決鬥學院作為培養決鬥者的搖籃，每年都會生許多的事件。上一年裡，決鬥學院受到了七星的襲擊以及三幻魔事件，而新的學期裡決鬥學院也生了不少的事情。
先期裡鮫島校長外出，學院由庫洛諾斯教授暫時管理，而學院也來了個新老師：拿破侖教頭。開學初兩人就為了廢除歐西裡斯紅宿舍而弄出了許多的事情，但都被十代他們制止了。這裡要說一下，十代和翔經過我的幫助以及自身的努力，在上一年升學考試中都升入了太陽神黃。不過在他們的要去下，穿的雖然是太陽神黃的衣服，但仍住在歐西裡斯紅的宿舍裡。
還有就是十代收了一個新的小弟，有著恐龍基因的迪拉諾劍山。以及我公司麾下的愛德·菲尼克斯進入決鬥學院做個掛名學生。而其中學院生了兩件重大的事件：第一件是學院原本歐貝里斯克藍宿舍變為了白宿舍，萬丈目成為了白宿舍的起人。第二件事是十代的元素英雄被愛德的命運英雄打敗了，幾天後十代消失不見了。要知道十代在我和凱撒離開學院後，已經隱約成為學院第一人了，但隨著他被打敗，庫洛諾斯教授和拿破侖教頭又重新燃起了廢除紅宿舍的想法。
天空中繁星點點，原本喧鬧的決鬥學院到了此時也格外的寧靜。就在這時，一高一矮兩道不和諧的身影出現在了決鬥場的入場口，打破了決鬥學院難得的幽靜。
「拿破侖教頭，你是怎麼把愛德·菲尼克斯請來的！」拿破侖教頭：「我打聽到愛德一直在找殺害他父親的兇手，我就跟他說如果他能幫我們把紅宿舍廢除了，我就幫他問一下黑暗決鬥社中的B有沒有他要的消息！」庫洛諾斯教授問道：「那你認識黑暗決鬥社中的B嗎？」「我不認識！」庫洛諾斯教授被拿破侖教頭的話弄得無語。
這時愛德從遠處緩緩走來，庫洛諾斯教授和拿破侖教頭趕緊迎了上去。一番對話後，愛德和拿破侖教頭與庫洛諾斯教授一同向決鬥場走去。
「帶來齋王大人的指令了嗎？」就在愛德要走進決鬥場時，一個聲音從旁邊傳了過來。愛德轉頭一看，原來的萬丈目。愛德眉毛微微一皺說道：「這關齋王什麼事？」萬丈目驚訝道：「你來這裡不是齋王吩咐的嗎？」愛德聽後臉的疑惑。
萬丈目：「之前和十代的決鬥你的牌組中寄存著齋王的力量，但就算十代輸給你後，也沒有成為我們光之結社的一員，也就是說齋王大人的力量對十代沒有用！」愛德疑惑道：「光之結社，那是什麼？還有你說得我的牌組裡有齋王的力量，是什麼意思？」「看來你什麼都不知道啊，那麼十代就由我來解決吧！」說完萬丈目轉身離開了。
看著遠去的萬丈目，愛德想到：『搞什麼？難道齋王說得越命運的人就是那個十代嗎？還有齋王，你到底想要幹什麼！』
決鬥室裡，決鬥台上關係到歐西裡斯紅宿舍存亡的決鬥馬上要開始了，原劇情中這場決鬥原本是明日香準備和愛德進行決鬥的，但由於明日香和我一起離開了決鬥學院，只能由翔上場和愛德決鬥。
看著眼前的愛德，翔：『好強烈的決鬥氣息啊，這就是把哥哥和十代大哥打敗的人啊！連哥哥和十代大哥都輸給了他，學院中還有誰能贏嗎？』這時翔腦海中浮現出一個人影，一頭稍微凌亂的黑，紫色的眼眸以及那邪魅的微笑。『如果是他的話，如果他還在的話，一定能打敗眼前這個人！』
在場的人有庫洛諾斯教授、拿破侖教頭、三澤、劍山、翔以及愛德。拿破侖教頭站起來說道：「歐西裡斯紅存亡的決鬥開始！」
「等等！」就在決鬥準備開始時，一個聲音從外面傳來。
翔一臉激動的說道：「這個聲音是十代大哥，他回來了！」
