但是1912年，十三世****從大吉嶺回藏以後，****與班禪之間的關係，逐漸惡化。其原因是：1915年，****在日喀則設立了基宗（相當於內地行政專員公署），任命僧官羅桑敦主、俗官木霞二人為基宗（後藏總官）。
基宗的職權很大，他們除管轄****在後藏的所有宗溪之外，也管轄班禪所屬四個宗和所有溪卡，這就侵犯了班禪的固有地位和職權。在設立了基宗之後，即向班禪轄區的百姓徵收與攤派軍糧稅款和烏拉。這樣就使班禪與****這間的關係日趨惡化。
1916年班禪寫信給****，指出基宗干涉寺政不當，並要求會晤，解決問題，****覆信拒絕。到了1919年春，****同意班禪去拉薩會晤，但無結果。
這樣，一直到了1923年，****命令扎什倫布寺的幾個負責官員前往拉薩，這幾個官員到拉薩後，未經審問，即被投入監獄。當班禪得知這一消息後，感到是大禍臨頭的先光，如不逃走，勢將危及自己的生命安全。於是立即決定，向內地出走。但他怕日喀則基發覺，作了必要安排。1923年11月15日夜，九世班禪領侍從15人，向北出走，無人知曉。三日之後，即11月18日晚，九世班禪的蘇本堪布羅桑堅贊等100餘人乘月色逃出，追趕班禪，疾行五日夜，才會合一起，直向藏北羌塘前進。由那裡越唐古拉山脈，即入青海境內。
1924年農曆5月4日到達蘭州，甘肅督軍陸洪濤率領官員、軍隊數千人在蘭州郊外迎接。班禪經過的街道皆用黃布鋪路，紮了彩色牌坊，「備極莊嚴」。北洋政府大總統曹錕特派李乃芬為「迎護專員」，率衛隊百人由北京前來蘭州歡迎，此後一直在外流亡，西藏事務由，十三世達賴喇嘛把持，他奉行的是「騎牆政策」，兩邊觀望的態度，後世一直在外高分裂活動的是第十四世達賴喇嘛，叫丹增嘉措。
第一百六十三章出擊西藏（三）
不過西藏事務一直都是自主處理，所以王九齡一個搞不好，說不定就會把西藏徹底推到英國人那邊去了。
王九齡要進軍西藏，可能會跟英國人打上一仗，不過王九齡已經準備好了，九世班禪已經聯絡上了，王九齡也讓人轉告希望他能來西藏主持西藏的事務，而且已經得到答覆，人也在趕來的路上。
昌都位於瀾滄江畔，為藏東政治、軍事、經濟中心，扼青、康、滇、藏交通要衝。昌都地區處於橫斷山脈地帶，全區高山連綿，河道縱橫，交通不便。因其戰略地位重要，西藏地方政府在昌都設總管府，統管昌都地區軍政事務,總管一職多由噶倫擔任。