內丹學的人體系統工程實際上是對人體精、氣、神三大要素的修煉，它追求一種人生的最高藝術境界。這種人體系統工程，是一種參天地、同日月、契造化、返自然的開發人體潛能的工程，它追求天人合一，後天與先天合一，人與道的一體化的境界。這種境界就是仙人境界，因之內丹學也稱仙學。
自唐末五代以來，內丹學門派林立，先是有以虛無為本、頓超直入的文始派，又有性命雙修、煉養陰陽的少陽派。少陽派中又有南宗、北宗、中派、東派、西派、伍柳派、青城派、三豐派等內丹門派，至今仍在繁衍。另外還有天元、人元、地元三品丹法的說法，將內丹門派分為上下、正邪等不同品級。為了揭開內丹仙學之秘，我們不妨認真考察一下，這些眾多的門派是怎麼創立出來的？各丹派宗師是如何成名的？
像鍾離權、呂洞賓那樣的仙人，和我們相去甚遠，雖然他們的法身據說還在勸世度人，但我們畢竟沒有親見他們色身修煉成仙的過程，沒有和他們一起切磋學問的機緣，因之尚難印證鍾離權十試呂洞賓、秘受丹訣、飛昇天界的傳說。我們可以退而求其次，從近世閔小艮、黃元吉、劉名瑞、趙避塵，乃至伍止淵、陳櫻寧等內丹學家身上尋點端倪。
我對這些內丹家根文獻資料和實地訪問都作過認真考察，摸清了他們的修煉過程和丹法特點。大略說來，這些丹派師，都在社會上贏得一批徒眾和追隨者，都有能使人信服的著作傳世，其著作或丹師自著，或由徒弟記述，內容卻少不了將自己和仙真聯繫起來的話。
近世內丹學家陳攖寧先生為研究實踐仙學耗盡一生心血，他能詩能文，有仙學著作傳世，社會影響頗大。他的書中，自稱於光緒二十三年（西元897年）在安徽省懷遠縣遇異人相聚二十日，授以胎息法丹訣，約定日後見於黃山之下。這段記述，與《史記#83;留侯世家》中張良在下邳圯上遇黃石公的故事相類，然而陳攖寧氏一九五三年寫的《自傳》中沒提此事，卻說自己遍訪名山，求教諸多禪師高道，「都是空跑，並無結果。我想，這樣尋訪，白費光陰，還不如自己看書研究，遂下決心閱讀《道藏》。」由此可知，苦讀丹經，是悟解丹訣的根本途徑，此言不虛。
陳攖寧《答上海錢心君七問》中又說譬如我自己是個學仙的人，設若僥倖將來修煉成功，必有特異之處，可以顯示給大眾看見。倘仍不免老病而死，又無絲毫神通，你們切切不要烘雲托月，製造謠言，說我已經得道，免得欺騙後人。像這一類的事，前人書中常有，我看了甚為厭惡。所以我自己不願蹈這種陋習。今世修煉神仙之術，能完全成功的，我未曾見過。但一半成功卻是有的，然也不足為奇。這全靠我們後起之秀髮憤有為，方可登峰造極，超過前人。我對陳攖寧先生這種實事求是、自強不息的學者風度甚為讚賞，曾閱讀過他病死前親筆寫的《遺囑》，知道他修煉的底細。
陳攖寧遺下兩本自著丹書，一曰《學仙必成》，是講清淨丹法的，其要訣為胎息；一曰《參同契講義》，是講陰陽丹法的，其要訣為合氣，這大概是他多年訪道參悟而來的丹家之秘吧！這些丹派宗師的成名，或者靠真修實證，或者靠靈解妙悟，或二者兼有之。然而要苦讀丹經而靈解妙悟如陳攖寧諸前輩，要入室靜坐而真修實證如伍止淵諸前輩，都須要下一番死功夫不可。今人對丹經中遇仙得道的故事聽得多了，總想自己有一天突遇仙人，授上幾句丹訣，得一本手傳丹經，便可得立地飛昇之效。一些庸才因機緣巧合曾被某丹派宗師收在門下，聽到過這丹師的隻言片語，保存有丹師授課的手抄講義，便以為得了真傳，打著這些丹派宗師的旗號招徒騙錢，實不過是「盲師引瞎徒」而已。
因此，我常勸人不必迷信某宗師嫡傳弟子、某門派第幾代傳人的旗號，實是有經驗教訓的。這些年來，我得到的手抄秘本，聽到過的丹法秘訣已經不在少數，也親見過幾位丹派宗師的傳人，被他們以『十試呂洞賓』的法子捉弄過。如果這些丹派傳人真是鍾離權那樣的神仙固然好，可惜皆無那種道行，相反，那些能授我以真傳的老師根本沒費周折，卻是自已巧遇的。
