楊增新一直認為自己並不在中央政府打擊的範圍內，他一直認為在楊洪森的關照下，他這個新疆王至少還可以幹上十年。其實他一直都在楊洪森的打擊的目標行列之內。只是因為他佔了地理上的優勢，才輪到現在。王多章事件只不過是楊洪森剷除他的借口。
楊洪森試探在國會提出的派兵進入新疆的議案遭到了駁回，所以他正在考慮別的辦法，繞過國會向新疆增兵。
新疆公署主任王多章被解職回南京，返回內地的途中行至哈密，在哈密王的幫助下解除了楊增新護送衛隊的武裝。
國府派兵進入新疆時，在哈密駐防有一個團，將哈密王給保護了起來。哈密王原來的部隊，被編為儀仗隊，哈密王接受了國府的建議，放棄了軍事、外交權，接受國府直接領導。
哈密成為了中央進入迪化的前進基地。楊增新並不是沒有注意到這支駐紮在哈密的中央軍，只是他將新疆地方部隊團的編制與中央團的編制等同化。
中央駐哈駐軍兵力將近3人，擁有卡車85輛，主要擔負著省城迪華至蘭州的交通運輸。駐軍在哈密老城還創辦了槍修所、火柴廠、皮革廠、被服廠，楊增新從來未將這些部隊看作戰爭部隊，而是作為生產部隊。
國府在哈密除部署主力團外，另編有數個農墾師，平時從事農業生產，戰時作為民兵武裝，配合中央軍作戰，王多章到達哈密後開始對擴大民兵武裝。
楊增新的派出去的衛隊幾個星期不回，這讓他漸漸生疑，從他在哈密的眼線提供的情報來看，王多章正在為武力驅逐他做準備，並且拉起了一支由漢、回、維組成的近萬人的部隊。
根據來自阿克蘇方面的報告，喀什方面的中央軍沒有新的動向。
楊增新進一步關注著哈密方面的動靜，王多章在哈密沒有折騰多久就離開了，擴建起來民兵武器，作為集訓結束，又重新打回了各所屬農墾師。
楊洪森的來電十分親密，顯然出王多章在哈密的行動純屬個人行為，中央對新疆的政策不會動搖。
這份電報並未讓楊增新更安心，反而更害怕了。
中央進入新疆後，他在專制統治引來了各民族的不滿。南京派至新疆的幹部，都是從基層爬上為**積極份子，接受過西學，普遍擁有著中學文化程度。他們將內地的那一套帶到新疆，為楊增新獨裁下的百姓吹來了一股新風。楊增新並不喜歡這些新東西，因為它會純樸的新疆人的思想變的複雜，他們就會產生一些不應該有的想法，這不利用新疆的穩定。
「總理，來自新疆方面的電報。」
楊增新仍然在推脫人力不足，不願派兵進佔伊犁、塔城以西的土地。而他的理由是這些地區，目前居住的都是老毛子，沒有中國人，而且白匪實力強大，對於中國來說這是一塊飛地，搞不好還會引來白匪對新疆內地的入侵。
「楊增新怕什麼，現在南京政府就這麼無能嗎？」
楊洪森遠實際沒有看上去的那麼惱火。
楊增新的電文並不是完全沒有道理，地方上有地方上的困難，可是楊洪森一心要搞掉楊增新。
「我們應當向新疆再派遣2至3個陸軍師。」
「那麼楊增新會怎麼看呢？」
「個人利益應退居於國家利益之後，我認為楊增新不能有效的處理好個人與國家的利益關係。」
「對於新疆的穩定，楊增新還是做出很多的貢獻的。」
「對於守土他是有功的，但是由於保守而使的南京政府無法收回對巴爾喀什湖44萬平方公里土地權益，那麼必將成為將國家的罪人。」
楊洪森要不惜一切代價收回國土，那可是44萬平方公里，可不是85平方米三室一廳。
南京方面給迪化的楊增新發出的措詞嚴利的電文，要求其迅速向西，收得失地。
不管是白俄還是紅俄，在楊增新看來都老毛子，老毛子可沒有一個好東西。讓他與紅俄合作打白俄，他才不摻合此事。
他採用步步為營的策略，行動極為遲緩。
由於他對俄國人採用一視同仁的態度，造成了很多準備投降中國人的白俄乾脆繼續當起了土匪，反正這地區暫時沒有管，他們就是大王。
迪化省主席禮堂內楊增新對著出征的將士訓話，新疆各界人員均參加了會議。
主席台的楊增新還是那樣一幅外人看來千年不變的冷酷表情。
就在他準備講話的時候，兩名下級軍官突然竄了出來，對著台上的楊增新連開數槍。主席台上一片大亂，兩名刺客並沒有逃跑，而是雙雙飲彈自殺。
楊增新遇刺，省府迪府頓時陷入無政府狀態。由於兩名刺客自殺，楊氏遇刺變得極為詭異，坊間有著各種各樣的流傳。
省府立即向南京發去電報，孫中山震驚。國府緊急任免樊耀南代新疆省長一職，接著調王多章回新疆擔任主席。
楊增新手下的軍官認為此事是中央所為，樊耀南等人與南洋合謀，楊派軍官聯合盧來發動叛亂，將樊耀南等新疆高級官員給殺了，接著與阿爾泰、塔城、阿克蘇方面聯繫，準備共同抵制中央政府。
樊耀南一死，整個事件就被定性成了嚴重的叛亂。
楊洪森以中華民國軍事委員會的名義，繞過國會直接調動軍隊向新疆增派武裝力量。
迪華的一些軍人指責楊增新遇刺乃是南京政府所為，南京方面求新疆軍人保持克制，停止叛亂，維護當時的治安和經濟穩定，等待中央派員對整個事件進行調查。
阿爾泰、塔城、阿克蘇的地方官員自守門戶，使得叛亂僅限制於迪化一線。
維吾爾上層貴族對於可能中央與地方之間的鬥爭敬而遠之，不過以哈密王等人為首的王宮卻緊緊的跟在南京政府身後，哈密王政治呼籲給南京政府以及楊洪森留下了很好的印象。
軍人首領在佔領迪化後要求南京政府對他們進行委任。
楊洪森利用中央宣傳工具，將楊增新的遇刺，描述成北疆內部某些心懷不軌之徒的叛亂。
南京政府拒絕了迪化軍人的要求。
為了阻止中央軍進入迪化，他們在奇台與哈密的中央軍進行了激戰。這支地方部隊在中央軍的武器相差甚遠，大量的騎兵在機關鎗的交叉火力下永遠的留在那片戈壁灘，奇台一役沒有任何懸念，缺乏統一領導和組織叛軍根本無法戰勝中央軍，即便他們取得奇台局部的勝利，也無法抵抗後續進入新疆的數萬大軍。
奇台一役加速了迪化叛軍的瓦解，士兵們不再聽從上官的指揮，他們開始在城市內大肆搶掠，事件已經變成了一場真正的叛亂。不過隨著中央軍大舉進入新疆，形勢這個時候越來越明朗。
楊增新遇刺、樊耀南遇害，楊增新集團的大小官員全都眼巴巴地看著伊犁鎮守使。
新疆百姓流傳著「文有樊耀南，武有楊飛霞」。此兩人在，則新疆天下太平。
楊飛霞對於楊增新和中央的矛盾不是不知，只是他寧可守在伊犁也不摻合。現在他必須表明態度，在電報中他願意接受中央領導，同時呼籲叛軍向中央軍投降，爭取寬大處理。楊飛霞的通過促使迪化叛軍迅速瓦解。而在這個時候迪化城內的另一夥正在密謀奪取新疆的這座省城。