拿下了甘肅，等於拔去了唐軍背後的釘子，對唐軍的戰略意義是巨大的，再也不用擔心背後的牢制，但這個戰略意義現在還沒能顯現出來，麻煩卻帶來了一大堆。
首先是財政上的麻煩，甘肅很窮，唐軍除了從肅王府手中拿到二十餘萬兩銀子，還有價值數十萬兩的珠寶古董外，其它都是賠錢，甘肅的府庫早已空空如已，官員們都已欠餉三個月了，難怪唐軍一來，一個個爭著投降，許多人還指望唐軍能發給他們欠餉，確實，宋獻策為了穩住這些降官的心，還承諾由唐軍補回他們三個月的欠餉。
這可把戶部侍郎李守忠弄急了，哪有明朝的欠餉由唐軍補發的道理，沒想到這麼荒塘的事還得到李鴻基的同意，其實李鴻基知道，明朝的官員都對朝庭的俸祿根本不在乎，不要說三個月欠餉，就是三年不發餉他們也無所謂，苦的只是一些微未小史，至於清官，現在還能找出幾個清官來。
這些官員提出要唐軍發欠餉只是一個試探，試探唐軍對他們的態度，若唐軍連欠餉都發了，那他們就可以徹底放心，李鴻基接到宋獻策的建議考慮了一下，還是爽快的掏出了這筆銀子，相對於他們投降節省下來的軍費，這筆錢只是小意思。
唐軍的這次出兵損傷了近一萬人馬，光這些人的撫恤，醫療就要花費上百萬兩銀子，數萬大軍出動，每個月又要多耗去幾十萬兩銀子，加上一場大戰，董學禮把能征的東西都征掉了，甘肅急需救濟，否則，百姓才不管你是官軍還是唐軍，也不管他們的糧是誰征的，沒有東西吃他們就得造反。
這些都不成問題，唐軍的庫房裡還有數千萬兩的銀子，糧食精糧雖然少，但粗糧卻堆滿了倉，關鍵是唐軍一些子損失了三大財源，是蒙古這邊，以前每年都有百萬計以上的利潤，而現在由於顧君恩的到處築城，還要安置數十萬百姓，已經投入了上千萬兩銀子，現在還要每個月補貼數十萬兩，這個投入起碼還要持續一年的時間。
第二是高迎祥的義軍被剿了，唐軍最賺錢的兵器生意沒得做，張獻忠由於緊挨唐軍，唐軍自然不得不防備張獻忠反咬一口，很多武器都要限製出售，加上張獻忠一直被盧象升壓著打，沒有能力去攻城，就是賣給他兵器也得賒賬見不到銀子回籠。
三是由於朝庭對唐軍全面禁運，唐軍境內的交易馬上蕭條了將近一半，商稅收入從最高達到二百萬兩一個月，一下子跌到只有一百萬兩左右，雖然這個收入比起朝庭來說，還高了很多，但朝庭主要的是農業稅。而唐軍的農業稅全免了。
李守忠自從接過戶部侍郎這個位子來，戶部的銀子就從沒有增加過，總是在不停的減少，雖然唐軍現在的銀子還堆滿了庫房，但比起高峰時已減少了三分之一，按這個速度下去，唐軍最多還可以支撐兩年。
錢糧還不是主要問題，付出再多，有了前幾次暴富的積累，唐軍再怎麼也是兩年後才用緊張的問題，關鍵問題是唐軍沒人了，準確的說是沒有那麼多當官的人。
本朝開國皇帝朱元璋出身布衣，非常體會農民的艱辛，他當皇帝後，每年都帶著兒子、孫子到鄉村巡視，自己親自挑上擔子，同時也讓兒孫們效仿於他。指著地裡勞動的農民給兒孫們說：「我過去就和他們一樣，一年到頭在地裡辛辛苦苦的勞動，我們吃的用的，都是他們給我們提供的，你們當了皇帝後，要愛護他們。」
他還把縣以上的官員都招集到京城開會，他說：我在你們中間當老百姓的時，看到貪官污吏橫行鄉里，就切齒痛恨。如今我當了皇帝，你們這些當官的，有膽敢欺壓我的老百姓的，絕不饒恕。
朱元璋有鑒於宋朝的三大害，冗兵，冗員，冗費，分別作了相應的措施，針對冗兵，他作出了衛所制，朱元璋曾自誇，本朝養兵百萬，未費國家一分銀，針對冗員，他大力裁剪官員，官員到了少之又少的地步。而冗費是由前兩項引起的，解決了前二項，這冗費自然沒有了。
