神農教導人族學會種植之後，眾族歸心。人類減少了飢餓的威脅以後，更加致力於各族的發展。在神農教導的基礎上，各族又針對自己地方的特性，改進了種種方法，糧食的產量一年比一年高。
神農有了這麼大的功勞，就有許多部落派人不遠千山萬水，一路跋涉，來到姜氏部落，拜見神農，感念神農恩德。起初神農還耐心接待，到了後來，神農厭其煩，不願每天都把時間浪費到這沒有絲毫作用的事情上去，再看部落中也沒有需要自己操心的事，就把所有事務交給別人，自己找了一座大山，獨自修煉去了。
這個時候的人界，仍然保留了很濃厚的靈氣，雖然比洪荒時代遠遠不如，但是有的地方比起地仙界也不會遜色。神農找到一處靈脈所在，便在山壁上打了一個山洞，周圍布上陣法，然後開始閉關。
通天教主在最後幾年中，也考慮到神農將要去人界生活多年，就把一些高級的功法用神念傳給神農。神農雖然到了大羅金仙境界，但是這些高級的功法仍然懂得不到百分之一。正好借這個機會好好領悟，如果能提升一個境界，那就更好了。
神農在人族施行教化之責多年，見慣了人間得生老病死，歷經了種種艱難困苦，心境早就磨練得堅定異常。只是一直沒有時間好好修煉，所以幾十年過去了，修為也沒有上漲多少。但是神農清楚，只要能將自己得法力提升起來，境界問題根本就不會成為阻礙，至少能讓自己提升到大羅金仙中期的頂端。
修行無歲月，等神農從入定中醒來，也不知道過了多少時間。神農只知道這次修煉，使得自己達到了大羅金仙中期。不要小看這一個等級，要知道修行的路上，越往後就越艱難，如果要和築基時相比，那根本就沒有可比性。等到以後到了晉陞准聖的時候，花的時間就更多了。至於准聖升聖人，那乾脆就不用去想。億萬年也不能出一個聖人。現在這些聖人那都是有各種各樣的功德或者別的機緣才能證道的，就算有這些功德和機緣，也沒有哪個不是經過多少億萬年才能跨出那一步。
神農一聲長嘯，揮手拂開山洞的石門，撤去外面的陣法。自己不知修煉了多少年，也不知道外面的人族現在怎麼樣了。神農決定還是先出去看看，如果沒有什麼問題，就回來繼續修煉。
等到神農來到山下，行走了好久，仍然沒見到一個部落。記得以前自己進山的時候還有好幾個部落都在這附近的。神農再也沉不住氣，起身往自己部落的方向飛去。
來到原來部落的地方，見到的情形就算以神農大羅金仙的境界，都被嚇了一跳。這那裡還是從前那個朝氣蓬勃的大部落？放眼望去，只有很少的人在忙著什麼，一個個都是老弱病殘、面黃肌瘦，規模只和當年自己剛從碧游宮回來的時候差不多。
神農來到部落中，發現自己認識的人都沒有幾個了。好在雖然神農不認識這些人，但是這些人一個個都認識神農。見到神農後，一個個都忍不住痛哭失聲，跪在地上，不住大呼，「神農」。神農急忙上前把他們扶起，問道：「發生了什麼事，還有的人呢？」
等到和那些人談過之後，神農才知道，自己這一閉關就是差不多二十年。本來這些年人族都一直順利的發展，年年風調雨順，五穀豐登。哪知，就在前不久，忽然一種從來沒有遇到過的病症襲來。一日夜間，就有幾百人死去。幾天之後，人們再也忍受不了每天死亡的威脅，就整個部落都往遠處遷移了。留下的這些都是為了避免拖累族人，自覺留下的。就連任姒，也在那場災難中去世了。任姒雖然從前服過廣成子的丹藥，但是那不過是一粒強身健體的丹藥而已，加上又過了這麼多年，也漸漸衰老了，終於沒有能抵抗住病魔的侵蝕。
神農聽了，安慰他們一番，便飛了起來，往臨近的部落飛去。看到的都是遍地的墳塋，據估計，至少有三成的人死在這場災難。神農拿出身上剩下的所有丹藥，化在水中，噴灑在部落周圍。有了這些丹藥，族人的病症馬上就消失了。
見到丹藥有效，神農就想回到金鰲島去，求丹藥治病。飛了不久，神農忽然想到，自己身上的丹藥即使在金鰲島也不多見，而人族何止千萬，就算把島上所有的靈藥用完也不可能就回全部人類。回想起自己以前嘗百草，辨五穀的時候，好像有許多的草類帶有藥性，如果能把這些藥草的性能分辨出來，一定能找到救治人族的辦法。
說做就做，神農便開始了嘗百草的試驗。現在的神農大羅金仙之身，一般的毒藥對自己根本就沒有什麼作用。神農只好自己封印住了法力，再來試驗。每吃下一種藥草之後，神農就靜下心來，仔細的體會那些藥草在自己身體起到的作用。雖然現在神農的法力還比不上一個金仙，但是修煉多年的體質使得他對體內各種異常的情況非常瞭解。當然對毒藥的抵抗力也遠比凡人要強。
一連幾年的時間，神農都在中毒，解毒的過程中度過，幸好有以前在碧游宮打下的基礎，使他總能在危險的時候找到能替代的解毒藥草。終於，神農將那能治那種病症的藥草找了出來。然後，這個消息迅速傳開，越來越多的部落知道了這個方法，人族部落的遷移才停止了下來。
解救了人族之後，神農就覺得疑惑了，整個人界，闡截兩教的傳道之人數不勝數，為何人界發生這種大事，竟然沒有一個人來幫助人類？後來在問了一些人之後才知道了答案。原來人族發病之後，就有許多部落就近前往那些仙人居所求救，但是到了那些地方以後，怎麼都不能進去，最好的情況就是被告知時機未至。神農聽了，氣的七竅生煙，想了許久之後，才明白過來。原來那些聖人門徒之所以會到人間傳道，目的並不是為了人族，而是要在人間收徒，傳承自己的教派。只有等到人類絕望的時候再出來，人類才會更加感激他們。想到這裡，神農總算明白了聖人不仁，以眾生為螻蟻的含義。
經過這件事以後，神農知道人族想要發展下去，還是要靠自己的努力。於是，神農將自己多年試藥的經驗寫出來，標明了每種藥物的作用，命名叫《神農本草經》，然後傳到人族各部。
有了藥書，就使得人族以後能為自己治療一些簡單的病症，但是仍然有事故發生，往往等到備齊藥物之後，病人也死了。神農還是覺得不夠，就讓各個部族專門挑出一些聰明伶俐的，跟他學習，以後專門負責部落治病，平時閒暇的時候就收集藥草，並加以處理。這樣一來，情況好轉了不少。可是這些藥物仍然需要準備時間，如果是急症的話，還是不能解決問題。神農就想到，如果人族也能煉丹，那不是就可以平時準備好藥物，如果遇到什麼突發事故馬上就能起作用？