不只是法國公開挑戰了美國的中立政策，大不列顛內閣的一些不明智做法也把美國的這一政策推向了崩潰的邊緣。因為農業歉收，法國出現了十分嚴重的糧荒。此時，大不列顛決定利用海軍的優勢，截斷法國的所有海上供應。1793年，英內閣指示扣留所有開往法國的商船，強迫商人卸下貨物，然後進行併購收買，並補貼給他們一定的運費。大不列顛的這一行為引起了美國各界的憤慨，美國政府為此向大不列顛提出了強烈的抗議，警告說這樣做的話便是違反了中立國的法律，並且還踐踏了人道主義精神。
面對美國的指責，大不列顛政府一意孤行，並且還扣留了美國海員為他們服務，由於美國人和大不列顛人同族同類，因此最容易遭遇英國軍隊的綁架。大不列顛拒不歸還大湖區一帶的碉堡的行為，進一步激發了美利堅合眾國的反英情緒。直到此時，華盛頓還仍舊感覺不能隨便採用武力，但國會內部有很多人都認為應當對大不列顛強硬一些。國內激進的親法派基本上不考慮本國的條件，強烈要求馬上使用武力奪回大湖區一帶的碉堡。但是華盛頓卻堅持認為不行，即使動手的理由很充分，也要首先擺平對法國和大不列顛的關係，否則一旦戰爭爆發，後果將會不堪設想。在俄亥俄地區，受到英國軍隊挑撥的印第安人也在不斷進行著叛亂。由於他們拒絕進行談判，韋恩的隊伍再次轉入了進攻。
1794年，新一屆國會開幕了，會上有很多棘手的事情需要進行決定。熱內的陰謀加上大不列顛的鼓動，令戰爭的陰雲再次飄到了美國的上空。華盛頓首先在開幕詞中對人民讓他再度當選為總統表示了感激。接著他說，面對歐洲的戰爭，美國應當採取的辦法是與各國保持和平友好的關係，只有這樣，才能確保美國的利益不會受到損害。他向國會強調必須要加強國防力量，否則美國在他人的眼中只會是一個弱國。美國需要和平，但是和平卻不能依靠他人來給予，它需要依靠強大的武力做保障。因此，華盛頓極力主張要採用擴軍備戰的辦法。在他的講演當中，華盛頓再次向議員們發出了忠告：當務之急便是要加緊償還所欠的國債，節省出寶貴的時間來發展經濟。依據眾議院的要求，2月23日，傑斐遜提交了一個美國和其他各國貿易往來的統計表。美國進出口商品的種類和範圍在這份表格中都可以令人一目瞭然。傑斐遜特別說明，當前美國的商品出口存在著好多的困難，因此他建議通過制定抵消關稅法和友好協商的方式，來為美國商品營造出安全、和平的出口環境。為了保障公民們的商貿以及海上交通的權利，傑斐遜建議國會盡快制定出有關這方面的法規。
美國當時的政局十分複雜，歐洲的態勢也充滿了變數。法國王后已經被處決了，殺人如麻的雅各賓派一直都沒有停手。美國在內部開始出現不和諧因素，美國軍隊不只要防備來自於歐洲的危險，還要對北非沿海的海盜進行打擊。形勢十分糟糕，這些事情全部都壓在了總統的身上。華盛頓全心全意地尋找著衝出困境的正確途徑。他對世界各國出現的事情基本都瞭然於心，一些反對聯邦群體的行動也沒有逃脫出華盛頓的眼睛，當前他們使用的唯一方法就是不停地誹謗華盛頓。
傑斐遜的商務報告很快便通過了眾院的審議，同時，麥迪遜還提出了一些有關於加強美國商人在海上安全的議案，議員們在審議這些議案時爭吵得十分厲害，甚至有人出言不遜。華盛頓認為，以上問題並不只是商業問題，它還涉及到親法派和親英派之間的派別之爭，這就無法避免地和政治拉上了關係。在全部的辯論過程當中，部分議員甚至還建議，應當在某些議案本子上面蓋上「親法」和「親英」的印記，以便讓大家明白誰是親法派，誰是親英派。此次辯論持續的時間超過了半個月，從1月13日開始一直到2月3日才結束。在進行表決的時候，第一項議案以5票的微弱優勢得以通過。其他那些議案卻是一拖再拖，直到三月底也沒有得出結果，最後不了了之了。
