謝赫·阿卜杜拉雖然支持查謨和克什米爾土邦加入印度，但他並不支持查謨和克什米爾土邦併入印度，而且還追求查謨和克什米爾土邦獨立。1948年初，謝赫·阿卜杜拉在聯合國參加克什米爾問題的答辯。1月28日，他與美國駐聯合國大使瓦倫？奧斯丁進行了會談。會談結束後，瓦倫？奧斯丁在給國務卿馬歇爾的電報中匯報說：「阿卜杜拉訪問的主要目的可能是使美國知道還有第三個選擇，也就是獨立。他看起來過於焦急地要傳達這一觀點……他不想讓他的人民受印巴爭執之累。如果克什米爾獨立，並能得到美國和英國在國家發展方面的援助，情況將會更好。當然，我沒給阿卜杜拉沿著此線發展的任何鼓勵，而且我相信，在離開之際他已經很好地理解了我們對這整個問題的立場。」Jain，RajendraKumar，US-SouthAsianRelations，1947-1982，RadiantPublishers，1983，p杄11杄這個時候，因為還在爭取印度和巴基斯坦加入西方遏制社會主義國家的陣營，美國並不支持謝赫·阿卜杜拉的克什米爾獨立計劃。
隨著形勢的發展，美國開始對謝赫·阿卜杜拉的獨立計劃給予模糊支持。1949年春天，與美國駐印度大使在斯利那加會見之後，謝赫·阿卜杜拉好像得到一種印象，與他1948年在紐約被告知的相反，美國和英國將會贊同克什米爾獨立，並為它提供國際保障QuotedinSarvepalliGopal，JawaharlalNehru:ABiography（VolumeTow，1947-1956），Delhi:OxfordUniversityPress，1979，p杄118杄。謝赫·阿卜杜拉也開始含含糊糊地宣揚克什米爾獨立的計劃。1949年底，謝赫·阿卜杜拉第二次訪問美國，他的計劃得到了美國的鼓勵。在紐約時，他與巴基斯坦駐聯合國代表喬杜裡？阿赫默德取得聯繫，並對後者說，要印度人離開克什米爾的唯一途徑是贊成克什米爾獨立。他據理力爭說，英國人和美國人決不會冒疏遠印度的風險而支持巴基斯坦〔巴〕阿爾塔夫·高哈，《阿尤布·汗：巴基斯坦的首位軍人統治者》，鄧俊秉譯，世界知識出版社，2002年，第181頁。謝赫·阿卜杜拉訪美返回克什米爾之後，美國駐印度大使韓德遜到那裡與他進行磋商。
克什米爾獨立計劃得到美國明確支持之後，謝赫·阿卜杜拉變得大膽起來。1951年11月5日，他在克什米爾制憲議會裡公開宣稱，應該把克什米爾建成「東方瑞士」。為了尋求國際支持，他在1952年1月出訪西歐國家。謝赫·阿卜杜拉和西方國家勾結，企圖建立獨立克什米爾國的陰謀，引起了蘇聯的警惕。1952年1月17日，蘇聯駐聯合國安理會代表馬立克在發言中說：
1950年10月，國民會議黨大會通過一項決議，建議召開制憲議會以決定克什米爾土邦的未來及其從屬關係。英美立即干預此事，以防克什米爾人民決心選定他們自己的未來，且獨自決定他們國家的從屬關係。它們匆忙向安理會兜售一項決議，宣稱克什米爾制憲議會的召集，及其可能採取的決定克什米爾土邦未來的行動，對克什米爾的地位沒有影響。Jain，RajendraKumar，Soviet-SouthAsianRelations，1947-1978，MartinRobertson&CompanyLtd杄，1979，p杄5杄
馬立克指責英美干涉克什米爾問題是想在那裡獲得軍事落腳點以對付蘇聯，他把葛拉罕形容為五角大樓的秘密代言人。尼赫魯的傳記作者戈帕爾就此評論說：「這是蘇聯在安理會第一次採取積極的態度，批評英美的克什米爾政策。這使尼赫魯處於尷尬之中，因為這使克什米爾成為冷戰競爭的一部分，並僵化其他國家的立場。」Gopal，Sarvepalli，JawaharlalNehru:ABiography（Vol杄2），Delhi:OxfordUniversityPress，1979，p杄116杄
