卻說黃帝斬殺蚩尤，班師而回。九天玄女和旱魃等人押著雨師向黃帝告辭，逕回天庭覆命。秦華見事已告一段落，盤算一番之後，也向黃帝告辭。並說道：「貧道尚有些許事務需要處理，就先行一步了。人皇若有需要，它日盡可來流波山找我，貧道必盡力而為。」語畢，駕雲而去。卻不回山門，逕往常羊山而去。
那風伯被秦華與廣成子打跑，念及蚩尤與雨師二人被黃帝捉去，心中憂慮不安。思及刑天去了天庭，久久不回，不知出了何事。於是望天庭而去，希望能將刑天找來，同去救回蚩尤等人。
待他來到天庭，卻發現刑天正與玉帝飲宴，二人相談甚歡。不由氣的渾身發抖，指著刑天大罵一通。刑天連忙追問之下，才知道發生了何事。急忙向玉帝告辭而出，欲下界相救蚩尤。
二人來到涿鹿，卻發現黃帝軍早已離去。空氣中瀰漫著大巫臨死前留下的血腥與滄桑的味道。大驚之下，抓了幾個留守當地的黃帝軍軍官來問，知道蚩尤已被黃帝殺死，而風伯卻被九天玄女等人抓回了天庭。
此時此刻，刑天哪裡還不知道自己遭了昊天玉帝的算計了。那玉帝分明就是想拖住自己，好讓黃帝軍從容擒殺蚩尤。虧得自己還一心想著霸佔天庭，恢復巫族榮光。也是一時鬼迷了心竅，竟落入了套中，害死了蚩尤，還害的雨師成為階下之囚。
刑天自責不已，惱怒非常。自覺沒面目回祖巫殿見一眾族人，心裡對算計了他的昊天金闕玉皇大帝恨到了極點。一把扯起干戚斧，怒氣沖沖地向天庭而去。決意要教訓玉帝，救回雨師。
那刑天殺氣凜然地闖進天庭，將一眾仙女驚的四散而逃。昊天玉帝正打賞手下相助人皇的有功之人，眼見刑天如此無禮地闖將進來，還將天門打壞。心中也是惱怒不已。暗想：我乃道祖親封的天帝，你刑天竟敢如此藐視於我，實在該死！不讓你知道我的手段，天下人還道我昊天真好欺負不成。
玉帝有心立威，也不叫手下眾將，自手提寶劍與刑天戰在一起。那昊天玉帝乃是鴻鈞道祖身邊的道童，也不知跟在道祖身邊多少年。一身法力神通厲害非常，早已達到准聖之境。手中昊天鑒又是頂級的先天至寶，威力非凡。刑天卻也是巫族極負盛名的大巫，武藝神通皆是頂尖，戰鬥經驗豐富。二人這一番龍爭虎鬥，直殺的天昏地暗，讓人看得目眩神迷。漸漸二人打出天庭，不覺來到常羊山旁。
那玉帝神通無數，漸漸卻是佔了上風。趁刑天不備，一劍削去。只聽「卡嚓」一聲，將刑天腦袋砍落在地。也是刑天自恃大巫金身強悍，歷來戰鬥都缺少防備，這才有此一失。
那刑天精修巫族密法，巫術詭異莫測，早將魂魄與金身緊密結合。雖掉了頭顱，卻仍未死。一邊持盾防備玉帝攻擊，一邊空出一手在地上亂摸，欲將頭顱尋回安上。那玉帝見刑天還未死，驚異非常，又恐刑天真的尋回頭顱，到時又是一場大戰。遂把昊天鑒一揮，常羊山裂開一個大口子，將刑天之頭落了進去，隨即合上。昊天上帝尤不放心，伸手布下符印將常羊山封住。這才轉頭來見刑天。卻沒有發現再他布出符印之前，常羊山地底一陣扭動，刑天之頭早就不見了。
那刑天雖掉了頭顱，感知力卻並沒有減退。知道昊天玉帝這一番施為定然是將自己的頭顱藏起來了。自己可能永遠也找不回腦袋了。不由一陣沉默，干戚神兵泛著冷幽幽的寒光，映照在刑天無頭的身體上，顯得無比悲壯與蒼涼。
昊天玉帝一陣得意。卻見那刑天身軀突然變化，上身衣服脫落，露出雙乳和肚臍來。憤怒的刑天將全身法力往這三處匯聚，使其感應力大增。竟以雙乳為眼，以肚臍作口，揮舞干戚，大呼酣戰。欲再次上前與玉帝大戰。洶湧澎湃的戰意籠罩天地，向著玉帝奔湧而來。天地彷彿在這一霎那間變得赤紅，竟為刑天滔天的殺氣與戰意所感，故而顯出異相。
