蘋果公司的創新並非流於表面。1994年起，該公司就一直在使用PowerPC芯片，該微處理器由IBM和摩托羅拉聯合生產。在當時幾年的時間裡，該芯片比英特爾公司生產的芯片更快，蘋果公司曾在自己的幽默廣告中吹捧過這一點。然而，當喬布斯重回蘋果時，摩托羅拉在生產新版本芯片方面已開始落後。這引發了喬布斯和摩托羅拉CEO克裡斯·高爾文（ChrisGalvin）的爭吵。1997年，喬布斯回到蘋果後，立即決定停止授權同類電腦製造商使用麥金塔操作系統。他打電話向高爾文提議，如果摩托羅拉加速研發可用於筆記本電腦的新版威力芯片，那麼蘋果公司可能會考慮為摩托羅拉破例，授權其StarMaxMac兼容機使用麥金塔操作系統。兩人的對話越來越激烈。喬布斯對高爾文說，摩托羅拉的芯片爛透了。高爾文也是個有脾氣的人，立即反駁。喬布斯掛了他的電話。摩托羅拉停止生產StarMax電腦，而喬布斯則開始暗中計劃拋棄摩托羅拉/IBM的威力芯片，轉而投向英特爾的懷抱。換芯片並不容易，這相當於要重新編寫整個操作系統。
喬布斯並沒有給予董事會任何實質性權力，但他還是秘密同董事會成員一起從各個角度討論想法，並仔細思考戰略。會議中，他會站在白板前，主導自由討論。就是否應該轉移至英特爾架構，董事們討論了18個月。「我們就這個事情進行辯論，提出了很多問題，最終一致決定有必要這麼做。」董事會成員亞瑟·萊文森回憶道。
保羅·歐德寧（PaulOtellini）時任英特爾公司總裁，後來成為該公司CEO；他開始與喬布斯私下碰頭。兩人相識於喬布斯努力保全NeXT公司的時候，歐德寧後來回憶，「他的傲慢態度那時還算有所收斂。」歐德寧待人冷靜幽默。2000年過後的最初幾年，他同喬布斯談生意的時候，發現喬布斯「暴躁脾氣又回來了，不像當初那樣謙恭」，但歐德寧並不生氣，反而覺得很有趣。英特爾公司與其他電腦製造商也有合作，喬布斯希望拿到比那些公司更好的價格。「我們必須用有創造性的方式來談攏數字。」歐德寧說。兩人的大多數談判都在散步時完成，這是喬布斯喜歡的方式。有時他們會沿著斯坦福校園內的小徑，一路漫步到山丘上。散步開始時，喬布斯會以一個故事開頭，闡述自己如何看待計算機演進的歷史，而散步結束時，已經在就具體數字討價還價了。
「人們都覺得英特爾是個難對付的合作夥伴，這是安迪·格魯夫和克雷格·巴雷特（CraigBarrett）掌管英特爾時給人的印象。」歐德寧說，「而我想要告訴大家，英特爾是一家可以合作的公司。」於是，英特爾派出一支精幹團隊與蘋果公司合作，在6個月的期限內成功完成了芯片轉換。喬布斯邀請歐德寧參加蘋果公司百傑集思會。歐德寧身著兔子裝一樣的英特爾實驗室外套，擁抱了喬布斯。2005年兩家公司就合作發表了公開聲明，一向矜持的歐德寧又一次做出了同樣的舉動。大屏幕上出現了「蘋果和英特爾，終於在」起」。
比爾·蓋茨對此感到驚奇。他對於設計色彩花哨的電腦機箱並無興趣，但是秘密換掉電腦內部的CPU，並能按時無縫完成，這是他真正欽佩的壯舉。多年後我採訪蓋茨，提起喬布斯的成就，他告訴我：「如果你說，好，我們現在要換掉微處理器芯片，但是一拍都不能落下，這聽起來是不可能的，但他們基本做到了。」