復辟失敗時，故宮中的景色是倉皇失措的，這可以從溥儀回憶錄中看到，他說：
「討逆軍逼近北京城，復辟已成絕望掙扎的時候，陳寶琛和王士珍、張勳商議出了一個最後辦法，決定擬一道上諭給張作霖，授他為東三省總督，命他火速進京勤王。張作霖當時是奉天督軍，對張勳給他一個奉天巡撫是很不滿足的。陳師傅（指陳寶琛）對張作霖這時寄托了很大的希望。這個上諭寫好了，在用御寶時發生了問題，原來印盒的鑰匙在我父親的手裡，若派人去取就太費時間了。於是，陳師傅當機立斷，叫人把印盒上鎖頭索興砸開，取出了刻著『法天立道』的寶。這道上諭並未送到張作霖手裡，因為帶信的張海鵬剛出城就被逆軍截住了。我對陳師傅忽然變得如此果斷大膽，有了深刻的印象。
復辟的頭幾天，我每天有一半時間在毓慶宮裡。唸書是停了，不過師傅們是一定要見的，因為每樣事都要聽師傅們的指導。其餘半天是看看待發的上諭和內閣官報，接受人們的參拜，或者照舊去欣賞螞蟻倒窩，叫上駟院太監把養的駱駝放出來玩玩。這種生活過了不過四五天，宮裡掉下了討逆軍飛機的炸彈，局面就完全變了。
給張作霖發出上諭的第二天，紫禁城裡聽到了迫近的槍炮聲，王士珍和陳寶琛都不來了，宮內宮外失掉了一切聯繫。後來，槍炮聲稀疏下來，奏事太監傳來了護軍統領毓逖稟報的消息：『奏上老爺子，張勳的軍隊打了勝仗，段祺瑞的軍隊全敗下去了。』這個消息也傳到了太妃那裡。說話之間，外邊的槍炮聲完全沒有了，這一來，個個眉開眼笑，太監們鬼話都來了，說關老爺騎的赤兔馬身上出了汗，可見關帝顯聖保過駕，張勳才打敗了段祺瑞。我聽了，忙到了關老爺那裡，摸了摸他那個木雕的坐騎，卻是乾巴巴的。還有個太監說，今早上他聽見養心殿西暖閣後面有叮叮噹噹的盔甲聲音，這必是關帝去拿那把青龍偃月刀。聽了這些話，太妃和我都到欽安殿叩了頭。這天晚上大家睡了一個安穩覺。第二天一清早，內務府報來了真的消息：張勳已經逃到荷蘭使館去了。
我的父親和陳師傅在這時出現了。他們的臉色發灰，垂頭喪氣，我看了他們擬好的退位詔書，又害怕又情傷，不由得放聲大哭。」
據說，清室擬好了第二次遜位詔書，擬派世續、溥倫持往謁段祺瑞，有人提醒他們說：這樣豈不是落了痕跡。於是改由內務府咨達民國的國務院，把復辟的一切罪名都全部推到張勳身上，一切偽諭概不承認。
張勳這次的政變，簡直就是兒戲，他的失策之處不只是太魯莽，許多手法也欠高明，舉例來講：
一、吝惜官爵名位，復辟後對於身任民國大總統的黎元洪，僅僅給以「一等公」，比起洪憲時期還不如，袁世凱稱帝時，尚冊封黎元洪為「武義親王」，張卻把他再貶一級。張所著重的，是兩個實力派，一個是直系首腦馮國璋，一個是桂系首腦陸榮廷，他冒用黎、馮、陸的名義「合同奏請復辟」，張勳認為全國只應有三個總督，除了自己是直隸總督外，馮國璋是兩江總督，陸榮廷是兩廣總督，其餘全部改為巡撫和都統。對於惟權位名利是圖的軍閥們，復辟這幕戲對於他們毫無好處，反而比不上袁世凱稱帝時期，因此軍閥們為什麼要擁護復辟，他們坐觀成敗，不落井下石，已經很夠「道義」了。
二、張既然重視實力，因此對於沒有兵權和地盤的段祺瑞便不予重視，他卻想不到段的號召力仍然很大。
三、復辟的真正主腦和策劃者，是張勳的參謀長萬繩。萬字公雨，他的叔父在張勳幼年貧困時期，曾接濟過他母子的生活費，有這個淵源，使張和萬的關係更深一層，萬在張勳幕內，極有權力，加以張勳平日耽於酒色，不大問事，自從徐州會議以來，萬便不斷的向張勳報告各方贊成復辟的情報，使張誤以為復辟的時機已經成熟。復辟後萬繩-和胡嗣瑗同內閣閣丞，胡嗣瑗是宗社黨，被潘復介紹，出任馮國璋的秘書長。他們都是暗中促成復辟的重要人物。張勳信賴這樣的狗頭軍師，怎會不失敗，所以事後張勳自己也承認是「上了萬公用的當」。
