「老船主，不好了！」
王直呼的一掌掃了過去，那水手趕緊改口：「侯爺，不好了！」
王直在北京時官封靖海侯，雖然到了海上，卻還是要下屬叫他侯爺，只是海賊們叫「老船主」叫慣了，有時候總改不了
「那個假和尚帶了人走了！盧老九，王鳳、申石行他們都跟著去了！」
這時港口內廝殺得厲害，到處都在起火。雞籠港內的地形周奇瞭如指掌，一被他們衝進去，整個雞籠港馬上就失控。
李彥直如今威震四海，光是他的名字就足以叫海賊們心中慌亂了，黑夜之中，他們也不知有多少兵馬殺來，甚至不知這些人從哪裡殺來。
王直此刻雖然手裡還掌控著幾千人，但破山揚帆遁去，部屬避難叛離，就只剩下毛海峰和徐海在身邊，幾千海賊見港內火光點點，哪裡有勇氣進去救援？何況這時他們就算衝進去了，只怕也會被捲入混亂之中。
「乾爹！快走吧！」毛海峰叫道。
「走？去哪裡？」王直大怒：「我不走！我要先平了這些叛徒，捉住玄滅和尚，再去會合徐碧溪，蕩平李彥直！」
這時元老謝和走了過來勸道：「五峰，我看你就……」
這個稱呼就像點燃了一個火藥桶，不等整句話說完，王直猛地抽出刀來，大叫：「你叫什麼！」竟然砍了過來，謝和猝不及防，竟被砍翻在地，毛海峰大驚，上前攔阻時也被砍中了脖子，大動脈泵出血來，一時不死，卻在地上抽搐著起不來了，一雙眼睛直直地瞪著王直。不知他為何要殺自己。
「老船主瘋了……老船主瘋了……」
大呼小叫之聲在碼頭傳了開來。王直剩下地幾千人也都亂了。王直本人見毛海峰漸漸不動。頭腦忽然清醒了許多。兩行淚水流了下來。看周圍眾海賊首領時。只見人人都怕他、忌他、畏他、要避開他。
「完了……真地全完了……」
手裡地刀噹啷一聲掉下。眾海賊猛地呼啦一聲散了。有地去投澎湖。有地去投破山。有地去投李彥直。
王直見狀。似乎連魂魄也不全了。兩腳發軟。竟而站立不穩。只是腋下一緊。已被扶住。回頭一看。竟是徐海。
「沒想到陪我到最後地竟然是他……」
「侯爺。」徐海叫道。
「別叫我侯爺了……」王直哀歎道：「如今我連船主都不是了。」
「侯爺。別灰心！留得青山在，不愁沒柴燒。」
「青山…：ｗaｐ．１６…我還算什麼青山……」
徐海也沒再說什麼，只是攙扶了他上了一艘帆槳並用船，混在四散逃離雞籠的船隻當中，出雞籠不遠，王直見船隻向西，便想徐海多半要先去會合乃叔徐惟學。
不料便聽外頭有人叫道：「不好了！聽說北桑已被官軍攻克，徐當家被部將割了腦袋去請功了。」
這是西邊才傳來的消息，此刻從雞籠逃出來地海盜船互相之間離得不遠。聽到消息你呼我傳，都道李雙頭一統東海大勢已不可逆。
王直在艙中頭腦發昏，聽到這個消息後大叫一聲，昏死過去。他就這麼渾渾噩噩的，在艙中也不知呆了多久，只知道海船一直在走，在黑暗中重病了一場，幸而有專人服侍，每日都有不知從哪裡搞來的清水和藥物。竟讓他熬了過來。
如此幾十個日夜，再出艙時，只見海面一片蔚藍，竟不知是何處，問徐海，徐海說：「我們到南洋了。」
王直驚道：「南洋？這……你怎麼越過澎湖的？」
徐海嘿了一聲說：「當時大員海峽帆船亂竄，我是趁亂混過來的。沒什麼人認識我。也有機兵上船盤查，但我就說老船主你是我叔叔，他們也沒認出你來。」
王直望著茫茫大海。喃喃道：「我居然還能逃出上天……可是我這衰朽殘軀。還能做什麼去？」
「保得性命，就總是好的。」徐海說：「等咱們過了呂宋。再到麻逸去。那邊如今是佛郎機人地地盤，李都督的船隊也到不了那裡。」
王直沒有一皺：「李都督？」
徐海咳嗽了一聲，忙說：「我曾奉叔叔的命令去給李某人下書，當時為了避免犯他的忌，所以口頭上改了稱呼，一時還沒改過來。」
王直如今雖然頭腦遲鈍，卻也將信將疑，但這時他能依賴的就只有徐海，因此直覺地沒再深究下去，只是問：「外面的局勢怎麼樣了？」
「那就不清楚了……」徐海說：「我們後面一直有李某人的私掠船追著，朝廷已經下了命令，誰捉到……捉到侯爺你，就官封三品，裂島為侯。不過雞籠被……被攻陷以後，大員海峽就通了，我們在南澳歇船時聽說，成千上萬的商船都正往上海那邊湧。至於李某人那邊，聽說他召集了大部分將領往雞籠去，現在大概在論功行賞吧。」
