朱祁鈺對進攻黑磯也不是很關心，在他看來，連宇都宮這樣的王城都被第十一軍給打了下來，如果萬軍平無法在兩日內打下黑磯的話，那第十一軍在宇都宮表現出來的戰鬥力就有水分，萬軍平這個騎兵出生的步兵軍軍長也該回去種地了。不過，很快朱祁鈺就不得不重視對黑磯的進攻。
可以說，攻佔黑磯，是朱祁鈺這次戰役安排中的關鍵點。為了完成包圍圈，朱祁鈺讓軍與近衛軍先後深入敵後，冒險行動，而最後來關上大門的就是第十一軍。只要佔領了黑磯，叛軍主力就無法進入任何一座有防禦價值的城市，不得不與明軍打一場野外的大規模會戰，而這正是明軍的強項，也只有在野外會戰中，才能最大限度的控制明軍的傷亡，同時消滅叛軍主力！同時，攻佔黑磯也是全面進攻的號角，只要第十一軍完成任務，近衛軍將從東北面，軍從西面，第十一軍與日本中央軍從南面同時向叛軍主力發動進攻。三面夾擊之下，叛軍主力必然迅速被殲滅！從這些方面來說，黑磯的戰役意義非常重大，也將是整場戰役的轉折點。
也就是在這裡，第十一軍遇到了麻煩。在到達的當天下午，第十一軍就發動了進攻。炮擊一直持續到了第二天黎明。在沒有收到第十一軍的具體戰報時，朱祁鈺警覺地意識到，第十一軍遇到麻煩了。等他率領侍衛團趕到前線戰場上的時候，果然發現，第十一軍持續了近一整天的進攻，竟然沒有多少收效，萬軍平也不敢向朱祁鈺匯報戰果了。
「陛下，末將這就帶步兵衝鋒，不打下黑磯，末將絕不回來見陛下！」萬軍平一副誠惶誠恐的樣子。他原本還想在上午讓炮兵再繼續轟擊黑磯，不過在見到皇帝親臨前線之後，也只有硬著頭皮強攻了。
「站住，誰叫你蠻幹的？」朱祁鈺看了萬軍平一眼，也沒有理會這個差點被他嚇破了膽的少將，立即就帶著侍衛團到了最前沿陣地的後面。
當朱祁鈺看清了黑磯城外的情況時，也就不再責怪萬軍平，確實，第十一軍盡到了全力，只是黑磯的防禦太頑固，所以還沒有能夠將黑磯打下來。
一般日本城市的城牆的高度都在三丈到五丈之間，只有極個別的大城的城牆高度超過了五丈。另外，城牆的厚度都在一丈左右。一些高一點的城牆厚度會達到一丈半，甚至兩丈。而黑磯城的城牆是屬於比較普通的類型，高度在四丈半左右，厚度一丈多點。另外，大部分日本城市的城牆都是用磚頭堆砌。然後用糯米漿，或者是其他的粘結劑固定的。很少有明帝國那種用純粹的岩石，以及最好的糯米漿鑄造的城牆。
這種城牆，是不可能抵明軍炮兵的轟擊的，所以如同宇都宮這樣的城市都被明軍炮兵迅速轟塌。不過，這次黑磯城的城牆卻很特殊。
整個黑磯的城牆長度不超過八里，讓朱祁鈺大驚不已的是，整條城牆外面都堆起了高三丈，下部寬達兩丈以上，頂部與城牆結合起來的土牆，或者是土坡。也許連城牆裡面也做過類似的加固。而這些泥土都是從附近河裡取來的淤泥，風乾之後，不但堅固，而且能夠抵擋明軍的炮擊！
在第十一軍炮兵重點轟擊的西門方向上，長達近兩里的土牆上佈滿了炮彈爆炸後留下的彈坑，讓人看上去，就如同是巨大的馬蜂窩一樣。
顯然，第十一軍已經在頭一天的戰鬥中盡了力，城牆外明軍官兵的屍體也證明，萬軍平甚至下令讓步兵發動了進攻。只是，在沒有辦法轟開城門，或者是轟倒城牆的情況之下，步兵的進攻往往就要蒙受巨大的傷亡，甚至可以說是送死！
這時候，上杉謙信也帶著日本中央軍的將領來到了前線。本來上杉謙信要去找朱祁鈺商討攻佔黑磯之後怎麼進攻叛軍的事情，當他聽聞朱祁鈺到了前線去之後立即就追了過來。見到黑磯城的模樣時，上杉謙信也大吃一驚。
