李彥直在日本呆了半年多，一邊讀書，一邊注視著東海與南海的變化。這日北面有風啟的書信至，他收到信件之後，決定提前北上。李介、陳羽霆一起趕到月港，問他北上之後，海外之事如何處理。
李彥直道：「我北上之後，海外之事，都由二哥作主，羽霆作副手。南海之事，也都歸二哥處理。若有大事二哥不能決，可會羽霆、牧民、吳平商議。我進京之後將盡量爭取開海禁的事，可效果如何，殊難預料。但無論發生什麼事情，都萬萬不能和朝廷對抗！」
他這次北上，事非尋常，所以給了李介、陳羽霆等相當大的獨立專權，準備頗為周詳。尚未出發，雙嶼那邊已派人送來了一份長長的清單，這份清單上珍珠成鬥，翡翠論斤！竟是大量的金銀財寶、海外奇貨！且不說每一件都是非同小可的珍寶，光是這數量也已經是駭人聽聞！
李彥直很清楚這是許棟、王直給他上京疏通的經費，也不客氣，便收下了。
送信來的王清溪道：「清單在此，東西太多，若運到月港三公子再運往北京去麻煩，所以我們就把東西存放在杭州了，等三公子到達杭州再取。」
李彥直道：「如今風向朝北，我想趁最後一陣北風，坐船直到松江府，然後走陸路前往京城。」
王清溪倒也乖巧，就道：「那我們就把東西取了送華亭縣去。」
李彥直安排好了海外之事後輕裝上路，只帶了義久隨行伺候。周文豹作貼身護衛，付遠帶了一隊人馬押送貨物在後面跟著，卻又不在一起食宿，如此迤邐上京。
沙勿略從南面來時，李彥直已離開了月港，他便無法去見這位李孝廉，不過在澎湖他卻順利找到了希拉裡，希拉裡見到了他又是高興，又是心虛，引了神父去見李介。
李彥直既走。海外便以李介為首。他是一條直來直去的好漢，見是希拉裡帶來的人，便很禮貌地接見了。
沙勿略仔細觀察眼前這個李老爺，聽說他是李孝廉地哥哥。眼下代理著李家在海外的所有事務，便有心在他這裡打開一個缺口。因向他陳說天主的真理。
這天主的真理。希拉裡平日也多向李介講過，當時李彥直在場，李介最信他弟弟，見弟弟一笑置之，心裡也就不怎麼當他回事。他有了這先入為主的觀念，便任沙勿略說得舌綻蓮花也不為所動，只道：「你來遲了，若遇到我弟弟。這些話可以和他說。他喜歡和人辯這個。」
沙勿略微笑著說：「主的真理，誰都能懂的。關鍵是你要放開懷抱。讓主進入你的心。」
李介卻道：「可希拉裡跟我弟弟說了後，我弟弟卻沒受洗信教啊。我信我弟弟，所以我想他既沒受洗，一定有他的道理。」
沙勿略無法，心想這人可真執拗得緊，要說服他看來還真得從先說服那個李孝廉，只好暫時作罷。
李介便派人送他去休息。澎湖此時已有好一座澎湖書院，希拉裡就住在那裡，向學生傳授歐洲語言，李彥直還給她撥了一個屋子，讓她在那裡供奉耶穌，也算是一個小小的教堂。李介對沙勿略說：「你要是肯留在澎湖，可以在那裡教書。」
沙勿略學識淵博，非希拉裡可比，李彥直若是和他相見一定會很高興，因為這個傳教士肚子裡有一整套地歐洲哲學理論，還懂得許多李彥直也未涉及地科學知識，又和歐洲教育界有密切的聯繫，人脈頗為豐厚，若他肯致力於科學教育，或者竟能把歐洲當時的教會大學體制在澎湖給複製一所出來，可惜他志不在此，滿心想的只是傳教。那一肚子科學知識，在他看來不過是傳教時可以用上地東西罷了。
既然走不通上層路線，沙勿略便想向下層入手，第二天便跑到海邊，向往來民眾傳教，此時他還不會華語，站在那裡大聲宣教，得由希拉裡來作翻譯，也有些水手、商人聽見便聽住了。
陳羽霆此時正為海禁未開、賊寇為患、國事日壞而心中憂愁，偶爾經過，聽沙勿略正在開導一個蝕本的商人，聽他說道：「你是因為自己地善良而被欺騙，但你地義行主已經看在眼裡。你喪失的只是現世的財富，但神的天平上，你的義卻增加了！人活在這個世界上，只要抱壞一顆義心，人生的道路就會像黎明的光，越照越明，直到中午！」
後半句把陳羽霆聽得心動，便上前道：「我心裡抱著公義，可為何我的心境卻是一片陰霾？」
希拉裡看見了他，有些詫異，但還是給他做了翻譯。