謝赫·阿卜杜拉訪問歐洲之後返回克什米爾。1952年3月23日，他在克什米爾制憲議會上說：「為討論起見，假設人民不批准加入印度，那麼，決不能推論說克什米爾當然要成為巴基斯坦的一部分。不會發生這樣的事。在法律上和憲法上不能發生這樣的事。可能發生的，倒可能是這樣：克什米爾土邦恢復它在加入印度以前所享有的地位。我們要把這一點弄明白。」Kumar，Vijay，Anglo-AmericanPlotagainstKashmir，Bombay:People𠖥sPublishingHouse，1954，pp杄189-190杄
1952年，克什米爾制憲會議進行選舉，國民會議黨獲得大規模勝利，這使尼赫魯對公民投票的前景感到更為樂觀，並與謝赫·阿卜杜拉討論在克什米爾進行排除「自由克什米爾」的公民投票可能。聯合國可以核查準備好了的選舉人名單，然後進行公民投票。印度軍隊將駐守在停火線附近，提防公民投票遭到襲擊。但是，謝赫·阿卜杜拉準備讓一些巴基斯坦和「自由克什米爾」的著名人士來參加討論，以便在「自由克什米爾」進行公民投票時他能夠獲得同樣的便利QuotedinSarvepalliGopal，JawaharlalNehru:ABiography（VolumeTwo，1947-1956），Delhi:OxfordUniversityPress，1979，p杄115杄。
在某種意義上說，克什米爾問題是印度國內穆斯林群體總問題的一部分SarvepalliGopal，JawaharlalNehru:ABiography（VolumeThree，1956-1964），London:JonathanCope，1984，p杄264杄。查謨和克什米爾土邦內以及印度國內的教派主義助長了謝赫·阿卜杜拉的獨立思想。國民會議黨執政之後，開始執行「新克什米爾」計劃，打算無賠償地沒收地主的土地分給農民，廢除克什米爾的君主世襲制。
因為印度憲法第31條規定，如果不支付適當的賠償，就不能剝奪私有財產的所有權，所以除非查謨和克什米爾土邦享有完全的內政自治權，不受印度憲法這一條文和其他類似條文的限制，土地賠償委員會的建議才能付諸實行Kumar，Vijay，Anglo-AmericanPlotagainstKashmir，Bombay:People𠖥sPublishingHouse，1954，p杄161杄。鑒於查謨和克什米爾土邦的特殊情況，印度制憲議會在1949年10月17日制定了專門針對它的憲法第370條（參見附錄Ⅱ），使它在印度聯邦內享有特殊地位。克什米爾享有廣泛的自治權，聯邦的權力僅限於《加入文件》所規定的國防、外交和交通三方面，其他權力歸土邦所有，中央在該土邦行使權力首先應該得到土邦議會的授權。納武拉卡說：「印度之所以做出如此安排，是因為起初戰爭仍在進行……土邦裡有些地方仍然控制在起義者或敵人手中。
印度還和聯合國糾纏於查謨和克什米爾問題。」Navlakha，Gautam，「InvokingUnion:KashmirandOfficialNationalismof『Bharat』」，inSathyamurthy，T杄V杄，Edi杄，SocialChangeandPoliticalDiscourseinIndia:StructuresofPower，MovementofResistance（Vol杄3，Region，religion，caste，GenderandCultureinContemporaryIndia），Delhi:OxfordUniversityPress，1996，p杄78杄1953年修定的《印度刑法典》還特別規定，「印度」意指不包括查謨和克什米爾土邦在內的印度領土古蒂譯，樓邦彥校，《印度刑法典》，法律出版社，1957年，第5頁。
