洛丹倫的災難
魔獸爭霸III：混亂之治
在長達數月的準備後，凱爾蘇扎德和他的詛咒教派在洛丹倫釋放不死瘟疫，發起了第一輪攻勢。尤瑟和他率領的聖騎士們試圖調查被感染的地區，希望找到方法阻止這場瘟疫。儘管有了他們的努力，瘟疫依舊傳播並有破壞人類聯盟的危險。
看到不死族橫掃洛丹倫，泰若納斯唯一的兒子，阿爾薩斯王子挺身而出，與不死軍團戰鬥。阿爾薩斯成功地殺死了凱爾蘇扎德，但是，儘管如此，不死軍隊轉化了在戰鬥中陣亡的每一個士兵，從而日益壯大。被看上去不可抗拒的敵人不斷襲擊和挫敗後，為了戰勝對手，阿爾薩斯不斷採取極端的方式。最後，他的同伴警告他正逐漸喪失對自己人性的控制阿爾薩斯的恐懼和決心最終導致了他的毀滅。他為了追蹤不死軍團的來源到了諾森德，想要永遠終結它的威脅。沒曾想，阿爾薩斯最後臣服於巫妖王不可思議的力量之下。阿爾薩斯舉起了被詛咒的魔劍——霜之哀傷，他相信它會拯救他的臣民。儘管魔劍賜予他深不可測的力量，但也吞噬了他的靈魂並把他變成巫妖王最偉大的死亡騎士。在人性漸漸淪喪之後，阿爾薩斯率領不死軍團與他自己的王國為敵。終於，阿爾薩斯殺死了自己的親生父親——泰若納斯國王，並帶領巫妖王的鐵蹄踏平了洛丹倫。
太陽之井—奎歐沙拉斯的淪陷
儘管阿爾薩斯擊敗了所有與他為敵的人，他還是受到凱爾蘇扎德鬼魂的糾纏。鬼魂告訴阿爾薩斯他要為了巫妖王計劃的下一個階段而復活。為了復活凱爾蘇扎德，阿爾薩斯要攜帶凱爾蘇扎德的遺體直奔隱藏在高等精靈永恆王國——奎歐沙拉斯中神秘太陽之井。
阿爾薩斯和他的不死軍團入侵了奎歐沙拉斯，圍攻精靈脆弱的防禦。銀月遊俠將軍莎瓦娜斯·風行者，英勇地進行了抵抗，但阿爾薩斯最後還是消滅了高精靈軍隊並勝利到達太陽之井。在他殘忍的命令下，莎瓦娜斯的屍體被復活為女妖，使她遭到無盡的詛咒並永遠服從奎歐沙拉斯的征服者。最終，阿爾薩斯將凱爾蘇扎德的遺體浸沒在太陽之井的聖水中。儘管這一舉動使永恆之水受到污染，凱爾蘇扎德還是轉生為巫妖。復生之後更為強大的凱爾蘇扎德解釋說這就是巫妖王計劃中的下一個階段。與此同時，阿爾薩斯和不死大軍揮師向南，在奎歐沙拉斯的高等精靈無一生還。高等精靈家園，已經創建9000多年的顯赫王國——奎歐沙拉斯，徹底滅亡了。
阿克蒙德的歸來和前往卡利姆多的旅程
當凱爾蘇扎德完全復原，阿爾薩斯率領不死軍團向南直指達拉然。在那裡巫妖可以得到麥迪夫強大的魔法書，此書可召喚阿克蒙德重回人間。那時，阿克蒙德將親自率領軍團完成最後的入侵。即便是奇林托的巫師也無法阻攔阿薩斯的軍隊偷走麥迪夫之書。很快，凱爾蘇扎德為施法準備就緒。10000年後，強大的魔鬼阿克蒙德和他的宿主再一次出現在艾澤若斯的世界。達拉然並不是最終的目的地，在基爾加丹本人的命令之下，阿克蒙德和他的惡魔們跟隨不死軍團來到了卡利姆多，目的是毀滅世界之樹——諾達希爾
