闖軍此次出征帶回來了豐富的戰利品，黃金一萬三千多兩，白銀四百三十萬餘兩百，還有珍珠四千多兩，各色緞五萬多匹，緞衣和裘衣一萬四千餘領，其它數萬車各式財物，二百多萬頭牛羊，除了牛羊馬匹李鴻基是從蒙古各部搶回來的外，其它財物都是繳獲後金此次從大明掠奪過來的，大明的財政收入除田賦外也就四百餘萬兩，還不如後金的一次搶劫，難怪後來朝庭會糧餉兩絕，只能轟然倒塌（以上數據來自清太宗實錄，除白兩是二百餘萬兩外未作改動，考慮到後金是集團搶劫，但各旗又都有自己的小團體，人人都會夾帶隱報，如果能把那些夾帶的也統計上，銀兩翻上一倍肯定沒問題，黃金還可能會翻上數倍）
此次闖軍出兵的軍費僅繳獲的黃金白銀就綽綽有餘，李鴻基將牛羊半賣半送給境內平民，幾乎每家都得到了好處，李鴻基要讓百姓知道，戰爭也能帶來財富，而不是象前那些酸儒所說窮兵黷武，賣牛羊所得的銀錢，拿出一半來賞賜軍士，並把這當成闖軍的定律，對外征戰的財富，除支付軍費外，一半歸於軍士。
唯一讓闖軍難以處理的就是那數萬蒙古人的婦孺，此事只能悄悄進行，按原先闖王所答應的一樣，按功勞全部分了下去，但如何分卻是一樣難事，女人不像財物，彼此都一樣，女子有年輕，有年老的，有漂亮的，也有不怎麼漂亮，按人數分大家都有意見，我和他功勞一樣，憑什麼他分的比我年輕漂亮，讓主持分配的高立功大為頭痛。
好在漢人有一個傳統，凡不能決定的就抓鬮，這種辦法看似公平，而且每個人都能接受，高立功給數萬名蒙古婦女編上號，讓士兵直接抓號牌，抓到年輕漂亮的士兵都興喜不已，抓到年老貌醜的也只能自歎倒霉。
此次闖軍參戰人員軍隊只有七萬，五萬民夫每人也給予了十兩銀子的賞金，根據軍功，牛羊變買的錢財軍中人員分下來每人最少也可得數十兩白銀，一時之間，草原回來的軍士人人都發了一筆小財，其它各軍都羨慕不已，對外戰爭的興奮大增，可是周圍找不到合適的對象，只得暫時作罷。
就在闖軍回到西安後的幾天，官軍已作好了進攻闖軍的準備，祁縣前線抖然緊張起來，闖軍在前線也增加到了四萬人馬，雙方的斥候已開始接觸，朝庭將李鴻基派出議和的人驅趕，朝庭連闖軍想將一部分俘虜的滿人獻上也不願意，雙方的小規模戰爭已經開始。
就在雙方劍拔弩張，都準備大打一場時，一件出發事件卻讓官軍不得不停下了進攻闖軍的腳步。轉而向闖軍求和起來，朝庭的大軍始轉向了安徽。
原來高迎祥進入安徽後，雖然兵士不多，但他手下還有赫搖旗，革裡眼賀一龍，混天王張應金，改世王許可變，九條龍馬士秀，混十萬馬進忠，順天王梁時正，過天星惠黨相等大將，計也有牛金星可用，攻破阜陽後，饑民來投，馬上又發展到一二十萬人，此時安徽的官府那能阻擋如多的流寇，急忙朝朝庭請求援軍。
朝庭此時卻已讓後金的入侵搞了個手忙腳亂，崇禎命各地官兵都彙集山西，哪有兵力可調，高迎祥連克蒙城，懷遠等地，把安徽攪成一鍋粥，好不容易東虜退去，朝庭的目光又放在了闖軍身上，曹文詔代天子出征，為天下督帥，一切軍事力量首先調往山西，安徽官府數次請援都被告之自行征剿。
高迎祥手下已是兵多將廣，唯有一事卻讓高迎祥煩惱不已，義軍發展太快，兵雖然容易拉，但兵器卻難求，他雖然攻破數城，兵器只有二萬餘件，其它都是柴刀，木棍，沒有好的兵器，人數雖多也無用，所有人自然都想到向闖軍購買，但闖軍兵器太貴，動則一二百兩銀子一把，他若想為手下配齊兵器，非得有個七八百上千萬銀子不可。
