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軒轅正在禱告間，天忽然降下一朵五色祥雲來，雲有一個美麗的仙女，仙音陣陣，軒轅連忙道：「拜見仙子，不知仙子可是為了軒轅而來的？」
軒轅也和神農一樣，沒有了前生的記憶，所以他認不得眼前這個所謂的仙子就是自己的外侄女了。
玄女露出一絲不可覺察的笑容，正色道：「我乃天皇伏羲的女兒九天玄女是也，剛才父皇吃到了人皇陛下的禱告，知道人皇現在有難，百姓不得安居樂業，民不聊生，特派我來助您一臂之力。」
軒轅大喜，望空而拜：「多謝天皇陛下大恩，天皇陛下總算沒有忘記我們。」
和他一起祭天的人也一起山呼道：「多謝天皇大恩。」
聲勢浩大，直衝雲霄，伏羲看到之後也不由有些激動。
九天玄女道：「陛下有心了，父親知道一定會很高興的，這是父親托我交給您的神兵，此乃當年父親大戰巫族之時所用的神兵，名叫『屠巫劍』。」
軒轅連忙跪下接過寶劍，他慢慢地反寶劍抽出來，還沒抽出一寸周圍的人就覺得空氣一冷，空氣的溫度好像一下子下降了幾十度一樣，軒轅周圍三尺的草地竟然結了一層厚厚的霜。
眾人不由倒吸了一口冷氣，好厲害的劍啊，不愧是天皇所賜的神劍，單這劍氣就可以把人凍死，不用看就知道那劍有多厲害了。
要知道此劍可是阿鼻、圓屠兩把寶劍合鑄而成的，劍身帶有先天殺氣，經過盤天的盤古鼎重鑄，更加精純，品質已經是一把先天至寶了。
此劍曾得伏羲的龍氣滋養，拔出來的時候，竟然有一聲響亮的龍吟，而且劍身金光纏繞，隱隱形成道道龍形，劍身面刻有一條金龍，另一面刻有漫天星辰。
軒轅大由失態地哈哈大笑：「有了此劍，蚩尤的『虎魄』算得了什麼，此劍以後就是我們人族的鎮族之寶了，既然天皇已經把你賞賜給了我，那麼就稱你為『軒轅劍』。」
從此「屠巫劍」就成了「軒轅劍」，此劍在軒轅與蚩尤的戰鬥在大放光彩，不愧「軒轅劍」之名。
軒轅為人皇，金口玉言，既然他封了「軒轅劍」為人族的鎮族之寶，從此此劍就是人族聖器了，天竟然降下一份功德來，軒轅得了三分，而「軒轅劍」卻得了七分。
「軒轅劍」得此大功德，竟然少了一分凶厲之氣，多了一分皇者之氣，讓人有一種想臣服的感覺。
九天玄女交了屠巫劍之後，收起嚴肅的神態，露出了調皮的本性，對軒轅道：「父親說你與蚩尤相鬥非常危險，讓我留在人間一段時間助你一臂之力，你歡迎嗎？」
軒轅大喜，他不知道這是玄女在假傳聖旨，他一時不知說什麼好，口吶地道：「歡迎，當然歡迎，有仙子相助，平定蚩尤指日可待。」
玄女千媚百態地橫了他一眼道：「你可不要對我起壞心思哦，我們是不可能在一起的，要是你對我有什麼心思的話，趁早收起來。」
軒轅的面一下子紅了大半，連連道：「不敢，不敢，我怎麼會有褻瀆仙子了想法呢？」
他本來對玄女還真的有那麼一絲想法的，但是玄女話已在前的，他也就不想自找無趣了，但他不明白玄女為什麼要這樣說。
其實他前世與玄女可是舅甥關係，要是兩人結合，豈不是了，伏羲是不會答應的，而且太一以後回復記憶之後也會反對的，兩人是不可能在一起的。
然而他們真的可以做到對彼此無情嗎，要是真的話，就好了，但是他們注定會有一段孽緣的。
玄女留在人間幫軒轅治兵，留下一部《玄女兵法》，她還教導軒轅部落的人飼養虎、熊、羆等猛獸參加作戰，軒轅部落的人慢慢地扳回了局勢，不再像以前那樣被人打得好像喪家之犬了，而是和九黎部落的人打得有勝有負。
其中軒轅劍也出力不少，蚩尤所以靠著「虎魄」魔刀之利，殺起人來比割韭菜還乾脆，軒轅有了「軒轅劍」之後，「虎魄」的威勢就沒有了，完全被軒轅聖劍克制住了。
論鋒利，軒轅聖劍可是連祖巫之體也可以辟開的主，論屬性，軒轅聖劍的功德之光正是虎魄那凶暴邪氣的剋星。
蚩尤與風伯他們商量如何對付軒轅，他們想到了陣法，風伯和雨師他們合計，花了七七四十九天創造了一個大陣，名叫「風雨迷天陣」。
