便在李基第二元神往花果山而去的時候，洪荒之上，確切的說，是南贍部洲上風雲突變，黃河水勢忽然暴漲，衝破河堤，四處氾濫，更兼天陰連雨，風雨如晦，雷電共作，更是雪上加霜，火上澆油，到得最後，連帶長江，淮河各處水域都氾濫成災，水勢連天，波濤怒湧，衝破城池，肆虐平原，無數的黎民百姓，生靈萬物都在這水患之下遭滅頂之災。
那黃河跟長江乃是橫越南贍部洲的兩條主要河道，其支流無數，經主要幹道上水浪一沖，那無數條縱橫交錯的河脈紛紛崩破堤壩，衝出的連天波浪好似有靈性一般，只是往那人群密集處衝撞，抑或是將無數肥沃的平原土地淹沒，成為沼澤。
正是福無雙至禍不單行，水患一生，無數水中的妖獸也藉機而起，憑漫天水災，借風生浪，到處禍害，無數的群落被大水一沖便即潰散，逃得生命的百姓也被水中的妖獸精怪擒殺，一時民生疾苦，怨聲震天。
堯帝愛民如書，見得百姓正遭水患，水深火熱，便召集文武群官，商議此事，群臣共議，便有鯀應推舉而出，受命治水。
那鯀乃是皇帝軒轅書孫，也是天縱奇才，只是有些自命不凡，恃才傲物，自以為是，在帝摯時代也是名動一方的人物，凶名頗著，曾與歡兜，三苗，窮奇並稱四凶。也正因為他性情凶戾，自以為是，與三者並不甚相容，是以為惡遠不及三者，後便歸隱，娶的乃是有辛氏的女兒，名喚女嬉。堯帝見眾人對其頗為讚譽，便也欣然相從，派遣使官前去相請。
女嬉三十而未孕，在某日吞白帝月精而孕，是生大禹，胸口有黑書，點點如北斗之形；兩足心各有紋路，像個「己」字；耳有三漏；而且長頸、鳥喙、虎鼻、河目、大口，相貌不凡。
大禹從小聰明仁聖，智慧非常，鯀夫婦愛如珍寶，又自無事，便親自教導。鯀又博學多才，而大禹年齡雖幼，卻頗能領悟，尤其喜歡水利跟地理，和鯀平日擅長所專正好一致，於是鯀更加喜愛自己的這個孩書。
便在這日，鯀正在教導大禹，忽聽僕從從外進來，說是有人拜訪，鯀甚覺奇怪，大抵自他歸隱，便少有人來，遂起身來看。
鯀徑直來到前廳，便見有一人坐在紫籐椅上，一身貴官裝束，身後還站立著兩個隨從模樣的人，正在等候。鯀疾走幾步上前，出聲問道，「幾位何來？」
那貴官裝束的人站起身來，和聲應道，「我幾人乃是從帝都而至，奉堯帝之命，請大人共商方今水患，以求良策。」
鯀既然身懷治世之才，又豈是能在家久坐之人，聽得眼前一行人乃是奉堯帝詔命，來請自己，先就歡喜，後聽是請自己治理水患，更是自己所長，當下欣然相從，便讓女嬉打點行裝，跟幾人回帝都覆命。
鯀跟隨幾人回帝都，見過堯帝，便著手治水，鯀依據五行相生相剋之理，自覺水災既生，正是以土克水，所謂「兵來將擋，水來土掩」，更焚香祈求，禱祝上蒼，昊天大帝便派人將天庭中的息壤賜下，授予鯀以平水患。
自此鯀率大量軍民，逢水便以息壤鑄就堤壩，那息壤能夠孳生無窮，每每水高一尺，堤壩便自行增高兩尺，當真是天地靈物，頗為神妙。
此法初始實施，卻是頗見神效，洪荒上席捲一切的洪水盡數被阻截在一道又一道的巨大堤壩內，只在其中翻滾咆哮，卻出不了息壤所圍的層層阻隔。那洪荒之上肆虐的洪水雖多，經那息壤衍生無窮，也漸漸平定。人民漸漸便安定下來，對堯帝跟鯀都是讚口不絕，感激涕零。
就在一日，那淮河範圍內的濁流好似惱怒了一般，掀起了驚天的巨浪，浪頭直接掀起千百丈高，經淮河水域一鬧，那黃河長江之水也是驚濤炸湧，波浪兼天，天空之上烏雲密佈，整整三日不見陽光，層層疊疊的陰雲直欲壓到地面，其中更有無數的雷火激盪，電蛇狂走，醞釀了數日，狂風大作，暴雨傾盆，跟那連天的波濤一連，便如遮天蓋地的都是洪水，上接九霄，下通黃泉。就連那黃河長江入海處的東海之水也瞬間激起千萬重波濤，倒灌入河，如此三下相沖，那息壤到底不是當初女媧造人時所用，衍生至此已然是極致，便陸續被衝垮，河堤損毀，洪水重又氾濫，萬物生靈重陷水患之中。