昊天玉帝見狀大驚，竟為刑天氣勢所攝，不敢再動手。趁刑天不注意，偷偷溜回了天庭。
那刑天舞動干戚，漸漸感應不到昊天玉帝的所在。心知玉帝已走，隨收了干戚。心中躊躇不定，卻又實在不願回去見自己的族人，索性在這常羊山中隱居起來。他卻不知在他與玉帝戰鬥之時，風伯已被天庭一干將士抓住，困了個結結實實，與雨師一道做了階下囚。
待刑天情緒穩定，秦華從隱身處顯出身形。卻聽刑天大喝一聲：「是誰！」手持干戚，戒備地對著秦華。這聲「是誰」卻是從腹中發出，帶著「嗡嗡」的回音。
秦華看著刑天無頭的身軀。卻依然那麼挺拔，那麼……滲人。心中湧起一股莫名的同情與佩服。開口說道：「刑天不愧是刑天，掉了腦袋還能這麼勇猛。在下不得不說聲佩服！」
刑天挺的這個聲音，沉默片刻，隨即說道：「我認得你！你是秦華，妖族知情司少監。我們雖未交過手，但也見過幾面。怎麼，你是專門來嘲笑我的麼？或者是想趁我重傷之際，取我性命，為你妖族出氣？」
秦華淡淡一笑，道：「刑天大巫言重了。巫妖二族均已隱居避世，我也早就不是知情司少監了，你不必對我抱有過多敵意。我此來其實是欲與你做一筆交易，不知刑天大巫又沒有興趣。」
「哼，我和你有什麼交易好談！你走吧，否則莫怪我出手無情！「說著揮舞神兵便要來趕秦華。
卻聽秦華說道：「莫非大巫不想找回自己的頭顱麼？」
刑天聞聽此語，一陣沉默。半晌才說道：「你有辦法？」
秦華喜道：「那麼大巫是同意與我合作了？如此甚好！實不相瞞，你的頭顱此時卻在我手中。」眼見刑天聞知此語，情緒激動。秦華連忙接著說道：「我也可以將它還給你，只是我怎麼能確定大巫你是真的與我合作呢？大巫法力高強，秦華自知不是對手，卻不得不防！」
刑天惱怒不已地說道：「我巫族中人向來說一不二，從不做欺詐之事。我說願意與你交易便決不會更改，難道還有什麼問題麼？」
秦華臉色一正，說道：「巫妖二族仇怨甚深，若不是有些事我礙於身份，實在不能親自出手，我絕對不會來找你。我們先小人後君子，你將手中盾牌交我保管。事成之後，我再還與你，可好？」
刑天無奈，只得答應。秦華收了盾牌，將頭顱還給刑天。也不多看一眼，留下一句話，說道：「我們先說定了，以後有事我會來找你的。」轉身匆忙離去。背後傳來刑天憤怒的吼聲：「秦華賊子，我顱內精血怎麼少了三滴，快快還我！」
秦華打個哆嗦，連忙使出滑雲術，眨眼便消失不見了。
卻說黃帝打敗蚩尤，大軍班師。炎帝榆罔大擺宴席犒賞三軍，極盡地主之宜。卻日日盼望黃帝軍早日回轉西北。誰料那黃帝竟將大軍駐紮，並將眾軍將家眷接來安置，明顯有長留此地，鳩佔鵲巢之意。那黃帝施行仁政，手下兵多將廣，又挾勝利之威，威勢日重。周圍部落多有投奔黃帝之意，黃帝也一一接納，好生安置。卻絕口不提西歸之事。
帝榆罔見狀，心中憂慮，日夜不安。遂暗暗整備軍隊，意欲除掉黃帝。黃帝乃天命之主，手下能人異士極多。百姓又大半歸心，並且也早早就有吞併炎帝部落，已成真正的天下共主之心。帝榆罔這邊剛一發動，黃帝便知道了。
二軍相爭，戰於版泉之野。黃帝軍不費吹灰之力就將帝榆罔擊敗，三戰而擒之。黃帝以神農氏炎帝一脈有大功於民，不願殺之，放逐帝榆罔於洛水一帶。後榆罔精研藥理，惠及於民，倉頡造字後，他這一脈後人將神農藥理整理成書，編成《神農百草經》流傳後世。