消息傳到德川幕府，德川家光不由大驚失色。他萬萬沒有想到中華帝國竟然會為了這等小事而向本國大舉出兵，並且還是二十萬大軍，看來是不惜發動一場兩國間的大戰了。雖然被這個消息深深的震驚，但大敵當前，德川家光還是不敢怠慢。他立即發出一連串的命令，動員全國所有的水陸軍隊集結，準備分頭迎戰敵人龐大的艦隊。
經過各路軍隊匯合完畢後，德川家光清點了一下軍隊數目。其中陸軍總數為十五萬，水軍就少的可憐了，滿打滿算也才將近五萬。由於德川家光在上任伊始便實行鎖國的政策，全國除了開放長崎、界作為對外港口外，一律禁止外國人來本國，也禁止本國人遠渡海外。雖然這種閉關自守的國策為幕藩體制迎來了安定時期，但也使本國人無法接觸到海外的各種先進技術。而在這種體制之下，自然也就使得水軍的發展處在始終停滯不前的狀態，甚至相比以往還有所下降。因此才會造就了今日水軍如此的規模也就不足為奇了。
清點完軍隊後，德川家光第一次有些後悔自己當年的閉關鎖國政策。如今區區五萬水軍，面對來勢洶洶的二十萬大軍，如何能夠相抗？德川家光皺緊了眉頭，陷入深深的擔驚受怕中。如果這場戰爭自己的一方戰敗，那不但會使得德川家族勢力大降導致自己下台，甚至會造成本國領土的喪失。
雖然德川家光萬分憂慮，但大戰迫在眉睫，如今已經容不得他再多做考慮了。他針對敵人兵分兩路的情況，緊急將水陸軍隊劃分為兩路。每路分得陸軍七萬五千、水軍兩萬五千，勉勉強強湊成了十萬軍隊，剛好與敵軍人數相仿。不過相比對方全是清一色的純水軍，自己的一方可就顯得遜色多了。不過形勢危急，德川家光已經顧不得這麼多了。他一面急令兩路軍隊立即分頭行動，一面又親自前往神社，祈求先輩能夠護佑自己。
當倭國的兩路軍隊剛剛抵達預定地點的時候，中華帝國的北洋艦隊已經率先到達倭國的能代沿海，準備在此登陸。
此次倭國北路的領軍大將乃是德川家光的親侄德川歲茂，此人由於飽讀兵書且擁有一身不錯的身手而深得德川家光賞識，因此才將此次領軍的重任交付於他。當他得知中華帝國北洋艦隊已經接近本國沿海只是，立即率軍急行，而且兩萬五千水軍也已經率先駕著數百艘戰船先行一步了。企圖在北洋艦隊登陸之前將之堵截在能代。
當德川歲茂率領七萬五千陸軍一路急行數百里抵達能代的時候，一個令他震驚萬分的消息同時傳到耳邊。那就是自己的水軍還未來得及接近能代沿岸，便被中華帝國的艦隊發現並將之徹底消滅。連同數百艘戰船及上面的兩萬五千名水軍，全數沉沒海底餵了魚腹。德川歲茂還沒有機會見到這場戰鬥，己方的水軍便已全軍覆沒，這個消息重重的打擊了他的信心。使之再也不敢有絲毫想法，當下嚴令手下的七萬五千陸軍死守能代沿岸，絕不能讓對方順利由此登陸。
但是能代沿岸根本就沒有可以固守的堅固防事，只是臨時性的構築了一些簡單的工事。但這對於船堅炮深的北洋艦隊來說，簡直就好似不存在一般。在元帥毛東珠的一聲令下，近千艘龐大的戰艦排列成數隊，隨後開始朝著岸上猛烈的開炮。頓時，飛沙走石、火光沖天，在隆隆的震耳炮聲中，那些還在依靠冷兵器作戰的倭國士兵根本就無法抵擋炮火的襲擊。對於北洋艦隊所展現出來的驚人實力也沒有事先料到，因此倭國士兵損失慘重。在很短的時間內，倭國士兵便已傷亡過半。而德川歲茂也被這種打法嚇破了膽，這才知道那兩萬五千水軍是如何在那麼短的時間內覆亡的。最後他終於警醒過來，知道再這樣守下去只能是全軍覆沒之局。當下連忙命令軍隊後撤，避開敵方炮火的射程範圍，待敵人登陸之後再與之決戰。
可是到了後來，德川歲茂才知道自己這種想法是多麼的可笑。當北洋艦隊在順利登陸之後，毛東珠派出一支兩萬人的登陸部隊開始掃除前方隱蔽的敵人。
直到兩軍短兵相接，倭國士兵立時被對方所施用的各種犀利武器所震懾。手榴彈、弩弓發射的火箭、震天雷等各種武器層出不窮，所有這些別說見過，連聽都從未聽說過。因此甫一接觸，倭國士兵立即損失慘重，被對方的犀利武器轟炸的體無完膚，戰士們大量傷亡。雙方還未真正的進行身體上的接觸，倭國便已損失了大批士兵。
混亂中領軍大將德川歲茂不幸被一枚手榴彈炸成重傷，渾身是血倒地昏迷不醒。一旁的親兵還以為他死了，當即驚聲尖叫起來。四周的戰士見到連主將都已陣亡，一時間更無鬥志，紛紛叫喊著向後方逃竄。而北洋艦隊的登陸部隊則緊緊在後面追殺，途中不斷的有倭國戰士倒下。
這場十萬人的戰爭僅僅不到一日就已結束，結果以倭國水軍全軍覆沒，陸軍只逃亡活命三千餘人而告終。北洋艦隊則水陸大軍齊動，由能代出發，經秋田、打越一路南下，沿途燒殺搶掠，無所不為，卻根本未曾受到任何阻礙。