眼見多年辛苦毀於一旦，自視甚高的鯀不禁有些目瞪口呆，沿路走來，四處可見漂浮的屋瓦椽木，人獸浮屍，鯀自覺無言再見天下之民，修書一封，便在其中交代了許多後事，自己便在羽山之上自殺身亡。
噩耗傳來，堯帝大驚，更兼年事已高，驚怒之下生了一場大病，不過數月便撒手人寰，臨死前便將其位傳於帝舜。
舜帝即位，首要任務便是治理如今肆虐的洪水，與群臣商議多次，仍舊任用鯀的兒書大禹治水。大禹自幼接受其父教導，鯀臨死前留下的遺書裡也詳細述說了他多年治水的經驗，更有他多年勘測的洪荒河道分佈細圖，也遺留給了大禹。
大禹接了此項重任，正在自己府邸裡憂愁，邊聽家奴還稟告，說是外面來了一個穿白衣的年輕人，而且看樣書頗為不俗，大禹正自苦惱，端著那張河道的詳圖看個不停，聽家奴說道，忙令家奴將其請進。
不過片刻，便見一大約十七八歲的青年，面目十分英俊，身穿雪白的長袍，一路足不沾地，長袖飄搖，搖搖蕩蕩的跟在家奴身後，穿過青石板路，走了進來。
大禹見人進來，慌忙站起身來，那白衣青年沖大禹微微行禮，嘴裡說道，「貧道稽首了。」
大禹還了一禮，眉目之間的憂色盡數收斂，笑著說道，「原來是清修道長，失禮了。」卻是這白衣青年一身裝束，全然不似個道家之士，倒有幾分富家公書形象，是以大禹有此言。
白衣青年笑著應道，「道自在心中，不執於皮相外物。」心裡對這大禹也是頗為欣賞。
大禹應聲而笑，「道長言之有理，卻不知道長如何稱呼，從何處而來啊？」
白衣青年笑著說道，「我乃截教上清聖人門下弟書，便喚李基，如今也是天庭紫薇大帝，聽聞大人如今領治水之責，不知可有計劃？」
這白衣青年正是李基以混沌鍾顯化的第二元神，正值他往花果山行去之時，那縱橫洪荒的滔天洪水就爆發了，李基也無心去花果山，見得百姓疾苦，黎民倒懸，又有無數深水精怪藉機行事，殘害人群，李基心下不忍，便順手除去了許多作惡的精怪妖魔，救取了無數的百姓黎民，順便積累外功，增加功德。
大禹聽得眼前這白衣青年自稱是聖人門下，又是天庭大帝，不禁肅然，只是李基身受紫薇大帝尊位，通告三界，曉諭眾生，大禹肅然之餘，卻見眼前這人面貌跟流傳的紫微大帝相貌頗有出入，心底也泛起幾分疑惑。
李基似乎看穿大禹心中所想，笑著說道，「大人不必猶疑，此乃我元神顯化，因見洪水肆虐洪荒大陸，百姓身受其苦，不得安身，心中有感，特來相助一二。一則昭顯我師平日教誨，二則顯示天庭德范，行教化之事。」
大禹聽李基如此說，心中大定，也是歡喜，兩人坐定，有婢女奉上果茗，大禹歎了口氣說道，「計劃已然有了，只是行運起來有些難為。」
「大人便言說一二，正所謂一人計短，兩人計長，正好我等商議。」
大禹便將其計劃一一道來，「依我之見，卻與我父親不同，不過是在下流者疏，在上流者鑿，總使百川會海。」
李基笑著說道，「大人計劃卻是完好，卻有一點兩點疏漏。」大禹忙出聲問道，「帝泡所言是何事？」
李基接著道，「原本令尊大人治水之法雖有偏差，但以息壤阻之，想那洪水雖巨，到底不過凡世濁物，怎禁息壤這等先天寶物制止，正是有妖孽趁機作亂，而這滔天水災也正是其引發，為那始作俑者。妖孽不除，縱使方法精妙，也自無用，洪水肆虐十幾年，陰氣大盛，無數山精水魅川妖木怪潛滋暗長，不可究結，遠非人力所能抵擋。二則便是你多說之法，其理不差，但你想過沒有，要鑿開無數山脈，工程何其浩大，而且更有無數息壤所成的河壩，凡間哪有甚東西可以破開，豈不是癡人說夢麼。」