1775年7月3日，雄姿英發的華盛頓把隊伍集合起來，在距離指揮部約半英里的廣場上走馬上任，就任大陸軍總司令官。在此之前，許多市民都趕到廣場旁邊的老榆樹下來看熱鬧。
華盛頓在羅伯特·李將軍的陪伴下開始檢閱隊伍，李將軍看起來很像瑞典的查爾斯二世，粗獷、高貴。華盛頓十分相信自己的這位老戰友，在宣佈就職後他就帶著這位老戰友前去查看邊防前線。
當時，駐紮在波士頓城裡的英國隊伍總司令官蓋奇已無兵可調，城裡的英國隊伍已經所剩無幾。大部隊此時仍然被阻隔在波士頓城外的隘口。美國軍隊伍形成了一個半圓形的包圍圈，從左邊的冬山到右側的杜切斯特隘口，全部都在美軍隊伍的牢牢控制之下。
華盛頓武裝起來的民兵有1.4萬人，這和過去估計的1.8萬人有極大差距。由於戰線拉得過長，嚴重損害了兵力的相互接應和補給。讓他很頭痛的是，美國隊伍中的戰士缺少組織紀律性。在視察過程中，華盛頓最滿意的是哨卡。這些哨卡通過帕特南和亨利·托馬斯將軍的加固，暫時還比較堅固。
物資低劣並且缺少組織性、紀律性的雜牌軍，牢牢圍住一座城市這麼長時間，讓華盛頓十分感慨。通過瞭解，有9000名官兵來自於馬薩諸塞州，其他5000人則來自其他各州，戰士們各自都有自己的將領，將領都是被自行推選出來或是被任命的，他們分別駐紮在自己的營地裡，將領們有的住在個人的帳篷裡，有的則和戰士住在一起。雖然條件很差，但戰士們的情緒都很高漲，這是一種不屈的精神，華盛頓把這種精神叫作獨立精神。
戰爭期間，康涅狄格州的總督喬納森·杜姆布爾是華盛頓最好的合作者，此人不但接受過良好的教育，處理公共事務的經驗也非常豐富。在美國獨立戰爭期間，杜姆布爾堪稱是一個靈魂人物，也是一位對民眾幸福忠貞不二的殖民州總督。華盛頓剛上任，杜姆布爾就寫信表示了支持，他還向華盛頓保證康涅狄格將是他最堅強有力的後盾，希望華盛頓能統一指揮隊伍，為美洲人民爭取和平和自由。
大陸會議在提拔將帥事情上有諸多不合理的地方，所以隊伍裡議論紛紛，華盛頓品格中的無私和公正派上了大用場，他負責平衡這些關係。斯賓塞將軍因為帕特南職位的提拔非常不滿，在沒有見到華盛頓的情形下就離開了隊伍。華盛頓來後做了大量的工作，他向將軍介紹了帕特南無私純潔的高尚品格和未來的戰爭，使斯賓塞將軍又重新返回了軍營。華盛頓雖然有很多朋友，社交面很廣，但對自己要求嚴格，並沒有沾染上吃喝玩樂的惡習。
由於總司令官地位的需要，馬薩諸塞州大會責成大會委員會去為華盛頓尋找男女管家和和廚師，華盛頓的地位要求他的膳食結構應體現出熱情好客的風格，管理廚房的人員為此頗費了一番腦筋。華盛頓每天都在對有關國家和軍隊的大事情進行思考，其他瑣碎事務總是安排他的副官米夫林上校去做。約翰·杜姆布爾是康涅狄格總督之子，也是華盛頓的侍從官。此人頗得華盛頓的賞識，他也喜歡呆在華盛頓身邊，非常崇拜華盛頓，但是他不久就和一位少將調換了工作，離開了華盛頓，原因是他不善於社交，恐怕勝任不了這項工作。
華盛頓將隊伍分成三個部分，分別駐守三個地方。沃德少將作為右翼，駐紮洛克斯波利高地；羅伯特·李將軍作為左翼，駐紮在前沿山和冬山一帶；帕特南少將和海思准將防守中間部位，駐紮在劍橋。7月4日，由於華盛頓的推薦，總督之子約瑟夫·杜姆布爾於7月24日被任命為兵站總督，以前在康涅狄格的時候，他就擔任過類似的職務。通過這樣一番整頓，官兵的界限和職責被劃分清楚了，軍營裡的秩序發生了可喜的變化，操練也逐漸變得正規起來。
