九月二十六日，中國人民解放軍影子部隊從唐山出發，前往浙江台州沿海集結。台州各地小型港口進港停泊的各種中小型船隻突然劇增，連雲港的重型坦克也裝完最後一輛。船隊點火出港集結編隊，準備啟航。
同日中央政府發佈台海事務一號命令：命令駐台灣省的中國軍隊立即出兵平叛，殲滅台灣省台南縣境內的「**」各主要機構、主要領導人物及所屬武裝力量。命令台灣地方政權採用有效措施平息大規模的社會動盪。本月內，即二零一X年九月三十日之前完成任務。否則中央政府將採取一切有力措施，包括派出武裝力量，前往平叛和平息社會動盪，恢復台灣地區社會秩序，保衛人民生命財產安全，維護國家領土完整。
晚八時台灣國防部會議室，國防部長：「中共今天發佈了對台命令，各位將軍，請發表看法。」空軍司令：「國軍從來沒有隸屬中共，沒有接受中共指揮的先例。我的態度是不必理會，就是要對台南採取行動都是陸軍的事，空軍無法出動戰機轟炸台南。」政戰主任：「政府及總統在對台、對大陸兩方面都沒有下決心。對台南的『**』下了立即解散的命令，但是沒有採取強力措施，更沒有給國軍下達平叛命令。政黨方面反而有若干反常現象，居住在國外的政客在這個非常時期回到國內的大有人在。特別是有幾位重量級人物這兩天都飛了回來，而且各政黨都有。整個台灣政界有一種詭異的氣氛。政客和國軍中、上級軍官的接觸也很多，特別是與掌握兵權的人。有的還多次密談。如空軍某師師長、情報部某副部長、海軍某艦隊高官、陸軍各部都有。面對這種形勢，國軍是難有作為。」海軍司令：「海軍各部各艦都作好了出海抗共的準備。海軍陸戰隊也能在接到命令後投入平叛。軍人以服從命令為天職，服從命令我責無旁貸。」總參謀長：「外有中共命令，上無總統指示，內有軍心不穩，防區內有第二個『國家級政府』。國軍的唯一選擇就是等待。」陸軍總司令：「我同意總長的意見。」
深夜日本總理官邸，官房長官：「根據情報支那的特種戰部隊都在原地駐防。特別是海軍陸戰隊各部，到目前都沒有要參加渡海的動向。軍方如何解讀這一現象。」防務大臣：「軍方的解讀是，支那為本土防禦做了最壞的預測。因此，留下了精兵防備。應該引起我們重視的情況是：
近日在支那東北地區開始出現東風-21型導彈；中共的J-11C、J10-B型飛機、JH-7B集結在濟南戰區，數量明顯多於廣州戰區。
說明中共已經預判到了日中開戰的必然性，從而加大了對日作戰準備。它雖然還不能改變日中軍事的總體態勢，但已經增加了日軍取勝的難度。支那共軍目前仍然以遠程導彈為主遏制關島美軍，以海軍的潛艇數量優勢為主力阻滯美軍航母。美軍航母戰鬥群已開上了關島至台灣航線，美軍的大規模掃雷清理航道行動還在繼續，為十支航母一體化行動開闢安全航道。但要使台灣及台灣海峽上空的空軍優勢達到能制空的程度，美軍航母戰鬥群至少要達到台灣東南海域五百公里，才能使艦載機有足夠的制空時間。要達到台灣東南五百公里洋面，美軍還需要十天時間，即要在十月五日美軍才能擁有在台灣地區上空投入五百架空戰飛機的能力。駐關島的陸基飛機只能用於保衛美軍的海上運輸線安全，不能參加奪取台灣制空權的作戰。我們判定美軍的F-22戰機不會出現在台海上空，只會出現在其航母戰鬥群的上空，保衛航母的安全，以保證艦載機能全部投入台海奪取制空權。支那的渡海作戰準備已進入最後階段，大量的重型坦克裝載完畢，其它裝備和物資也基本裝載完畢，等待啟航。我們判定按遠、中、近的距離，渡海部隊應從十月一日至三日分別啟航。登陸戰應在十月三日晚至十月四日早晨打響。」總理：「情況已經清楚，明天確定最後的作戰方案。」