接下來的日子神農便在陳都定居下來，每日隨在伏羲左右，助伏羲打理人族事物，有章有法，有理有節，且待人和善，胸有容人之能，是以人皆稱道，老幼愛戴！
伏羲見神農已然在人族中積累了威望，遂召開人族大會，問眾臣道：「吾自做了共主以來，戰戰兢兢，不敢有絲毫差池，如今證道在即，吾當傳位於人，眾卿看誰可接位？」
下方大臣你看我我看你，有東方巡查大臣道：「神農有大賢德，且受族人愛戴，可當共主之位！」一干大臣紛紛附和。b111.net
伏羲滿意地點點頭，對神農說道：「賢弟既然眾望所歸，那便由賢弟接位吧！賢弟莫要推辭。」
神農起身向伏羲施了一禮，又向眾人施禮道：「神農定當為我人族盡心竭力，絕不敢懈怠！」
伏羲聞言滿意道：「如此甚好！三十日之後便是吾證道之日，屆時便是賢弟接位之時！」
伏羲將於三十日之後證道，傳位於神農的消息不日便傳遍了整個人族，遠近人族皆紛紛朝陳都湧來，想要見證這流傳千古的盛事！
三十日後，這日陳都大街小巷擠滿了人，人山人海，萬人空巷，人們的目光紛紛投注在陳都中心的高台之上。只見此時高台之上早已擺好了一干祭祀用的祭禮，燃香也點燃了。一聲鐘響，伏羲手拉神農在一干大臣的簇擁下來到了高台之下，全城皆安靜了下來，針落可聞！
這時只聞一聲清揚響亮的歌聲從東方天際傳來：鴻蒙初判我先生，三千法則育魔神。縱橫混沌億萬載，唯有三千道魔神。縱觀盤古開天地，無窮大道胸中藏。頂上三花有神妙，胸中五氣變化多。他人要問吾是誰？逍遙洪荒數青辰。
眾人聞言一望，只見來者面貌約為二十四五，銀髮披肩，面貌俊美而又妖異，銀色的雙瞳螢光閃閃，身穿雪白長袍，腳踏九宮踏雲靴，腰圍玉帶其上別著一根青光流轉的玉笛。坐在一隻肋生雙翅，似虎非虎的異獸身上，身後站著有巢氏以及燧人氏。下方的神農一眼便看出，此乃上次駝他一次的窮奇。
眾人一看來者是那不知多少年未曾現身的聖父後，孺慕之情以及崇敬激動的心情在一瞬間充斥整個胸腔。無數人族叩首而拜，道：「聖父聖壽無疆！聖父聖壽無疆！聖父聖壽無疆！」
伏羲與那神農連忙上前而拜道：「伏羲（神農）拜見老師！」
青辰微微一笑道：「都起來吧！」
「謝老師」「謝聖父」
青辰正待說話，只見這時天際異鄉遍地，蓮花朵朵，仙音清唱，一輛鳳帳寶車自三十三天落下。眾人一看，卻是女媧娘娘降臨凡塵，眾人又是一陣山呼拜倒不已。
卻見那女媧娘娘瑩瑩走下包車，向著青辰一拜道：「女媧見過青辰聖人！」
青辰也還了一禮道：「不必多禮！」
女媧娘娘點點頭，對伏羲說道：「兄長今日證道，當真是可喜可賀！」
伏羲聞言歎了口氣，隨即笑道：「億萬年苦修，今日終於證道，的確不易啊！」
這時只見天際有一輛九龍御輦朝陳都飛來，九龍御輦之側正站立著玄都*師。待到九龍御輦在陳都半空中停住，玄都*師從御輦上駕雲下到地面，先向鴻玄和女媧娘娘施禮道：「弟子玄都拜見青辰聖人，女媧師叔。」
青辰和女媧娘娘聞言點點頭。
玄都*師又朝施禮伏羲，道：「貧道見過聖皇，貧道奉老師法旨而來，聖皇且先接過法旨吧。」
伏羲聞言忙領著身後的一干人族跪拜於地，高聲道：「伏羲恭請教主法旨！」
玄都*師從袖中取出太清符詔，高聲念道：「人教教主太清太上道德天尊敕令：人族共主伏羲聖德賢明，造福人族，今日功德圓滿，傳位於神農後居於火雲宮，欽此！」
伏羲拜了三拜，高聲道：「伏羲領教主法旨！」旋即站起身來從玄都*師手中接過太清符詔，轉身對神農說道：「賢弟，今日為兄證道，人族從此便交給你了！」
