1669年6月14日，是鰲拜照例要進武英殿奏事的日子。一大早，康熙召集這群親信侍衛，問：「你們都是朕的親信手足，你們到底是怕朕呢，還是怕鰲拜呢？」眾侍衛齊聲答道：「我們當然是只怕皇上啦！」康熙於是對眾侍衛數落了鰲拜的種種罪惡，要他們在鰲拜覲見時，當場擒拿。這群天天隨侍左右的年輕人當即表示聽命。
鰲拜雖然氣焰熏天，但進殿面君時，按制度也不能隨帶保鏢，面對一大群有皇上撐腰的生龍活虎般的少年侍衛，只能束手被擒。李國榮：《康熙智擒奸相鰲拜》，載於《科技文萃》1994年第5期。具體的過程由當今影視劇一遍遍地渲染，現代人大概都耳熟能詳了。
擒住鰲拜之後，康熙火速命令效忠自己的官員們將其黨羽一網打盡，大臣會議審實鰲拜罪狀30條，議將鰲拜革職，立斬，子侄兄弟一併斬首，眷屬家產籍沒。鰲拜請皇上察看他當年在搭救清太宗皇太極時，身上留下的刀疤箭傷。康熙帝念其歷事太宗、世祖兩朝，效力多年，屢建戰功，不忍加誅，將死罪改為終身拘禁。將同黨多人處斬，其餘分別做撤職、降級處理。不久，鰲拜在幽所鬱鬱而終。
康熙除鰲拜一事，現在看來是典型的皇帝與權臣的鬥爭。它的戲劇性之處，或者說它令人著迷的地方，就在於這是一位年輕的皇帝用「年輕人的方式」解決的。鰲拜作為「天子自將之師」鑲黃旗的重要將領，忠心事主，始終不渝，在皇太極去世後堅決擁立其子為皇位繼承人，甚至不惜兵戎相見，最終爭得福臨即位。為此他與睿親王多爾袞結下怨仇，在後者攝政期間，多次遭受殘酷打擊，三次論死。鰲拜作為清初一員驍將，其性格是耿直倔強、敢於抗爭的。他對故主皇太極忠心耿耿，一片赤誠，對順治也始終堅守臣節，稱得上是一個難得的忠義之臣。但鰲拜的政治思想是落後的，在清朝入關後依然固執地堅持關外的落後制度，背社會、經濟潮流而動。在後期他因擅權而被革職抄家、身死禁所，康熙至此才算做了真正的皇帝。
三康熙與孝莊——祖孫之謎
康熙二年（1663年）二月，康熙生母去世。從此，康熙由祖母博爾濟吉特氏（孝莊文皇后）撫育。
康熙和孝莊的祖孫感情很深，對孝莊言聽計從。孝莊在康熙早期就深深介入了政治。在現在的影視劇中，孝莊是一位熱門人物。在一些後人的筆下和眼中，孝莊似乎成了清政府前期垂簾聽政式的操縱者，一直處在權力和政治漩渦的中心。實際上，這是對孝莊的誤解，也是對康熙早期歷史的誤解。
孝莊嫁給皇太極的時候才13歲，是蒙古科爾沁博爾濟吉特氏向滿族人謀求政治利益的籌碼之一。在皇太極駕崩前，孝莊的活動很少。雖然她謚號孝莊文皇后，事實上她從未做過皇后，福臨被立之前她是皇太極五位正妃中的最末一個。直到當上太后，她才有了接觸政治的機會。而順治康熙兩帝在位期間，她更多的是輔佐而非主政。
孝莊與順治母子之間，也有一定的矛盾與隔閡。在教育兒子方面，至少在順治婚姻問題上，孝莊並不是一個成功者。1661年，順治在鬱鬱寡歡中感染天花而病逝。孝莊在極度悲痛中，又把心思精力全部轉移到新的皇位繼承人玄燁身上。孝莊對玄燁的要求非常嚴格，玄燁出痘痊癒後，孝莊就讓他「入書房讀書」，還讓皇孫與隨從「站班當差」，同大臣一起參加各種跪拜禮儀。