3月27日，有人建議將所欠大不列顛的債務扣下來，留作自己的國庫基金進行使用；不但這樣，美國還應當向大不列顛政府抗議，責令他們賠償美國商船的損失。英國軍隊的殘暴行為激起了美利堅合眾國人民的極大憤慨，各州都有群眾進行集會，要求嚴懲大不列顛的肇事者。現在，親法派佔了上風，很多人都感覺，假如在此情形下美國人仍和大不列顛保持友好的話，那麼簡直就是太懦弱了。為了表明他們的反英決心，很多人還聯合成立了民主公社。在這一關鍵的時刻，美國駐英公使送來了消息說、大不列顛已經撤銷了過去制定的法規，嚴令大不列顛各艦釋放被扣押的美國商船。同時，大不列顛政府還發表了聲明，承認他們在對待商船的做法中有過激行為，因此特向美國人民道歉。4月4日，美國國會就大不列顛做出的新承諾開始了辯論。聯邦黨人認為大不列顛為美國解除了憂難，因此，他們不同意美國政府採用強硬辦法；反聯邦黨人現在也不再像過去那樣激進，他們同意觀察一下事情的發展情況，然後再做決定。傑斐遜儘管是一位親法派，可他強烈要求美國不要捲入戰爭，最好是通過和平談判的方式來解決所有的糾紛。
當時美國的部分地區已經出現了叛亂，要想將叛亂平息，需要動員7000名士兵，假如任由叛軍勢力蔓延，局勢就一定會變得更加嚴重。8月7日，華盛頓發出了公告，責令那些反叛者馬上解散，假如在9月1日前仍舊不能解散的話，政府就要採用強硬的手段。同時，華盛頓還指示賓夕法尼亞州、新澤西州、弗吉尼亞州和馬里蘭州各派一支隊伍組成一支討伐大軍。沒過多久，這支隊伍的總人數就已經達到了1．5萬人。華盛頓認為，如果不及早剷除此次叛亂的話，就一定會釀成十分嚴重的後果。這些叛亂社團大多都由一些心術不正的人建立，他們首先打算毀滅的是人民對政府的信任，將人民不滿政府的種子播撒出去。假如讓這些種子開花結果的話，美國將無法繼續進行經濟建設。
反叛者拒不解散，華盛頓於9月5日再次發佈了警告，聲明政府將要採取強有力的手段，來對這些冥頑不化的反叛者進行討伐。很快，華盛頓就親率大軍前往賓州西部鎮壓叛亂了。就當要離別費城的時候，華盛頓接到了摩根少將的來信，在信裡，摩根說自己正帶領著一支弗吉尼亞民兵行進在討伐叛徒的路上，李將軍是這支隊伍的總指揮。華盛頓對他的行為深表感謝，同時他和摩根約定在坎伯蘭要塞地區進行會面。隊伍集合完畢後，華盛頓到了貝德福德，在這裡他接到了通知，然後便返回了費城參加了第三次國會。
國會於11月9日開幕，華盛頓在國會上發表了演講。談到賓夕法尼亞州邊陲出現的叛亂時，華盛頓強烈地譴責了事件的幕後「挑動者」。在講述了這場暴亂的因果之後，華盛頓說：「出現了這樣的事情，我感覺到十分遺憾。是一些人的野心導致很多人喪失了做人的權力。實踐證明，現在美國的繁榮昌盛已具備了很好的基礎，人民充分瞭解到了自由和民主的真正含義。即便是有人搞陰謀詭計，但聰明英勇的我國人民一定會將這些人的陰謀粉碎掉的。正如捍衛我們的權利不受侵害一樣，美利堅合眾國絕對不會允許有人對法律進行踐踏。華盛頓又說，「很多反叛者被眼前一時的利益所迷惑，當他冷靜下來之後，則必然會為個人的行為感覺到慚愧。追求自由和正義的美國人正在用雙手建設自己幸福的家園，假如《美利堅合眾國憲法》被推翻的話，那麼全部美洲大陸將會再次陷入到痛苦的深淵當中。」華盛頓對那些居心叵測的人的指責，讓大家看到了他的勇氣和魄力。