趙子丹和「龍域」的合作正式開始。
「龍域」十分慷慨地貢獻出了他們在香港的秘密基地，然後按照趙子丹的要求對地下部分進行擴建。在國家的力量下，僅僅一個星期就出現了一個佔地數十多畝的地下秘密基地。
基地的外層是厚達三米的金屬牆，並且安裝上了最先進的感應系統，保證任何生命體或者能量甚至精神力接觸這一層牆壁，整個基地就會響起警報。這是基地保密性最大的保障之一，完全在弗瑞德的監視下進行，保證不會出現任何的差錯。
在內層，則是同樣厚達三米的鋼筋混凝土牆壁，這是基地的主要支架。這些支架，將整個地下基地分作三層。地下一層研究的是武器，地下二層進行綜合類研究，電子、能源、基因等等研究室，都建立在這裡。
而地下三層，也是趙子丹心目中最為重要的一層，則是主要研究超能力。在這裡匯聚了各個種類的科學家，所有對超能力研究有幫助的人都可以在這裡看到。
三層的科學家加起來足有兩百多人，是從「龍域」的科研組織「龍腦」和科學院抽調出來的精英。聽說，派駐到這裡的科學家其綜合實力已經遠遠超過了身在北京的科學院。由此可見，上面對這一次合作計劃的重視程度。
在完善了防禦體系之後，趙子丹首先提供了武器和基因方面的資料，為的就是盡快武裝自己的「神域」。當然，對趙子丹選擇的課題，「龍域」方面也是極為滿意。武器，不管在什麼時候，對一個國家來說都具有重大的意義。特別是能源研究組和武器研究組共同研發的「粒子」類武器，對國家來說更是具有舉足輕重的作用。
當然，若是製成武器，粒子類武器同樣是最完美的單兵裝備。粒子武器的那種無堅不摧性，在正面戰鬥的時候即便和火神或者海神這樣的S級超能者對上，也是勝算很大。
只不過在這方面的研究，即便最深入的美國方面也只是有一個皮毛罷了。反倒是激光類的武器，雖然還不成熟，卻已經有了成品。像之前查爾斯的枴杖，其實就是一件激光武器，只不過因為無法解決能源問題，所以當時只能發射三道激光束。
基因，也是超能力研究的一個主要課題。也是「超級戰士」計劃中，兩大訓練內容之一。除了修補人類本身存在缺陷的基因片段之外，還有一種方法就是人為地在基因片段中加入某一種超能基因（異體類超能者所具有的基因片段），或者乾脆嵌入動物基因。
前者的研究已經很是完善，不過對人體的增強效果很是有限，比樸銀姬這樣的先天進化類型的超能者在能力的增長上還要差一些。根據大量數據，基本上肯定這一類型的超能者最終不會超過C級。
而後者，雖然也有不少的成功者，不管是鑲嵌入超能者的基因還是動物的基因，但是失敗者更加多，而且通過這樣的方式製造出來的超能者一般都存在或多或少的缺陷。
可是有一點卻是肯定的，那就是凡是成功的，一般都有著很強的實力。而且，有的超能者力量一覺醒就十分強大。在過往的歷史中，曾經出現過S級的超能者。
另外這種方式，還可能製造出能力十分奇特的X類超能者。比如說美國，在4年前的一次「超級戰士」計劃中，就憑借一段超能者基因，製造出了一名X類的超能者。
這名超能者不但本身繼承了基因片段中原有的「狂化」的能力，這種能力在融合進身體的時候還發生變異，讓這名超能者獲得了另外一種能力——吞噬。
吞噬，不僅僅是吞噬敵人的肉體，還能吞噬敵人的精神力，進而轉化成自己的精神力。
當然這名超能者最後的下場很慘，剛開始的時候在MOS相關高層的默許下他行事肆無忌憚，不斷地在美洲大陸吞噬非MOS的超能者。在不斷的吞噬下，他的肉體力量和精神力都達到了一個驚人的高度。不過也正是因為這種貪得無厭，最後他硬生生被自己強大的精神力給撐得變成了白癡，然後成為了MOS繼續研究的對象。
在基因研究方面，除了「龍域」本身所具有的超能者基因片段之外，研究組還根據在瑞士阿爾卑斯山脈中找到的泰坦身體肌體，進行了研究。當然，在自己研究的同時，研究組還不斷地借鑒來自「眾神之國」的研究成果，進境十分之快。
據研究組的組長，一個有著滿、蒙、漢以及哈薩克四族血統的老科學家的說法，他們可以在半年之內研究出將基因完美嵌入普通基因的方法。按照他的說法，泰坦的基因其實並沒有進行突變，而是進行了某方面的自然進化，並且稱這是「生命之石」造成的功效。
在「龍域」本身的資料庫中，也有相關的案例，只不過那些案例相對於泰坦來說都不算完美罷了。
「超級戰士」計劃的另外一個內容就是精神力訓練。通過各種方式對精神力進行催生、鍛煉。這個內容比之鑲嵌入基因更加地危險，腦域畢竟是人體最為脆弱的部位，細微的創傷都可能對人體造成不可挽回的傷害。
