第一部《殷家血案》
小法醫楊秋池遇上雪崩，帶著一堆器械穿越時空回到大明，變身小仵作，重操「舊業」。
殷家少奶奶白氏和她的妹妹被人殘忍地殺死在房中。現場的證據指向了管家胡三，經過調查卻發現胡三並非殺害白氏姐妹的真正兇手。真兇到底是誰？
白氏死而復生，但是她拒不說出兇手。她「復活」的當天晚上，居住的小樓無故起火，難道是兇手想殺人滅口？
殷家的血案還沒有查明，卻意外查到了一封不知寄給誰的謀反信。此事驚動了錦衣衛，他們插手能查個水落石出？
葫蘆還沒按下瓢又起，這兩個案子的千頭萬緒還沒理出個所以然，應天府的百千總去要來為女兒討個公道……
且看小小仵作如何利用現代行刑偵手段，抽絲剝繭、把這紛繁複雜解得個順理成章。
第二部《白骨謎案》
秀才龍子胥殺妻埋骨，定於秋後問斬，他一直苦苦喊冤。楊秋池心存疑慮，化驗了凶器上的血跡，發現並非人血。
楊秋池復原了屍體的頭骨，辨認出死者並不是龍子胥的妻子，而是醉鶯樓頭牌姑娘金可瑩。龍子胥之妻身在何處？這金可瑩又是何人所殺？
案情有了眉目，楊秋池艷福又至，大賈之女郝倩，有沉魚之貌，詠絮之才，願嫁楊秋池為妾。這是餡餅還是陷阱？
楊秋池順籐摸瓜一路追蹤，兇手卻總是先他一步殺人滅口……
第三部《縱火迷雲》
楊老太爺的小妾曾發花癡病，羞愧之下投繯自縊，楊老太爺擔心她所生的孩子並不是自己親生，便求楊秋池做個親子鑒定。
楊秋池細查之下發現那小妾是被人謀殺，儒雅的楊清水、愛爭寵的二姨娘、善妒的楊家少奶奶……楊老太爺一干人似乎都有嫌疑……
楊秋池前往湖廣清溪縣赴任，途徑武昌，沿路饑民遍野、遺骨千里，兩次賑災的糧食都無故被燒，迷離百變的案情威脅著天下蒼生。楊秋池抽絲剝繭，對手手段奸詐，勢力不凡，死亡的陰影正一步步籠罩過來……
第四部《苗疆慘案》
楊秋池前往湖廣鎮遠州赴任，新官上任，就接到了燙手的山芋。苗寨寨主雲天擎的兒子雲愣，縱火燒死了縣衙王典史及其小妾，當場被抓獲，判斬立決。監斬當日，苗眾聚集企圖劫持法場，雲愣大呼「冤枉」。乖乖，又是一起錯案？
楊秋池一路追查王典史小妾行蹤，發現雷雨過後的山路旁，有一具女屍，其狀慘不忍睹，經辨認正是王典史的小妾趙氏。
一指庵的尼姑來報，山上發現一具屍體。其死狀與趙氏一案現場頗為相似。難道連環殺手就在附近？