號稱太空航母的黑暗戰艦，艦體的內部結構主要分為六個部分，依次分別是：指揮塔、戰艦甲板、艦炮台、中部船艙、核心系統室和動力區。指揮塔是黑暗戰艦甲板的上層建築，黑暗船員們在這裡指揮控制著整艘黑暗戰艦，而雷達和通訊設備也安裝在這裡。戰艦甲板武裝著數量眾多的太空導彈匣和激光炮，而戰艦甲板下面是錯綜復雜的艦內通道。船炮台是黑暗戰艦主要的攻擊力量，至於動力區卻是擁有三十多部曲引擎，以正反物質反應為動力，從而給黑暗戰艦源源不斷地提供能量。中部船艙是一些黑暗船員的生活區，實行部分軍事管制，核心系統室位於黑暗戰艦的中後部，全艦的核心都在這裡，假如遭受攻擊破壞，這對黑暗戰艦來說將是一個致命的打擊。
考慮到，核心系統室的重要性，看完地圖以後，趙小智就建議說：“好！我們現在就前往核心系統室，只要那裡被破壞了，黑暗戰艦也就將徹底毀滅。”
對於趙小智的決定，王小可表示認同說：“好主意！我們現在就前往核心系統室吧！”
既是要擒賊擒王，王小可倒是樂意充作先鋒，前頭帶領之下，其他同伴也就跟在後面作為支援。於是，在走到一個通道的岔路口，大家突然現，前面正好有兩個黑暗士兵正在把守關口。因此，為了順利實施突破，王小可在掂腳以後，他隨即使出了一招：天元破魂刀，飛步奔襲之後，王小可就大力舉起了屠龍寶刀。
不過，就在刀鋒利落的瞬間，這時，後邊卻是傳來了趙小智的聲音說：“小可！你先等一下。……”
有鑒於此，一陣凌空暈倒以後，王小可倒是回頭抱怨說：“小智！你到底要干什麼啊！沒看到，我要殺了那兩個黑暗士兵嗎？……對了，這兩個人怎麼像木頭人一樣，還站在那裡一動不動？真奇怪啊！”
趙小智本以為那兩個黑暗士兵會使用手中的機槍進行必要的反擊。可是，面對王小可的沖鋒攻擊，兩個黑暗士兵一直是蚊絲不動，所以倍感奇怪的趙小智這才馬上阻止了王小可的屠殺行動。結果，群策群力之下，五個孩子就一起圍在兩個黑暗士兵的面前搞起了研究活動。
揮刀佯攻之下，王小可隨即嚇唬說：“我殺！我殺！我殺殺！……我殺！我殺！我殺殺！……哈哈！小智！這兩個黑暗士兵不會是瞎子和聾子吧？”
看到眼前奇異景象，李小櫻和莊小月也詢問說：“小智！這到底是怎麼回事呢？”
思索以後，趙小智突然領悟說：“原來如此！看來黑暗戰艦裡的邪惡生物都是依靠接觸來現敵人的存在。這就如同蟻**裡的螞蟻一樣，只有當同伴遭受攻擊，其他同伴才會現敵人的存在，從而趕來增援。所以，只要我們不碰觸到這些黑暗士兵的身體，那麼，這些邪惡生物就永遠現不到我們，而我們也可以暢通無阻地前往核心系統室了。”
聽到趙小智的解釋，眾人馬上認同說：“恩！還是小智說的有道理。”
正因為如此，既是看穿了這些黑暗士兵的弱點，收起魔法裝備的孩子們自然是要將計就計，並且大搖大擺地從兩個黑暗士兵的面前走進前面的通道了。
然而，等到煩人的幻覺徹底消失，半信半疑的黑暗士兵就向身邊的戰友詢問說：“你剛才有沒有看到有五個孩子已經入侵黑暗戰艦呢？”
雖然自己也曾看到類似的幻覺，但是另外一位黑暗士兵還是反駁說：“那不過是你的幻覺，因為我們的防御系統是絕對無敵的。”
導彈防御盲目科技，面對馬奇諾防線的轟然倒塌，思維定式的黑暗士兵們，這一回，可是完全沒戲。因此，處處闖關之下，眾人的進攻行動那順風。於是乎，如同混入蟻**的這些孩子仿佛被視作同伴，而懷疑自己已經得了幻覺症的黑暗士兵們，無一例外地都對這些入侵者給予放行通過。不過，游走在軍事重地的孩子們，雖能騙過黑暗士兵的眼睛，但卻騙不過無處不在的間諜微星。而在緊密跟蹤之下，入侵者的一舉一動早就通過影象數據，傳送到了黑暗戰艦的指揮塔所在的監控屏幕。
監視之中，負責監控的黑暗船員就趕緊匯報說：“報告英明的黑暗船長！黑暗戰艦的內部出現了五個入侵者，從年紀上看都是十二歲左右的地球人。”
什麼？地球人？怎麼可能呢？黑暗戰艦怎麼可能出現地球人呢？莫非，是剛才從兔子王國的民用宇宙飛船潛入到了黑暗戰艦。不過，根據邪惡龍神王大人所提供的資料上看，此次任務的防范重點，就是要阻止五個魔法師前往火星，從而防止天空之珠落入魔法聯盟的手中。如果這五個地球人正是邪惡龍神王大人所說：五個非常厲害的魔法師的話，那麼，黑暗戰艦現在的處境就非常危險了。想到這裡，突然間，黑暗船長馬上神情緊張起來，之後，它就命令說：“不好！趕快傳令全艦官兵加強戒備，你們盡快調查這些孩子的來歷，看他們是不是魔法世界裡的魔法師。……”
因為黑暗戰艦出現了緊急情況，所以屏幕開啟以後，這時，一位負責軍事管控的黑暗軍官卻是疑問說：“黑暗船長！這是黑暗戰艦的例行演習嗎？還是真有入侵者已經突破了黑暗戰艦的無敵防御系統？”
與此同時，負責調查的黑暗船員馬上匯報說：“報告英明的黑暗船長！根據間諜微星從入侵者身上采集的dna樣本分析結果，目前已經確定這些孩子年齡在十二歲左右。而且，經過竊取的魔法聯盟絕密檔案，從公元180年~公元190年的人口出生記錄中，以及dna比對中，目前已經排除這些孩子是魔法世界裡的魔法師。”
聽完匯報以後，黑暗船長那顆懸著的心頓時放松下來，改口之余，黑暗船長隨即不以為意地說道：“沒事！這只是一次例行演習。……”
由於情報上的嚴重失誤，黑暗船長這回是一錯到底。況且，二十一世紀的魔法師，怎麼可能出現在魔法聯盟二世紀的人口出生名單中呢？於是乎，為了保全自己的英明形象，黑暗船長就打算在神不知鬼不覺的情況下，親自動手除掉這幾個毫無反抗能力的孩子。
不過，其中一位黑暗船員認為做法不妥當，它就建議說：“報告英明的黑暗船長！我們要不要把無敵防御系統已經關閉的事情先公之於眾呢？”
既然那五個孩子並未魔法師，收拾起來就很輕松。想到這裡，以為穩操勝券的黑暗船長隨即冷笑說：“呵呵！不用了！我打算親自前往核心系統室去會一會那幾個孩子。”