在混亂之中，一名神秘的先知站出來指引凡間的種族。他不是別人，正是麥迪夫——最後的守護者，從外層空間奇跡般的返回以贖回以前犯下的罪過。麥迪夫告戒部落和聯盟所共同面對的危險，敦促他們聯合起來。被世代的仇恨所困擾的獸人和人類並不贊同。麥迪夫被迫分別與兩個種族達成協議，運用預言和謊言，引導他們渡海來到傳奇之地——卡利姆多。獸人和人類很快發現了隱藏已久的卡多雷文明。
在薩爾的帶領下，獸人歷經磨難穿越了卡利姆多的蠻荒之地。儘管他們把凱恩·血蹄和他強大的牛頭人戰士看做是自己的朋友，但許多獸人開始屈服於惡魔浸染在他們體內多年的殺戮欲。薩爾最好的將領，格瑞姆甚至被原始的本能所控制背叛了部落。格瑞姆和他忠實的戰歌部落的勇士進入了阿森維爾森林，與古老的暗夜精靈哨兵發生衝突。不可避免地獸人重新踏上了好戰之路，半神人森納瑞死將格瑞姆和他的部下驅逐了回去。然而格瑞姆和部下被難以置信的憎恨和憤怒所戰勝，設法殺死了森納瑞斯並玷污了古老的森林。最後，格瑞姆幫助薩爾擊敗了最早用自己憎惡和憤怒的血統詛咒獸人的惡魔領主——馬諾若斯，贖回了自己的榮耀。隨著馬諾若斯的死亡，加在獸人身上的血之詛咒也最終消失了。
當麥迪夫努力說服獸人和人類需要形成聯盟的時，暗夜精靈正以他們特有的秘密方式抗擊不死軍團。不朽的暗夜精靈高級女祭祀，泰蘭德風語者拼盡全力阻止惡魔和不死族佔領阿森維爾森林。泰蘭德意識到需要幫助，所以她將暗夜精靈德魯依從千年的睡眠中喚醒。召喚了她遠古的情人馬歐弗容恩·暴風之怒，泰蘭德成功地加固了防禦並驅逐了不死軍團。有了馬歐弗容恩的幫助，泰蘭德開始奮起消滅燃燒軍團和他們的不死盟軍。
當尋找更多冬眠中的德魯依時，馬歐弗容恩發現關在古老墳塚監獄中他的兄弟，伊利丹。泰蘭德確信伊利丹會加入他們對抗不死軍團，便釋放了他。儘管伊利丹幫了他們一段時間，他還是逃走追逐自己的利益。
暗夜精靈下定決心團結在一起與燃燒軍團戰鬥。軍團從未停止對永恆之井的渴望，它是世界之樹力量長久的源泉，也是暗夜精靈王國的心臟。如果攻擊世界之樹的計劃成功。惡魔將一點點瓜分世界。
聖山海加爾之戰
在麥迪夫的指引下，薩爾和卡利姆多人類勢力的領袖，吉安娜普勞德摩爾，意識到他們必須將撇開成見。同樣地，在馬歐弗容恩和泰蘭德的領導下，暗夜精靈也意識到如果要保衛世界之樹，他們也必須團結。為了同一樣的目標，艾澤若斯世界上的種族齊心協力，盡最大的努力來保護世界之樹的能量。擁有超群力量的馬歐弗容恩成功釋放了諾達希爾的原始狂暴，完全摧毀了阿克蒙德和軍團殺奔永恆之井的部隊。最後一戰動搖了卡利姆多大陸的根基。無法從永恆之井中汲取力量的燃燒軍團，被凡間的聯軍所擊潰。
背叛者的宿命
魔獸爭霸III資料片：冰封王座
在燃燒軍團入侵阿森維爾期間，被關了一萬年的伊利丹從墳塚監獄被釋放出來。儘管他試圖滿足同伴，但還是很快露出本來面目並吸收了名為古爾丹頭骨中的能量，那是擁有強大力量的術士寶物。這樣，伊利丹具有了惡魔之軀和強大的力量。他也得到了一些古爾丹古老的記憶——尤其關於薩格拉斯之墓的，傳說那個島地下城中存放著黑暗泰坦薩格拉斯的屍體。
