金門之戰的失利，引起了全軍、全國震動，這次失利在我軍戰史上也是極其罕見的，過去戰史上幾次失利如長征中的湘江之戰、紅軍西路軍的失敗及皖南事變損失人數也不少，但卻沒有一次全軍覆沒，而這一次，卻損失了全部投入作戰的3個團9000多人，竟成建制覆沒。
金門失利後的第二天，28軍副軍長蕭鋒和政治部主任李曼村面色慘白、失聲痛哭地來到兵團葉飛司令員的辦公室，葉飛司令員慘痛地對他們說：「哭什麼，哭解決不了問題，現在你們應該鼓勵士氣，準備再攻金門。這次失利，我身為兵團司令員，由我負責，你們回去吧。」
蕭鋒、李曼村剛剛離開葉飛司令員的辦公室，葉飛就收到了第3野戰軍的批評：「查此次損失為解放戰爭以來最大者，其主要原因是因為輕敵和急躁所致。」同時要求10兵團「將此次經驗教訓深加檢討」。當天，10兵團即向3野報告說：「我們檢討造成此次金門作戰之慘痛損失原因，主要是我們急躁勝利沖昏頭腦，盲目樂觀輕敵所造成。……直到已發現胡漣兵團已開始從汕頭船運增援金門，仍要求應在援敵未全部到達時予以攻擊，在船隻不足的情況下，未斷然下決心停止攻擊，這是最嚴重的罪行。」
10月1日，由當時的福建省委第一書記張鼎丞、兵團司令員葉飛、兵團政委韋國清、29軍軍長胡炳雲、29軍政委黃火星、28軍副軍長蕭鋒和政治部主任李曼村參加的10兵團黨委擴大會在廈門老虎山洞召開，蕭鋒第一個發言：「金門戰鬥的失利，是領導判斷失誤，指揮也有失誤，是驕傲輕敵的結果，是違背了毛主席不打無準備之仗的指示，也違背了粟裕首長指示的三個條件。這次失利是我對福建人民犯了個極大的錯誤，請求10兵團黨委、3野前委給我應得的處分。」葉飛很決就接過他的話說：「金門戰鬥的失利，主要責任在我，我是兵團司令員、兵團黨委第一書記，不能推給蕭鋒，他有不同意見，我因輕敵聽不進，臨開船時、在電話上我還堅持只要上去兩個營，蕭鋒掌握好第二梯隊，戰鬥勝利是有希望的。是我造成的損失。請前委、黨中央給嚴厲處分。」
葉飛在會後真的給陳毅司令員起草電報，並報中央，請求處分，毛澤東主席當時表示「金門失利、不是處分的問題，而是要接受教訓的問題。」11月8日，毛澤東主席又提出：「以3個團去打敵人3個軍，後援不繼，全部被敵殲滅，這是解放戰爭三年多以來第一次不應有的損失。」
中央軍委同時命令葉飛總結經驗，接受教訓，準備再次攻金。
1950年，美國悍然入侵朝鮮，黨中央、毛澤東主席決定停止解放金門的任務，集中全力剿匪，這樣，葉飛將軍和我10兵團的將士失去了一次「立功贖罪的機會」。