直到1967年，這個困擾科學家最久的謎團被一隊美國考古學家揭開了。
美國考古學家在克里特島60米厚的火山灰下挖出一個古代商業城市。經考證，這座城市確實是在公元前1500年前後被火山爆發生成的火山灰所埋葬。隨後出土的還有1980年英國考古學家在克里特島克諾索斯發掘出的一座王宮廢墟，他們在王宮建築上發現了雙斧標誌，學者一致認為，這就是米諾斯王國的雙斧宮殿（希臘神話中曾提到雙面斧是克里特島上宮殿的重要特徵）。
那麼，到底什麼火山，威力究竟有多大，居然如此輕而易舉的將當時地中海文明中心的米諾斯王國毀於一旦。
毀滅元兇——桑托林火山
考古學家大膽推測，這個終結者應該是克里特島以北約130千米的桑托林火山。桑托林火山海拔僅為566米，十分不起眼，因此，它的寧靜讓島上祖祖輩輩的居民都感覺很安全。但是，這個被忽視的火山卻在公元前1500年左右發威了。
為了比較桑托林火山爆發的猛烈程度，地質學家查閱了1883年東印度喀拉喀托島火山爆發的記錄。那次爆發使喀拉喀托島的底部裂開，冰涼的海水湧入，它和滾燙的岩漿相摻和使得膨脹的氣流產生了無法抗拒的壓力，掀掉了1460英尺高的喀拉喀托山的頂峰，噴出的煙塵火柱竄入50多千米的高空，把岩石甩出80千米之外。火山塵繚繞地球擴散，世界各地的落日變得血紅，數月後竟然引得美國康涅狄格州和紐約市的消防隊都出動了。等到這次噴發施盡淫威終於平息下來時，火山的空殼塌陷進一個200米深的海底火山口。因此而產生的海嘯毀滅了295個城鎮，淹死36000人，還把一艘輪船推進內陸3000米。爆發時的轟鳴聲使方圓760多千米內的房屋全都震動，聲音則傳到3200多千米之外。
地質學家認為，桑托林島與喀拉喀托島火山爆發屬於同一類型，只是比它還要猛烈許多倍。當時在空中釋放出的能量相當於數百個氫彈同時爆炸。專家模擬出桑托林爆發時的場景：火山突然噴發，岩漿直接衝向克里特島，人們還來不及反應就已經很痛苦的死於汽化，即便有島民想逃跑，火山灰也會很快在他們的肺裡凝固成水泥。
據雅典地震學院的加蘭諾帕勒斯教授估計，覆蓋在桑托林島上的火山灰厚達30多米，而喀拉喀托的火山灰只有30厘米厚。風把桑托林島的火山灰吹遍62.5平方千米的地區，主要是吹向東南方，沉積在海底，即使到了今天，如果你到克里特島潛水，仍能看到78米厚的火山噴發沉積物。島上的城市幾乎在一瞬間就被埋在厚厚的火山灰下，並波及地中海沿岸及島嶼。據記載，當時埃及的上空曾出現三天漆黑一片的情景，《聖經》中對以色列人出埃及時的一段描寫很可能就來源此。「摩西擎起手中的神杖，向天空一伸，天空立即變得一片烏黑，如同一塊龐大無比的黑幕，嚴嚴實實罩在埃及的土地上，一直持續了三天。在這三天之中，唯有以色列人家裡有光亮，埃及人全都伸手不見五指，寸步難行，陷入了深深的黑暗之海」。
噴發停息以後，成為空殼的火山陷入海平面下400米的火山口中，造成巨大的海嘯，浪頭高達50米，漩渦中心的波浪更有1.6千米高。滔天巨浪以每小時320千米的速度呼嘯而去，猶如幾十米高的巍巍長城，粉碎了克里特島上的城市、村莊和良田沃土。船隻被狂濤擊碎，曾經的無敵艦隊此刻不堪一擊，米諾斯王國也隨之化為烏有。不到3小時內，海浪還吞沒了尼羅河三角洲，繼續淹沒了1000多千米之外的敘利亞古港烏加裡特。
那次火山爆發，起碼造成島上75%人口的死亡，就連遠在地球另一極的地方也留下了這個火山爆發的證據：科學家從遙遠的格陵蘭島、黑海以及埃及都探測到這次火山噴發產生的灰塵，還從愛爾蘭和加利福尼亞發掘出遭到這次爆發引起的霜凍破壞的植物化石。
所幸，火山噴發後還有分散在各地的倖存者。有人設法爬上高山，有人當時正在遠航。考古證據表明，他們當中的大多數人逃到了克里特島的西部，從那北渡，到達希臘海濱的邁錫尼城，雖然當時希臘也遭遇了海嘯侵襲，但是多虧刮的是西北風，所以沒有受到火山灰影響。
當大量的火山灰降落下來，填滿了肥沃土地，當大片的海水毀壞了莊稼，克里特島的土地大約數十年不能耕種，許多逃出去的人就再也沒有回來。這些難民逃到邁錫尼城後把文字、藝術、射箭等技藝教授給希臘人，他們也教會希臘人製造青銅器和金器，還有可能幫助他們營造了大陵墓和宮殿，當時文明程度還遠遠落後於克里特的邁錫尼隨後在公元前1400左右繁榮了起來。
亞特蘭蒂斯的原型
後來，大約公元前350年柏拉圖在他兩篇對話錄《克裡斯提阿》和《泰密阿斯》中寫到「傳說12000餘年以前，有座亞特蘭蒂斯島（大西洲），建立在島上的亞特蘭蒂斯王國曾征服過埃及與北非地區；在與希臘人作戰後，阿特蘭提斯人退回了自己的國土。後由於火山、地震的突然爆發，僅一日一夜的工夫，這塊陸地便沉入了海底。」
據說，柏拉圖的有關記錄是從他的表弟柯裡西亞斯那裡聽來的，而柯裡西亞斯又是從其曾祖父卓彼得斯那裡聽來的，而卓彼得斯又是從當時雅典著名政治改革家和詩人梭倫（約公元前638—559年）的口裡聽來的。梭倫任滿去職後，曾用了10年時間，漫遊於埃及、塞浦路斯、小亞細亞等地。考古學家加蘭諾帕勒斯認為，梭倫肯定是讀錯了埃及數字符號，把「100」讀成「1000」，因此使所有的數字增大了10倍。如果去掉那個多餘的「0」，毀滅的年代應該是發生在梭倫生前900年，即公元前15世紀，也就是桑托林火山毀滅克里特島的時候，而除了時間上的不符外，柏拉圖關於亞特蘭蒂斯的描寫幾乎都是米諾斯王國的翻版：克里特和亞特蘭蒂斯的房屋內都喜歡用紅色、黑色和白色的石頭做裝飾；傳說中的亞特蘭蒂斯人喜歡在城市中心的角鬥場玩鬥牛遊戲，而克里特島居民也喜歡；還有一點很重要，聖托裡尼和大西洲崇拜的神靈都是海神波塞冬與它的三叉戟。
這些以及其他相似之處至少已使一位著名歷史學家得出結論說：「亞特蘭蒂斯之謎已最終得到了解答。」
曾經的古文明中心，曾經的地中海霸主，曾經的富庶大國在大自然的面前被徹底打敗，並永遠消失在蔚藍的海水中，而它的文明也因此被埋葬，除了倖存於邁錫尼文明中的部分。
現在，我們知道了那個真理，那就是：不管文明程度有多高，面對像超級火山這樣的自然力量，人類根本束手無策，再強大的人類文明也會不堪一擊。