充滿力量並重獲自由的伊利丹再一次踏上漫遊世界的旅程，他要尋找一個可以實施自己偉大計劃的地方。然而，基爾加丹找到了伊利丹，給他一個難以拒絕的命令。基爾加丹對阿克蒙德在海加爾山被擊敗感到非常惱火，但他有比復仇更重要的事情做。感覺到他創造的生物巫妖王的力量日漸強大，難以控制。基爾加丹命令伊利丹去毀滅納祖並消滅所有不死天災。作為交換條件，伊利丹可以得鮮為人知的力量並在殘存的燃燒軍團領主中獲得一席之地。
伊利丹同意了，立即動身去毀滅冰封王座——巫妖王靈魂居住的冰晶體。伊利丹清楚他需要強大的寶物毀滅冰封王座。運用他從古爾丹記憶中獲取的知識，伊利丹決定找到薩格拉斯之墓，獲得黑暗泰坦的遺物。他召喚了古老的海伯恩的殘餘並從黑暗的海下巢穴中把蛇型那加引誘出來。那加在狡猾的女巫瓦斯帶領下，幫助伊利丹到達了傳說中薩格拉斯之墓所在的破碎之島。
伊利丹和那加出發後，典獄長瑪維·影之歌開始追捕他。瑪維看守了伊利丹一萬年，現在要再次把他抓獲。然而，伊利丹設計逃脫瑪維和她的獄卒的追捕，成功地得到了薩格拉斯之眼。帶著它，伊利丹來到了從前的巫師城市——達拉然。在城市土地能量線的輔助下，伊利丹用薩格拉斯之眼對巫妖王的位於遙遠諾斯然的的冰冠老窩施了毀滅性的法術。伊利丹輕而易舉地擊潰了巫妖王的抵抗，打破了世界屋脊。在最後關頭，趕來協助瑪維的他的兄弟馬歐弗容恩和女祭祀泰蘭德，阻止了伊利丹的毀滅性法術。
深知基爾加丹對他毀滅冰封王座失敗的不滿，伊利丹逃到了荒涼的外域：君諾大陸最後的殘餘，獸人從前的家鄉。在那裡他躲避基爾加丹的憤怒，計劃下個步驟。在成功阻止伊利丹後，馬歐弗容恩和泰蘭德回到阿森維爾森林保護他們的人民。然而瑪維沒有輕易離開，他追隨伊利丹到了外域，決定把他帶回去審判。
血精靈的崛起
與此同時，不死天災把洛丹倫和奎歐沙拉斯徹底改造成了毒氣瀰漫的瘟疫之地。只有一小股聯盟的抵抗力量留了下來。其中一群主要由高精靈組成，由太陽行者王朝最後的王子：凱爾薩斯領導。凱爾，本身就是名法力超群的巫師，逐漸意識到聯盟的失敗。高精靈為家園淪喪感到悲哀，為對死難的人民表示尊重，他們決定稱自己為血精靈。儘管他們在絕境中全力防衛天災，但與賦予他們法力的太陽之井切斷聯繫使血精靈十分痛苦。為了要滿足族人對魔力的依賴，凱爾做了不可思議的事：他投靠了海伯恩的先祖，加入了伊利丹和他的那加，目的是找到可以依靠的新的魔法力量。聯盟指揮官指控血精靈為叛徒，將他們從善良陣營中驅逐。
走投無路之下，凱爾和血精靈跟隨伊利丹到了外域，在那加和血精靈聯軍的幫助下，伊利丹擊敗了一直在追捕自己的典獄長瑪維，擺脫了她的糾纏。以外域為基地，伊利丹集聚力量發起了對巫妖王和他的冰冠要塞的第二輪攻擊。
瘟疫之地內戰
巫妖王納祖知道他時日不多。在冰封王座的禁錮中，他懷疑基爾加丹會派人毀滅他。伊利丹強大法術的傷害已經使冰封王座破裂，因此，巫妖王的力量也日漸衰弱。為拯救自己，他召喚了最強大的僕人：死亡騎士阿爾薩斯王子。
儘管自己的力量也隨巫妖王的虛弱而漸漸流逝，阿爾薩斯還是挑起了洛丹倫的內戰。在女巫西歐瓦納斯帶領下的一半不死軍隊政變，一舉控制了不死帝國。在巫妖王的召喚下，阿爾薩斯被迫將不死天災留給凱爾蘇扎德掌管，戰爭擴散到了整個瘟疫之地