雖然闖了這滔天大禍，張勳不只沒有滅門之禍，也沒有怎麼大不了的麻煩，不過是一場賭博，把兵權和地盤輸了。據說徐世昌在接到阮忠樞的信後曾向段祺瑞說：「紹軒雖為禍道，但只不過是一莽夫，請念北洋同胞之誼，窮寇莫追。」段點了頭，於是徐電張勳說：「執事既不操柄，自可不負責任，至於家室財產，已與段總理商明，亦不為己甚，昌當力為保護。」
徐世昌雖然承當保護張的家室財產，可是張勳的愛妾王克琴卻跑了。王克琴是民國初年紅絕一時的女戲子，是一代尤物。早在袁世凱、楊士驤先後任直隸總督時代，她便花枝招展，不待通報便出入總督衙門，是賣官鬻爵的好內線。她曾看中兩個候補道祁頌威和孫多祺，據說這兩個人都是美男子，也因為獲得她的青睞而由冷官變成炙手可熱的紅員。癸丑年（民國2年）她在漢口演戲，段芝貴高坐鄂督位子，被她迷得六神無主，乃把她藏之金屋。小段的大夫人忿而自縊。張勳愛色如命，得知這塊肥肉落在小段手裡，乃不客氣地向小段要，小段不敢不允，忍痛割愛。從此王克琴便成為徐州辮帥金籠裡的金絲雀，張原來寵姬小毛子因而鬱鬱致死。張這次北上，也攜王克琴同行，把她留住天津德租界，大家呼為帥夫人。張勳事敗後，這位帥夫人像出籠的小鳥，風流韻事傳遍人間。北京恆利金店一個漂亮的小夥計周子明被她看上了，不久這位小夥計變成了新開張的寶成金店店主，當然由於帥夫人的垂青所致，可憐辮帥這時卻躲在荷蘭使館中見不得人。
小皇帝溥儀的退位詔書如下：
「宣統九年五月二十日，內閣奉上諭：前據張勳等奏稱：國本動搖，人心思舊，懇請聽政等言。朕以幼沖，深居宮禁，民生國計，久未與聞。我孝定景皇后遜政恤民，深仁至德，仰念遺訓，本無絲毫私天下之心，惟據以救國救民為詞，故不得已而允如所請，臨朝聽政。乃昨又據張勳奏陳，各省紛紛稱兵，是又將以政權之爭致開兵釁。年來我民疾苦，已如火熱水深，何堪再罹干戈重茲困累。言念及此，輾轉難安，朕斷不肯私此政權，而使生靈有塗炭之虞，致負孝定景皇后之聖德。著王士珍會同徐世昌，迅速通牒段祺瑞，商辦一切交接善後事宜，以靖人心，而弭兵禍。欽此！」
這個詔書後來只是夾在大總統命令中的一個內務府聲明內：
「大總統令，據內務部呈稱：准清室內務府函稱：本日內務府奉諭：前於宣統三年十二月二十五日欽奉隆裕皇太后懿旨，因全國人民傾心共和，特率皇帝將統治權公諸全國，定為民國共和，並議定優待皇室條件，永資遵守，等因。六載以來，備極優待，本無私政之心，豈有食言之理。不意七月一號張勳率領軍隊，入宮盤驅，矯發諭旨，擅更國體，違背先朝懿訓。衝入深居宮禁，莫可如何。此中情形，當為天下所共諒。著內務府咨請民國政府，宣佈中外，一體聞知，等因。函知到部，理合據情轉呈等情。此次張勳叛國矯挾，肇亂天下，本共有見聞，茲據呈明咨達各情，合及明白佈告，鹹使聞知。此令！中華民國六年七月十七日國務總理段祺瑞。」
溥儀的父親載灃在復辟失敗後的日記裡，曾這樣記下了當時的情形：
「二十日，上門。張紹軒（勳）辭職，王士珍代之，不久，徐菊人（世昌）往見皇帝，告知外邊情形。……二十一日。上門。現擬採用虛下漸停之法。回府。已有表示密電發出，以明態度云云。蔭兄（載澤）來談。
二十三日。上門。回府。……聞馮（國璋）已於南京繼任（代理大總統）云云。張紹軒遣傅民傑來謁。六弟來函……
二十四日。由寅正余起。南河沿張宅一帶開戰，槍炮互放，至未正余始止射擊。張紹軒已往使館避居。
