在場的孫承宗卻別有一番感受，他今年已經七十又三了，人到七十古來稀，到了他這個年紀應該回家飴孫養老了。但是皇的挽留讓他很是感動，所以他決定在留下來幫皇完成兵制改革的事宜。從朝中的大臣來看，也沒有多少人能夠適宜做這件事，得罪人的事情旁人躲都躲不及。孫承宗當然不會計較這個，而且他也知道皇的一貫作法是不會讓他吃虧的！
皇說完之後，接下來是孫承宗開始匯報總的駐兵改革事宜，這個奏議每個內閣大臣手裡頭都有一份，但因為這個問題關係到其他眾多問題，所以要拿出來探討，同時也是要面對眾大臣的質疑。
「在四年的時候，老臣主持兵制改革，在武昌，桂林，成都，南京，鳳陽，青海，福州，外加九邊重鎮都駐有五萬左右的兵力；每行省設立六衛，將士三萬三千六百人，守於各要道州府。當時遼東事急終究未能盡善盡美，今日女真已滅，需重新議定駐軍，使之大明根基鞏固。」
說著孫承宗攤開大明的地圖，貼出各處駐軍所在位置，然後一一指道：
「如今遼東已經平定，瀋陽需要重新駐軍震懾遼東，所以在此另加十衛人馬！中都鳳陽是我大明龍興之地，但從軍事來看，駐軍跟南京相近重合，是以老臣認為設定一衛人馬即可，駐軍遷至濟南為佳。另外近幾十年來，陝西動亂頻繁，如無人馬預備始終不妥，因此西安需駐兵十衛。甘肅之地有蒙古人窺視，自然也要駐兵，原本甘肅鎮就屬九邊，是以駐兵與此鎮二合為一，同樣駐兵十衛。青海全土尚未劃入大明治下，所屬衛所先暫由神武軍節制，是否駐兵日後再做計較。江西南昌再設立十衛人馬，以穩定南方的局勢。另外九邊中的宣府，薊州，山海關，將重新設為三萬人馬的駐兵。」
賀逢聖道：「廣東、福建、浙江不設駐兵是否可行，畢竟這些年番人多有騷擾！」
孫承宗道：「這三省之所以不設駐兵，那是因為這些省將設立水師，水師不僅可以海作戰，必要的時候也可以登陸作戰，所以就無需另外設駐兵了！」
賀逢聖聽罷連忙點頭，看來孫承宗是考慮得很周全。
旁邊的李標卻是盯了地圖好一會，才板起手指數著道：「按照孫大人的方案，只有瀋陽，濟南，西安，武昌，桂林，成都，南京，蘭州，福州九個地方設立四十五萬人馬，宣府，薊州，山海關共九萬人馬，加余留下的九邊二十八萬，京軍的十萬，那麼駐兵人數是在一百零貳萬。如果十九個行省有五十四衛所，那麼人數也在二十七萬間，那麼我大明兵衛總共就一百二十九萬。加水師，漕丁，直衛人數已達一百五十餘萬。這總軍數與我現在軍馬人數大致相當，我有兩個問題問孫大人，第一京師的兵力是否過弱？第二這駐兵是否要屯田？若不屯田，糧食從何而出？」
李標說完，其他人都沉吟起來，可以說李標雖然不大管軍事，但這兩個問題問的相當有水平。要想軍隊改制，那麼這兩個問題就要解決好。
孫承宗頓了下道：「嗯，李大人說的這兩個問題，我也正要回答。按照我大明初制，京師人馬雲集百衛，兵力達六七十萬之多，然人數過多，戰力低下，且北地物產貧瘠不能供養，單靠南方輸送恐不能及。況且我大明京師自從英宗之後，兵力一直處於十二萬間，皇新建京軍之前，實際人數更只有五萬。因此，京營額度保持十萬之數也是合適的，戰力之高低不在乎於人數，且在於民心、正統、裝備。京師之地有四方守衛，
若有不測只需登高一呼，勤王者雲集，因此常備兵力無需太多。」
李標聽完沒有提出異議，因為孫承宗說的是事實。雖然歷來京營的兵額有這麼多，但實際人數卻少的可憐，幾百年都是如此也沒有發生過什麼動亂。再者現在的京軍是精銳中的精銳，皇必然優先裝備，將其打造成虎狼之師，這是地方軍隊無法比擬的。
這一條大家算是點頭默認了。
「至於屯田，我與不少大臣都交流過，認為現在就停止屯田似乎過於太早，地方也難以供養數十萬大軍，因此除去京軍外，衛所與駐兵都需要屯田，只是屯田的分數將會酌情考慮，因為衛所的衛兵將負擔地方事務。」
