女娃出走後，發覺女娃不見的神農氏連忙命人尋找，四處詢問，方知女娃離開帝都後一路向東而行。神農氏御下，也有大神通修士，倒也堪得金仙修為，便一路追尋而去。
行至東海，那金仙四處打聽得知，有人遠遠望見一女童跳入海中被巨浪捲走沉入海底不見，卻有一小鳥自海中飛起，常銜西山林石，填塞東海。
回來後，那金仙將所聞報於神農氏，神農氏聞言，忙去往東海，親眼看見了精衛神鳥，心中大慟，自覺對不起幼女，又想起這些年來，自己忙於政事，十分愧對家人，更是傷悲自責。
此後，神農氏便無心政事，開始找尋下一任人皇。
卻說，有熊族軒轅自拜廣成子為師已有二十年，不僅修得仙人之身，更學得文武兼濟，有治理天下之才。神農氏聞其才能，又加以考驗，遂將共主之位傳於軒轅，自己證得地皇道果，飛昇前往火雲洞潛修。
軒轅初為共主，年輕氣勝，經驗不足，凡有不服法制者，常起兵攻伐。終於，引得北方一大族不滿。
自水火二神爭帝大戰之後，聖人現世，西方接引、准提佔據西方，三清佔據東方及四海。巫妖二族式微，妖族大多遁入深山老林，巫族則退守極北祖巫殿。
有少許巫族與人族混居，在北方建了一個大部落，名喚九黎。九黎族近來得一奇才，叫做蚩尤，修行八九玄功，已經達到四轉境界，並且得到了祖巫傳承，煉成了巫神不死之身，強悍無比。
蚩尤就任九黎族族長，對軒轅十分不滿，與其八十一個兄弟一起帶領九黎族勇士起兵造反，與軒轅決戰於逐鹿平原。
九黎族人大多是巫族與人族混生而成，各個凶悍，實力遠非普通人族可比，蚩尤大軍一路開來，連連攻破數個人族大部落，所破小部落更是多達數十個之多。
其間，九黎族大軍實力日漸壯大，蚩尤旗下，更有風伯、雨師、雷王、火蜈等昔年巫族成名大巫。軒轅大軍根本抵擋不住，縱有廣成子、雲中子等闡教金仙相助，卻還是節節敗退。
此時，三十三重天庭乃是由道祖鴻鈞座下童子旱天、瑤池執掌，有道祖在頭上頂著，二人號令三界，諸大神通者乃至聖人都會給一些面子。
軒轅乃是諸天仙神共立的人皇，蚩尤公然反叛，第一個丟面皮的就是天庭之主。於是，旱天、瑤池命九天玄女並十萬天兵天將下凡，助軒轅抵抗九黎族大軍。
原本，蚩尤的大軍佔了很大的優勢，幾乎是勢若破竹，但天庭的意外介入，以天兵砥柱了蚩尤的大軍，卻是令雙方陷入了對峙之中。
軒轅見戰事不利，連忙相求於廣成子，廣成子無奈，只得回轉崑崙山，上得玉虛宮中，晉見原始天尊，上稟道：「師尊，那風伯、雨師皆是頂尖大巫，又修得不死之身，吾等師兄弟，最多只能與之持平，軒轅畢竟只是普通人族，修行日短，不過玄仙修為，根本就不是蚩尤的對手，還請師尊示下。」
原始天尊道：「徒兒勿慌，蚩尤那斯雖然修得八九玄功，煉成巫神不滅之身，人皇軒轅卻也不是無法應對。」
廣成子忙問道：「如何應對？」
「昔年十二祖巫主宰洪荒天地，妖族二皇為與之抗衡，曾滅殺億萬人族，取精血生魂融入先天精金、星辰光華煉就一柄妖皇寶劍，欲破祖巫真身。後來，巫妖大戰之時，帝俊以此寶劍破開祖巫強良真身，卻被燭九陰擊折此劍。大戰後，妖皇寶劍為妖師鯤鵬所得，復原後，卻是威力大減，但破開大巫之身還是不在話下的。為師已命你師兄燃燈連同八景宮的玄都、截教的多寶前往北海奪取，不日便有消息傳來，你且安心在玉虛宮中休息一日，再返回不遲。」
「是，師尊。」廣成子恭聲應道。
原始天尊道：「你且去偏殿，取幾粒玉虛金丹，爭取將翻天印完全祭煉。」說罷，擺了擺手示意他下去。
「多謝師尊。」廣成子大喜，領了聖人法旨，忙退出了玉虛宮。
原始天尊搖了搖頭，卻是將目光轉向了北海方向，眉頭不禁皺起。
這燃燈，乃是曾經在紫宵宮中聽過道的，後拜入原始天尊門下，原始天尊只准其為記名弟子，可自由來去，且添為闡教副教主。其一身修為已經達到准聖之境，更有先天三大靈燈之中的靈柩燈，以及先天靈寶乾坤尺，實力非凡。
八景宮中的玄都，乃是老子的唯一弟子，深悟太清大法，已經斬去一屍，身懷八景宮燈、乾坤圖，比之燃燈，還要更勝一籌。
而那多寶，更是通天座下大弟子，修為已經破入准聖多年，距離斬卻第二屍也不遠了，而且他還兼修了八九玄功，手握乾元寶劍，實力可謂是三人之最。
可如今，三人同往北海，去對付一個身受重傷的鯤鵬，怎到現在還沒有回音？