黃帝將蚩尤抓住之後便辭別清虛率軍向有熊城行去，清虛待黃帝走遠之後收起天地玄黃玲瓏寶塔將刑天、九鳳、相柳三人放出，刑天三人剛才雖然被困，可外界一切都被看在眼中，見蚩尤大敗，巫族剩餘的族人幾乎被屠戮一空，將巫族僅剩的一點家底輸光，臉上不由升起一片慘然，欲去救蚩尤又一想那軒轅一定會將蚩尤嚴加看守，僅靠自己三人恐怕無法將蚩尤救出，刑天不由慘笑一聲說道：「九鳳、相柳你們先走吧帶剩餘的族人去祖巫殿，護持好祖巫殿等我回來。」說完又對清虛說道：「我巫族本可贏得此戰，不料有你清虛和那昊天插手，使得我巫族大敗虧輸，我現在不是你對手，不過此仇我一定會報。」說完便向三十三天之上飛去。清虛看著刑天向天庭飛去，不由想到：「聞名後世的刑天舞干戚就要上演了嗎？不過你刑天卻是注定要成為一悲劇英雄啊，那昊天侍奉道祖無數歲月，學得多少神通誰也不知道，法力、修為更是極高，你雖為祖巫之下最強的大巫卻也不是對手啊，或許你也知道這一點，可是那股悍勇之氣和為族人出頭的心卻是不由你不去啊。」清虛看著刑天義無反顧的向天庭飛去，不由想起了他前世所知道的封神之戰，一眾截教弟子雖明知出山可能會上封神榜，可為了同門之誼卻是一個個出山而去，只為報師兄弟被殺之仇。不由得歎了口氣。搖搖頭轉身向九華山飛去。
卻說為報昊天無故相伐之仇向天庭飛去，欲殺昊天上帝為死去的族人報仇。只見刑天左手握著長方形的盾牌，右手拿著一柄閃光的大斧，一路過關斬將，砍開重重天門，直殺到昊天上帝的宮前。昊天上帝正帶領眾大臣在宮中觀賞仙女們的輕歌曼舞，猛見刑天揮舞盾斧殺將過來，頓時大怒，想到：「無論如何我乃是奉道祖符命而成天帝，你刑天竟然就如此直接殺上來可，若是讓你安然離去，我的面子卻是放到何處？」想到此處便拿起寶劍就和刑天搏鬥起來。兩人劍刺斧劈，從宮內殺到宮外，從天庭殺到凡間，直殺到常羊山旁。昊天上帝到底道行高深覷個破綻，一劍向刑天的頸脖砍去，只聽「卡嚓」一聲，刑天的那顆像小山一樣的巨大頭顱，便從頸脖上滾落下來，落在常羊山腳下。巫族只修煉體術，卻是無有元神，故刑天雖被昊天上帝將首級砍下，卻也是未死。忙把斧頭移到握盾的左手，伸出右手在地上亂摸亂抓。他要尋找到他那顆不屈的頭顱，安在頸脖上再和昊天上帝大戰一番。他摸呀摸呀，周圍的大小山谷被他摸了個遍，參天的大樹，突出的岩石，在他右手的觸摸下，都折斷了，崩塌了，還是沒有找到那顆頭顱。他只顧向遠處摸去，卻沒想到頭顱就在離他不遠的山腳下。昊天上帝怕刑天真的摸到頭顱，恢復原身又來和他作對，連忙舉起手中的寶劍向常羊山用力一劈，隨著「轟隆隆」「嘩啦啦」的巨響，常羊山被劈為兩半，刑天的巨大頭顱骨碌碌地落入山中，兩山又合而為一，把刑天的頭顱深深地埋葬起來。並在常羊山之上加上封印，將刑天的頭顱永遠的埋在常羊山下。
聽到這異樣的響聲，感覺到周圍異樣的變動，刑天停止摸索頭顱。他知道昊天上帝已把他的頭顱埋葬了，他將永遠身首異處。他呆呆地立在那裡，就像是—座黑沉沉的大山。想像著昊天上帝那洋洋得意的樣子，想像著自己的心願未能達到。他憤怒極了。他不甘心就這樣敗在昊天上帝的手下。突然，失去頭的刑天，赤裸著他的上身，把他的兩乳當作眼，把他的肚臍當作口，他的身軀就是他的頭顱。那兩乳的「眼」噴射出憤怒的火焰，那圓圓的臍上，發出仇恨的咒罵，那身軀的頭顱如山一樣堅實穩固，那兩手拿著的斧和盾，揮舞得是那樣的有力。他一隻手拿著盾牌，一隻手舉起大斧，向著天空亂劈亂舞，繼續和眼前看不見的敵人拚死搏鬥起來。看著無頭刑天還在憤怒地揮舞盾斧，昊天上帝心裡一陣顫慄，不由自主地害怕起來。他不敢再對刑天下毒手，悄悄地溜回天庭去。
而在洪荒，黃帝將蚩猶帶回部落歷數蚩尤數十條罪過，判蚩尤斬首之刑，周圍深受蚩尤欺凌的各部落皆是扶老攜幼前來觀看。當蚩尤被押出來時，周圍爆出一片片的為黃帝的叫好聲和對蚩尤的咒罵。刀斧手將蚩尤壓倒，用斧鉞砍去卻是絲毫不傷，只聽蚩尤一陣哈哈大笑：「哈！哈！哈！哈！哈！哈！軒轅小兒，吾乃大巫至深，不要說這平常斧鉞，就是先天靈寶輕易也傷我不得，，哈!哈!哈!哈!!哈！」
黃帝笑道：「汝真以為我殺不死你？」說完便將腰中懸掛的軒轅劍解下交給刀斧手說道：「可用此劍斬蚩尤之頭來。」那刀斧手接過軒轅劍後便向蚩尤砍去卻依然無法傷得蚩尤分毫。眾人一時極為無奈，就在此時只聽半空之上傳來數聲龍吟，眾人抬頭看去，只見一童子趕著五匹龍馬從天而降，蚩尤看見這五匹龍馬卻是臉色大變。只聽那童子上前對黃帝說道：「火雲宮兩位聖皇命我送來五匹龍馬以裂蚩尤，黃帝大喜，忙令眾人將蚩尤的四肢和頭顱繫在龍馬身上，命五位族民向五個方向驅趕龍馬，只聽那五匹龍馬一聲長嘶，便開始向五個方向跑起，蚩尤身上也想起了吱吱嘎嘎的聲響，可就是無法將蚩尤殺死。
黃帝見狀從刀斧手手中去過軒轅劍，對著蚩尤頸部及四肢連接處接連刺出五劍，只聽得蚩尤一聲大喊，整個整個身子被分成六份，就算這樣蚩尤也還未死，只聽蚩尤笑道：「軒轅小兒，你能耐我何，而且那分成六份的屍體竟然有漸漸復合的樣子，黃帝大驚，忙讓人將五匹龍馬趕往六方極遠之地，埋於山下，並由幾位修士聯手布下封印陣法，將蚩尤的六份屍體封印在大山之下，使其用不能復合。
自此黃帝在真正得到了洪荒人族所有部落的認可，成為正真的天下共主。
而就在黃帝剛剛處死蚩尤之後便得到消息，神農的兒子榆罔不服自己接任人皇之位，趁自己剛打敗蚩尤實力損傷之時起兵叛亂。