李標聽到這想知道詳細一點的情況就問道：「那敢問孫大人，這具體分數如何確定？」
「按舊制來算，每軍授田五十畝為一份，每衛所共計兩千五百頃。如果以四分屯種，六分操演，每衛所耕種一千頃！」
這是曹珖突然出言道：「祖制，邊地，三分守城，七分屯種。內地，二分守城，八分屯種。孫大人這樣已然減少軍屯產糧，如今軍屯尚不能自給，何況再削減！」
孫承宗如實道：「如果不夠只能是朝廷補給！」
「問題是朝廷能夠負擔得起嗎？」
「根據核算應該是沒有問題的，我們現在種植的玉米、蕃薯較之以往的產量有了很大的升。同時地方衛兵將減少鄉兵，民壯，那麼地方的支出要少很多，這部分的俸祿同樣可以補給衛所。而且大明的兵力以後將會進一步裁減，此時劃定軍數是因為現行軍馬有這麼多，貿然裁軍將不利於朝廷的穩定！」
「還要減少人馬？！」
幾個內閣大臣心裡都嚇了一跳，現在朝廷的人馬比之明初可是少了很多，如果再降低能否夠兵力鎮守四方呢？錢龍錫瞥見在場只有皇跟傅宗龍神色不變，看來是早有商議過的。孫承宗這麼說，也就是代表了皇的意見，所以錢龍錫儘管很是疑問也沒出聲。
反而是賀逢聖先出言道：「孫大人，如果這樣一旦朝廷要用兵，豈非無兵可用？」
孫承宗解釋道：「並非無兵，這是跟兵制環環相扣，如今朝廷徵集士兵將採用十年義務兵制，十年之後，退役的兵士也達百萬，一旦有戰事便召集回隊，瞬間可得百萬將士。這便是藏兵於民！」
「好主意！」賀逢聖忍不住出聲讚道。
李標道：「此法雖善，可一旦成亂民反成心腹大患！」
孫承宗搖搖頭道：「李大人所慮固然如此，但我軍徵兵皆為有家有戶之人，若非家破人亡必然不會冒險做那株連九族之事。只要官員清正廉明，百姓何來造反！」
這話讓李標無從反駁，一想也卻是如此！
孫承宗接著道：「為了京師的安全，京師的有空餘之地將會優先安排退役的京軍，或者安排至直衛，從而確保京師能夠有足夠的人員徵集。同時義務兵制的年限也會進一步降低，十年之期只能讓朝廷徵集百萬之人，因此將年限設置在六年，從而使在任何一個時期都能徵集三批軍士。如此以足夠兵力用於四方！另外還有一些關於互調地方徵兵，軍糧倉庫等等的設置在方案後頁，各位可以參詳！」
大臣們審閱過後，知道孫承宗不僅設想詳細，而且後邊還涉及到了幾個重要的改革舉措。那就是將設立參謀將軍一職，將原來只屬於各總兵官、副將們的幕僚們正式納入到朝廷的官職。五軍都督府將不再按前後左右來劃分地域，而是根據職能進行劃分，重新分為樞密府，後勤府，徵兵府，稽查府，斷事府
使得五軍督府自稱一體系，跟兵部相合管理天下兵馬。按照職能劃分，樞密府實際可以叫做總參謀府，只是為了彰顯它的地位，讓功成身退的宿將們到樞密府養老，發揮餘熱的地方。這樣才不會使得武官的職位可以升到朝廷政府，而不是一輩子都在地方。
總兵官的職位也固定了下來，屬於從二品。各地駐軍總兵官與地方巡撫平級，不受地方節制。駐軍總兵官任期三年，同時朝廷為其在京師置辦宅邸，三年後將按照表現進行升調。至於不能在本省做總兵官等等條件限制幾乎與巡撫一致，可以說巡撫是地方的封疆大吏，而總兵官將是軍隊的一方實力人物。
再往下看，眾人才覺得此番改制實際也是次的繼續。將巡撫一職定下後，都指揮所納入了地方，同時理順了地方跟朝廷中央的關係。雖然迫於品級，使得布政使這一級的的文武官員的品級都掉了一級，但是所得的俸祿不減反而加了，是以當時也沒有引起什麼轟動。由地方到軍隊，竟是一步步的進行。
這麼龐大的改制，不用說就是皇再後邊主持，孫承宗不過是一個出頭人而已！錢龍錫跟李長庚老持穩重早想得明白，是以對軍隊的改制方案算是默認了！