暗部的生活一如止水想的一般不平靜，睡覺的時候，他根本不敢熟睡，因為不知道誰會突然蹦躂出來攻擊你，雖然說止水也可以用結界術的，但是他自身也希望能夠提升一些警覺性，很快，不到一個月，他就練到了被攻擊的時候悠閒的使出瞬步，利用查克拉吸附在牆壁或者是天花板上繼續睡，反正睡哪都和睡那硬梆梆的石床沒啥區別，只是剛開始就狼狽多了，如果不是他的五感比普通人要敏銳的多，並且有瞬步和時空忍術，並且在一擊致命的地方布上結界的話，他恐怕早就死了不知道多少次了吧，不過這也多虧了止水的睡眠需求並不多的成分在裡面，即使每天訓練的累死累活，睡個三四個小時就足夠了。
至於洗腦訓練嘛，無非是用暗示和催眠，也就是整天在他們耳邊念叨，要效忠木葉，效忠團藏之類的話，不過這些對於擁有寫輪眼並且精神力極高的止水來說根本沒用，似乎宇智波家也很放心止水不被洗腦，宇智波富岳也只是稍微囑咐了下而已，畢竟他擁有著三勾玉寫輪眼即使精神力再怎麼弱也不至於被洗腦，看來團藏並沒有完全掌握他的資料呢，連他開了三勾玉寫輪眼這點也不知道，嘛，本來知道的人就不多，除了父母還有宇智波富岳和三代死去的四代還有卡卡西之外，似乎就沒其餘人知道了。不過富岳的意思是要取得團藏的信任，深入木葉上層，所以止水也只有裝作被成功洗腦的樣子，演戲，對他來說不是什麼問題，曾經姑姑有一段時間很迷舞台劇，就讓他報了戲劇部，那段日子簡直就是地獄，一個同人女會讓人鬱悶，一群同人女，就讓人欲哭無淚了。
正常的訓練分三種，暗殺訓練，拷打訓練，還有抗毒訓練，暗殺，顧名思義，就是隱藏氣息，出其不意又不被任何人發現的殺人，至於拷打訓練，也就是被吊那吊著，哪疼打哪，還有電擊，撥指甲等各種各樣的刑訊方法，第一次下來，開始止水還能忍著，到最後是根本沒力氣叫了，結束的時候由醫療忍者簡單的治療下就讓他自己回房了，現在止水也不愁沒聖光治癒的試驗品的，他自己身上的傷就是個非常好的試驗品，不過對自己用治癒能力比對別人使用要困難的多，從而導致的就是，止水對那治癒能力的控制是直直上升。至於抗毒訓練，則再次證明了初始神出品質量絕對可靠，這個身體對藥物完全免疫，以至於抗毒訓練他直接跳過，空出時間做其他的訓練。
這樣的基礎訓練一共做了一年左右的時間，這一年裡止水除了暗殺訓練之外，幾乎沒有踏出過這個陰暗的地方過，至於清和那邊，他早就把這一年裡需要的資料全部整理好放在他那裡了，他只要定期控制著清和分別拿給他就行了，其實，並不是不能讓清和自己送過去，現在的清和，已經完全是他的傀儡了，只是送去的時候還要應對大蛇丸的一些刁鑽的問題，有些是清和根本答不上來的，所以止水只有親力親為了，至於陌離，她依舊過著她悠閒的生活，沒事YY美男，逛逛街，完全的過著普通居民的生活，而有止水的結界在，也不用擔心她的生命問題。
倒是鼬，在一段時間沒見到止水後去問了父母止水的去向，在富岳回答他進了暗部沒有辦法出來的時候鼬就再也沒問關於止水的事了，不過從他越發努力的訓練中可以看出這娃的志向，變強，進入暗部找哥哥，嘛，這也只是止水單方面的猜測而已，誰知道他有沒有其他的原因呢，而就在止水進入暗部過了大半年的時間，鼬開了寫輪眼，八歲，開寫輪眼……
在卡卡西奇怪怎麼這段時間沒見到止水而去問三代的時候，得到了止水進了根的這個消息後很是生氣，但是生氣也沒有辦法，止水姓宇智波，而且偏偏生在分家，分家是沒有違抗宗家的權利的，不過自從止水進入暗部並且挺過了那些艱難的訓練之後，宇智波一族和木葉的關係就變得微妙了起來，似乎有什麼陰謀在暗處慢慢滋生……
至於止水這一年裡幾乎沒踏出過這個屋子又怎麼知道外面事情，關於這點，既然初始神讓陌離跟他姓，其中必定是有羈絆的，他可以通過類似於心電感應之類的東西和陌離聯繫，而且他也能夠讀取清和的記憶從而獲得外界的情況，雖然說是只是醫療忍者，但是從病人口中還是能夠得到不少有用的情報的。
而在止水剛剛被宣佈『畢業』後，就被團藏找了去。
「玄火，你結業後的第一個任務，暗殺雷之國一個大名，這個大名僱傭了不少高手保護，而且很會躲藏，任務等級為S級，這個任務你將會和火影直系暗部的雷一起執行。」
「是。」雷嗎，這個代號他可不陌生，最終測試嗎……