昊天經過巧語勸說，終於借得素色雲界旗，便是想招使上界仙人下凡幫助軒轅消滅蚩尤之亂，插足人族之事。
卻說天地初開時，誕生了一桿旗，名為五方旗，是防禦中靈寶，先天有靈，妙用無窮。這五行旗成形時，卻是化作五旗，皆為防禦少有的靈寶。分別是中央戊己杏黃旗，東方青蓮寶色旗，南方離地焰光旗，西方素色雲界旗，北方玄元控水旗。那瑤池金母得素色雲界旗，便得西方庚金氣運，卻是展旗就能聚仙，因此又名聚仙旗。黃清造的五行旗便是他們的代替品。
受王母之命，被聚仙旗招來的是九天玄女，算是女仙之首。
昊天帝道：「那蚩尤是大巫之身，你可將此劍帶下，贈與人皇。」
九天玄女接過，應道：出殿外，出了天宮，向地界而去。那玄女到了逐鹿之野，軒轅軍中，見那人皇軒轅一臉英氣，相貌不凡，不知怎的心中生出無邊情愫來。那軒轅是土德之身，先天九陽之體；九天玄女卻是六陰之體，兩者自然是想吸引。他們自然而然號了起來。
昊天給軒轅的劍，也不是凡劍，乃是當年帝俊所煉的屠巫劍。采星辰之精煉成，鋒利非凡。是日，軒轅和蚩尤再次戰在一起。軒轅雖然修為不比蚩尤，但屠巫劍卻是輕易就把蚩尤傷了。
蚩尤見大巫之軀竟然擋不住軒轅的劍刃，大怒不已，吼叫連連，卻見那八十個銅頭鐵腦的怪物圍上前來，蚩尤大叫道：「都天神煞，巫血分身，合體！」只見一陣血霧瀰漫，將蚩尤和那八十個怪物籠罩其中。軒轅和玄女見血霧瀰漫，趕緊退開，並命大軍撤後。軒轅一方後撤，但蚩尤大軍見沒有了頭領，正不知
所錯，血霧一下擴展開來，將大軍遮掩，頓時從中傳出陣陣慘叫聲。軒轅連忙命大軍再次後退，不久，血霧之中沒了慘叫之聲，那血霧一下子向中心之處聚集。
原來是蚩尤以鮮血為引，施展巫族秘法，真正成銅頭鐵骨，屠巫劍也傷不得了。這時候，蚩尤狂叫連連，揮起化血神刀，殺得軒轅大軍死傷無數。
這時，一道人唱諾而來：「鴻蒙之初有真仙，見過盤古來開天。洪荒億載苦修道，玄仙不敢在我前。」
這道人好大的口氣，竟稱自己是混沌未開的得道真仙，還誇除去聖人，沒有人再敢排在他前面。到這道人看是慢慢走來，但一眨眼就到了跟前，端是要得。近前一看，卻是一個面型消瘦，穿一簡樸青色道袍的年青道人。眾人都不大相信他有什麼大本事。
不過，軒轅在看到道人後，卻是很歡喜，慌忙跪拜道：「弟子軒轅拜見老師。」
這正是黃清前來。黃清點點頭：「起來吧！你現在為人皇，卻是不能再拜我了。今次前來，我是要替你降伏蚩尤的。」
軒轅謝過大恩，對黃清恭敬有加，黃清也不理，便向蚩尤走去。
眾人聽到軒轅喊黃清老師，大吃一驚，轉瞬也就明白眼前少年是何人了。鴻蒙道人是現在六位聖人的師弟，神通廣大，降服一個小小的大巫，自然不在話下。當然這個「小小」是相對於黃清來說的。
眾人但見黃清走到蚩尤身前，微微一笑。那蚩尤看見黃清走來，雖不知道黃清為何人，他卻是感到面前的人如洪荒大地般，威壓股股而來。巫族人皆是好勇鬥狠之人，蚩尤也不管太多，拿著化血神刀心下一橫，就劈打起來。那一刀威力竟劈得空間都碎裂，軒轅眾人禁不住齊齊後退，臉色大變。黃清也不看到勢，混沌珠祭起，兩人就這樣突然消失在眾人面前，然後又突然出現，就像從來沒消失過一樣。