「陛下，看來叛軍已經在戰爭中總結出了怎麼對付炮兵的辦法了！」
「哼！」朱祁鈺冷笑一下，說道，「如果有足夠的時間，這世界上沒有任何一座城市能夠擋住明軍炮兵的轟擊。不過，我們現在沒有足夠的時間。」
「那讓我們的人上去試試，黑磯就兩萬守軍，如果強攻的話，中央軍有五萬人，再加上明軍的炮火支援，打下黑磯肯定沒有問題。」
「沒有必要冒險，就算沒有足夠的時間，朕都有辦法在明天日落之前打下黑磯。」朱祁鈺很是自信的樣子，「放心，辦法是現成的。當年瓦刺堡壘比黑磯堅固十倍以上，最後還不是淪陷了嗎？攻城，不但要注重火力，必要的時候，從內部突破也是不錯的辦法。」
「陛下準備挖地道進入黑磯？」上杉謙信皺了下眉毛，「這樣太冒險了。黑磯的守將既然知道怎麼加強城牆，就一定想到了我們可能會挖地道從內部突破，他也肯定有所準備……」
「將軍，放心吧，挖地道的辦法太落後了。」朱祁鈺笑了一下，說道，「東征時，我們採用了一種攻城的辦法，就是將戰壕修到距離城牆不到五百步的地方，然後將一種特殊的火炮送上去，直接壓制城牆上的守軍，讓步兵趁機攻城。只要步兵能上到城牆上，打下黑磯就不成問題。現在，我們的火炮都經過了改進，射程增加了很多，如果我們用炮兵直接壓制城牆上的守軍，然後讓步兵挖掘戰壕到城門附近，埋上幾百斤的炸藥，還炸不爛城門？就算叛軍把城門給堵死了，我們也能炸城牆，一段段的炸，知道炸垮城牆，到時候，看叛軍還怎麼守！」
「不過，這需要很多時間。」
「對，確實需要人手與時間，這就需要上杉將軍提供幫助了。」
上杉謙信一愣，立即笑著說道：「那就由中央軍負責挖戰壕，埋設炸藥吧。第十一軍提供炮火掩護，並且準備進攻。
「那就這麼辦，另外朕安排幾個爆破專家協助你們埋設炸藥！」朱祁鈺向北面看了一眼，又說道，「不過，我們還要做好更多的打算。恐怕光是挖這條戰壕就要花掉大半天的時間。現在黑磯的守軍肯定把消息傳了出去，叛軍統帥察覺到陷入了我們的包圍圈之後，必然瘋狂突圍，如果他們向黑磯方向前進的話，那我們就要想辦法將叛軍擋在黑磯城外。」
「唯一的辦法就是在黑磯城北面設置防線。」上杉謙信蹲了下來，用一根枯枝在地上畫出了大概的戰場示意圖，然後說道，「黑磯城東北面有一條河流，叛軍要想進入黑磯，就必須渡過這條河。如果我們能夠在河的南岸設置防線，然後用炮兵打擊渡河的叛軍，並且在河灘上埋設地雷的話，應該能夠阻擊叛軍數日。到時候，只要打下了黑磯，就能將第十一軍，中央軍的兵力都調到這邊來，而且近衛軍與軍也將縮小包圍圈，我們就能將叛軍圍死在河邊，最後讓叛軍無可退卻，全殲叛軍！」
朱祁鈺邊點頭，邊思考了一陣，最後說道：「那麼，我們就還要做一件事情，讓近衛軍與軍由守轉攻，提前對叛軍發動進攻，迫使叛軍向黑磯撤退！」
「如果能夠放開黑磯北面的防禦，讓叛軍認為進入黑磯城固守的機會更大一些的話，效果就更好了。」
兩人都笑了起來，此時兩人都想到了同一點上。只要能夠將叛軍趕到黑磯北面的戰場上去，那麼不但能夠更快的殲滅叛軍主力，而且還將大大減少戰役難度。當然，關鍵仍然是明軍能夠以多快的速度打下黑磯。如果在叛軍主力到達北面的河對岸時，黑磯仍然在叛軍的手裡，甚至守衛黑磯的叛軍衝出來接應的話，恐怕第十一軍與日本中央軍就要面臨一場苦戰了。
