雙執政官體系的十年是沙星文明迷茫的十年，首先，沙星人民經過一次內亂之後，失去了黃金年代、白金年代的熱情，人類自私貪婪的劣根性被內亂中種種事端所激發，對於很多人來說，內亂中的發生的種種醜惡行為無疑是一種強烈的暗示——人原來還可以這樣做！伴隨這種情緒而來的就是道德、自我約束力的淪喪！貪污、搶劫、詐騙……種種不良行為暫露頭角……
87年5月，一名宇宙艦隊後勤部中校接受賄賂，隱瞞了一批質量不合格的軍用餐杯，事發東窗，這名中校被處以死刑，其他涉案軍隊人員則因玩忽職守罪被開除軍籍。中校受刑前曾上訴，要求給予改過自新的機會……軍事審判團首席的答覆是「不是不給你改過自新的機會，但是，你必須先贖你的罪！很遺憾，對於沙星來說，你的這種褻瀆軍隊榮譽的罪已經超過了你生命的價值，所以，你只有死路一條！」
此次著名的「軍杯案」是一個標誌性的分水嶺，以此為界限，軍隊系統對於違紀行為加重處罰，三年間先後有25000多人遭到開除軍籍處分，48人判死刑，其中不乏少數錯誤很輕的人！這種過激處罰雖然犧牲了個體利益，卻維護了軍隊的整體榮譽，總參謀長巴比倫羅訓言說「軍隊可以給你的無上榮耀和優越的生活條件是以高度的自律為代價的，沒有控制力的傢伙趁早退役！軍隊是不尊重個人利益的！榮譽和恥辱才是軍隊最大的桎梏！」這種霸道的邏輯最終維護了軍隊的光榮，無論沙星社會如何的道德淪喪，軍人身份依然受到所有人的景仰。
除此之外，軍事執政官與政事執政官之間的明爭暗鬥也是伴隨迷茫年代揮之不去的痼疾……
沙元85年5月，雙執政官體系運轉剛一年，政事執政官提出沙星軍校作為公民資格體系的延伸，應該歸屬政事官管理。軍事執政官方面堅決地否定了這一提法，認為公民資格體系到沙星人獲得公民資格就告一段落了，軍校完全是宇宙艦隊後備人才基地，當然歸屬軍事執政官管理了……雙方爭執不下之際，巴比倫羅又出奇招，安排軍事執政官江雨視察軍校，並以方博威弟子的身份給廣大軍校生講課。任軍校校長十年的不敗名將方博威在軍校的威望是連開國元勳揚風也不能比肩的，借方博威的人氣，江雨很快得到軍校生的邀請出任沙星軍校榮譽校長。這下子，除非周青本人出馬，否則誰也沒資格爭軍校的控制權了，而非軍人系統的周青很難在軍校獲得完全的，暗自盤算之後，周青只好放棄了控制軍校的想法……
沙元86年8月，政事執政官提出立法權歸議會，執政官只具有執法權。這場爭執持續整整一年，到87年9月，長老會首席長老艾得華去世，麥可長老繼任首席位置，長老會出面立法權歸議會的提案。無奈之下，巴比倫羅提出了政事執政官對立法具有一票否決權，為執政官體系保留了一分退路，但是，在周青任職期間，顯然這種否決權不大會有機會使用……
沙元88年2月，著名的「軍杯案」剛剛塵埃落定，幾名法理學者就對沙星軍隊的內部條例提出異議，認為它違反法理原則，超脫沙星法律體系之外，應該予以取締，至少，應該由立法機構議會進行整理後重新發佈……巴比倫羅對此的答覆是加緊查處了一批違紀軍官，處死了12名犯有嚴重罪行的軍人，然後冷笑著對公共新聞網絡說：「沙星文明起源於方舟艦隊，所以，軍隊系統才是沙星的根本，如果內部條例和議會的什麼東西衝突的話，要改的是議會！你們不要本末倒置了！」
同年11月，軍事執政官方面發動反擊，認為公共新聞網絡資訊多有不當之處，議會管理失職，而且，軍方需要有自己的媒體平台跟廣大民眾交流。於是，次年4月，不顧議會的反對，軍媒網向全沙星開通，依靠軍隊的威望和廣大民眾對軍人生活的好奇與嚮往，在加上巴比倫羅組織的幾次演習直播，軍媒網迅速取得與公共新聞網絡的分庭抗禮的地位……
沙元92年1月，政事執政官提出治安部隊擴軍案，要求給治安部隊配備大型艦隻和新型武器，在治安部隊基礎上重建守護者艦隊，在四軍之戰中顯露頭角的第15空間站萊恩克爾上校領少將軍銜成為新守護者艦隊的指揮官。軍事執政官方面起先對此事冷眼旁觀，到93年初，待艦隊大體成型後，突然以檢閱實力為名組織軍演，結果，新守護者艦隊在與麥克代斯指揮下的眾神艦隊、羅雨禾指揮下的亢龍艦隊以及江雨本人指揮下的遠征艦隊的對抗中被打的找不到北，三戰三敗，而且遭遇的都是全軍覆沒的圍殲戰……一時間，新守護者艦隊在沙星幾乎成為笑談……
