段飛的船隊第二日便離開了蘇州，繼續沿運河南下，華明等人各自帶著一批錦衣衛前往任務所在地輔助防禦，段飛的船在嘉興停靠了許久，從船上搬下許多巨大的箱子，這些箱子都沒法讓人來抬，而是用滾木的方式，幾個人拉幾個人推，好不容易轉到一些底較平的小船上，由剛投靠段飛的蘇州衛千戶韓星率領五百名從蘇州帶出來的衛所兵押送往海寧衛。
韓星哭喪著臉目送欽差船隊繼續南下前往杭州，他的心情跟剛離開蘇州時截然不同，因為段飛一路上跟他說了許多話，交待了許多事，他的任務沒有想像的那麼簡單啊。
隨行的還有一個名叫烏懷安的錦衣百戶，負責改船裝炮的就是他。
段飛的船下午抵達了杭州，杭州知府邵世潔聞訊趕來相迎，這人是王景隆剛提上來的，能力出眾且頗有廉潔之名，原來的知府已經被王景隆摘了頂戴，送南京吏部候審去了，杭州官府也被清洗了一道。
從錦衣衛獲取的消息來看，這個邵世潔的祖上曾有人做過生意，因此家境富庶，對開海通商持支持態度，雖然對土改頗有微詞，但是對蘇州搞的工業化生產模式還是挺感興趣的，上任不到兩個月，他已經在杭州做了些工作，召集杭州幾個大商家討論過，大家都頗有興趣，只要時機得當，估計也要走蘇州的路子。
邵世潔按照官場規矩設宴招待段飛，相陪的除了杭州府官員之外，還有許多杭州當地的大賈，席間客套一陣之後大家便開始出言試探，對於樂意接受新思想的人，段飛是來者不拒的，他欣然回答著大家的問題，不論提問者是官還是商，只要有人問了，他就盡可能的詳細回答，將改革開放的前景盡情宣揚，並且做了許多許諾，只要他在位一日，就絕不會讓大家的投資打了水漂。
邵世潔小心翼翼地提議道：「大人，下官有意向蘇州學習，搞『改革開放』，不過不知道朝廷裡會有什麼反應……」
段飛道：「皇上定然是支持的，不過朝中官員多半會反對，邵大人不必著急，等你的正式任命下來，本官也準備妥當，在朝中有了奧援之後，杭州再大舉改革不遲。」
邵世潔點點頭，說道：「下官明白，就等大人順利剿倭回京坐鎮了！」
段飛微微一笑，看來外地官員也知道他在朝廷裡缺少能夠扛得住的幫手啊，錢如京獨木難支，而且他的份量跟楊一清、王守仁等相比又太輕了點，還沒有辦法影響朝中風向，倘若段飛不能回京坐鎮，就得把一個有足夠份量又得皇上信任的人提上去，在段飛心中，這個人就是蘇州知府桂萼。
段飛沒有將心中的想法當眾說出來，他只是微微點頭，說道：「估計還要大約半年的時間，不過你們可以先在杭州小心試點啊，這個事情早辦早好，遲了就被別人搶了先手，後面要追可就難了。」
大家心領神會地連連點頭，在段飛耐心解釋下，基本上沒有什麼問題了，這時突然有人大聲問道：「段大人，聽說宗設氣焰高漲，即將洗劫江浙沿海，不知大人打算如何應對？」
段飛笑道：「本官已作出萬全的安排，並準備親自坐鎮杭州，有杭州衛數千官兵還有高大的城牆，以及本官帶來的三千錦衣衛，想必宗設絕不敢來杭州騷擾，其他地方本官另有安排，倭寇只要膽敢上岸，本官就叫他有來無回！」
「仰大人虎威，這下我們就放心了！」在場的商人和官員多半都鬆了口氣，聽說段大人要放棄杭州的防守，原來只是虛晃一槍，他其實準備親自坐鎮杭州啊。
安撫了杭州的官商，又傳出了足夠的訊息之後，段飛並沒有直接前往欽差行轅，在安排好部屬駐紮之地後，段飛先來到杭州府衙，他要提審寧波爭貢之役中的罪魁禍太監賴恩和日本假供使副手宋素卿。
段飛先提審的是原寧波市舶司總管大太監賴恩，此人收受賄賂，偏袒宋素卿等假使團，導致爆寧波之役，宗設洗劫寧波，據說收穫最大的就是搶了賴恩的家，這兩個月宗設勢力展如此之快，其中一個原因就是因為手裡有大把現成的銀子，可以不斷買船買炮，還可以招攬沿海大批散兵游勇，迅在海上形成了最大的倭寇集團。
賴恩死不足惜，他似乎也知道了自己的命運，被帶上來後就是一副奄奄一息的樣子，渾身草屑狼狽不堪，段飛拍著驚堂木喝問道：「犯官賴恩，你可知罪！」
賴恩也不狡辯，他垂頭喪氣地答道：「小人知罪，請大人給我個爽快吧。」
段飛冷笑道：「你貪贓枉法行賄受賄，在市舶司擔任總管大太監十餘年，民怨鼎沸，如今又造成如此惡果，實在是罪不可恕，犯官賴恩接旨！」
段飛朗聲念道：「奉，天承運，皇帝詔，曰……犯官賴恩貪贓枉法草菅人命，罪大惡極，詔令錦衣衛都指揮使段飛，將賴恩押往寧波，當眾施以剮刑！欽此……」
賴恩終於有了點生氣，他慟哭起來，嚎啕著向北叩拜，嚷著皇上饒命，段飛當即命人將他押了下去，緊接著將宋素卿提上公堂。
同樣坐了近兩個月大牢，宋素卿的情況跟賴恩截然不同，只見他束整齊，衣裳整潔，神情坦然，若非手腳戴著鐐銬，還真看不出他坐了那麼久的大牢。
宋素卿實在看不出已經有三十出頭，他面上無須，肌膚嫩白，足以讓許多女人羞慚欲死，說他二十出頭還差不多，不過請報上可是記載著他在正德四年的時候就曾作為日本使節團成員來過大明，甚至還引了一場爭議。
宋素卿原名朱編，浙江鄲縣人，弘治八年公元1495年堯夫壽莫對明貿易團至寧波時，其父朱漆匠受日商『場四五朗』的委託代購漆器。但直到日商回國，其父也未能按價交貨，遂以子朱編抵債。朱編至日仕於細川氏，改名宋素卿。
宋素卿率細川貿易船至寧波時，為其叔父認出，州官上報欲治其罪。武宗指令，既為使者，治其罪，恐招日人抗議，致生他隙。受到禮部不得再充任使臣的警告後，宋素卿於正德五年回國。
段飛恨倭寇，更恨漢奸，他見宋素卿整潔乾淨毫不慌亂的模樣心中不由暗怒，喝道：「宋素卿，你可知罪！」
宋素卿鎮定自若地說道：「大人，小人不知所犯何罪，還請大人明示。」
段飛冷笑道：「你身為大明人，卻替日本人賣命，假冒供使團，賄賂寧波市舶司大太監賴恩，處處排擠真供使，直接引了寧波之亂，害死了數不清的鄉親父老，你罪惡滔天，竟然還敢在本官面前裝傻！本官現在問你，你可知罪！」
宋素卿淡然道：「欲加之罪何患無辭？大人，若沒有其他指控，小人依然堅信自己無罪！」