阿肯色號沉沒之後，美國的其餘戰列巡洋艦的也在其被一一擊沉，太平洋的海戰告一段落，接下來的仍然是無聊的潛艇戰，美國人的潛艇就像是無處不在的蟑螂，頑強的騷擾著太平洋航線上，那些船長的心-
由於中國的戰艦更多的將注意力轉移到那幾艘美國戰列巡洋艦，所以對於反潛的工作就做得少了很多，美國潛艇進入了第二個黃金時期、儘管中國海軍很早就介入了南洋上的護航作戰；儘管中國早就向德國派出了軍事代表團，掌握了美軍潛艇的基本戰術-
但中國反潛措施遠遠沒有真正落實——沿海地區沒有實施***管制；航線上燈標和航標照舊大放光明；夜間航行的船隻仍舊開燈行駛，並公開使用明碼通訊；那些紙面上要求嚴格的條例沒有人執行，只是一紙空文-
中國沿海基本沒有編組護航船隊，幾乎全是單船航行。一句話，中國人的警備實在是太鬆懈了，他們還以為戰爭還在中國的勢力範圍內！所有這些燈光和無線電通訊，都被美軍潛艇很好地加以利用，成為掌握中國船隻行蹤最理想的情報來源。
所以說中國海軍無論在組織上，還是在反潛兵力訓練和數量上，都遠遠沒有做好反潛準備。當時中國海軍在海上戰役指揮機構和司令部機構內都沒有專門地反潛機關。反潛兵力僅有包括七十六艘驅逐艦、五十六艘掃雷艦、十四艘獵潛艇、十一艘炮艦和二十三艘近海巡邏艇在內的約二百八十艘各型艦隻，反潛飛機也只有區區七十二架。
在太平洋東岸沿海活動的美軍潛艇由於數量較少，也就沒有採取集群攻擊戰術，而是實施單艇遊獵，通常白天在遠離商用航線的海域潛座海底，養精蓄銳；夜幕降臨後則在航線上以水面狀態搜索目標。一旦發現獵物，往往接近至魚雷最小射程的距離才發射魚雷，以確保不浪費魚雷，而對小型船隻，美軍潛艇因為遠離基地難以獲得補給，艇長都不捨得使用魚雷，一般都用甲板上的火炮將其擊沉。
美軍這十五艘潛艇取得了極大地收益，尤其是哈根海軍少校任艇長的青魚號。創下了擊沉八艘運輸船，計五萬三千噸的記錄。哈根在航海日誌中感慨地寫到：「如果有三十艘或艘潛艇的話，我敢保證一定會取得更大的戰績！」
整個一月，美軍潛艇在太平洋總共擊沉運輸船四十八艘，計二十七萬七千噸，幾乎全是一月最後兩周在中國海域取得的，加上在印度洋和太平洋海域的戰果，總共擊沉六十二艘，三十二萬八千噸。
由於首批美軍潛艇在太平洋東岸的輝煌戰績。大大激發了美軍潛艇部隊低落已久地士氣。二月十日，鄧尼茲又向中國派出第三批十五艘潛艇。這批都是排水量一六百噸的大型潛艇，有足夠的燃料穿越巴拿馬，溜進太平洋。
十七日，中國開始加強了沿岸目標的警戒，並開始對重要目標實行***管制，使得美軍潛艇難以發現岸上目標。炮擊計劃只得取消。
儘管在太平洋東岸活動的潛艇取得了令人矚目的戰果，但是說實話，這種傷害並不是致命的，對中國而言是非常幸運的。要是大批美軍潛艇到達太平洋東岸，後果將不堪設想！即便不會導致戰局逆轉，但是付出更大的代價是無疑的。美國人地短視給了中國人調整的機會。
從六月中旬起，中國擴大從台灣出發的護航運輸船隊規模，並減少船隊次數。從每五天一次改為七天一次，這樣就擠出了兩個護航大隊用於加強太平洋東岸的護航。這個辦法其實並不難辦到，但是卻有驚人的效果，中國商船的損失減少了一半以上
六月底。中國開始實行護航運輸船隊制度，這樣美軍潛艇地狂潮終於被遏止，潛艇被強大的護航軍艦逐出了攻擊比較容易得手的近海海域，再也難以從容獲取戰機。儘管如此，美軍潛艇在六月也取得了擊沉七十四艘，計四十三萬一千噸的戰績。
七月中國開始在整個東海岸都建立起了護航船隊體系，中國海軍總司令譚楓霖上將根據幾個月的經驗認為護航船隊體系是解決潛艇威脅的唯一辦法，