人在此陣中，如在暴雨迷霧之中，方向不辨，最後只能一輩子死中裡面，是一個非常厲害的大陣。
軒轅的部隊與蚩尤開戰的時候被困在陣中，幸好有玄女相助，造了一輛「指南車」才有驚無險地出了陣。
軒轅非常感激玄女，兩人在一起久了日久生情，玄女雖然知道這樣是不對的，但是她卻無法阻止自己心中對軒轅的仰慕。
兩人於是結合為夫婦，玄女留在人間大約十年，為軒轅生了一個女兒，名為「魃」，魃生的和母親一樣美麗，與父親一樣聰明，深得二人的喜愛。
然而玄女滯留人間的事終於被伏羲發現了，而且他們的結合也請伏羲大發雷霆，事後伏羲把玄女召回天宮，鎖在火雲洞中。
這也不能怪伏羲「棒打鴛鴦」，畢竟他們一個是舅舅，一個是外甥女，他們的結合是的，為此伏羲還把月老罵了一頓。
後來查明是月老的小童調皮把兩人的「姻緣線」牽在一起了，所以才會發生這樣的事，不過後來伏羲想了一下，畢竟軒轅已經轉世過了，兩人已經沒有了血緣關係，也就不再管他們的事了，由他們去。
軒轅與玄女在一起的日子大約十年，也就是三千多天，有的野史中記載「黃帝擁女三千」就是說黃帝軒轅與玄女相處了三千多天而已。
此時以訛傳訛就成了「黃帝御女三千」，把黃帝說成了「前無古人，後無來者」的超級無敵絕世猛男，其實這只是後人亂說而已。
天一日，地下一年，魃很快地出落成一個漂亮的美女，與她的母親玄女有五分相似，相貌卻不比母親差，而且她繼承了父母的優良血統，修煉起來特別快，竟然在十幾年間就成了天仙。
軒轅自玄女回天宮之後，無心再娶其他女子，一心放在和蚩尤的戰鬥和修煉，他的功力也漲得飛快，很快就成了大羅金仙。
他的部落又安定下來了，不再像以前那樣東蹦西跑了，他的部落也在戰鬥中也長起來了，不再像以前那樣對蚩尤無力反抗了。
這年春天，他正在巡視部落的時候，發現部落中有一個美麗的少女竟然穿著一身金色的綵衣，在陽光下閃閃發光，他以為那少女是哪一路神仙。
一問才知道竟然是一個凡人，他驚問道：「那你怎麼穿著神仙一樣的衣服呢？」
那少女道：「好教陛下得知，這是我養蠶用蠶繭織成的。」
軒轅看了一下那所謂的「蠶繭」，以及它們做成的布，發現這種布非常柔軟，不但美觀，還很實用。
那時候的人還沒有真正的衣服穿，人們冬天穿獸皮，夏天就穿樹葉做成的「衣服」，如果把這種養蠶的方法推廣的話，人們不是有衣服穿了嗎？
那個少女正是嫘祖，她給軒轅詳細地講解了如何養蠶，如何讓蠶結繭，如何抽絲剝繭做成布等等，軒轅聽得戰鬥連連。
之後軒轅就讓她把這些方法教給人們，為了讓人們聽從她的指揮，軒轅還與她結為夫妻，於是從那時開始，人們就學會了如何養蠶，萬民有了衣服穿，不再過著衣不遮體的生活了。
然而那時候雖然人們學會了養蠶，但把蠶繭製成布的效率卻很差，其中有一個女子，名叫「嫫母」，嫫母雖然長得相貌醜了一些，但她很聰明，發明了纏絲機和織絲機。
軒轅知道之後，對她大為讚賞，讓她在族中推廣開去，後業在嫘祖的撮合之下，軒轅不計嫫母面貌醜陋，娶了她為次妃。看來我們的老祖宗也不是以貌取人的，現在的人每天都叫著要娶一個美女作老婆卻顯得膚淺了。
另外軒轅還有其他的嬪妃，史記載他有「四妃十嬪」，四妃之中，嫘祖是當仁不讓的正妃，而嫫母卻是次妃，另外還有兩個次妃分別是方雷氏和彤魚氏，這兩個妃子沒有多少記載，其他十妃就更加不清楚了。
這些妃子給軒轅生了二十五個兒子，其中得到姓氏的有十四人，司馬遷的史記之中記載著後世的顓頊、帝嚳、唐堯、虞舜，以及夏朝、商朝、周朝的君主都是黃帝的子孫。
補充一下，由於軒轅之位是神農所傳，炎帝部落與黃帝部落合在一起，因此就把新的部落稱為「炎黃部落」，人民稱為「炎黃子民」，我們都是「炎黃子民」的後代，因此我們就被人稱為「炎黃子孫」。
而西方的人不同，他們的祖先同是女媧所造，但他們的祖先是被准提拐走的「亞當」，沒有受過「炎黃」二帝的教化，所以算不得「炎黃子孫」。