日機在退出轟炸的時候，遭到了第五艦隊防空戰鬥機的第二次攔截。這些防空戰鬥機之前只能眼睜睜的看著航母在彈雨中「搖擺」。現在，日本戰機已經離開了艦隊的防空火力網，他們自然不會讓那些日本飛行員安全的返回自己的航母。
「魚雷攻擊！」
聽到參謀軍官的叫聲，談仁皓立即衝到了右側的舷窗旁。航母的艦島在飛行甲板的右前側。當他向海面上看去的，海面下，六條灰色的魚雷正在靠近戰艦，速度都非常快，距離已經不到400米了。
做任何規避動作都太慢了，這是日本潛艇發射的「長矛」氧氣魚雷，其最大航速接近50節，而且在這一航速下，射程達到了22千米，該雷直徑610毫米，要比唐帝國海軍裝備的530毫米魚雷大得多，戰雷頭裝藥達到了500公斤，而其他國家的潛射魚雷裝藥也就250到300公斤左右。而「長矛」魚雷另外一個重要特徵是，其散發的氣體極容易溶入海水，因此沒有明顯的尾跡，戰艦上的瞭望員很難在遠處發現，而等到發現的時候，已經太遲了。
這六條魚雷都是從極近的距離上發射的，在「太祖」號附近巡邏的一艘重巡洋艦發現了日本潛艇的潛望鏡，並且迅速的招來了兩艘驅逐艦。不過，這已經無法阻止射向「太祖」號的魚雷了。「太祖」號以最大的轉彎速度向左轉向，爭取將艦艏朝向魚雷，不過這都太遲了。400米，對於速度近50節的「長矛」魚雷來說，僅僅需要不到20秒的時間就能擊中航母，而對於速度為33節的航母來說，20秒，僅能航行260米左右，轉向的話，最多轉過30度而已，而六條散射的魚雷能夠覆蓋足足六艘航母艦長的範圍！
第一枚魚雷集中了航母右舷靠近艦艏的部位，爆炸產生的強大力量直接將航母右側重達2.5噸的錨給炸上了天，整個艦艏都被炸變了型，飛行甲板前端也被捲曲了起來。最為嚴重的是，在航母艦艏留下了一個直徑近5米的大洞，附近的20多名艦員全部犧牲。如果不是航母上的所有水密門都已經關閉的話，光是這個損傷就足以讓「太祖」號喪命了。
第二條魚雷擊中了航母右舷艦島後面的舯部部位。談仁皓只感到腳下一震，接著整個人都被彈了起來，撞在了天花板上，然後再率在了地板上。艙室裡的十多名參謀軍官幾乎都被震飛了，談仁皓也在這個時候失去了知覺。這條魚雷在航母右側動力艙上留下了一個大洞，位於右側的四台鍋爐全部停機，航母損失了三分之一的動力，而且在兩分鐘之內就近水1000噸，導致航母嚴重左傾。
第三條魚雷大概是命中了航母右側尾部的螺旋槳的傳動軸。雖然沒有直接命中艦體，不過爆炸產生的強大衝擊波直接損壞了三根螺旋槳的傳動軸，僅剩下了最左側的螺旋槳還能夠繼續工作，同時在艦艉上留下了一個不大的窟窿。
「太祖」號遭到魚雷攻擊的時候，護航的那艘重巡洋艦已經朝著伸出海面的潛望鏡開炮了。當時艦隊處於防空作戰狀態，艦隊編隊非常密集，而且驅逐艦這類防空火力薄弱的戰艦都被安排在了艦隊外圍。重巡洋艦上是沒有深水炸彈的，而且也沒有探測潛艇用的聲納。就算重巡洋艦上的官兵都急得跳腳了，他們唯一的武器就是將放空炮的炮口對準潛艇的潛望鏡開上幾炮（主炮的俯角太小）。
十五分鐘之後，四艘反潛驅逐艦趕了過來，艦隊裡的其他戰艦也都散開了。「太祖」號航母僅僅只能以8節的速度緩慢航行，而且戰艦右側進水非常嚴重，接替受傷艦長的參謀長已經下令關閉了所有受損區域附近的水密門，同時向戰艦左側注水，以讓航母恢復平衡。航母上的十多台抽水機都在全速運轉，將戰艦裡的水抽出去，以減緩航母下沉的速度。「李靖」號大型巡洋艦也靠了過來，將一根電纜連接到了航母上。因為航母上的三個動力艙已經有兩個進水，旁邊的發電機艙也受到了影響（這是「皇帝」級航母在設計時的一個非常明顯的缺陷），結果導致抽水機無法全功率工作，不得不依靠其他戰艦提供的電力來排水。
發動襲擊的日本潛艇根本就沒有時間逃出艦隊反潛驅逐艦的打擊範圍。而且這附近的最大水深超過了200米，而日本最好的潛艇的極限下潛深度也才150米左右。四艘反潛驅逐艦如同主人受到了攻擊的看門狗一樣，瘋狂的在海面上搜索著。很快，就有兩艘驅逐艦開始投放深水炸彈。隨著一下下沉悶的爆炸聲傳來，海面上也騰起了一股股的白色水柱。唐帝國的驅逐艦上都裝有至少數十枚深水炸彈。這些驅逐艦讓日本潛艇溜了進來，就已經失職了，現在他們如果還找不到日本潛艇的話，那這些驅逐艦的艦長肯定要受到懲罰。
談仁皓很快就被轉移到了「李靖」號上，他仍然處於昏迷狀態之中，開始爆炸那一下，讓他連續兩次撞在了鋼板上，而且在落下的時候，頭部首先著地。萬幸的是，脖子沒有摔斷，不然帝國海軍就要損失一名精英人才了。
伍顯昱直接接過了艦隊的指揮大權，他只遲疑了兩分鐘，然後就下令艦隊全速返回舟山港，同時讓防空戰鬥機在另外兩艘航母上降落，補充燃料後再次起飛，負責警戒。隨後，他留下了兩艘重巡洋艦，四艘驅逐艦伴隨遭到重創的「太祖」號航母返回舟山。伍顯昱可不敢拿第五艦隊的全部家當做賭注，就算遭到了損失，最多也只是「太祖」好完蛋。
「李靖」號迅速的脫離了「太祖」號航母。此時，沒有人相信這艘遭到了重創的航母能夠回到舟山港，因為航母的進水速度遠遠大於排水速度，而且好幾道水密門已經損壞了，根本就無法阻止海水在艦體裡蔓延。