高迎祥倒是還有一百餘萬兩銀子，但傾其所有也不過能買一萬把兵器，總不能一點錢也不留吧，義軍雖然不發軍餉，但許多將領還是很愛財，高迎祥為了籠絡他們，也經常不得不花大把的銀錢，而且有時要賄賂官兵，也要花錢，高迎祥找大家商議能不能攻打一些富俗的城市，多弄到點銀子好購買兵器。
義軍人雖眾，但大多是新附的農民，沒有多少作戰經驗，兵器的缺少也使他們戰力大損，義軍雖然讓安徽官府疲於奔命，但攻破的只是一些縣城，要想攻破大的州府還是很困難，這也是朝庭不急於派兵進剿的原因。
眾人議來議去，富有的莫過於合肥，淮南這樣的大城，若能攻破一座，勝似破十座縣城，義軍首選攻淮南，沒想到在淮南城下碰了一鼻子灰，淮南城高牆厚，官軍與後金打野戰雖然不行，但守起城來，就是後金也要頭痛，若沒有數倍兵力休想攻破，自然不是他們這些烏合之眾能比，在淮南留下數千具屍體後義軍不得不放棄。
高迎祥一咬牙，將手上的銀子拿出來全部買了兵器，此時闖軍正在草原和後金交戰，巴不得義軍的力量越強越好，以便吸引朝庭的注意力，周鳳梧作主還送了他一萬多件兵器，並給了他們上千枝火槍，有了這批兵器，義軍力量大增，正要再攻淮南，好報上次一箭之仇，但牛金星獻計道：「天王，淮南城厚，再攻未必見效，不如改攻鳳陽。」
高迎祥疑惑地道：「鳳陽能有淮南富嗎，都說鳳陽十年有九年澇，攻這個窮地有何用。」
牛金星道：「天王，鳳陽地上窮，但富的是地下呀，天王莫非忘了鳳陽是本朝太祖出生之地，那裡有他的寢凌，裡面金銀珠寶必定無數，恐怕幾個淮南也趕不上。」
眾人本就是無法無天之徒，聽說鳳陽財寶眾多，要挖皇帝祖墳，興趣大增，都吵嚷著攻鳳陽，高迎祥頭腦一熱，頓時發令道：「好，大夥兒都到鳳陽去，挖了皇帝老兒祖墳。」
其實牛金星讓高迎祥攻佔鳳陽，焚燒皇陵，完全是不懷好意，普通人被挖了祖墳尚且要找人拚命，何況是皇帝，高迎祥若挖了崇禎祖墳，必然天下振動，引來朝庭全力對付，簡直是自尋死路。
但牛金星自有打算，他早找好了退路，他的心腹手下牛金寶早投靠了闖軍，他也由牛金寶和闖軍牽上了線，牛金星一方面是想貪財，想從皇陵找到一些好寶貝，另一方面是完成闖軍給他的任務，讓義軍鬧得越大越好。
高迎祥率眾十萬餘人，號稱二十萬大軍，向鳳陽進發，鳳陽為明太祖所建，朱元璋即帝位以後，建都南京，而以臨濠（今鳳陽）為中都。中都始建於洪武二年（公元1369年），至洪武八年（公元1375年）停建。由於興建和使用的時間短暫，沒有形成政治中心，但它在城市規劃上的某些佈局思想，包括它城內的宮殿佈局，卻影響了明北京城的規劃。
鳳陽留守朱國相，指揮袁瑞征，呂承蔭聽到義軍率大軍前來鳳陽，大吃一驚，他們手中只有三千餘官兵，他們只得拚命向負責鳳陽守衛的漕運總督楊一鵬求救，楊一鵬的駐地遠在淮安，遠水一時解不了近渴，守城還得靠他們自己，要命的是鳳陽城因為是太祖發家之地，為了不破壞風水，鳳陽沒有城牆，讓三千士兵在沒有城牆的地方敵十萬人，義軍淹也要把他們淹死。
朱國相、袁瑞征、呂承蔭三人商議該如何迎敵，呂承蔭提議全軍撤進皇陵抵抗，鳳陽本身較小，而且不富，賊軍的目的恐怕也是鳳陽的皇陵。
皇陵位於城西南7公里處，在陵墓的外圍，有3道城垣，形成3城包裹陵墓的平面佈局。由於皇陵地處明中都城的西南，為了使皇陵與中都城連為一體，所以皇陵的3道城門都是以北門為正門，而皇陵也因此是坐南朝北，神道與神路置於陵墓之北。皇陵的第1道城是夯土城垣，周長達28里。
第2道城是青磚砌起的城垣，高2丈，周長6里多，四邊開四門，皆有高大的城樓。第3道城是皇城，青磚壘砌，周長75丈。