據我個人觀察，內丹法訣全要靠自己下死功夫摸索，在苦讀丹經、多方修煉、狠力摸索中突遇真師一句點破，恍然穎悟，這叫『心有靈犀一點通』。有時丹師自己瞢然不覺，無意中說出的話，徒弟反而由此頓悟，也是有的。內丹仙學之途應是『條條大路通羅馬』，並非僅靠某一種方術才能達到仙人境界。學道者摸索的途徑不同，悟解丹經或真師點化的焦點不同，便是形成諸多丹法門派的原因。
佛陀的十大比丘弟子，成佛途徑各異，阿那律失明，修成天眼第一；觀世音耳聾，以天耳通得證菩薩果；《楞嚴經》十種仙，得道途徑亦各不同。佛法如此，內丹仙學也不例外，否則豈能有這麼多門派？因之我認為，真師真訣，無法教會那些沒下死功夫的庸人；真師真訣僅是一種機緣，能否得遇這個機緣，依那條途徑修成正果，創立什麼門派，全在於學道者自己的悟解和狠力摸索。
內丹學千門萬戶，從功法上講，無非是陰陽雙修和清淨孤修兩類，或二者相互結合形成的門派。清淨孤修派中實際上不外胎息法門、止觀法門、存思法門、煉氣法門、采日月精華法門、辟榖法門等，都是古仙行之有效的老法子。實際上唐代以前的古人，功法樸拙，更易開發人體潛能，得道成仙的人更多。後世丹法繁文縟節疊床架屋，得訣離，修習更難。丹家明白返樸歸真的道理，才能抓住要害，破解各門類丹法秘訣。陰陽雙修派中有栽接法門、採補法門、合法門、感應法門等，也不難尋流溯源，揭開其中的隱秘。
仙學修煉，雖然分諸多門派，但根本要訣，都要從《道德經》中「致虛極，守靜篤」六個字做起，都要在人體精、氣、神三大要素上下功夫。這個功夫，少則三年五載，多則幾十年，要萬緣放下，將「虛寂恆誠」四字變成自己的人生體驗，這豈是那些滿腦子功名利祿，沉溺於官場、情場、市場的人所能辦到的？因之我認為修道者真想得到仙人境界的生命體驗，就畏要學王重陽做『活死人』的榜樣。
內丹仙學修煉既然須下三年五載『活死人』的靜功夫，則入手之初必須先作好準備，安排好個人、家庭及與之關聯的社會事務，以解脫俗緣之累。俗緣未盡的人是無法安心修道的。丹家修煉，須與道友相互切磋和彼此照應，儘管是清淨孤修法類的丹師，也應邀集三、五道友作為伴侶，同修同證。同時，還要備足這些人的生活費、醫藥費、旅遊費、營養費，提供人身安全保障，才能擇地入室修煉。丹室宜背山面水向陽避風，多植松柏，泉水叮咚，清靜優雅，生活方便。室內光線不明不暗，空氣新鮮，潔淨無菌，陳設簡單。所居之地以人體工程的進度，每階段有不同的要求。
內丹學要花十來年死功夫從根本上變化人的體質，開發人體潛能，凝煉人體精、氣、神，這須要外部環境和人體的內部環境相適應，以便發生天人感應的作用。
初關仙術，須選擇山明水秀，土厚樹茂，生氣聚集的地方。丹家要借天地之生氣，培補人體元氣，以行煉精化氣之功。中關仙術，須擇洞天福地，超塵絕俗，松青竹翠，彩雲霞光的靈氣凝結之地。丹家陽神出殼，須借天地之煞氣戰勝邪魔。以上是丹家流傳的說法，須要讀者自己參詳。
內丹仙學將精、氣、神作為人體生命的三個基本要素，譽為『三寶』，是煉丹的『藥物』。內丹學有三大要件藥物、鼎爐、火候。弄懂這些是修習內丹功夫的理論準備。人體的精、氣、神有先天和後天之分，後天的精、氣、神是呼吸氣、交感情、思慮神，屬有形有像、人為的東西；先天的精、氣、神是無形的、自然本能狀態的、功能性的、超越時空的東西。
先天的精、氣、神在內丹學中稱作元精、元氣（寫作氣）、元神，它們分則為三，合則為一，既是生命運動的三個層次，又是屬於同一個生命運動的三種表現形式，相當於物質運動的熱、力、光三種效應。