明朝縣分三等，二十萬人以下為下縣，二十萬人到三十萬人為中縣，三十萬人以上為上縣，以上縣官員的配置最齊，為縣令一名，縣丞二員，主簿一名，典史一名為朝庭正式官員，馬伕每人一名，還有給官員配製的柴薪皂隸，共十人。算未入流，由國家付給薪俸。
一個三十萬人以上的縣只有五名官員管理，再加上柴薪皂隸和馬伕共二十人，以這二十人自然管理不了一個若大的縣，所以縣以下的基層組織實行裡甲制度：以自然村為單位，「一百一十戶為一里」，「一里十甲」。一里之中，推舉其中丁糧多的十戶為里長戶，每年輪差其中的一戶為里長，其他的九個里長戶，協助里長開展工作。其餘的百家又分為十甲，每甲十戶，加上各自的甲首共為十一戶。
里長的職責主要是：對裡內人戶進行管理，對本裡農業生產進行督促，對應繳納的田賦和物料進行監督，還有主持祭祀，征輸差役，拘傳罪犯和調處糾紛等。
所以現在大明將近二億人口，實際在冊官員只有二萬多人，太祖的本意自然是好的，官員越少，百姓的負擔自然越輕，實際上這兩條措施在本朝初期取到了巨大的作用，所以在朱元璋剛剛趕走了蒙古人，中原一片殘破的情況下，還可以發兵數十萬，深入草原追擊元朝殘餘勢力，取得軍事上的巨大勝利，永樂年間也有能力持續對北元勢力進行打擊，還可以造出巨大的寶船讓鄭和七下西洋。
但後世子孫自以為這一制度能用之萬年，卻不知由於本朝開始時，漢人的富戶壕紳都被蒙人壓制，成不了氣候，有的大壕紳也是投靠蒙古人的漢奸，自然遭到太祖的嚴厲打擊，所以本朝初官員雖少，卻能牢牢的撐握大權，各種稅收，差役都能完成的很好，也取到了與民生息的作用。
但越到後來，官員至休，土地兼併，形成了越來越多的壕強，基層的裡甲不是朝庭正式官員，而是自行推舉，這種制度下，里長之職自然慢慢全部撐握在壕強手裡，而縣令在稅收，差役上慢慢也要依靠他們，否則憑那麼二十來人，怎麼收數十萬人的稅，而這些壕強自然不會有那麼老實，收到的稅會全部交給朝庭。
要命的是許多壕強都與官府有千絲萬絛的聯繫，許多人來就是官員至休，朝中還有門生子弟，他們少交稅，當地的縣官也不敢輕易得罪他們，若壕強有功名在身，還可以免稅，許多人因賦役繁重，紛紛托避在壕強門下，這樣來達到不交稅的目的，而交一部分給壕強就可以了。
所以從本朝中葉以後，農民逃亡日眾，致使裡甲殘破不全，「縣無全裡，裡無完甲」的現象比比皆是。如鳳陽府的裡甲就曾殘破到「有一里僅存四、五甲者，有一甲止存一、二口者」的嚴重局面。如陝西省有的地方「裡甲日益侵削，僅存十之二、三」，甚至「有數甲全逃者」。再如江西省興國縣在嘉靖三十年猶有四十四里，到萬曆年間就僅存三十四里了。
其實這些人不是逃亡了，還是在原地，只是托避於壕強門下，從官府的徵稅名單上減去了而已，他們的交稅對像轉向了壕強，這樣，本朝越到後來，人口越多，徵稅之人反而越少，稅賦自然越來越重，朝庭的收入卻沒有增加。
那些壕強也不是善茬，剛開始托附於他們的農民確實得到了好處，比起朝庭的賦稅來可以少交一大筆，但慢慢的他們的租金也會越來越高，或許為了吸引農民投入他們的門下，租金會比朝庭的稅收略低，但也不會低到哪裡去，所以朝庭徵稅人越少，就越要加稅，朝庭加稅，那些壕強也會加重對名下農民的盤剝，形成了惡性循環。事實上，以大明二億的人口，朝庭所有的稅收不超過三千五百萬兩，每人平均不到二錢銀子，何來稅重之說，可是中間被壕強剝去的銀子，恐怕有十倍於朝庭稅收，才會讓各地怨聲載道，烽煙四起。