二十九日。初伏。差人贈予徐太傅洗塵餚饌。大雨。世相（續）來談，據雲已晤徐太傅，竭力維持關於優待條件。惟二十五所宣佈之件（指『退位詔』）須另繕改正，今日送交雲。
徐太傅差人來謁。申刻親往訪問徐太傅晤談刻許。
初四日。徐太傅來答拜，晤談甚詳，並代段總理致意阻輿雲。
十二日。小雨，民國於六月以來，關於應籌皇室經費及旗餉仍如例撥給云云。
十四日。遣派皇室代表潤貝勒往迎馮總統。甚妥洽。……
十七日。上門。民國代表湯總長化龍覲見，答禮畢，仍舊例周旋之。……
北京城內的復辟醜劇既然曇花一現地煙消雲散了，討逆軍總司令段祺瑞遂凱旋回京，他這時充滿了再造民國的氣概，那份得意，自非筆墨所可形容。隨同段入京的，有湯化龍和張國淦等。他們一行抵京後，立即前往府學胡同的段宅密商「總統」問題。張國淦建議迎黎元洪復職，以維持正統，可是段的成見極深，張才一開口，段的臉色馬上沉下來，咆哮著說，「這是什麼話，我怎麼還能和他共事？」張說：「和他共事容易，換另一個人來當總統就很難了。他是一個赤手空拳，又受過挫折的人，今後當不會再鬧意氣。」張的話委婉動聽，段倒是很聽得進，不過他對於黎免他總理職這一幕創痛甚深，所以他並不肯接受張的建議。這時，段的身後跑出一個拿手槍的人來，大聲叱罵說：「那個敢替黎某人作說客，就以軍法從事。」說這話的人，原來是討逆軍總部的軍法處長丁士源，張只得報以苦笑，他心裡想我這人生來命苦，黎的左右疑我是段黨，段的左右又疑我是黎黨，以前在黎面前建議起用段為國務總理，黎的親信金永炎也曾摸出手槍來罵我替段做說客，如今段的親信丁士源又罵我是替黎做說客，兩邊不能做人，實在太慘了。
但是，張國淦仍勸段在禮貌上對黎有所表示。他的理由是：「你今天的國務總理，仍是他所任命，他現在還在日本領事館中，理應接他出來。」段接受了張這一點提議，於是派江朝宗到日本公使館接黎回居東廠胡同私邸。黎離開日本公使館後，段就親赴日本公使館，對林權助公使保護黎總統表示謝意，同時也感謝日本在討逆軍行動時的各項幫助。
現在，北京政府面臨一個新問題，黎元洪的總統地位究竟存在還是不存在？第一種說法是黎在復辟政變發生的第二天，就已經引咎辭職了，7月2日黎發表冬電，根據《約法》第四十二條及《大總統選舉法》第五條規定，請馮國璋以副總統代行大總統職權。冬電是黎自己草擬的，所以馮取得總統地位合情合理合法。第二種說法是：冬電只是請馮暫在軍署（江蘇督軍公署）代行大總統職務，不是請馮長期地代下去。這含意是黎在失去自由時期，授權馮暫代，一旦恢復自由，當然回任總統，而馮的代理資格也隨之消失。
當冬電發表不久，上海報紙刊出黎的另外一個電報：
「元洪負國民付託之重，本擬一俟內閣成立，秩序稍復，即行辭職，以謝國人。今既枝節橫生，張勳敢以一人之野心，破壤群力建設之邦基及世界各國承認之國體，是果何事，敢卸仔肩？」
這個電報據說是因為北京電報局在辮子軍的嚴密監視下，不能發出，因此派專人送到上海，交由公府軍事幕僚金永炎發佈的。反黎派認為這個電報是金永炎所捏造，而擁黎派則認為冬電是北洋軍偽造以堵塞黎元洪回任總統之路。
馮國璋在復辟政變討平後，發表通電說：
「現在京師收復，應即迎歸黎大總統入居舊府，照前總理，國璋即將代理職權奉還黎大總統，方為名正言順。」
黎元洪在這種情況下如何能夠復職，所以在他返回東廠胡同私邸後，即通電全國，宣告去職。次日，又發出第二電，詳述去職情由。文云：