玄燁即位後，孝莊的活動驟然增多。《清史稿》中關於孝莊文皇后最多的筆墨，也是用在敘述她在康熙一朝的作為上。順治去世之後，在孝莊的主持下，宣佈先帝遺詔，由年僅8歲的玄燁即位。孝莊在玄燁即位後，並沒有直接以太皇太后的身份干預朝政，她表現得像一個極其具有耐心的祖母，以血肉之情關照康熙。玄燁日後回憶：「朕自幼齡學步能言時，奉聖祖母慈訓，凡飲食、動履、言語，皆有矩度。雖平居獨處，亦教以不敢越軌，少不然即加督過，賴是以克有成。」《清聖祖御制文二集》。可見，孝莊對玄燁的飲食起居，言行舉止，都悉心照料，而且十分嚴格，完全按照帝王的標準訓練這個愛孫。為使玄燁自幼就接受滿族文化教育，她指使自己信賴的侍女蘇麻喇姑，既照料玄燁的生活，又教他說、寫滿語、滿文。同時又讓其入書房，請名師為其講讀儒家的四書五經，且「必使字字成誦，從不敢自欺」，使其具有中國傳統文化的深厚根基。在學習滿漢文化的同時，孝莊也給康熙灌輸「祖宗騎射開基，武備不可馳」的思想，讓侍衛教練玄燁的騎射本領，如同讀書寫字一樣，日有課程，終使玄燁弓馬嫻熟，箭不虛發，為日後親政治國奠定了紮實的基礎。
《清史稿》記載說：太后不干預朝政，朝廷每有大政，康熙「多告而後行」，委婉地說出了孝莊在康熙朝前期舉足輕重的作用。後人在正史中找不出孝莊直接干政的記載，孝莊對康熙早期朝政的影響是間接的，多給予指導性的建議，而不是命令。
感情是雙向的，康熙對這位老祖母也充滿了深深的眷戀之情。康熙8歲喪父，10歲喪母，因此對撫養教導自己的祖母有特殊的依戀。康熙晚年曾深情回憶說：「憶自弱齡，早失怙恃，趨承祖母膝下三十餘年，鞠養教誨，以致有成。設無祖母太皇太后，斷不能有今日成立。」康熙對祖母極好，康熙出行時，如果祖母不能同行，他時時不忘將自己的行蹤向祖母報告。
一次，孝莊去五台山禮佛，康熙備下八人抬暖轎一乘。因考慮到轎夫行走山路不便，孝莊堅持乘車上山。康熙暗中令轎夫隨車後行，由於山路顛簸，乘車實在不穩，孝莊面露難色。這時康熙命轎前行，來到祖母面前。孝莊大為感動，撫著孫兒的背讚歎說：「車轎細事，且道途之間，汝誠意無不懇到，實為大孝。」
康照二十一年（1682年）春，康熙以平定「三藩之亂」，率眾東巡盛京祭告祖陵，同時巡邊設防，加強東北地區的軍事防禦。當車駕行至吉林烏拉時，康熙與官兵一起捕魚，收穫頗豐。康熙馬上想到了遠在京城的祖母，他當即命令將親捕之魚浸在羊脂中，差人快馬加鞭送到紫禁城，他說，只為祖母看到魚時能嫣然一笑，可見祖孫感情之深。
