清虛離了大赤天一路直如風馳電掣般向王屋山飛去，俗話說山中方一日，世上已千年。在這聖人道場呆了一炷香的功夫，誰知道人間已然過了多長時間。就這樣等清虛回到王屋山之時神農已然在上清觀等了數月。
原來清虛在去大赤天之前便將神農相貌告知孔宣和白翎童子二人，讓他們在神農來時將神農留在王屋山，他自己去去就來。不料這一去便是數月時間，神農憂心族民，若不是孔宣與白翎二人苦留，神農怕是已然回了陳地。
清虛進入上清觀大殿便讓白翎將神農煥來，神農聞聽白翎言道老師已歸，便急忙趕來。進入大殿見清虛端坐於蒲團之上便大禮參拜道：「弟子神農氏參見老師，老師萬壽。」清虛虛空抬手將神農扶起說道：「你的來意我已知曉，但是為師並不精通於丹術。」
還未說完便見神農一臉的失望忙說道：「不過為師已然從太清境大赤天求得煉丹之術。當將此法傳授於你。」神農聞言大喜忙準備拜領，卻又聽清虛說道：「不過此術乃聖人之法，不可輕傳。」神農忙問道：「那要如何才能得傳這聖人之法？」清虛笑言道：「此事說難也難，說易卻也是極為容易。」
神農忙問道：「究竟是何法？」清虛道：「無它，只要一誠心爾。」說完便閉目入定去了，不在理會神農。神農苦思良久方一臉釋然，出門駕雲而去。
孔宣待神農離去之後便進殿問到：「老師，那丹術大老爺不是已然交給老師，讓老師傳於神農麼？怎的老師又要為難於他？」清虛笑道：「癡兒，大師伯雖說將此書卷交與為師，讓為師傳於神農，但聖人之術又豈是可以輕易傳人的？不讓他經歷一番怎顯得此術之貴重，況且聖人雖為聖，卻也為人。大師伯為人教教主，如此也可是眾生知曉大師伯的恩德。」說完便再次閉目入定去了。孔宣聞言思索片刻後搖搖頭離去。
卻說神農自離開九華山便日夜不停的趕赴陳地，待到得陳地便召集眾人說道：「我師欲傳我煉丹之術，但此術為聖人所傳，不可輕授，你等可隨我沐浴齋戒，七天後隨我同拜太清聖人，以求聖人傳下丹術救我萬民。」說完便讓人開始修建祭壇，自己也在打坐片刻略恢復元氣後便帶領眾人沐浴齋戒。
七天後，神農讓人在祭壇上擺上混元無極太上人教教主太清聖人太上老君之靈位，靈位前供奉時令鮮果、豬牛羊三牲。神農率眾族民拜祭道：「下界弟子人皇神農氏率天下萬民叩首頓拜，洪荒萬民不識草木丹石之術，病無所醫，今弟子率萬民在此頓拜，請聖人教主慈悲，傳下丹術救我洪荒萬民！」
神農生後眾人皆拜道：「請聖人慈悲，救我洪荒萬民。」可那靈位卻是無有絲毫反應，神農想起老師曾言欲得此術須有誠心，便也不起身一直拜伏於地。眾人一直這樣從早跪到晚，又又由晚跪倒早，那靈位始終無有一絲反應，眾人直跪了三天三夜，除卻一些老弱無法持久暈倒之外，其他人皆一直跪於原地。
突然從三十三天外降下一道清光罩在靈位之上，進而將所有跪拜之人包於其中，眾人只覺一股清涼之氣從頂上灌下，不但這三天三夜跪拜的困乏一掃而空，而且多年的痼疾也是全部消失。
眾人待清光散去後皆拜謝道：「多謝教主聖人！」清虛見天降祥兆便知大師伯已然同意此時將丹術傳於神農便現出身形對剛剛起身的神農說道：「神農，吾奉聖人之命將此丹術傳於你，望你用此丹術救治萬民，不要辜負太清聖人傳你丹術的心意。」說完便將那一卷丹書交給神農，又從袖中將太上老君所煉的丹鼎取出，說道：「此鼎可喚之『神農鼎』，乃是太清聖人怕你煉丹沒有好的爐鼎專門替你所煉。」說著便將神農鼎交給神農。
神農接過神農鼎後又再次拜謝太上老君賜鼎。清虛見此事已完便對神農說道：「你我以後要再見面卻是不知在何時了，望你自己珍重，一切好自為之。」說完便駕祥雲而去。神農感念太上老君賜下丹術、爐鼎以救萬民，便在人族各部落建太清觀，讓百姓知道老君的恩德。又念清虛為兩代帝師功勞卓著，便命人在陳地修建上清觀主祀上請聖人通天教主，清虛道君陪祀，截教之名開始在人族之中傳播。清虛卻是成為道門二代弟子中第一個揚名洪荒的。
神農自得到丹書之後便在陳地苦苦鑽研，以求早日學會煉製丹藥之術，以便傳於族人，早點解決困擾族人的病痛。這且不說。此時清虛已然來到軒轅丘，因為此時未來的人皇——公孫軒轅已然出生，清虛要趕在廣成子前面收其為徒，以廣大截教門戶。
卻說在軒轅丘有個人族部落叫——有熊，其部落首領叫少典，少典有兩位夫人，其中一位叫附寶。有一天晚上，附寶見一道電光環繞著北斗樞星。隨即，那顆樞星就掉落了下來，附寶由此感應而孕。懷胎24個月後，生下一個小兒，少典為之起名叫軒轅。
軒轅一生下來，就顯得異常的神靈。生下沒多久，便能說話，族人皆異之。這一日少典正在處理族中之事，突然有人來通報說是被稱為兩代帝師的仙人清虛道君前來，少典大驚，忙叫那人帶路自己前去參拜，通報之人說道清虛道君已在自己家裡，少典忙一路小跑跑到自己家中，剛進家門便見一身穿月白道袍，頭戴紫金九宮冠的道人正坐於家中，懷中抱著自己的少子公孫軒轅。少典忙上前參拜。
清虛將其扶起道：「你就是有熊部落的少典？」少典答道：「在下正是。不知仙長駕臨此地有何要事。」清虛笑道：「族長不必擔心，貧道次來只因族長之子軒轅與貧道有師徒之緣，貧道欲帶起上山修煉，不知族長意下如何？」少典聞言大喜想道「清虛仙長收兩徒皆為人皇，難道我兒有人皇之命？就算不能為人皇，能得清虛仙長教誨也是天大的機緣啊。」想道此處便說道：「能得仙長收小兒為徒是小兒的福分，在下又怎能不答應。」
附寶聞言雖然不捨，但附寶也是聰慧之人，知能得清虛道君收為弟子日後必能成為一大才。清虛見少典夫婦已然同意便說道：「那貧道就將其帶走了，十五年後貧道便會放其歸來。」說完便駕祥雲向王屋山飛去。