「寒電計達。頃聞道路流言，頗有總統復職之說，窮加揣擬，驚駭何極！元洪引咎退職，久有成言，皎日懸盟，長河表誓。此次因故去職，付託有人，按法既無復位之文，揆情豈有還轅之理？伏念無洪夙闕裁成，叨逢際會，求治太急，而躓於康莊；用人過寬，而蔽於輿凡。追思罪戾，每疚神明。國會內閣，立國兼資，制憲之難，集思尤貴。當稷下高談之日，正沙中忿語之時，縱殫慮以求平，尚觸機而即發；而元洪揚湯弭沸，膠柱調音，既無疏浚之方，竟激橫流之禍，一也。
解散國會，政出非常，縱謂法無明條，鄰有先例，然而謹守繩墨，昭示山河，顧以懼民國之中殤，竟至-初心而改選，格蘆縮水，莫遂微忱；寡草隨風，府隳特操。二也。
張勳久蓄野心，自為盟主，屢以國家多故，曲予優容，遂至乘瑕隙以激群藩，結要津以徼明令。元洪雖持異議，卒惑群言，既為城下之盟，復召奪門之變。召峰螫指，引虎糜軀。三也。
大盜移國，都市震驚，撤侍衛於東堂，屯重兵於北闕。元洪久經驗浪，何憚獰飆？顧憂大廈之焚，欲擇長城之寄，含垢忍辱，貯痛停辛。進不能登合授仗，以殄凶渠；退不能闔室自焚，以殉民國。縱中興之有托，猶內省而滋慚。四也。
輕騎宵征，擬居醫院，暫脫身於塞庫，欽奮翼於澠池；乃者鬧人者不通，偵騎交錯，遄臻使館，得免危機。自承復壁之藏，特栗堅冰之懼，亦既宣言公使，早伍平民，雖於國似無錙黍之傷，而此身究受羽毛之庇。五也。
凡此愆尤，皆難解免。一人叢脞，萬姓流離。睹鋒鏑而痛傷兵，聞鼓鼙而慚宿將。合九六而莫鑄，投四裔以何辭！萬一矜其本心，還我初服，惟有杜門思過，掃地焚香，磨濯餘生，懺除夙孽。寧有辭條之葉，仍返林柯；墮溷之花，再登茵席。心肝倘在，面目何施？……況馮總統江淮坐鎮，夙得軍心；段總理鍾篪不驚，再安國本，果能舉左摯右提之實，寧復有南強北勝之虞？
至於從前兵諫，各省風從，雖言愛國之誠，究有潰防之慮。此次興師討賊，心跡已昭，何忍執越軌之微瑕，掩回天之偉績，兩年護國，八表齊功，公忠既已同孚，法治尤當共勉。若復潔短衡長，黨同伐異，員嶠可到，而使之反風；宣房欲成，而為之決水，茫茫慘黷，豈有寧期？鼎革以還，政爭迭起，凡茲兄弟鬩牆之事，皆為奸雄竊國之資。倘諸夏之偕亡，詎一成之能藉？殷鑒不遠，天命難謀，此尤元洪待罪之軀所為垂涕而道者也。勉戴河間，奠我民國，慚魂雖化，枯骨猶生；否則荒山越翳，縱熏穴以無歸；窮海田橫，當投荒而不返。攄誠感聽，維以告哀。」
黎元洪黯然回到東廠胡同的第三天，7月16日發生了一樁意外事件，原來黎每天起床很早，他的習慣是6點多鐘在花園散步，雖在日本使館寄居時亦如此。16日早上，黎照例早晨散步，忽然看見一個陌生大漢，手持利刃在園外探頭探腦。這天黎很機警，立刻感到這件事太不尋常，來者可能是刺客，於是乘對方沒有注意到，悄悄地躲到花廳去。果然來的惡客已進了園門，黎的衛士發見，大呼有刺客，刺客則舞動大刀，向迎面來的衛士砍去，一連砍死了正目王鳳鳴、護衛馬占成、連長賓世禮三人，還砍傷了伍長李保甲、衛兵張洪品兩個衛士，然後飛步逃走，逃到東口小巷，才被一個帶槍的衛士開槍把他打死了。
堂堂的大總統官邸發生了如此嚴重的血案，自然是北京城內的一樁大案，軍警趕來勘查，很快就查出兇手的來歷，原來他竟是黎宅的衛隊排長，山東曹州人，姓王名得祿，據說他是患有神志失常的精神病人。警察局的公報說：黎的衛士曾在被火焚燬的張勳宅內搶東西，因分贓不勻，發生內哄，互相仇殺。公報又說黎宅衛隊共有300餘人，是黎總統用私人名義招募的。同時特別強調這件血案和政治無關。可是這一強調卻不能自圓其說，因為黎的衛隊中，不可能用一個患精神病的人做排長，既然兇手患了精神病，又怎麼會與搶東西分贓不勻有關。這和兩年前搜查蔡鍔寓邸一幕頗有異曲同工之妙。