神農肅然道：「皇兄放心，神農定將人族治理好！」
伏羲點點頭，隨即牽著神農的手在眾人的目光下走上了高台，從懷裡取出人皇印璽崆峒印對神農道：「皇弟，接印吧！」
神農神情嚴肅地雙手接過崆峒印，高舉過頂，道：「今日神農登位，從此誓以畢生之力造福人族，天地鑒之！」話音剛落，從崆峒印上騰飛出五條九爪神龍，圍繞神農盤旋吟嘯，皇者之氣澎湃綿長，諸邪辟易！於此同時天降一團斗大的五彩功德分成兩份，一份有一成大小落在了有巢氏和燧人氏身上，一份有九成大小落在了伏羲身上，伏羲得了人皇功德頓時氣息飄渺，王者之氣收斂，已然證了天皇道果，從此萬劫不磨，厲無量量劫不滅！
眾人見伏羲證道，紛紛上前恭喜，伏羲一一還了禮，隨後登上九龍御輦，朝眾人一拱手，道：「伏羲去矣！」隨後九龍御輦騰空而起，載著伏羲往三十三天之上，混沌之中的火雲宮去了。
女媧娘娘見伏羲既已證道，便向青辰施禮告辭，回轉媧皇宮去了。
青辰來到神農面前說道：「神農，你如今已是人皇，日後若有困難可著人來太初仙島！」
神農聞言恭敬地說道：「聖父但請放心，神農定不會辜負所望！」
青辰聞言點頭道：「如此便好！」隨後便跨坐窮奇回太初仙島。
自此，人族進入了神農統治的時代！
神農自登位成為共主之後，凡事親力親為，以身作責，教導人民製造弓箭以獵獸，將耕種五穀的方法傳播到各個角落，從此人們不再缺少食物，並且還有剩餘，有時剩餘多了吃不完又不能長期保存，無奈只得扔掉，浪費不已。神農針對這個問題特意召開大會徵求眾大臣的意見，最後終於想出了一個辦法。
神農命人在陳都城內建立了一條大街，並以之為市致天下之民，聚天下之貨，交易而退，各得其所。如此人們有多餘的物品便拿到這裡互相交換自己認為值得和有用的東西，不僅大大減少了浪費，更將之用在了有用的地方。
那時候的人族還是用獸皮裹身，後來神農治麻為布，並將之推廣，從此人們用麻布來做成衣裳，不用再穿獸皮，逐漸走出愚昧！
雖然有伏羲發明了瑟，但人民除了生產還是沒有什麼更加豐富的生活，神農於是乃取東海之桐，削之為琴，結絲為弦，長三尺六寸六分，上有五弦，曰：宮、商、角、徵、羽。其聲可道天地之德，能表神農之和，能使人們娛樂，人皆謂之為神農琴也！
時人族每烤制食物皆用手，如若不小心常會被灼傷，更是缺少盛物的器皿，神農乃以土製成各種可是盛裝的器皿，謂之為陶器，自此人們可以用陶器來盛食物，方便了許多。
雖然知道了春夏秋冬，但卻不知該在什麼時候種植谷種，什麼時候是收穫的季節，神農於是乃歷數年觀察四時變化，冷暖交替，在伏羲曆法上加以改進，立歷日，立星辰，分晝夜，定日月，月為三十日，十一月為冬至。從此人們懂得了什麼時候該是種植谷種，什麼時候該是收穫，如此生產大大增加了許多。
一系列的治理措施下來，人族的生活明顯有了較大的提高，人口也增加迅速，在巫妖大戰中損傷的元氣也正在慢慢地恢復。神農對百姓無有相害之心，刑政不用而治，甲兵不起而王，是以諸侯大臣盡皆擁護，百姓人人愛戴！
神農見人們的生活在他的治理下日漸好了起來，心裡高興不已，走在陳都的大街小巷上，看著熙熙嚷嚷的往來族人，心中充滿了自豪感。忽然一陣悲痛的哭聲從前方不遠處傳來，神農大奇，忙走上前去，推開擁擠的人群一看，只見地上正坐著一個滿臉淚水的少*婦，她正抱著一個嬰兒，只是明眼人一瞧便知那嬰兒早已氣絕了。
神農上前輕聲問道：「你這孩子怎會如此？」