雖然一直爭鬥不斷，但是，慶幸的是巴比倫羅這個老參謀長能夠獨當一面，軍事執政官江雨本人則可以將全部精力集中於沙星文明的科技力量和空間能力的發展，十年來，沙星宇宙艦隊以降臨帝國為假想敵，進一步完善了第二空間填塞戰術。同時，在念能部總長李星和遠征艦隊念能部指揮官、執政官夫人徐郡的通力合作下，集團化第四空間跳躍得到突破性進展，以大量的念能水晶為的1000單位以下的艦隊意念空間跳躍也獲得了成功……
與日益增長的空間能力相伴隨的是沙星文明的擴張力。在迷茫年代中，鑒於對已知的世界沒有切實地控制，沙星文明在擴張策略方面有所變化，宇宙艦隊探索部原先的勘探隊進行了重組，並建立了專門的移民部，負責在整個仙女星系內適宜居住的行星上建立移民基地，而仙女星系外的其他星系的勘探工作都暫時停止了下來。但是，由於第三空間的存在，源源不斷的反物質供應使得在資源方面沒有特別的需要，所以，移民星球建設的必要性並沒有得到沙星高層的認可，到沙元94年初，僅僅在仙女星系的外圍恆星系建立了幾個類似前哨站的移民星。與之相對應的是，在荒漠星系內，15個行星除了最內層緊鄰沙星太陽的烈炎星沒有開發之外，其餘14行星全部得到完全開發，其中，冰原星人口達到8億，艷陽星6億，沼澤星3億，戈壁星2億，其餘各大行星基本保持在5000萬到1億的水平，而沙星本身人口卻有所下降，大約只有15億人仍舊定居於此，到沙元93年末沙星執政府人力資源部的人口統計數字是4,123,619,822，其中天擇者大約3億9千萬人……
銀河方面，魯左星人忠實地履行了盟友的職責，將降臨帝國的動態及時地反饋到沙星：降臨帝國在十年間穩步地向整個銀河擴張，在銀河各個角落建立智能化基地，銀狐率領的帝國艦隊日益強大，單以規模而論，比起鼎盛時期的風雷艦隊也不遑多讓。與此同時，魯左文明本身也從風雷帝國造成的破壞中復甦，借助沙星的反物質技術和力場技術迅速崛起，儼然成為真正的銀河系實力大國！魯左王族諾達克米西甚至隱約向江雨提起了先發制人，會攻降臨帝國的作戰計劃……
沙元94年1月，軍事執政官和政事執政官產生新的分歧。因為按照克裡南執政時代的慣例，從公民資格體系培教部出來的年輕人們，如果表現出特別超人的天賦，譬如類似於周青的優秀天擇者等，會被沙星軍隊破格直接授予公民資格然後應征服役。這種手段雖然並不公平，但是，對於當時沙星白金年代意念文明發展的要求以及念能力這種特殊的需要天賦的能力來說，是非常必要的，如果不是採取這種手段直接集中了大批優秀天擇者的話，沙星意念文明發展至少要被滯後10年。到了迷茫年代，軍隊系統繼續利用這種措施收攏人才，而沙星的社會中，像周青這樣能真正有魄力拒絕軍隊的人並不多，於是，大量的人才被軍隊直接從培教部調走，這引起了政事執政官的反感。周青聯合議會和長老會共同提出抗議，認為這種破例的公民資格授予方式是針對白金年代沙星意念文明起步的特殊情況制訂的，在現階段的沙星應當予以取締，以保證公民資格體系的公平性，而實際上，如果真的是優秀人才的話，並不需要花過多的時間來獲取公民資格，所以，這種犧牲公平的方法得不償失。而軍事執政官方面，巴比倫羅以降臨帝國大敵在側，沙星宇宙艦隊新開發的第四空間跳躍戰術急需大量天擇者為理由，拒絕取締這種做法。於是，周青下令人力資源部停止簽發新一批破格授予者的公民資格，軍隊如果再直接徵用這批人員的話，那就意味著「非公民也可以直接參軍！」這就是整個公民資格體系的崩潰。無耐之下，巴比倫羅離開冰原星基地，親自趕往沙星斡旋協調，誰知道周青居然閉門不見，要求與軍事執政官直接對話。巴比倫羅大怒，通過軍媒網發表講話，認為政事執政官在故意拖延軍隊的發展，動搖沙星文明的根本！這是雙執政官體系以來，軍、政矛盾第一次擺到了檯面上，在40億人民眼前爆發……眼看10年來至少表面上穩定的政治局面就要再度崩潰……