徐海的這個消息是確切地，不過這已是雞籠被李介攻破之後不久便發生的事，離王直從他口裡聽說已隔了許久。
當日李介攻破雞籠，李彥直聽說兄長立功，大喜過望，馬上就率領大部隊來與李介會師，兄弟二人相見，自有一番悲喜。李彥直見二哥兩鬢間有白髮，已經是步入中年的形貌，心中在高興之餘又復感傷，眼角濕潤地笑道：「待這事一了，咱們就衣錦還鄉，可有好些年沒回尤溪了。」
李介卻說：「若爹娘還走得動，也可以接他們出來到處看看這海邊地風光。」李彥直一聽，就知道李介對大員這片土地已有感情，便想：「既然二哥不想回去，那我就設法把這大員建設成一個世外桃源，讓二哥有個安養之地。」
他當即便上書朝廷，稱李介以濱海之民入海，開拓大員、呂宋，如今又率大員、呂宋民眾來附，於國家實有開疆拓土之功，暗使御史上表稱讚，封李介為呂宋公這卻是後話了。
他兄弟二人一體，李介也知道只要老三掌權，自己就不會吃虧，所以一直沒怎麼計較，更沒和陳羽霆吳平王牧民等搶功，但其他部屬卻要好好封賞一番。到達雞籠後李彥直就召吳平、王牧民、張璉、張維諸將以及林道乾、張岳來雞籠，這時南北內外兩支力量一合，李彥直手下不但炮利船堅，而且猛將如雲，獨當一面者七八個，驍勇善戰者不下數十，從吳平到王牧民，從戚繼光到俞大猷，均是陸上猛虎、海中鯊魚，要精兵有精兵，要強將有強將，環顧當世，更無敵手了。
當日諸將到齊後，李彥直升帳點將，論功行賞，先宣示朝廷設立海軍都督府之旨意。他宣佈將他從上海帶來的海府軍本部以及留守澎湖、大員的海上機兵團合併為大明海軍，又分出北海、東海、南海三支海軍，各設都指揮使一人，都指揮同知一人。
北海海軍轄長江口以北海面，下管金州、威海、平壤、濟州四衛，以王牧民為都指揮使。其中濟州衛有名無衛，此衛的建設任務也將由於北海都指揮同知張岳負責。
東海海軍轄長江口以南海面，下管寧波、泉州、琉球、澎湖、呂宋五衛，以吳平為都指揮使，以張維為都指揮同知。吳平和張維現階段最重要的任務是清理大員海峽的海盜殘餘，以確保東海商貿的正常進行。
南海海軍轄大員海峽以南海域，這一帶眼下形勢最為複雜，從東海被放逐下來的私掠艦隊、海盜全部湧進這片海域，傳說大賊頭王直也在這片海域逃竄，這樣一來，東海雖然乾淨了，南洋卻亂了。那些私掠艦隊不敢侵犯呂宋，卻都奔滿剌加、麻逸去了。只是在南洋李彥直所掌控的軍事力量又相對比較薄弱，並無一員足以與王牧民、吳平鼎足而三地大將，因此李彥直便任命蔣逸凡巡按南海，以張璉為都指揮同知，會同率領浙、閩衛所官兵下南洋的胡宗憲一起處理南洋之事。
軍伍既分，又定班職，所有親信舊屬全部升了高官。至於職守則互有調動，比如蔣逸凡代表李彥直先行下南洋，而林道乾則調到上海協理市舶司總署的事務等等。
大員、呂宋在升格為府以後，地方官員也跟著水漲船高，知縣變了知府，至於行政、司法體系則維持不變，算是「因俗而治」。
安平鎮以北的沿海農村，在抗擊海盜的守衛戰中被打了個稀巴爛，戰後大員政府幫助部分民眾回遷，但有些已經呆在內陸不願動了，這時海禁已開，便有大量的閩浙新移民遷徙至此，成為重建大員的新力量。
隆慶元年上海市舶司總署正式開關，東南各省的貨物早已雲集，大員海峽打通以後，外國商船接天蔽雲而至，竟讓這一年出現迸發性的交易量！市舶司按照明文規定地關稅，見船抽水，見貨抽成，儘管陳羽霆的班底個個久經歷練，但在這段時間也點貨點到眼發疼，收錢收到手發軟！張居正原本以為這海關能收到十幾萬兩銀子補充軍費就不錯了，哪知海外商人進港之後的一個月裡，市舶司總署的關稅進賬就已接近兩百萬兩！要知道太倉一年的歲入，有時候也才兩百多萬啊！而這還遠不是最終的數字。
李彥直接到陳羽霆的信後心中大定，有了這筆錢打底，海軍都督府衙門的養軍費用就有保障了。