那女子聞聲抬首一看，見是共主，心中一驚，正欲起身參拜，卻被神農摁住，神農和聲說道：「無須如此多禮！你且告訴我這孩子怎會夭折了？」
女子聞言又是一陣哭泣，悲傷地說道：「只因是病死了！」
神農聞言心下恍然，原來如今人族不識醫藥，是以每有生病便不知治療，故而常有死亡，這個問題也困擾神農許久，只是以前有太多的族中事物要*持，並沒有花太多的精力在這方面。今日他看到一個幼小的生命就這樣的消逝，心底裡好似有塊重若千斤的巨石壓著，心潮起伏，久久不能平靜下來！
神農安排人幫那女子收殮了孩子的屍體，隨後一個人回到家中，苦思數日，終於下定決心。他帶著一眾隨從一路往西北而去，神農一行人逢山過山，逢水渡水，如此走了七七四十九日，來到一座山勢陡峭的山峰前，眾人抬頭一望，只見峰頂高聳入雲，山體長滿了青苔，濕滑難行，濃濃的霧氣照籠之下難辨道路，飛鳥難渡，野獸絕跡，似是到了絕路！
一眾隨從紛紛勸神農回去，神農堅定地說道：「如今族人正在遭受病痛的折磨，我身為人族共主若不尋到可以治癒病痛的神藥又如何回去面對族人，又如何面對聖父？」一席話說得隨從盡皆無言。
神農皺著眉頭思慮著該如何翻過這座山，忽然被一陣聲音驚醒，他順著聲源一看，只見山腳的叢林裡正密密麻麻地垂掛著*的籐條，有數十隻金絲猴正在籐條上來迴盪漾，玩耍得不亦說乎。
神農雙眼一亮，大喜道：「果然天無絕人之路！」旋即命一眾隨從上前砍伐了許多籐條，將之搭成架子，每日一層，如此春去秋來，風吹雨打，整整一歲而過，從未間斷，有三百六十層，終於將之搭到了山頂！
神農帶領著眾人沿著架子爬上了山頂，一望，只見山上奇花異草遍地開放著，顏色各異，姿態不同，萬千種花草香氣混雜在一起不但沒有難聞，更有一股清心寧神之效！神農精神一震，旋即大喜，忙令人在周圍搭上冷杉，以免不注意被野獸攻擊。隨即便居住在山上，白天親自嘗試各種花草，察其寒、溫、平、熱之性，辨其君、臣、佐、使之義，夜晚就在火光下記載下來。他發現了一種綠色葉子的木葉，食之可解百毒，謂之查，又作茶也。神農嘗中毒七十餘次，均靠著茶葉解毒。
神農站了起來，正欲繼續試嘗那些還未嘗過的異草，卻見東方天際遠遠飄來兩朵七彩祥雲，神農定睛一看，只見有巢氏和燧人氏聯袂而來。
待到兩人降下祥雲，神農忙領著眾人上前拜見，疑惑地問道：「不知先祖何來？」
有巢氏看著神農蒼老了許多的容顏，心底忍不住地歎了口氣，對他道：「神農，聖父知你嘗百草，屢種劇毒，是以賜下先天靈寶赭鞭於你！」言罷從袖中取出一條色呈褐色，長有三尺六寸的神鞭給他。
神農接過赭鞭，拿在手裡掂量了一下，只覺其輕盈靈動，不用祭煉便可用之，他問道：「不知此寶有何功效？」
有巢氏笑道：「此寶遇毒則色變，可辨萬毒，更有諸多妙用，正是適合你用。」
神農聞言大喜不已，朝東海太初道場拜道：「神農謝過聖父賜寶！」
兩人見寶物已經送到了神農手上，對他說道：「我等也該回去復旨了，神農，卻是苦了你了！」言罷兩人皆同時歎息。
神農微笑說道：「先祖說的是哪裡話？神農身為人族共主，若不能為我人族謀福又有何用？」
燧人氏朗聲大笑道：「好好好！你說得不錯！想我人族自誕生之日起雖有諸多磨難，但卻一步步地走到了今日，靠的不就是我們這種刻苦耐勞，無所畏懼，永往無前的精神麼！」
有巢氏聞言點頭稱然！
神農也一臉嚴肅地說道：「神農定當謹記先祖的教導，神農此生只為我人族而存！」
兩人聞言點點頭，隨即告辭了神農一行人，駕雲而去。E