李將軍在改革軍營事務中做了大量的工作。他總結了在歐洲戰役中的經驗，制定了一整套規章制度。但是他有些時候顯得過於粗暴，在注重自己在軍事上的權威。「上帝青睞最強的隊伍」是他的座右銘。華盛頓和李將軍不同，他喜歡以軍令的方式執行決議，十分注重工作實效。
軍營吸引著大家的目光，日常總會有許多人前來參觀，萊福槍隊讓大家震驚。那些自地方隊伍裡選拔出來的精英，都長得非常強壯剽悍，許多人的身高都超過了6英尺，個個都是叢林戰的高手。很像華盛頓早年接觸過的一些人。丹尼爾·摩根上尉是土生土長的新澤西人，他負責指揮一隻萊福槍隊。他曾經在佈雷多克軍中服過役，並且擔任過駕駛員，後來成為了一名將領。為了來到華盛頓身邊效力，他和自己的隊伍連續走了3個星期，行程超過600英里。
正當華盛頓緊鑼密鼓調遣隊伍準備攻打波士頓的時候，康涅狄格州總督和馬薩諸塞州議會分別緻信給他，請華盛頓派軍隊去沿海的幾個地方進行保護。姆布爾在信裡特別提到新倫敦地區的安全，令自己感到十分憂慮。華盛頓立刻與他的將帥們探討了這一要求，從全局出發，華盛頓不失尊重地回絕了，並且給出了明確的答覆。
華盛頓認為，把英國隊伍從波士頓趕出來是當期主要的任務，雖然波士頓的英國隊伍已經被圍困了很長時間，卻看不出有投降的意思。這是一場決定性的戰役。華盛頓命令隊伍把這個地區的牲畜趕離海岸，以切斷敵人的補給線。在重重圍困之下，英國隊伍的食品和蔬菜幾乎斷絕，戰士們已經沒有了戰鬥意志，而這時的美國隊伍則開始縮短包圍圈。隨著戰士人數的增多，一個實際的事情擺在了華盛頓面前，那就是缺少彈藥。通過多方努力，來自新澤西的彈藥幫了華盛頓的大忙，一個難題解決了。
伴隨著這場戰爭的進程，還有一件事情令人痛心：李將軍在西班牙的時候，曾經是伯格因將軍的部下，兩人交情篤厚，經常有書信往來。原本同屬於一支隊伍，現在卻為了各自的理想而戰。當李將軍聽說伯格因來到前線時立即致信問候，不久，伯格因將軍建議在雙方都要承諾保證彼此安全的基礎上，要和李將軍會一面。馬薩諸塞州地方會議對雙方會面一事進行了探討，決定批准這次會面。他們增派阿布裡奇·傑裡先生和李將軍一同前去，目的是為了不引起大家的猜疑，並規定所有會面都要有傑裡先生在場。李將軍充分考慮了事情的後果，於是決定取消會面的計劃。
華盛頓上任後把處理波士頓軍營事務做為重點，同時，其他軍營裡的事務也義不容辭，這需要統籌兼顧。蘇勒將軍於7月份發來信件，華盛頓馬上意識到了事情的危險性。這時候前方愛國志士正在前線浴血奮戰，可是在內地的紐約西部和加拿大邊境卻相繼發生了不少事情，約翰遜兄弟煽動了印第安人在紐約西部進行叛亂。還有，自從本尼迪克特和伊桑·愛倫佔領香普蘭湖和迪貢德拉以來，為了各自的利益，兩個人都在明爭暗鬥，原因很多，主要是馬薩諸塞州和康涅狄格州地方大會任命不合理，兩人都有軍事領導權和委任狀，這讓手下無所適從。雖然班尼迪克特·阿諾德自己也認為愛倫作為這個基地的指揮官比較合理，但既然議會已經給了他這項權力他當然不會主動放棄。對於如何解決這件事情，愛倫也有自己的看法。在寫給阿巴尼委員會的信中，愛倫要求增加食物和兵力，幫助自己對這個地區進行控制。紐約州地方大會的看法是，倘若這樣做了便是越權，所以把這個問題又交給了大陸會議。大陸會議在徵求了康涅狄格州大會的意見後，又認為這件事情既然發生在紐約州境內，就應該由紐約州大會解決。