與此同時，鄭成功所率領的南洋艦隊也到達了坊津沿海。並與早已守候在這裡的倭國水軍進行了一場不對稱的戰役。這支南下防衛大軍首領乃是德川家光的族弟德川家行，此人帶軍一向以穩健著稱。此次派出水軍企圖在海上攔截南洋艦隊，豈知雙方一番交戰之下，自己的水軍根本就不堪一擊，轉瞬之間便被對方弄了個全軍覆沒。德川家行大驚失色，在驚歎於對方火力威猛的同時，也暗自擔心依靠幾萬陸軍無法抵擋對方登陸。在親眼見識過了對方兇猛無匹的火力之後，德川家行慌忙命令全體陸軍撤退，任由對方登陸。
德川家行打得如意算盤，他知道阻擋不住對方登陸，便企圖與對方打一場巷戰。他命七萬五千名士兵各自尋找藏身地點，或民房、或密林、或高牆之上，待對方軍隊進來之後，便突然施以偷襲，如此方有取勝的希望。
不過鄭成功這麼多年來身經百戰，當然也不是傻子，他見對方忽然撤走數萬軍隊，且在登陸之後也沒有看到對方的身影。便料到如果不是倉惶逃走便是躲藏起來企圖偷襲己方。鄭成功思慮良久，嘴角露出了冰冷的笑意，隨後他吩咐手下，從戰船上卸下幾門大炮，命人備足了炮彈，接著一聲令下，幾門大炮在前方開路，其餘三萬登陸部隊在後壓陣，緩緩的前進。沿途所過之處，凡是感覺能藏人的地方必先轟上兩炮。就連當地百姓的民房都不放過，由此也炸死了大批的無辜百姓。
果然，鄭成功的這招非常奏效，一路的炮火過後，躲藏起來的倭國士兵紛紛被炮彈轟炸而死。不但沒能偷襲到對方，反而糊里糊塗的被大炮炸死。德川家行萬分惱火，沒想到對方竟會如此狡猾，根本就不上自己的當。無奈之下只得命令藏匿的戰士全數出來，與敵軍決一死戰。
倭國士兵雖然被大炮炸死不少，但還有五萬多人，在人數上還佔有一定的優勢。而且在德川家行的嚴令下，人人鬥志旺盛，抱著必死的決心與敵人誓存亡。不過在戰場之上，人的精神鬥志固然重要，但武器裝備的好壞更能決定戰爭的勝負。因此當倭國士兵遭受到對方前所未有的重創之後，立即有如霜打的茄子，個個茫然失措，再也拿不出先前的鬥志。敵人的武器實在是太過強大，且殺傷力驚人，只是短短的時間己方便傷亡過半。德川家行雙目中露出驚駭萬分的目光，顯然是被這種作戰方式所震撼。他心中清楚，就算己方再來十萬人也不是對方的敵手。這種念頭一旦生出，便再也提不起任何鬥志，德川家行無奈的命令手下撤退。
鄭成功一邊命令部隊在後面緊緊追殺，一邊重新登上戰船，水陸並進向倭國北方進發。
當德川家光得知南北兩路大軍全部大敗的消息後，頓時震驚的癱倒在地上。如今他再也沒有軍隊來抵擋敵人的步伐，萬分無奈之下，當晚德川家光慌忙召集族人開了一個緊急會議。經過長達一夜激烈的討論，依然沒能得出任何結果。
北洋艦隊與南洋艦隊分兩路快速南下與北上，企圖在德川幕府的老巢江戶會師。兩路大軍所過之處屍橫遍野，血流成河，燒、殺、搶為所欲為，給倭國民眾帶來了沉重的災難。
德川家還在為如何化解對方洶湧而來的攻勢之際，北洋艦隊與南洋艦隊已經快速的殺到，直接會師於江戶。德川家光聞訊大駭，在左思右想之下，他為了保住性命只得決定向中華帝國俯首稱臣。
於是，德川家光親自率人將北洋艦隊和南洋艦隊的元帥毛東珠、鄭成功恭迎進江戶城自己的幕府內。待兩人敬如上賓，禮遇之極，而鄭成功為了安他的心，特意帶來中華帝國皇帝吳三桂的聖諭。闡明了中華帝國並無吞併倭國之意，此次出兵實是由於本國民眾逼得太狠才不得已而為之。此戰過後，兩路軍隊都可以即刻撤回國內，而德川家光還依然可以繼續做幕府的主人控制整個倭國。
德川家光聽了先是一喜，接著苦笑道：「這場戰事結束之後，恐怕本人再也無法擔任幕府的主人，而且整個家族都可能會被乘勢而起的各方勢力所逼下台。皇帝陛下的好意本人心領了！」
鄭成功聞言笑道：「將軍不必擔心，我陛下早就料到此事，對此他早有準備。一旦倭國成為中華帝國的藩屬國，那我們便有義務維護倭國的安定。如有人膽敢犯上作亂，中華帝國必不會等閒視之，定會幫助將軍平叛一切反動勢力，而將軍也可穩坐幕府首領之席位！」
德川家光聽了不禁喜形於色的道：「那可太好了！多謝皇帝陛下厚愛！我德川家光必將誓死相報！」
鄭成功點了點頭，繼續道：「此次戰爭責任全然都在將軍，雖然我等可以立即撤回國內，但如此一來國內的兩千萬民眾定然不會答應。因此，希望將軍能夠為我等補償一些此次戰爭的賠款，以及當初襲擊我船隊等的賠償，只有這樣方能堵住國內民眾的口。將軍你看如何？」
德川家光最關心的就是自己的家族能否繼續統治倭國，如今這個問題已經解決，那其餘的一切都好說。當下他很痛快的便答應了鄭成功的要求，令鄭成功不禁偷偷暗笑。