若官兵能退入第二道城牆防守，或許能撐到援兵到來之際，但朱國相和袁瑞征卻反對，朝庭有令，擅入皇陵者死，二人生怕以後就是擋住了義軍，也會被朝庭問罪，只進入外圍城牆還有借口，若進入內城，非死不可，恐怕還要連累家人。
呂承蔭無法，棄了鳳陽，和眾人先進入道城垣，若守不住，再進入第二道城，，高迎祥率眾趕到鳳陽，果然直奔皇陵而去，三千兵丁分佈在一萬四千米的土牆上，每隔近五米才有一人，如何能守。雖然官兵拚死抵抗，無奈寡不敵眾，根本來不及退入第二道城就已全軍覆滅。
義軍消滅官兵後，都被鳳陽皇陵的氣派震憾住了，明皇陵陵墓是橢圓形覆斗式大平頂，高出周圍地面五米。陵墓堆土而成，封土堆底邊東西長五十多米，南北寬三十五米，陵前北部的金水橋向北，有長二百多米、寬六米多的神道，兩旁對稱排列著雕琢精美的三十二對石像。
高迎祥等人就如土包子進城，看得嘖嘖稱奇，不虧是皇陵，建得比一座城池還要好多了，赫搖旗粗聲粗氣的道：「天王，朱家的子孫就知道驕奢淫逸，全是從他們祖上傳來的，一座死人墓修成這樣，不如一把火燒了。」
高迎祥點了點頭，眾人都是窮人出身，對官府本就沒有好感，見了如此精美的陵園，想起自已以前的窘迫的生活，心中自然充滿忌妒，自己得不到的東西，放火燒了最好。
有心急的人馬上就要點火，牛金星連忙攔住，指了指地下道：「天王，下面的皇陵還沒有挖，現在可不能放火。」
高迎祥恍然，馬上命令眾人挖開寢陵，果然得到金銀珠寶無數，取出各種財寶後，義軍把寢陵中的屍骨也拋了出來，和官兵的屍體混在一起，一把火燒了個精光。崇禎後來就是想找到祖宗的屍體重新造墳也不成了。
十數天後，官兵增援部隊才到達，義軍早已從容而去。
消息傳到北京，朝庭一片嘩然，崇禎掩面而泣，自道無顏見祖宗，眾臣都惶恐不安，這突然而來的惡耗打亂了原來的所有安排，崇禎命令暫停經筵，自己換上黑色的袍服，從乾清宮搬到偏殿，以示哀痛和對自己的懲罰。
根據傳統觀念，國家有大變，天子德行有虧，是要負主要責任，明朝天下大亂，多年不靖，祖陵又被搗毀，天子應當下罪已詔，崇禎倒毫不含糊，罪已詔馬上就擬定好了，但下詔之前，大臣的責任也不能不懲。
鳳陽巡撫楊一鵬被捉拿下獄，不久斬於西市，守陵太監楊澤被逮後自殺身亡，鳳陽巡按御吏吳振纓遠戍邊衛，朝庭對闖軍的攻勢也被叫停，崇禎嚴令曹文詔先剿滅高迎祥等流寇，與闖軍暫時議和。
李鴻基當然樂得暫時休整，同意的朝庭和議，雙方暫時互不侵犯，李鴻基還提出雙方通商，朝庭不得限制物質進入闖軍境內的要求，這於這一點朝庭卻不同意，朝庭自許天朝上國，所需物品應有盡有，朝庭最拿手的一招就是貿易戰，對蒙古和後金莫不如此，經常因為對方的不恭，關停雙方的互市，又惹來的對方的搶劫，被迫開市，這一招朝庭玩了數百年，雖然效果不顯，朝庭卻經常做，如此才能顯示朝庭的富有和氣派，開市只是對蒙古和後金的恩惠。
如今闖軍為叛賊，朝庭萬沒有和對方交易的道理，否則就會把闖軍的地位和原先的番邦等同，朝庭死咬不放，不肯鬆口。
隨著朝庭對闖軍的圍團，闖軍境內各種日用品漸漸稀少起來，許多來自江南的物品不是價格大漲，就是根本沒貨，闖軍此次繳獲的數萬車財物雖然大大緩解了這種情況，但過不了多久就會重演，長期下去，對闖軍的商業自然會大受影響。
難得有這麼一次威脅朝庭的機會，闖軍自然不會放過，李鴻基數次向朝庭使者提出，若是朝庭不同意互市，他就是同意和朝庭和平共處，他的部下也會慫容他學蒙古人，金人一樣率軍來搶，到時雙方又只能刀兵相見。
崇禎急於剿滅高迎祥報仇，僵持了一月之久，見沒有辦法，只好照準，曹文詔的大軍才能脫身，朝安徽而去。