不過，蚩尤卻是躺在地上動彈不了，而化血神刀落在一邊。其實在那瞬間，蚩尤已被黃清用大法移到混沌珠裡，黃清一指點在他身上，他便法力被封，再一指點在化血神刀上，剎那間，黃清防佛再次置身洪荒太古，見到十二個巫人不停吼叫，最後成一個拿著巨斧狂劈的大漢。黃清領悟著，十二都天神煞大陣，在腦中再次演練著。
黃清也不管眾人，身形一閃逕自而去，蚩尤留給他們善後。眾人心中具是大驚，准聖已是如此存在，幾近無敵，那傳說中的聖人，不知厲害到什麼程度。當時，也沒人顧及黃清的離開，只在想辦法破大巫之體，除去蚩尤。
東海蓬萊島鴻蒙殿中，黃清坐在蒲團上，雙眼緊閉，左手持鴻蒙鐘，右手持開天斧，五行旗繞著週身神秘地旋轉。頂上慶雲湧現，現出三花，花上又有一灰濛濛的混沌珠懸浮。其實，黃清三魂七魄已合成一道人影出現在其身體內，那人影也是黃清。體內充滿混沌之氣，只見黃清用混沌之火不斷煉化一拇指大小的鮮血，正是共工身隕後黃清所得到的盤古精血。
當黃清煉化盤古精血之後，整個人又轉到混沌珠世界裡，再次進行未成工作。黃清以身為鼎，用蠶絲玄鐵煉一十二桿旗，布十二都天大陣，吸收精血。只是瞬間，那旗桿就吸收絲絲元靈而來，黃清感到無數信息湧向元神，，混沌之氣也是越旋越快，「轟」一聲爆響，黃清終於聚出了盤古真身，但卻是很弱小，還不大真實。
太極生兩儀，兩億生四象，四象化八卦，其中又有三才，五行，六合，七星，還有之後的九宮，十絕等等，乃至於天地萬物。道生一，一生二，二生三，三生萬物。最初的道，便在這混沌之中。盤古開混沌，清者為天，濁者為地，再以自身演化萬物。這便是道！
從合到分，從分再到合，便是大道，是為合道。
黃清在合道，鴻蒙鍾、五方旗、開天斧在不停旋轉、翻滾，到他最後合道時，這三件他成道之寶，便為更甚於接引十二品蓮台、准提七寶妙樹的法寶。它們是乾坤鼎所出，混沌珠所孕育，乃是先天靈寶。
合道，是一個漫長的時間，但黃清卻可以預見了。此時，他成道已不可避免，即使聖人也不可能殺死他，只可以把他封印鎮壓，他的法力神通幾可比擬聖人，欠缺的只是道行罷了。
黃清也沒停止修煉，他沉浸在大道中，悟，不停地悟，他悟道的同時，也把道化進成道之器中，截天道而成靈寶。以自身為混沌，開天闢地，然後演化洪荒，造化萬物，大道所在。
修行不知歲月，黃清悟道當中，神識感應又有一份功德加身，便知軒轅已辭去人皇之位，功德圓滿，到火雲宮修行去了。這卻是因為黃清算出軒轅劍已經出世，此劍本就是那屠巫劍，在軒轅到太清天兜率宮拜訪老君之時，被老子放到八卦爐中，加入人皇功德和軒轅九陽之血重新煉製而成。爐中出了兩把劍，一把是聖道之劍軒轅劍，那軒轅劍長三尺，劍身兩面，一面刻日月星辰，一面刻山川草木，劍柄兩面，一書漁牧農耕，一面書聖人教化之篇章；另一把名為騰空，也為人教聖劍。軒轅退位，將皇位傳給了顓頊，而那把騰空劍也成了顓頊的佩劍。
老君於此明白，以教化功德可演化後天聖器，不比先天靈寶差。便將此事告知元始，至於通天，關係不深，並沒有說。
而黃清早已知道教化功德之重要，他收軒轅為徒，便有此打算，因此他得到的好處並不比老君少。他也不想浪費這份功德，是想等成聖以後，煉出一功德聖器。
又過了些年，盤古真身已凝聚完成，此時離封神時間僅一百年而已。