北京政府於6年3月14日正式公告和德國斷絕外交關係，照會內容如下：
「關於德國施行潛水艇新計畫一事，本國政府，本注重世界和平，及尊重國際公法之宗旨，曾於二月九日，照達貴公使提出抗議，並經聲明萬一出於中國願望之外，抗議無效，迫於必不得已，將與貴國斷絕現有之外交關係等語在案，乃自一月以來，貴國潛艇行動，置中國政府之抗議於不顧，且因而致多喪中國人民之生命。至三月十日，始准貴公使照復，雖據稱貴政府仍願議商保護中國人民生命財產辦法，惟既聲明礙難取消封銷戰略，即與本國政府抗議之宗旨不符，本國政府視為抗議無效，深為可惜。茲不得已，與貴國政府斷絕現有之外交關係，因此備具貴公使並貴館館員暨各眷屬離去中國領土所需之護照一件，照送貴公使，請煩查收為荷。至貴國駐中國各領事，已由本部令知各交涉員一律發給出境護照矣。須至照會者。」
黎元洪同時佈告全國云：
「此次歐戰發生，我國嚴守中立，不意接本年二月二日德國政府照會，德國新定之封鎖計畫，使中立國商船從是日起，在限定禁線內行駛，諸多危險等語。當以德國前此所行攻擊商船之方法，損害我國人民生命財產，已屬不少，今茲潛艇作戰之計畫，危害必更劇烈。我國因尊崇公法，保護人民生命財產起見，遂向德國提出嚴重抗議，並聲明如德國不撤銷其政策，我國迫不得已，將與德國斷絕現有之外交關係。在我國深望德國或不至堅持其政策，仍保持向來之睦誼，不幸抗議已逾一月，德國之潛艇攻擊政策並未撤銷，各國商船多被擊沉，我國人民因此致死者，已有數起。昨十一日據德國正式答覆，礙難取銷其封銷戰略，實出我國願望之外。茲為尊崇公法保護人民財產計，自今日始，與德國斷絕現有之外交關係。特此佈告。」
中國政府宣佈與德國斷絕國交同時，宣佈收回天津和漢口的德國租界，解除中國境內的德軍武裝，停付德國賠款和欠款。對德國僑民則仍表示友好，在中國各部門服務的德國人一體留用，各地德國商人照常營業，傳教士照常進行宗教活動。德國公使辛慈下旗歸國時，黎元洪還贈給他許多珍貴的禮物。辛慈於3月27日過上海返國時，上海官方還派人到車站迎送，兵士舉槍致敬，軍隊奏國樂如儀，一切禮節就和未絕交以前一樣，正應了中國一句傳統的俗語：「君子絕交不出惡聲」。
中國和德國絕交之後，中國政府應該歸還德國的賠款，以及欠款就都停止交付，把這些錢提存中國銀行。荷蘭駐華公使公然送來了一個照會，聲稱他受德國政府的委託，代管德國在中國的利益，中德並未宣戰，中國政府不能適用對待敵國的辦法，沒收德國的利益和財產。英、法兩國的駐華公使則要求將上述款項提存外國銀行。
對德絕交令下後，黎元洪鬆了一口氣，他認為對德的一篇文章已經做完了，可是在段祺瑞而言卻認為這個問題只走一半的路，還有另一半宣戰問題沒有做。所以黎、段兩人的惡化關係，並未因對德絕交而緩和，反而因此更為惡化。因為段認為對德絕交案是第一步，第二步是對德宣戰案。梁啟超首先發表《絕交後之緊急問題》一文以鼓吹對德宣戰。可是，全國各地反對對德宣戰的空氣非常濃厚，3月13日康有為元電，3月14日張勳寒電，3月16日王占元諫電，都是一片反對之聲。康電激動地說：「請懸吾目於國門，以視德艦之入。」居然以伍子胥自居。上海商界聯合會通電反對參戰，全國各地商會紛紛響應。馮國璋於11日離京南返，也有電報來反對參戰。段質問他為什麼出京後與在京時的言論前後不符，他回答說，業經查明，反對參戰的電報是由新聘秘書伍憲子擬稿發出的，不能代表他本人的意見。這是一件荒唐可笑的事情。伍憲子是康有為的門徒，可能受了康的指使，慫恿馮反對參戰，但是電報已經用馮的名義發了出去，又怎樣能夠說不能代表他本人的意見呢？
段祺瑞的本意也是為國家利益打算的，他之所以堅持對德宣戰，是受了協約國必勝的影響，認為如果不參戰，戰後便分不到勝利的果實。各地軍閥們反對參戰，是因為怕一旦參戰後，勢必要拋棄了地盤、權位、財富和嬌妻美妾，還要率兵遠赴歐洲打仗，敵人又是最能打仗的德國陸軍，所以軍人們都和段唱了反調。黎元洪則是和段意氣之爭，他的左右告訴他的儘是不利於段的資料，這些資料也都是事實，所以黎對段的參戰案便持反對意見。
段的「親日」和「參戰」是怎樣形成的呢？
段親日是受曹汝霖的影響，曹汝霖被稱為新交通系領袖，他說服段的理由是：「英、美雖強而遠，遠水難救近火，袁項城外交失敗在此；日本近而強，中國內政問題未有不得日本支持而能成功者。袁捨近圖遠，忽視日本而親英，結果日本反對帝制，袁遂失敗。」他這套理論似是而非，可是卻打動了段。