當天上午，三萬日本中央軍就開始在黑磯城北面的河南岸修建防禦陣地，陣地設置在河岸南面兩百五十步之外，而在陣地外的河岸上，第十一軍的一個步兵師在這埋設了至少三萬枚地雷。就算一枚地雷炸掉一個叛軍，這也夠三萬個叛軍「享受」了，而且一枚地雷往往能夠炸死炸傷多人。
同時，日本中央軍的幾千工兵開始挖倔戰壕，隨後明軍炮兵地爆破專家也開始幫助這些日本軍人埋設炸藥。當時，明軍還沒有專業的工兵隊伍，而懂爆破的基本上都是炮兵部隊的官兵。其實日本中央軍也沒有工兵隊伍，只不過，他們主要的人物就是送送輜重，以及設置陣地，一次被朱祁鈺戲稱為工兵之後，明軍就這麼稱呼日本中央軍了。
日本中央軍也接過了第十一軍設置在黑磯城外的防禦陣地，他們除了繼續加強陣地的強度，設置更多的防禦工事之外，也會偶爾組織一兩次小規模的進攻，騷擾城內的守軍。
第十一軍的步兵撤到後方，除了準備最後進攻黑磯的任務之外，還充當了預備隊。而第十一軍的炮兵則分成了兩部分。其中一大半來到了黑磯北面的防線後方，準備抵抗叛軍主力，而另外一部分則留在了黑磯西面的炮兵陣地上，準備在步兵進攻黑磯的時候，為其提供炮火支援。
在南線部隊準備進攻黑磯，抵擋叛軍主力進攻的時候，朱祁鈺也派人給近衛軍與軍傳達了命令，讓梁岳與謝正卿兩人分別由守轉攻，迫使叛軍主力向南前進，進入第十一軍的伏擊圈，並且最終完成包圍行動，在黑磯城北面殲滅叛軍！
可以說，此時戰場上的氣氛是非常緊張的。黑磯城內的叛軍發現日本中央軍在挖掘通忘城牆的戰壕時也弄清楚了對方的意圖，不過他們卻沒有太多的辦法。一是明軍的炮兵佔有絕對優勢，所有上到西城牆上的叛軍都將遭到明軍的炮火壓制，更別說出城迎戰了，那完全是去送死。
二是日本中央軍在挖掘戰壕的時候，採取了明軍的辦法，即在進入了守城叛軍的火力打擊範圍之後，將戰壕挖得更深了，然後用厚度超過了三寸的木板蓋在上面，同時在木板上還鋪了一層濕潤的泥土。這樣，就算叛軍的炮彈直接打在木板上，也不會造成太大的傷亡，而且叛軍的火炮根本就不敢上城牆上來，在城內的拋射，準確度就降低了很多，很難直接命中。另外，叛軍也難以用火油來對付戰壕裡的中央軍。
當天晚上，叛軍組織了一次反擊，兩千多死士衝出城來，準備摧毀日本中央軍修建的戰壕。不過，這兩千多叛軍確實都成了死人，早就守在外面的明軍步兵，以及日本中央軍官兵毫不客氣的將這兩千多叛軍給消滅掉了。
第二日一早，戰壕就修到了距離城牆不到五十步的地方。叛軍也瘋狂的行動了起來，將一切認為可以對付戰壕的辦法都用上了，甚至從城牆上拋下巨大的石塊，任何可以砸垮戰壕上的木板！不過，這全都是徒勞的舉動，當叛軍想到用火燒的時候，在城牆附近的戰壕上早就堆滿了叛軍扔下來的石塊，磚頭，原木等等。結果，火燒也沒有燒出個結果來！
當朱祁鈺趕到前線觀戰的時候，一百名日軍中央軍的士兵正魚貫進入戰壕。他們每人都帶了一個裝著十斤炸藥的炸藥包。在進入戰壕之後，他們按照明軍爆破專家的要求，將炸藥包按照規定的方式堆在了戰壕的最前端，即靠近城牆根部的地方。當一百個炸藥包都堆好了之後，明軍爆破手引燃了導火索，同時戰線上的進攻部隊也進入了進攻陣地，炮兵則開始炮擊城牆兩端的叛軍。
當巨大的爆炸發生的時候，朱祁鈺微微的笑了起來。硝煙散去的時候，黑磯城東面城牆靠近城門的地方，已經被炸出了一段大概有二十丈寬的缺口，而批進攻的日本中央軍已經從陣地裡衝了出去，在他們身後，早就已經組織好了第十一軍的明軍步兵也開始推進了……