黎自兇案發生後，不敢留居東廠胡同私邸，他先把張國淦找來商量，黎對張說：「現在怎麼辦？我變成下台總統，可是又走不了，像今天這種情形，我這條命早遲要斷送了的。」張說：「他們說兇手有精神病，是分贓不勻而互相殺戮，你就讓他們這麼說好了，既不能爭辯，也不必聲張，因為事情再鬧僵了，你更沒有出京的機會。」黎說：「但是我仍以早日離京為上策，愈早走愈佳。」張說：「這件事如果和老段要求一定辦不到，還不如等老馮來京後，和他磋商，這是心理作用，馮不會喜歡北京城裡有兩個總統，因此一定會同意和幫忙的。」
黎請張陪同遷到法國醫院暫住，段祺瑞借口黎的衛隊分子複雜，就派江朝宗解散了黎的衛隊，另派軍警保護黎宅。過去黎曾被袁世凱軟禁瀛台，屢次要求回湖北黃陂原籍，袁都說要和他朝夕商談時政，不放他南行。現在他宣佈下野，想去天津或青島做寓公，段祺瑞雖然堅決不願和他朝夕商談時政，可是卻也不放他出京，他發覺自己再度變成了政治俘虜，陷身在段的樊籠中。
和北京黎宅兇案遙遙相對，上海也發生了情節離奇的奪印案。原來張勳復辟時，黎托庇日本使館，曾密令總統府軍事顧問丁槐攜帶「中華民國之璽」、「榮典之璽」、「冊封之璽」、「大總統印」、「陸海軍大元帥印」五顆印前赴上海。丁受命到上海後，住在三洋涇泰安找。7月13日他發表談話，否認黎有冬電，他說總統未委託馮國璋代行總統職權，只任命馮為討逆軍總司令。
丁槐帶了總統五顆大印抵上海的消息，立刻傳到馮耳裡，7月14日馮發表寒電奉迎總統復職，同時又派副官長何紹賢到上海向丁索印。丁見何後，拒不交印，他寫信答覆馮說此行是呈明元首，冒險護印來申，未有元首證狀，不敢私相授受。他否認黎有寒電命他交出印信。他在信中說：
「昨由軍署抄來元首寒電，命槐即日將印信賚京匯交總理轉呈鈞座。奉電之下，不勝惶惑。寒日並無京電，元首是否自由？送京既恐受欺，賚寧復為抗命。思維再四，不得不仍候元首親筆，以定行止。」
丁槐在泰安棧屢次接到匿名恐嚇信，同時發覺有人在暗中監視他的行動，他感到大印會被強奪。乃由泰安棧搬到外國人所開的江西路客利飯店，整日不敢外出。那時中國政府不能在租界捕人，丁不出門一步，綁他的票是不可能的。7月20日夜半，英國會審公廨忽然派人把他捕去，並且在房中搜到了五顆印信。次日即將丁槐引渡。原來馮命令淞滬護軍使盧永祥，叫他向上海領事團交涉，說是丁槐潛藏總統大印，請求引渡，上海領事團接受當地軍政長官的要求，於是採取行動。
丁槐字衡三，曾在雲南任職，是軍界的老前輩，人都稱為丁老前輩。被捕引渡後，便以盜印罪名被解到北京候審，抵京後不久即獲釋放。
在此以前外交總長伍廷芳也攜帶印信從北戴河到了上海，以上海交涉員公署為臨時辦公處，發表陽電（7月7日），否認北京偽外交部，通知各國繼續行使外交總長職權。伍曾以代理國務總理身份副署命令免去段的國務總理，因此段恨之刺骨。段所提的理由，是說伍已解除了代理國務總理兼職，當然也同時解除了外交總長本職。所以段以國務院名義通電否認伍的外交總長資格，聲明他所辦理的外交一概無效，並請馮國璋就近制止。可是伍的外交總長資格是無法否認的，他是在張勳抵北京的同一天（6月14日）化裝離開北京，後來李經羲組閣並未任命新外交總長。所以伍的外交總長職務，從來沒有在官方文件上解除過。
馮國璋接到段祺瑞的電報後，就照轉給伍廷芳，勸伍到天津辦公，因為天津已成立了「國務院臨時辦公處」，如果不願往天津，就請將印信退還。這個電報馮稱伍為「秩庸先生」而不呼總長官銜。伍既然和段有矛盾在先，當然不會去天津，同時也拒不交印。馮、段就用壓力強迫上海交涉員朱兆莘，拒絕伍借署辦公。7月9日，馮以代總統名義補下一道命令，解除伍廷芳的處交總長職務，伍只得交出了印信。