後來，段聽了日本公使一席話更受影響，日使說：「世界上任何國家，未有不安內而能攘外者。中國政府倘欲實現統一，日本願借款和供給餉械，先成立模範軍（註：就是後來的參戰軍）為中央直接之武力，借可作統一中國的力量。」段聽了大為感動，他自認是袁世凱的繼承人，始終沒有放棄由北洋系統一中國的美夢。同時他也知道舊的北洋系已腐化到了極點，督軍團只是搖旗吶喊，相互利用的工具，如果想以武力統一中國，既無可用之兵，又無可用之財。如今日本人打中了他的要害，願意支持他武力建軍統一中國，豈不是正中下懷。這就是段祺瑞親日的原委。
至於對德問題，日本初是不贊成中國對德絕交的，因為中國這樣做是尾隨美國，日本頗有醋意，所以日本一再告訴中國如要和德國絕交，不必先談條件。到了中國和德國絕交後，美國深感滿意，認為中國這樣做已經很夠了，不必再進一步對德宣戰，日本人獲知美國意思，就反過來極力運動中國參戰。日、美在中國的相對態度，正好像黎、段對德問題的態度一樣，你贊成的我就反對，我贊成的你也反對。
黎認為對德問題只應做到絕交為止，反對採取進一步的宣戰步驟。有一天，段邀請徐世昌、梁啟超、王士珍等同到公府向黎討論對德宣戰的利害關係，並且請黎宣示其反對宣戰的理由，黎說：「我對這個問題是沒有成見的，但是我認為少數應服從多數，現在輿論界都反對宣戰，我們不能不予以重視。」平日素以輿論權威自命的梁啟超接著說：「輿論？什麼輿論？我就是輿論界之一人，但我就是堅決主張宣戰的。」黎把眼光望住了王士珍說：「軍界也不贊成。聘老就是一個。」王士珍被黎抵得毫無閃躲的餘地，只得含糊其詞地說：「德國陸軍世界第一，如果德國戰勝，事情就難辦了。」
事實上，此時黎、段兩人的對立已經發展到水火不能相容，黎的軍事幕僚們正在竭其所能地進行著倒段的陰謀。哈漢章利用前清末年與馮國璋在軍咨府共過事的關係，極力慫恿黎採取聯馮制段的策略。蔣作賓與張作霖有密電往來，極力誘惑張擁黎倒段，允許事成之後給以更大的權力地位作為報酬。蔣的密電被段查出來，曾怒不可遏地下了一道逮捕蔣的手令，由於有人勸他慎重考慮，這道手令才沒有發佈下來。段原是看不起張作霖的，從此也就不能不予以重視，因此派人到奉天進行聯絡工作。
3月27日，廣東督軍陸榮廷繼馮國璋之後到了北京，這是護國戰爭後西南派軍人親自到北京來的第一人。陸是由上海取道津浦路北來的，22日在南京會見了馮國璋，24日火車經過蚌埠時會見了倪嗣沖，倪陪同他到徐州會見了張勳。張勳和他早年曾在蘇元春營中同事，因此，把他當作親密的友人，親自到車站來迎接。張勳十分感慨地說：「咱們弟兄倆多年不見面，當年的老同事只剩下了咱們倆，而咱們倆也都是老頭子了。」他情意殷殷地邀請陸榮廷下車到巡閱使署盤桓幾天。當到達巡閱使署大花廳的時候，張勳就行著前清同寅見面的跪拜大禮，陸只得也跪了下去，在舉行宴會的時候，倪談到他反對對德宣戰的一大套理由，並且請陸表示意見。陸說：「軍人以服從為天職，對外交問題不應當表示意見。」倪聽了很掃興地說：「干帥（陸）打起官話來，我們就沒有什麼話好說了。」張看見局面尷尬，遂轉變空氣說：「今天老兄弟相聚，不談國事，只敘舊情。」
陸榮廷到了北京，於28日謁見黎、段，29日到清宮會見溥儀。因此復辟派散佈謠言，說他「獻女為妃」和「宣統皇帝賜以內帑三萬」。段對陸寄以很大的期望，想把他拉過來作為在西南各省中的得力爪牙，像以前拉攏龍濟光一樣，黎對陸也很重視。國會議員因為陸有「再造共和」的虛譽，特於4月5日在迎賓館公宴招待。陸在北京的時期，所受到的熱情招待還遠過於離開北京不久的副總統馮國璋。
陸逢人表示他不貪名、不貪利、不爭權位，不要地盤，願意「解甲歸田」。他推薦部下陳炳-、譚浩明繼任廣東、廣西兩省督軍；示意北京政府撤換與他不能合作的廣東省長朱慶瀾。黎、段都懂得他所需要的是更高的權位和更大的地盤，便於4月10日發表命令任陸為兩廣巡閱使，並根據他的請求以陳炳-為廣東省督軍，譚浩明為廣西省督軍。這是繼長江巡閱使張勳之後的第二個巡閱使。但是張勳不能節制長江各省，陸榮廷卻能節制廣東、廣西兩省。從此，巡閱使就成為駕乎督軍之上的一個大頭銜了。陸在巡閱使命令發表後，沒有和任何人告別，悄然回到南方去了。
4月18日，北京政府因財政總長陳錦濤有接受賄賂的嫌疑，下令免陳的職，並移送法院處理。這是內閣閣員因犯刑事案受到法院逮捕的第一人。黎堅決主張提出袁世凱「嵩山四友」之一的李經羲繼任財政總長，黎看中李不是沒有原因的。原來李是「合肥相國」李鴻章的侄兒，與淮軍系統有歷史關係，與張勳的關係更深。黎原來想借重北洋派元老徐世昌或王士珍代替段組織內閣，以免引起北洋派的反感，但是這兩個人都不敢接受，因此不得已而求其次，想把這個有實力背景的老官僚擺進內閣中去，以便在適當時期派他由代理總理轉為正式總理。這一財政總長提名案，在4月27日通過眾議院。