康熙二十六年（1687年），孝莊因年事已高而病倒。康熙見祖母病重，心急如焚。他衣不解帶，睡不安榻，晝夜守在祖母身邊達一個多月之久。所有的藥品及食物他都親加調理，送至祖母唇邊。祖母安睡時，他也不肯離去，隔著幔帳靜候，席地而坐，一聽到皇太后的聲息，立即上到榻前，凡是祖母所需，親手奉上。在孝莊病重的一個多月裡，康熙一刻都不離開祖母的病榻。而孝莊疼愛孫兒，常勸其回宮內休息，但康熙都不肯離開。見祖母的病情越來越重，康熙每日至佛堂禱告，後來他竟不顧嚴冬，步行到天壇為祖母祈禱，在佛前許願，如果能讓祖母身體康復，情願用自己的壽命換祖母的陽壽。其情其景，催人淚下。
康熙的禱告終於沒能換來奇跡的出現。康熙二十六年（1687年）十二月二十五日，孝莊皇太后壽終正寢，享年75歲。康熙皇帝悲痛欲絕，泣不成聲，在祖母梓宮前長跪不起，身體大壞，直至暈厥。
宮中慣例，死人是不能停在宮中過年的。孝莊死在年前，應該趕緊出殯。但康熙破了例，堅持不能草草出殯辦喪事。孝莊的喪事一直籌備到來年的二月才隆重操辦。
孝莊生前遺言，不願離子孫太遠。康熙就將孝莊太后安葬於今河北遵化馬蘭峪的清東陵旁的昭西陵，也就是順治的身邊。
四康熙與蘇麻喇姑——師徒之謎
在影視劇中，康熙身邊還有一位侍女蘇麻喇姑。她陪伴康熙的時間遠遠超過了祖母孝莊。
劇中的蘇麻喇姑是孝莊太后的侍女，端莊美麗，才智過人，並且與康熙年歲相當。歷史上，蘇麻喇姑確有其人。那麼真實的蘇麻喇姑到底是個什麼樣的人呢？
蘇麻喇姑，科爾沁左翼中旗人，蒙古族，原名索瑪勒，又寫成蘇墨爾。她的名字來自蒙古語Somal，意思是毛制長口袋。父母為她起這個名字，也許是剛剛出生的小索瑪勒像家裡的那只口袋一樣珍貴。「索瑪勒」與滿語「蘇喇喇」意思相近，加上她長期生活在清宮裡，後來索性改為蘇麻喇姑。滿語「姑」與漢語中的「姑」同義。
蘇麻喇姑確切的生年不知，她是作為13歲的孝莊的陪嫁侍女進入清宮的。照此推算，蘇麻喇姑的年紀應該與孝莊太后相仿，也就比康熙大40歲左右。因此蘇麻喇姑的真實形象與現在影視劇中的形象大相逕庭。康熙與她斷不可能產生戀情。
但就是這個侍女，在清朝前期的宮廷中發揮了重要作用，比影視劇所刻畫的有過之而無不及。
蘇麻喇姑大約在蒙古就學會了蒙古文字，入宮後又系統學習了滿語、滿文以及宮廷生活中必備的各種禮儀等知識，逐步具備了一定的文化素養與辦事能力，並以她過人的聰明，很快便受到主人的欣賞與信賴。李文：《傳奇侍女——蘇麻喇姑》，《北京檔案》1994年第3期。她對宮中日益增加的漢語和漢字也留心學習，終於成為會三門語言的少數侍女之一。蘇麻喇姑心靈手巧，在裁剪方面也是行家裡手，凡她做的衣服，既美觀，又合身。而且，早年的草原生活和後來的塞外經歷，使蘇麻喇姑練就了不凡的馬上功夫。她常常騎馬外出，為孝莊辦理各種事情，是孝莊身邊最得力的侍女。
1636年，皇太極正式稱帝，改國號為大清。孝莊被封為西永福宮莊妃。也就在這一年，在孝莊的推薦下，蘇麻喇姑參加了「國初衣冠飾樣」的制定，受命制定滿族衣冠服飾。作為一名侍女，她居然能夠參與清開國時期這樣一項重要的工作，可見她頗受器重，開始引起朝野上下的關注。蘇麻喇姑至此算是走出了深幽的後宮，涉足了政治。