只見十代氣喘吁吁的跑進決鬥場，三澤問道：「十代這段時間你去哪裡了？」十代：「我在海上漂流時遇到了新的英雄牌組！」
「新的英雄牌組？」愛德疑惑道。十代轉頭對著愛德：「嗯，一條光線從宇宙中**過來……」十代開始述說他那完全讓人摸不著頭腦的奇遇。
「愛德，我的牌組終於完成了，現在就讓你看一下我的新英雄，新空間人！這一次我絕對不會再輸了的！」「不管來幾次都是一樣的！」「不試一試，怎麼知道呢！」
「dueL」愛德、十代打開決鬥，英雄間的第二次決鬥開始了。
某地的地下決鬥場此時正在進行一場至關重要的決鬥，決鬥的雙方是地下決鬥連續2o場不敗的地獄守衛者與決鬥學院的凱撒、職業聯賽的新星丸籐亮！
此時雙方的情況：
地獄守護者：前場：一隻【復合史萊姆】[攻15，後場：兩張蓋牌。生命：7
凱撒：前場：無，後場：一張蓋牌。生命：3oo凱撒大喊到：「我的回合，抽牌！時間膠囊除外的卡回到手中！」凱撒拿回的卡是載融合！
「接著我動【力量結合】從手牌或場上把融合需要的素材放入墓地，特殊召喚一隻融合怪獸！但是手牌和場上都沒有那些素材，所以動攻魔法卡【電子學輔助】支付一半生命，這張卡的效果可以代替機械族融合需要的素材，出來吧，【電子終結龍】[攻4！」
凱撒：「接著由於【力量結合】的效果，【電子終結龍】攻擊翻倍！雖然回合結束後我會受到【力量結合】的反噬，受到4點傷害，但我這回合就結束掉這場決鬥！」
「不會讓你得逞的！動【史萊姆的落**】，怪獸特殊召喚時，恢復怪獸攻擊力的數值的Lp，並破壞特殊召喚的怪獸！」一道紅色的光芒把電子終結龍化為碎片，地獄守衛者的生命也上升到了15！
地獄守衛者嘲笑道：「沒轍了吧，這樣你肯定敗北了！」凱撒捂著頭輕輕說道：「不要…」「不要，你說什麼呢？」守衛者用輕佻的語氣說道。
「我…不想輸！！！」這瞬間凱撒覺醒！「無論是什麼形式，無論什麼方法，我想贏！」
地獄守衛者：「沒用的！」
凱撒全身散著一股恐怖的氣息：「我終於明白天麟的話了，一直以來我的決鬥只要能做到尊敬對手，勝負如何我都無所謂。但不是不對，我的內心深處其實很渴望…對勝利！所以就算從你手中奪走勝利也…」
凱撒：「打開蓋牌【生死的呼聲】，特殊召喚【原型電子龍】，接著從手牌動魔法卡【載融合】，從場上或墓地把融合素材除去，特殊召喚一隻暗機械族融合怪獸！」卡片猶如飛一般一張張從凱撒眼前越過，凱撒從中猛的抽出一張卡：「特殊召喚【嵌合載龍】！」
凱撒身後浮現出電子龍、電子護罩龍、電子鐳射龍、原型電子龍、電子麒麟以及電子終結龍的身影，凱撒大喊道：「我把這六中怪獸除去，這是為了生存下來的我的掙扎！出現吧，嵌合載龍[攻48！」六隻電子怪獸融合為了一隻全身六個頭的電子龍！
地獄守衛者驚訝道：「攻擊居然有48oo！」
凱撒：「【嵌合載龍【攻擊【復合史萊姆】！進化聚合衝擊！看著被破壞的復合史萊姆地獄守衛者：「【復合史萊姆】被破壞時攻擊表示召喚3只攻擊力為5oo的史萊姆en，接著動【絆倒陷阱】，把墓地的一張陷阱加入手卡。我選擇的是【酸之終結·機械病毒】，下回合這張卡動後，凱撒亮，你就下地獄去吧！」
凱撒冷笑道：「是嗎，可惜你可沒有機會再動它了，因為這場決鬥是我贏了！」地獄守衛者：「這怎麼可能！」「【嵌合載龍】可以進行融合素材次數的攻擊，進化聚合衝擊波五連彈！」五雷電波聚為一體，橫掃全場，劇烈的爆炸使得整個地下決鬥場亂成一片…
地獄凱撒亮，覺醒了…