮轉報毛澤東，毛澤東的指示也由王尚榮轉告葉飛。葉飛問：「彭老總那裡怎麼報告呢？
主席交代我同他住一起的呀！」他說：「你別管了，此事由我辦。」
所以，炮擊金門是在北戴河指揮的。也可以說是毛澤東直接在指揮。前線則由張翼翔、劉培善代葉飛指揮。