力進行護航船隊體系的組織，從最早的局部護航，即一個錨地護送到下一個錨地，逐漸擴大為整個太平洋護航體系，
並開始組織岸基航空兵為船隊提供空中掩護，還從太平洋艦隊向東部海疆區調撥了一批軍艦，編成六個護航隊，每隊包括兩艘驅逐艦、兩艘武裝拖網漁船和三艘其他船隻，以加強東部海岸地護航力量。至七月十五日，美軍潛艇被逐出中國太平洋各主要航線，整個上旬，美軍潛艇只擊沉了十艘運輸船。
八月二十三日，鑒於中國東海岸護航船隊體系的建立和強大岸基航空兵的空中掩護，美國下令潛艇撤出太平洋東岸，南下至還沒有建立起護航船隊體系的墨西哥灣活動，以最小地代價換取最大的戰果。整個五月，美軍在墨西哥灣和加勒比海共擊沉了四十一艘運輸船，約二十二萬噸。加上其他海域的戰績，美軍總共擊沉一百二十五艘運輸船，計六十萬七千噸。
六月二十四日，美國潛艇的艦長就聯名上書，要求根據戰爭的發展重新確定潛艇所承擔的任務，特別是提出在同盟國裝備了新型雷達後對潛艇威脅越來越大的不利情況下，強烈要求建造具有高航速的新型潛艇，並將建造這種潛艇的重要性提高到決定戰爭勝負的高度。
斯塔德邁爾級潛艇因由潛艇工程師斯塔德邁爾所發明的高效發動機而得名，這種發動機通過氧化氫與海水反應產生動力，這樣就能徹底改變柴油發動機必須定時上浮出水，以給蓄電池充電的傳統方式，能夠長時期在水下進行高速航行。可惜當時還僅僅是在研製期間，定型批量生產還需要不少時間。
在美國人的強大國防工業面前，這本來不算什麼，但是美國的工業所要做的事情實在是太多了，戰列艦的修改，航母的建設，這些大工程站用了太多的資源，所以美國潛艇部隊所期望的優秀潛艇並沒有很快的變成現實。
七月開始，中國護航體系已延伸到加勒比海，並開闢了四條新的護航航線：將太平洋牢牢的控制在手中。然而這並不算完事，八月底，中國對近海護航體系進行了調整，開始實施分段護航體系。
所有在中國太平洋沿岸航行的船隻均被納入這一體系，以關島、夏威夷和舊金山為三個重要的起始點，其中關島為起點，舊金山是終點，船隻到達夏威夷後再編組成橫渡太平洋的船隊，開往美國西岸。
為了減輕起始港口負擔過重的情況，制定了嚴格的時間表，一些直達紐約的船隊無需進入中間港口，由護航軍艦進行交接，變更船隊代號就可前往紐約。這一體繫在一九一七年得到了全面推廣，並一直使用到戰爭結束。
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正是由於該體系的實行，一九一七年八月中，在太平洋海區沒有損失一艘船隻，只有墨西哥灣損失了三十艘船隻。近海護航體系和分段護航體系的實施，使一九一七年八月中國在太平洋東岸的損失減少到三十九艘，佔全部護航船隊編成中的九千零六十四艘次船隻的０.大低於橫渡太平洋的護航運輸船隊１.護航體繫在近海航行中對於保證船隻安全。
相對於中國的護航成功，美國人的處境就有些不妙了，如果不能切斷中國遠征軍的臍帶，那麼上一次世界大戰中，那只突然出現在紐約人民面前的恐怖軍隊就會再次出現，然後是第二次的投降，這是美國所有人都無法接受的結局，是無論如何都不能發生的。
所以美國人急需一種武器來扭轉這種不利的局面，他們仍然迷信武器的力量，而沒有認識到，第二次世界大戰是一場殘酷異常的戰爭，拼的是國家的綜合實力，而不是一樣兩樣的武器。
不過還是要驚歎一下，美國人的創造力真是不一般，很快的一艘空前絕後，領先時代一百年的武器就被美國人研製了出來，並且很快的投入了生產，中國的航線繼續面對著美國人的威脅！