詳細點說，「後天精」是人在**時射出的「先天精」指人的性功能，廣義上包括生殖系統、內分泌系統、血液循環系統等自然功能。精是形體的精華，是人軀體中的生命物質。「元氣」是人體生命運動的機能，體現為高度有序的能量流和軀體活力。內丹仙學以煉心為基本功夫，故對「神」的剖析極為細緻。
人的心理系統中的意識活動和無意識活動，都是人類在進化過程中大自然賦予的重要心理功能。人的無意識活動決不是一種無足輕重的自然現象，而是人類進行生存鬥爭，改造自然和社會的重要潛能。內丹學以開發人體潛能為目標，將煉心即煉已功夫貫穿人體工程的始終。柳華陽《金仙證論》說『蓋己者，即本來之虛靈。動者為意，靜者為性，妙用則為神也』。說明內丹學注意到人的意識是分為不同層次的。
我多年來對道教中的內丹學苦思冥想，反過來又給自己原來所瞭解的天體物理學、物質結構理論、心理生理學以很大衝擊，逐漸在腦子裡形成一種新的物質、能量、信息的宇宙圖景，試圖用以解釋內丹學中的各種人體潛能現象。為了使人們對內丹學中煉神的功夫有清晰的、實質性的理解，我將用自己創造的一套心理學術語來描述它。
根據我對內丹學的研究，可以斷定人的意識可分為三個層次。人的正常意識活動在表層，我稱之為『常意識』，包括人的感知、判斷、推理等一系列思維活動，內丹學將常意識稱作『識神』。內丹功法在入靜初期一切雜念、游思都屬於識神的活動，通過常意識的自我控制可以凝煉為意念力，集中意念力又能開發深層意識「潛意識」，潛意識是一種非理性的意識，包括人們平常不易覺察的童年記憶和隱藏的性慾、各種人生慾望、心理創傷等，這些潛意識在背後強有力地影響著人們的心理程序，人們可以從夢境、幻覺、靈感、直覺、精神病等心理狀態中破譯出潛意識的原形。內丹功夫中出現的不良心境、惡劣情緒、各種魔境、幻覺等都是潛意識作怪。內丹功法要淨化潛意識，並通過一定方式（如熟讀丹經、牢記師傅、背誦口訣、默唸咒語、反覆訓練等），將煉丹的程序編碼輸入潛意識之中，使之轉化為『真意』充當引導煉丹過程的『黃婆』。潛意識可以在內丹修煉中逐步人格化，凝煉為陰神。陰神是人格化了的潛意識，可以脫體而出，具有透視、遙感，預知等超心理學的人體潛能。
人類心理的最深層次是『元意識』，在內丹學中稱作『元神』。在內丹修煉到元意識顯現時，呈一種極端清醒卻毫無思維的心理狀態，這說明元意識是比潛意識更深一個層次的意識，是一種遺傳的本能意識。元意識是人類在漫長的生物進化中遺傳在頭腦中的尚未開發的信息庫，它包藏著生物進化史上曾經有過的智慧和能力，是人身真正的『自我』，因之丹家也稱之為『主人公』。元意識在內丹學人體工程中通過開發和凝煉，可以逐步人格化為陽神。
這樣，內丹學實際上是一項凝煉常意識、淨化潛意識、開發元意識的人體系統工程。陽神是元神的凝聚體，有成熟的人格，可以脫體存在，是人的身外之身，丹家稱作『法身』。
內丹學中還有一最重要的理論，是關於「先天一氣」的學說。內丹學認為，在宇宙未創生之前，是一片虛無。當宇宙創生之時，先有一氣產生，丹家稱之為元始先天一氣、真一祖氣、太乙含真氣。這種先天一氣，是宇宙大爆炸之前的初始信息，是宇宙本源的節律，是生機勃勃的道氣。
內丹學的清淨功夫或陰陽功夫，都是要通過陰陽交感的原理將先天一氣招攝到體內，使自己的身心與宇宙的自然本性契合，反回到先天的道的境界。內丹家煉精化氣、煉氣化神、煉神還虛的步驟，也是要通過元神的激發，在量子層次上調諧人體節律和宇宙的內在節律，使元意識凝聚為陽神，在人腦與宇宙的同構感應中，達到天人合一的絕對境界。