李鴻基在陝西，山西境內鼓勵百姓向官府告發，打倒了大多數壕強，分了他們的土地，自然受到了所有農民的歡迎，但實行這些制度必須有有足夠多的官員，既使原明朝的降官全部任用了也遠遠不夠，何況一大部分還要剔除，所以剛開始李鴻基都是採用軍管，這些都由軍隊來完成，但軍隊總要退出，這些退出的地方李鴻基增加了鄉一級編置，以十里為一鄉，設一名鄉長，鄉長為九品，屬於在冊編置，把基層權力收回唐軍手中。
陝西，山西唐軍屬下已有近八百萬人口，一百多萬戶，可成一千二百多個鄉，僅鄉長便需要一千多名，還有那些空缺補充的官員，總共需數千名人員之多，唐軍每年培訓出來的只不過數百人而已，兩省還有好多地方的行政是由軍官擔任，現在又多了一個甘肅，至少又得增加上千名官員，這些人到哪裡去找。
李鴻基不是不想加快人員的培訓，而是這年頭識字之人奇缺，你要培訓也要有老師，雖然陸續有些秀才，舉人來投，剛開始當然要以軍隊為先，這些人放到軍隊當參謀，文書尚且不夠，自然不會考慮補允官員，而且現在唐軍還處於免稅期，除了商業稅要狠抓外，其它都可暫時不管，所以唐軍境內在打倒大部分壕強後還能正常運轉，但總不能一直這樣下去，何況為了以後打下地盤，還要貯備一大批人才。
李鴻基把洪承疇，許鼎臣找來，讓他們商量解決這個問題，對於朝庭官員太少的問題，洪承疇等人並不清楚，像他們都是家族出身，把基層政權交給那些家族管理視為理所當然，但問題是那些大的家族在上次密謀造反中被闖軍一網打盡，後來又牽連了不少人，所以現在唐軍境內大的鄉紳減少，不足以管理基層，唐軍自然要加以管理。
洪承疇道：「唐王，如今我軍節節勝利，連滿人也敗於我軍，唐王又已進王位，何不向境內發出求賢令，擇日舉行大比。」
「你是說科舉，有人會來嗎？」科舉李鴻基不是沒想過，只是讀書人大都出生於官宦之家，或是壕紳富戶，而今這些人許多都在草原開荒種田，李鴻基除了民憤極大之人外，連那些牽涉到褚家謀反的人，也只處死了幾個主謀，大部分只是抄家後流放到了草原。還有一些人雖然沒有受到牽連，但唐軍減租減息，提高商業稅等行為嚴重傷害了他們的利益，恐怕也沒有幾個人會自己，唐軍境內的窮秀才，窮舉人之類則大部已投到唐軍門下，想博一博封妻蔭子，那還有舉行科舉的必要嗎，若是沒有人來，唐軍豈不要大失面子。
洪承疇道：「唐王可以下大赫令，凡是考取之人，若以前有犯罪流放草原的可免去他們全家的流刑，這樣他們的子嗣為了獲得唐王的大赫，必會參加。」
許鼎臣在旁道：「唐王，此次大比還可以稍微把時間放寬，並規定大明境內所有學子都可參加，亦可從外面引來一批人。」
李鴻基一愣，道：「官府封鎖如此嚴密，就是有人想來，也來不了。」
許鼎臣笑道：「總有人能進得來，既然那些商人為了賺錢能把貨物都帶進來，一個大活人還進不來麼。」
李鴻基一聽，馬上想出了一個辦法，道：「好，我軍可以向那些商人懸賞，凡能引一個學子過來，每人發一百兩賞兩。」
許鼎臣讚道：「唐王高明，為了如此重賞，那些商人肯定會千萬百計把學子帶過來。」
商議好後，李鴻基馬上發出求賢令，唐軍在三月後舉行大比，不論哪個省份，只要學識優秀既可參加，考中後馬上授予官職，這個求賢令通過走私商人和唐軍各地的間諜馬上在全國流傳開來，引起掀然大波。