英國軍隊安全撤退後，華盛頓開始推算他們的去向。他分析英國軍隊可能會去紐約，於是便快速地做出了對應的安排。但是這次華盛頓估算錯了，威廉·豪將軍帶領下屬去了哈利法克斯，目標是和從大不列顛本土趕來進行支援的艦艇匯合。同時，大不列顛政府新任命的北美海軍總司令官理查德·豪勳爵也將到來。
豪將軍兄弟兩人儘管性情不太一樣，但是聯手作戰之時，仍舊十分默契，也就是說，北美大陸將變成他們聯合調兵遣將的戰場。和威廉·豪將軍不同，理查德·豪勳爵十分喜歡商業和冒險活動，他對北美洲大陸做過細緻的研究，這一點可以讓他有效地發揮艦艇的威力。英皇喬治二世就曾經這樣評價他：「此人一生都在不停地為國家效力，儘管已經年過半百，但身體卻依然十分強壯。作為一名海軍指揮官，他做事果斷、極富魅力，無論何時都能保持頭腦冷靜。作為海軍士兵，大家都願意在理查德·豪勳爵麾下效力。」
理查德·豪勳爵後來的行為驗證了以上的看法。面對這樣有力的對手，假如是以前的美國軍隊，一定會被擊垮，但自從華盛頓接任總司令官以來，美國軍隊也產生了很多變化。波士頓戰役勝利後，大陸會議認為敵軍的目的是中南美洲，因此就把那裡的殖民州化分為兩部分：一部分是弗吉尼亞、南卡羅萊納和佐治亞洲，由一名少將、四名准將負責；另一部分是紐約、賓夕法尼亞、新澤西、馬裡蘭和特拉華州，由一名少將、兩名准將負責。同時，李將軍被任命為南方戰區的指揮官，主要負責監視亨利·克林頓爵士的一切動向。
李將軍被任命為南方戰區總司令官後，加拿大遠征部隊總司令官一職就分派給了喬治·亨利·托馬斯將軍，這一職位本來是想留給菲利普·約翰·斯凱勒將軍的，但考慮到他的健康問題，大陸會議最終仍改變了初衷。儘管這樣，大陸會議對菲利普·約翰·斯凱勒將軍也還是懷有很大的希望，他被派往奧爾巴尼，保證美國軍隊後勤補給資源線的安全。假如補給資源線被截斷，遠征部隊勢必會整個部隊覆沒。在這一關鍵崗位上，菲利普·約翰·斯凱勒將軍還要照顧到紐約州加強防禦工事的建設。
李將軍是一位生性豪放的人，儘管有時候喜怒無常，打仗之時卻是勇猛無比、剛毅果斷。3月7日，他志得意滿地前去南方履任了。華盛頓對李將軍的認識十分深刻，他充分認可了李將軍的理論知識和各方面的實踐經驗。李將軍對事業的熱情、執著，並不是每個人都可以做到的。
同時，華盛頓開始大規模招兵買馬，並於4月13日抵達紐約。李將軍在任時建設的工事大部分已經完成，剩下的也正在抓緊時間進行。華盛頓猜測敵軍進攻的方向會是長島，因此他特意派勇敢善戰的格林帶一支隊伍駐到了那裡。美國軍隊在紐約的兵力總計雖然有10000人，但其中包括很多老弱病殘和一部分正在放假的戰士，實際上可以投入戰鬥的戰士不超過8000人。
紐約兵力不足，總是讓華盛頓感覺到非常憂慮。在紐約有很多人不願意和美國軍隊合作，部分人甚至明目張膽地投到了敵軍那一邊，特賴恩總督就總是住在英國軍隊的炮艦上，而且時刻和紐約的親英分子維繫著聯絡。在華盛頓的建議下，紐約州安全委員會指示取消他們這種聯繫，違者將受到嚴厲懲處。為了多爭取到一些勝利的希望，大陸軍指揮部裡所有的人，從華盛頓到戰士全部都在忙碌，他們放棄了所有娛樂活動，每天從早到晚不停地工作。儘管生活艱苦，但華盛頓夫人能留在身邊為他們帶來了很多安慰。她經常展示自己獨有的女性魅力，為指揮部注入了一股新鮮血液。