最後，西歐瓦納斯和她的反叛不死軍隊（被稱為放逐者）佔據了洛丹倫廢棄的首都。在殘破城市之上建立他們自己的防禦工事，放逐者發誓要將凱爾蘇扎德和他的走狗趕出這塊大陸。
決定拯救自己的主人，虛弱的阿爾薩斯抵達了諾森德卻只發現伊利丹的那加與血精靈聯軍在等著他。他與奈如伯盟友要飛速趕到寒冰王冠冰河保衛冰封王座，而伊利丹的部隊也在去那裡的路上。
巫妖王勝利
即使已經很虛弱，阿爾薩斯還是趕在伊利丹之前到達了寒冰王座。阿爾薩斯用手中的魔劍——霜之哀傷劈開了困住巫妖王的冰牢，並因此釋放了納祖的附魔頭盔和胸甲。阿爾薩斯戴上了有著不可思議力量的頭盔，成為新的巫妖王。納祖和阿爾薩斯的靈魂融合在一起，變的無比強大。如納祖所預料的，伊利丹和他的部隊倉皇逃回外域。阿爾薩斯成為世界上最強大的魔物。
現在，新的不朽巫妖王阿爾薩斯居住在諾森德，傳說他正致力於寒冰王冠老巢的重建。他的得力助手凱爾蘇扎德率領著瘟疫之地的不死天災。西歐瓦納斯和放逐者們龜縮在特瑞斯福林地，那只是被戰爭分裂的王國的一小部分。
古老的仇恨：卡利姆多的殖民
儘管勝利屬於他們，凡間的種族發現他們處於已經被戰爭破壞的世界中。不死天災和燃燒軍團毀滅了洛丹倫的文明，在卡利姆多也幾乎完成了他們的侵襲。森林需要治癒，積怨需要撫平，家園需要重建。戰爭在每個種族身上留下了深深地創傷，從聯盟和部落簽定了脆弱的和約開始，他們已經無私地緊密團結在一起，為一個新的開始而努力。
薩爾領導獸人前往卡利姆多大陸，在他們牛頭人朋友的幫助下建立新的家園。為了紀念薩爾被謀殺的父親，他們把這塊土地命名為杜若塔。獸人們定居下來重建一度輝煌過的社會。現在惡魔的詛咒結束了，部落從好戰尚武的整體變有些分散，專注於生存和繁榮而不是征服。在高貴的牛頭人和狡黠的黑矛部落巨魔的協助下，薩爾和獸人們在自己的土地上開創新的紀元。
剩餘的聯盟力量在吉安娜普勞德摩爾帶領下定居在卡利姆多南部。遠離塵翻沼澤的東岸，他們建造了簡陋的港口城市希拉莫。在那裡，人類和矮人的聯盟為了在這塊經常威脅他們的土地上力求生存。儘管杜若塔和希拉莫的保衛者們簽定了休戰協議，但殖民地脆弱的和平不會持續太久。
人類和獸人之間的和平在強大的聯盟艦隊到達卡利姆多後瓦解了。強大的艦隊在海軍上將戴林·普勞德摩爾（吉安娜的父親）的指揮下，在阿爾薩斯毀滅王國前啟航，已經在海上艱苦航行了幾個月之久。普勞德摩爾上將在尋找他能找到的所有聯盟倖存者。
普勞德摩爾的艦隊給這個地區的穩定帶來了嚴重的威脅。作為第二次戰爭中知名英雄，吉安娜的父親是部落堅定的敵人，而且他決定在獸人們站穩腳跟前毀滅杜若塔。
普勞德摩爾上將逼迫吉安娜作出可怕的決定：要麼支持他與獸人戰鬥並背叛新建立起來的聯盟，要麼為了維持聯盟與部落達成的脆弱的和平與他親生父親為敵。在靈魂的煎熬中，吉安娜選擇了後者，她幫助薩爾擊敗了她瘋狂的父親。不幸地，在吉安娜來調解或證明獸人不再是嗜血的怪物前，普勞德摩爾上將戰死沙場。被她的忠誠打動，獸人允許吉安娜的部隊安全返回希拉莫的家園。