沙勿略沒有猶豫，便道：「那是因為你地心還沒有放開，你還沒有真正地相信自己地正義！所以你才在為成敗而憂愁。記住孩子，不要為明日的事情而憂愁，因為明日將發生什麼事情，你尚且不能知道呢。」
陳羽霆道：「那怎麼樣才能放開自己地心胸呢？」
沙勿略道：「要放開自己的心胸，首先就不能太過依賴自己的聰明和力量。」
陳羽霆問：「這是何解？」
沙勿略道：「你認為你的聰明能夠洞察一切世事嗎？你認為自己的力量能夠主宰一切世事嗎？」
陳羽霆失笑道：「那當然不可能。」
「是啊。」沙勿略道：「可是你卻是憑著你的聰明的指引在做事，依靠著自己的力量在做事，但因為你無法洞察一切世事，又無法主宰一切世事，所以你常常會有想不通的時候。並因此而苦惱，所以你常常有做不到的時候，並因此而失落。你地心都是這些苦惱和失落，當然就充滿了陰霾。」
陳羽霆又問:「那該怎麼解決呢？」
沙勿略道：「既然你已經找到了問題的癥結，就應該已經知道藥方了才對——要想解決你的迷惘，就要找到一個能指引你的人，要想不再失落，便得尋求一種依靠。」
「指引的人……依靠……」陳羽霆喃喃自語了一會，道：「我身邊有這樣一個人的。」
沙勿略便問事誰，陳羽霆是就是李孝廉。沙勿略問道：「既然如此。他解決了你的迷惘沒有？他讓你不再失落沒有？」
陳羽霆搖了搖頭，說道：「他給我解決了很多問題，不過，還是有一些事情。我也不知道該怎麼和他說。其實有一些困惑，他也和我一樣迷惘。」
沙勿略笑了笑。道：「可憐的孩子。這麼說來，這位李孝廉也不是全知全能了？」
陳羽霆苦笑道：「當然不是。」
「這就對了。」沙勿略道：「他自己也有迷惘，自己也有困惑，怎麼能夠解決你的迷惘，解決你的困惑，做你信仰上地依靠呢？」
陳羽霆聽得呆了，問道：「可除了他，還能有什麼人能為我解決迷惘、提供依靠呢？」
「沒有人。孩子。沒有人！」沙勿略說：「沒有人是全知全能地，所以沒有人能徹底解決你的迷惘。也沒有人能為你提供真正依靠。」
陳羽霆微感失望：「這麼說我的煩惱還是沒法解決。」
「不！」沙勿略道：「你的煩惱，是可以解決地！」
這時他布道的事情已經傳開了，裡老蔡大路趕來喝問：「你這外國人，跑到這裡來幹什麼！」喝問之後才發現陳羽霆，便看了他一眼。
沙勿略微笑著歡迎他，道：「又來了一位長者。」
蔡大路很不友好地瞪了他一眼，問：「你在這裡做什麼？」
陳羽霆忙道：「林老，別這樣，沙勿略神父在給我們講道理，幫我們解除心中地疑惑。」
蔡大路頓足道：「陳里長，你怎麼這般糊塗！本朝地規矩，那些僧尼道士只能在寺廟道觀裡講這些，是不可以跑到大街、市集、碼頭講的！」
大明洪武皇帝遺制，對各宗教活動都有嚴格的限定，並有相當嚴密的管理辦法，朱元璋對宗教管理的制度延續了五六百年，而其精神則延續了六七百年，直到共和國，其宗教管理的精神理念依舊與朱元璋的宗教管理精神一脈相承。
澎湖、大員一切草創，許多大明固有的制度一時都還用不上，或者李彥直覺得不妥而沒有提及，之所以會在宗教問題上有過強調，主要是因為有希拉裡地存在，李彥直才會特別把這個問題提了出來，明白地訂立了規矩，要所有僧尼以及進入澎湖地佛郎機，在進行宗教活動時都到指定地方——通常也就是寺廟或教堂進行。
沙勿略聽了希拉裡的翻譯後忙說：「我們不是和尚、道士，我講地也不是什麼神道，而是真理。」
陳羽霆頷首道：「沙勿略神父說的，確實和那些裝神弄鬼的和尚道士不同。」
蔡大陸卻不管這個，對沙勿略冷笑道：「管你是神道，還是真理，總之李孝廉說了不行就不行！」又責陳羽霆道：「陳里長，你也真是！帶頭違反規矩，你叫以後怎麼管這澎湖、大員？」
陳羽霆臉上一熱，便對沙勿略道：「神父，真是不好意思，雖然我覺得你說的話很有道理，不過本朝的規矩立在這裡，不好破壞。要不，等三公子回來了，你說服了他，再布道吧。三公子是一個講道理的人，我想以他的慧根，一定會明辨神父你和那些和尚、道士不同。」
到了這份上，沙勿略也就只好聽從。