康熙出生後，孝莊為康熙挑選老師，蘇麻喇姑憑各方面出眾的能力中選。
康熙在宮外避痘的幾年間，蘇麻喇姑往返於宮殿和福佑寺兩地，擔當起了教育玄燁的重任。《嘯亭雜錄·蘇麻喇姑》記載，玄燁幼時「賴其訓迪，手教國書」。從現存的史籍中，我們可以看到，玄燁的滿文字體舒展流暢，雍容大度。這一成就，固然是因為玄燁刻苦努力、勤加練習，但也是蘇麻喇姑手把手教育的結果。
8歲的玄燁即位後，為了更好地照顧和培養皇孫，孝莊將玄燁接入慈寧宮與自己同住。蘇麻喇姑就繼續擔負起對玄燁進行培養教育的重任。康熙的許多良好習慣和作風，都是在這一時期逐步養成的。蘇麻喇姑對玄燁的日常生活方面也照顧有加。正是在蘇麻喇姑的精心照料下，小玄燁的身心才得到了健康的發展，為他以後六十餘年的治國生涯打下了堅實的基礎。可以說，幼年的康熙有兩個老師和呵護者，一個是孝莊太后，一個就是蘇麻喇姑。
康熙終生都對蘇麻喇姑非常敬重。他尊稱蘇麻喇姑為「額涅」（滿語，即額娘、母親之意），表明了他對蘇麻喇姑的尊敬。終康熙一朝，也只有玄燁的乳母瓜爾佳氏，才能與蘇麻喇姑共享這一殊榮。
蘇麻喇姑與孝莊文皇后朝夕相處，形影不離，廝守達60餘年，二人之間實際上早已超出了一般的主僕關係。特別是在皇太極駕崩之後，孝莊文皇后剛剛31歲，正是青春鼎盛時期便過上了孀居生活，很需要有一位知音相伴，而與她年齡相仿，一直獨身的蘇麻喇姑當然是最佳人選。在公共場合，她們是主僕關係，但在私底下，她們卻形同姐妹。
正因為如此，蘇麻喇姑在宮中的實際地位很高，頗受尊敬。孝莊文皇后稱她為格格，這是清朝皇室女兒的專用封號；順治皇帝與她論平輩；康熙皇帝則視她為母；康熙的眾皇子們則尊稱她為祖母。內務府在上奏中赫然將蘇麻喇姑置於皇室成員之列，玄燁予以默許。可見，玄燁已將蘇麻喇姑視為自己家庭中的一員，而且宮內外的官員都清楚。陳曉東：《歷史上的蘇麻喇姑》，《歷史雜談》2002年第9期。而蘇麻喇姑卻很有自知之明，始終謙恭謹慎，她不僅在孝莊文皇后面前畢恭畢敬，小心侍奉，而且對小自己幾十歲的康熙帝奉若神明，在皇帝面前總是自稱奴才。徐廣源：《蘇麻喇姑的生前死後》，《北京檔案》2003年第4期。
蘇麻喇姑一生未曾婚配。在康熙成年後，她又接受孝莊的安排，撫養孝莊的重孫、康熙第十二子胤祹。在蘇麻喇姑的言傳身教下，胤祹長大後，很有辦事才能，曾多次奉康熙的旨意辦理各類事務。康熙六十一年（1722年）十一月，胤祹被任命為鑲黃旗滿洲都統，他是玄燁諸子中擔任八旗都統職位的第一個。他處事不偏不倚，善於同大多數皇子搞好關係。玄燁晚年時，諸皇子拉幫結伙，在成年的皇子中，沒有參與的極少，胤祹便是其中之一。這都是蘇麻喇姑潛心教導的結果。
1687年12月25日，75歲的孝莊文皇后逝世。痛失相伴六十多年的主人，蘇麻喇姑萬分悲痛。之後，她更是將撫養胤祹作為孝莊給她遺留的最後任務，加倍用心。