查謨和克什米爾君主制的廢存涉及印度的乙部邦乙部邦（PartBStates），印度共和國成立後，印度逐漸把許多大大小小的土邦改土歸流，由土邦組建的邦就叫作乙部邦，在英屬印度基礎上建立起來的邦叫作甲部邦。問題。因此，國民會議黨的無賠償土地改革、廢除封建君主制和有限加入印度的政策，遭到土邦內外印度教教派主義分子的猛烈抨擊，夏雅馬？普拉薩德？穆克吉、塔拉？辛格等人領導發動了大規模的遊行示威，企圖迫使查謨和克什米爾土邦完全加入印度，退而求其次也要把非穆斯林佔多數的查謨和拉達克兩省分裂出來併入印度。
印度的教派勢力非常偏激，在他們的心目中只有印度教徒才是真正的愛國者，印度國家主權和統一的扞衛者，穆斯林則是叛國者和異類王紅生，《二十世紀印度教民族主義的歷史與社會談源》，《北大史學》第4期，北京大學出版社，1997年，第218頁。利雅茲認為：「教派主義者的真正目的是，因為尼赫魯偏袒穆斯林，想以此為難他並把他趕下台。」Rizvi，Gowher，SouthAsiainaChangingInternationalOrder，NewDelhi:SagePublicationsIndiaPvt杄Ltd杄，1993，p.54杄
教派主義勢力並沒能把尼赫魯趕下台，卻加劇了謝赫·阿卜杜拉的憂心，也使他的克什米爾獨立計劃有冠冕堂皇的理由。他在給尼赫魯的一封信中說：
我不禁對自己失去信心。很明顯，印度有股強大的潮流，那些人根本不在乎您所看重的把聯邦建成一個真正世俗國家的政策，也不在乎您的克什米爾政策……我多次說過，我們之所以加入印度，是因為我們看到印度有兩顆希望之星，也就是甘地先生和您自己，儘管我們和巴基斯坦有那麼多的聯繫，但我們沒有加入它，因為我們相信我們的計劃與他們的政策不相符合。但是，如果我們被迫得出這樣的結論：我們不能按自己的路線來建設我們的邦國，這些路線與我們的特徵相符合，那我將如何回答我的人民，如何面對他們。Gopal，Sarvepalli，JawaharlalNehru:ABiography（Vol2，47-56），Delhi:OxfordUniversityPress，1979，p杄131杄
謝赫·阿卜杜拉認為教派主義者的行為違背了《加入證書》，並且在查謨地區屠殺穆斯林。他的傳記作者R杄N杄考爾說：「謝赫·阿卜杜拉感到困惑並認識到，不但查謨和拉達克在滑離他的控制，甚至於克什米爾的穆斯林也在失去對他的信任。」R杄N杄Kaul，SheikhMohammadAbdullah，APoliticalPhoenix，NewDelhi:SterlingPublishers，1985，p杄60杄1952年4月10日，他公開地說：「如果印度的教派主義死灰復燃的話，那我們將如何讓克什米爾的穆斯林相信印度並不想吞併克什米爾。
……這樣發展下去將導致中斷克什米爾加入印度。」QuotedinIbid杄，p杄59杄有學者認為：「謝赫·阿卜杜拉大無畏而坦誠地表達了他的擔心。這是一種自然的率性流露，因為他缺乏真正政治家那種對自己觀點隱而不宣的品質。作為一個誠實的人，他大膽地說出了自己的擔心，絲毫也不考慮這些意見可能會被歪曲。由於相信生活在一個虛幻的世界裡，他真的想要取消加入印度並使克什米爾獨立。」R杄N杄Kaul，SheikhMohammadAbdullah，APoliticalPhoenix，NewDelhi:SterlingPublishers，1985，p杄68杄