華盛頓不只要憂心紐約州的安全，加拿大美國軍隊的處境也讓他十分掛念。到了紐約後，他已經給加拿大的湯普森准將增派了四個步兵團、一個步兵連以及一支工兵隊伍，後來他又指示沙利文准將率領六個步兵團前去支援。儘管這樣，大陸會議還是不停地詢問華盛頓，是否向加拿大繼續增兵。從當時華盛頓寫給大陸會議的回信裡，我們可以看到他內心的茫然。在紐約州，華盛頓基本不清楚敵軍會從哪個地方進攻，假如貿然抽調隊伍去支援加拿大，敵軍一定會乘虛而入。那時，就算是團團圍住了魁北克，華盛頓也不敢保證威廉·豪將軍會否率軍支援。從現在掌握的情況來看，英國軍隊極可能會兵分兩路，盡力保證魁北克的安全。魁北克的戰略地位太重要了，作為英國軍隊的後方補給資源站，假如失守，英國軍隊的損失將會十分巨大。華盛頓徵求了一些將軍的意見，他們全部認為有必要加強紐約州的守備，至少要把守備隊伍增加到一萬。
直到此時，華盛頓還不清楚敵軍就要發起一次進攻，卡塞爾領主、布倫瑞克公爵全部會前去給英國軍隊助戰，並且，布倫威克的4300人以及13000名海地人已經全部加入了英國軍隊。華盛頓顯然對正在出現的事情不甚明瞭，他只能以靜制動。接下來的幾日裡，華盛頓連續接到幾份關於敵軍隊伍行進的報告。直到5月17日，他才從菲利普·約翰·斯凱勒將軍的信裡清楚了敵軍究竟想幹什麼。
班尼迪克特·阿諾德在魁北克城下受阻，在一場激烈的戰鬥中，他自己受了傷，差一點成了殘廢。但是美國軍隊並沒有因此撤退，而是繼續圍困魁北克。由於在這場戰役中的出色表現，班尼迪克特·阿諾德被提升為準將。整個冬季，魁北克守備隊伍和美國軍隊對峙著，雙方全在等候著援軍的到來。班尼迪克特·阿諾德面對著很多困難，不只彈藥快要用完，後方的補給資源也遲遲送不上來。為了補充軍需品，班尼迪克特·阿諾德被迫使用了強硬手段，這引起了加拿大人的反對和不滿。同時，很多戰士的服役期滿，已經有人要求回家。有一段時間，美國軍隊戰士人數竟然不到700人。
加拿大人的決心開始動搖。更讓人擔心的是當地居民開始對美國軍隊不滿，很多貴族階級和領主已經宣佈不再協助美國軍隊，假如態勢繼續發展下去，美國軍隊很快就要潰敗。雖然如此，班尼迪克特·阿諾德的戰鬥意志依然沒有下降。一旦有時間，他就會帶領小股隊伍前去騷擾敵軍。4月1日，伍斯特將軍帶領支援部隊從蒙特利爾趕到，而且接管了領導權。就在伍斯特到來的次日，班尼迪克特·阿諾德從馬背上摔了下來再次受傷。喬治·亨利·托馬斯將軍在4月中旬抵達魁北克，當時美國軍隊的境況十分糟糕，人數儘管增加到了2000人，但其中有數百人沒有戰鬥力。疾病、疲勞開始折磨美國軍隊戰士，部分服役期滿的戰士也要求離去。冬天很快就要過去了，如果河水一旦解凍，英國軍隊的救援應當很快就到。假如是那樣，美國軍隊的處境將會更加危險。看到河流的冰層已經開始融化，喬治·亨利·托馬斯將軍當即指示著手進攻。