而且即便成功，新生的精神類超能者的精神力都不會太穩定。一般來說，都會存在各種後遺症，其中最常見的一種就是狂化——精神狂化。
精神狂化之後，超能者的精神力會在短時間內提高很多，可是因為缺乏秩序性，所以此時的超能者本身已經無法正常思考。不但如此，他們為了消除精神上的痛苦，會本能地消耗精神力。於是各種精神類的攻擊就會出現，所造成的危險，不管是對自己還是對他人，都是十分巨大的。
當然，也有那種相對安全的方式，只不過效果自然也差得很。能夠製造出E級的精神類超能者就已經是奇跡了。到底是超能者中的貴族，想要人為製造並不是那麼容易的事情。
考慮到這個實驗所具有的危險性和所帶來的種種麻煩，趙子丹並沒有在這方面安排太多的人手，也就是根據現有的一些資料進行整合罷了。是純粹的理論研究！
武器方面，只要研究出來就可以直接配備人員使用，並且讓普通人具有強大的攻擊性。所以這是趙子丹最為重視的一個方面，幾乎每天趙子丹都會詢問一次進度，並且保證全方位資源供應。在資金上更是不餘餘力地。
反正他的錢來的方便，瑞士銀行中的大量呆帳，小日本或者美國佬以及其他曾經對中國製造過巨大傷害的國家、組織以及富豪個人的大量存款，一切所能利用的資源都被趙子丹，不，應該說是弗瑞德利用起來。
若是這些錢用光了，弗瑞德還可以在期貨市場這些來錢快的渠道進行操作，將那些一條條金融巨鱷變成死魚。總之，在資金上趙子丹沒有任何的後顧之憂，根本不要國家一分錢。
對此，「龍域」方面自然是感激非常，即便知道趙子丹本身有著這方面的先天優勢。因為不管怎麼樣，趙子丹根本就是在用自己的錢提供國家進行研究，此中貢獻之大遠遠不是常人所能想像的。
於是，原本和趙子丹之間還有著些許嫌隙的易呈文以及柯冰兩人看向趙子丹的眼神變得溫和起來，特別是前者心頭上的那種危險感覺也消失不見了。
在和政府的合作計劃正常進行的同時，趙子丹也在回來的劉鐵男等十三人身上開展了「超級戰士」計劃。
當然，為了不致於出現損失，趙子丹首先採用的還是基因修補技術，以及對腦域溫和的刺激，以增強十三門徒的精神力。
整整半個月訓練過程過去了，十三門徒變得完全不同了。雖然他們表面上看起來似乎沒有不同，甚至連胖瘦也沒有什麼改變，可是身為當事人的他們自己卻是可以感覺到彷彿身體之內突然多出了一個發動機，源源不絕地給自己提供動力。
過了幾天，他們又有了完全不同的感覺。發動機消失了，他們感覺到自己好像正在進行升級的電腦，改變的不僅僅是硬件，軟件方面也在進行不斷地變化。他們可以感覺到每一個細胞中都蘊含了爆炸性的力量，輕輕揮舞手臂都可以聽到手臂高速破空所發出的聲音。
這才是真正的脫胎換骨！這個時候，他們才知道為什麼老闆說他們之前的訓練比起這一次的改造來，根本就是小巫見大巫。
當然，最讓人驚奇的不僅僅如此。十三門徒中的老三、金牛座的黎俊，在修補基因之時產生了意外突變，具備了一種超能力——角質化。
自然界的有些動物，比如說犀牛，它門頭上的角硬度十分之高，一般的物理傷害根本不在話下。而黎俊正是擁有了將皮膚角質化的能力，就好像憑空多了一件覆蓋全身的防彈衣，而且還是很難破壞的那種。
原本按照趙子丹之前定下的規矩，誰的能力第一那麼誰就坐上「教皇」的寶座。可是黎俊卻是很喜歡自己所代表的金牛座，並且道自己的能力也和金牛座十分貼切，所以不用換了。
當然，真實情況是黎俊這個同樣從「臨海村」走出來的年輕人對劉鐵男很是敬重，自然不肯佔據「老大」的位置，反而讓老大變成小弟。
對此，趙子丹也不勉強，在對劉鐵男勉勵一番之後維持了原先的排名。
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為了驗證一下眾人經過改造之後的真正實力，趙子丹安排身為D級超能者的樸銀姬和十三門徒進行對戰。最終結果，黎俊、劉鐵男以及賣魚仔三人居然和樸銀姬這個曾經給了十三門徒太多震撼的超能者打了一個平手。
當然說是平手，其實樸銀姬還是佔據很大優勢的。至少繼續戰鬥下去，贏的人肯定是樸銀姬。
黎俊是依靠自己角質化的皮膚擋住了樸銀姬的大力攻擊；劉鐵男則是以綜合實力和樸銀姬暫時打了一個不分勝負；至於最後的賣魚仔，則是完全靠著自己的速度，勉強和樸銀姬周旋。
經過實際測定，十三門徒中最差的天平座楊文立，也達到了E－的級數。也就是說，經過改造之後，十三門徒所有人如願地步入了超能者的行列。
從此，「十三門徒」之名在「神域」之內正式被樹立起來，漸漸開始成為趙子丹手中的一柄利器。